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消痈散结方治疗非哺乳期乳腺炎网络药理学研究
编辑人员丨1周前
目的:基于网络药理学及分子对接方法探讨消痈散结方对非哺乳期乳腺炎(non-puerperal mastitis,NPM)的作用靶点及机制。方法:检索TCMSP中消痈散结方组方药物的有效成分及各成分相应的作用靶点信息,检索GeneCard、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库中NPM相关基因,将消痈散结方核心靶点及疾病相关基因数据取交集,利用STRING数据库对交集基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,借助Cytoscape 3.8.0建立消痈散结方治疗NPM活性成分-作用靶点-通路调控网络。利用R语言包对作用靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,采用vina进行分子对接验证。结果:获得消痈散结方组方药物47个有效成分,1 692个NPM相关潜在靶点,筛选获得消痈散结方治疗NPM核心靶点235个,消痈散结方治疗NPM关键成分包括槲皮素、柚皮素、山柰酚、薯蓣皂苷元、木犀草素等,核心靶点为细胞间黏附分子-1(ICAM-1)、血管内皮生长因子(VEGFA)、TNF、IL-6、表皮生长因子受体(EGFR)、IL-1B、趋化因子-8(CXCL8)、趋化因子-2(CCL2)等。GO富集得到1 492个生物过程条目,KEGG通路富集得到105个通路,主要包括TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、IL-17信号通路、C-型凝集素受体信号通路等。分子对接验证消痈散结方的关键活性成分与潜在核心靶点有较好的结合性。结论:消痈散结方治疗NPM具有多成分、多靶点的特点,主要通过免疫炎症反应、药物代谢、细胞适应性应激反应、血管机能调节等信号通路发挥对NPM的治疗作用。
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编辑人员丨1周前
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基于网络药理学和高通量分子对接虚拟筛选参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎活性成分及作用机制
编辑人员丨1周前
目的:筛选参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的活性成分并探讨其作用机制。方法:基于网络药理学和高通量分子对接技术,从TCMSP、中药分子作用机制的网络药理学在线分析工具(BATMAN-TCM)及Targetnet数据库中检索参麦注射液的化合物和预测靶点,并构建成分-靶点网络;从在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和GeneCards数据库中检索"coronavirus pneumonia"相关基因,与化合物作用靶点共有的部分构建靶基因间的蛋白相互作用网络;使用DAVID6.8进行基因功能、通路富集分析;通过PDB数据库获取蛋白质的晶体结构,采用AutoDock Vina和Python脚本进行高通量分子对接。结果:共获得27个化合物和224个靶基因,鉴定出干预冠状病毒的15个核心成分与15个核心靶点,分别为CASP3、NOS2、PARP1、CASP8、NOS3、BCL2、ADA、OPRM1、TGFB1、TLR9、ACHE、SLC29A1、BAX、ADK、PNP。核心靶点主要作用于肺结核、癌症通路、乙型肝炎、细胞凋亡等信号通路。虚拟筛选后得到与冠状病毒相关靶点对接较好的成分有薯蓣皂苷元、豆甾醇、β-谷甾醇、人参皂苷Rh1苷元。结论:本研究筛选出了参麦注射液干预冠状病毒的主要活性成分及作用靶点,为参麦注射液治疗COVID-19提供参考。
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编辑人员丨1周前
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基于生物信息学和动物实验探讨完带汤治疗盆腔炎性疾病后遗症的作用机制
编辑人员丨1个月前
目的:基于生物信息学、分子对接及动物实验探讨完带汤治疗盆腔炎性疾病后遗症(sequelae of pelvic inflammatory dis-ease,SPID)的作用机制.方法:通过基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库检索SPID相关数据集,借助limma分析筛选差异表达基因.通过HERB数据库检索完带汤作用靶点,将其与SPID差异表达基因取交集,作为完带汤治疗SPID的关键靶点.将关键靶点导入STRING数据库,绘制蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图.通过Cytoscape软件的Analyze Network插件进行拓扑分析,从而筛选核心靶点.通过Web Gestalt数据库进行基因本体(Gene Ontol-ogy,GO)功能分析,借助Reactome平台进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析.采用HERB数据库和中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)获取核心靶点对应的化学成分,将其作为完带汤治疗SPID的关键成分.利用AutoDock软件对完带汤关键成分与核心靶点进行分子对接验证.从46 只SD大鼠中随机选取10 只作为空白组,其余大鼠沿输卵管-卵巢方向注入混合菌液0.1 mL从而建立SPID模型.将造模成功的大鼠随机分为模型组、头孢呋辛酯组、完带汤组,每组7 只,灌胃21 d,每日1次.HE染色观察输卵管病理形态学改变,ELISA检测血清转化生长因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)水平.结果:从GEO数据库获取GSE165004 数据集,筛选得到SPID的差异表达基因3 073 个.完带汤作用靶点446 个,完带汤治疗SPID的关键靶点58 个.通过PPI网络筛选得到10 个核心靶点,包括丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、糖原合成酶激酶-3β(glycogen synthase kinase-3 beta,GSK-3β)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶 9(caspase 9,CASP9)等.GO和KEGG分析结果主要涉及白细胞介素-4 和白细胞介素-13 信号、凋亡的内在途径、生物调节、代谢过程、细胞增殖等.分子对接显示,完带汤关键成分与核心靶点具有较好的结合活性.HE染色显示,空白组大鼠输卵管结构清晰正常;模型组大鼠输卵管结构欠清晰,黏膜上皮细胞减少,可见炎性细胞浸润;头孢呋辛酯组、完带汤组大鼠输卵管结构基本清晰,可见少量炎性细胞浸润.ELISA结果显示,与空白组比较,模型组大鼠血清TGF-β1 水平升高(P<0.01);与模型组比较,头孢呋辛酯组、完带汤组大鼠血清TGF-β1 水平降低(P<0.01).结论:完带汤可能通过薯蓣皂苷元、毛蕊异黄酮等活性成分作用于MAPK1、TGF-β1 等靶点,抑制炎症反应,从而发挥治疗SPID的作用.
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编辑人员丨1个月前
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黄精化学成分、药理作用研究进展及质量标志物(Q-Marker)预测分析
编辑人员丨2024/7/20
中药黄精为百合科、黄精属植物黄精Polygonatum sibiricum Red.、多花黄精Polygonatum cyrtonema Hua或滇黄精Polygonatum kingianum Coll.et Hemsl.的干燥根茎,用药历史悠久,性平、味甘,归脾、肺、肾经,具有养阴润肺、补脾益气、滋肾填精之功效,用于治疗肺虚燥咳、脾胃虚弱、体倦乏力、口干食少、精血不足、内热消渴等.本文对黄精的化学成分及现代药理研究进行综述,并基于其药理活性、药效物质、植物亲缘学、药材配伍、加工炮制和网络药理学等研究,预测分析了其质量标志物(quality markers,Q-marker).初步确定黄苓素、甘草素、β-谷甾醇、薯蓣皂苷元、5,4'-二羟基黄酮、3'-甲氧基大豆苷、新甘草苷和黄精多糖为黄精的质量标志物,为黄精质量控制和临床用药提供参考依据.
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编辑人员丨2024/7/20
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磺酸功能化离子液体催化制备薯蓣皂苷元研究
编辑人员丨2024/7/6
目的:探索磺酸功能化离子液体 1-磺丁基-3-甲基咪唑三氟甲烷磺酸盐([BHSO3MIm]CF3SO3)作为催化剂在薯蓣皂苷元制备中的应用.方法:以盾叶薯蓣提取粗皂苷为原料、[BHSO3MIm]CF3SO3 为催化剂,水解制备薯蓣皂苷元.通过单因素试验对反应温度、反应时间、离子液体用量、溶剂体积进行考察,采用响应面分析方法进一步优化反应条件,确定最佳反应条件.进行 12 次循环实验,考察该离子液体循环使用性能.结果:最佳反应条件为反应温度 100℃、反应时间 5.17 h、离子液体用量 2.56 g、水溶剂体积 6 mL,在该条件下薯蓣皂苷元产率为12.99%.该离子液体循环 6 次时,循环效率为 82.70%,循环 10 次时循环效率降至 58.12%.结论:在薯蓣皂苷元制备过程中,[BHSO3MIm]CF3SO3 作为酸催化剂,表现出了水解效率高、性能稳定、易于回收、循环使用性能良好等优势,具备较强的应用前景.
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编辑人员丨2024/7/6
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基于HPLC多成分定量结合化学模式识别分析不同产地蒺藜质量差异
编辑人员丨2024/6/15
目的 建立同时测定蒺藜中槲皮素、山柰酚、异鼠李素、白杨素、蒺藜皂苷、蒺藜皂苷K、蒺藜皂苷D、蒺藜呋甾皂苷B、蒺藜苷元、海柯皂苷元、薯蓣皂苷元和替告皂苷元含量的方法,探索主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)及灰色关联度分析(GRA)模型在蒺藜质量差异评价中的应用.方法 采用HPLC法,以乙腈-0.05%磷酸为流动相,梯度洗脱;检测波长为360、203 nm;通过对多指标成分含量结果进行PCA、OPLS-DA分析,同时建立GRA模型,综合分析不同产地蒺藜质量差异.结果 方法学验证结果均符合《中国药典》要求;12种成分在各自范围内线性关系良好(r>0.999),平均加样回收率(n=9)在96.92%~100.18%(RSD<2.0%).PCA、OPLS-DA分析显示蒺藜苷元、异鼠李素、山柰酚和槲皮素是影响蒺藜产品质量的主要潜在标志物.GRA相对关联度0.3397~0.597 1,蒺藜质量存在一定产地差异.结论 HPLC同时测定蒺藜中12个成分,简便可靠,PCA、OPLS-DA和GRA可用于不同产地蒺藜质量差异分析.
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编辑人员丨2024/6/15
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中药调控氧化应激治疗男性不育症实验研究进展
编辑人员丨2024/6/15
氧化应激(OS)是指机体遭受各种有害刺激时产生过多的活性氧自由基而无法及时清除,导致氧化系统和抗氧化系统平衡失调,引起组织或细胞功能紊乱和损伤的一种状态.OS与男性不育症(MI)关系密切,OS通过影响精子发生,损伤精子膜、脱氧核糖核酸(DNA)、线粒体,降低精子运动能力,加速细胞凋等途径使精子质量下降,导致MI.研究发现,单味中药的有效成分多糖类化合物(黄芪多糖、党参多糖、枸杞多糖、黄精多糖、山茱萸多糖、当归多糖、女贞子多糖、石斛多糖),黄酮类化合物(菟丝子总黄酮、槲皮素、紫云英苷、羊藿苷、金丝桃苷),皂苷类化合物(人参皂苷、蒺藜皂苷、薯蓣皂苷元),苯丙素类化合物(五味子甲素、姜黄素、白藜芦醇),环烯醚萜苷类化合物(桃叶珊瑚苷),氮苷类化合物(红景天苷),低聚糖类化合物(巴戟甲素),苯乙醇苷类化合物(肉苁蓉苯乙醇苷)多肽类化合物(牡蛎肽)具有抗氧化作用,可提升雄性动物MI模型的生殖功能.
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编辑人员丨2024/6/15
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天麻素与薯蓣皂苷元配伍对大鼠缺氧损伤脑微血管内皮细胞的保护作用
编辑人员丨2024/5/25
目的 探讨天麻素(Gas)、薯蓣皂苷元(Dio)及其组合物(GDC)对大鼠缺氧损伤脑微血管内皮细胞(BMECs)的保护作用和对脑微血管新生的影响及其作用机制.方法 将BMECs分为 5 组:正常对照组,模型对照组,Gas组(1、2、4、8、16、32 μmol·L-1),Dio组(0.25、0.5、1、2、4、8 μmol·L-1),GDC组(Gas和Dio浓度分别为 1 和 0.25、2和 0.5、4 和 1、8 和 2、16 和 4、32 和 8 μmol·L-1).分组给药12h后,对模型对照组、Gas组、Dio组和GDC组通过氧糖剥夺法建立BMECs缺氧模型.检测乳酸脱氢酶(LDH)漏出率、白细胞介素 1β(IL-1β)含量、超氧化物歧化酶(SOD)活力、丙二醛(MDA)浓度;观察Hoechst 33258、FITC-Annexin V/PI染色,采用Transwell小室实验、细胞划痕实验和小管形成实验,考察Gas、Dio及GDC对缺氧损伤BMECs的保护作用及促进血管新生作用.进一步利用网络药理学和分子对接方法研究GDC抗脑缺血的作用机制.结果 Gas、Dio以 2、0.5 μmol·L-1组合时,可显著提高缺氧损伤BMECs细胞活力(P<0.05),促进细胞增殖;与模型对照组比较,Gas组LDH漏出率降低(P<0.05);Gas组、Dio组与GDC组IL-1β含量均显著下降(均P<0.05),Gas 组、GDC 组 SOD 活力升高(P<0.05),Gas 组、Dio 组以及 GDC 组凋亡小体减少.GDC 可促进BMECs缺氧模型的增殖、侵袭、迁移以及小管形成,表明其在细胞水平上一定程度促进血管新生.网络药理学研究发现,Gas与半胱天冬酶 3(CASP3)、过氧化物酶体增生激活受体 γ(PPARG)、凝血因子Ⅱ(F2)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、丝氨酸苏氨酸蛋白激酶(Akt)1 蛋白具有良好的结合活性,Dio与内皮一氧化氮合成酶(NOS3)、KDR蛋白具有良好的结合活性,Gas、Dio可能主要通过血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、磷酯酰肌醇 3-激酶(PI3K)-Akt信号通路以及缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路调控脑缺血后血管新生.结论Gas、Dio及GDC具有抗缺氧损伤作用并可促进缺氧损伤后血管新生,作用机制可能与其作用于Akt1、NOS3、VEGFR2 等蛋白,调控VEGF/Akt/MAPK等信号通路促进血管新生有关.
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编辑人员丨2024/5/25
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基于网络药理学探讨益金方治疗肺癌的作用机制
编辑人员丨2024/5/11
目的:基于前期研究成果并结合网络药理学及分子对接技术,探讨益金方治疗肺癌的作用机制.方法:从多个开放数据平台获取益金方药物作用基因和肺癌相关基因.基于Cytoscape探索药物成分-靶点关系谱,探寻关键化合物.基于STRING平台完成蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络的建立,采用Cytoscape-CytoNCA拓扑分析筛选核心靶点.通过R-ClusterProfiler对靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析.最后,利用AutoDock对关键有效成分与肺癌通路相关核心靶点进行对接验证.结果:益金方的主要药物有效成分有 157 个,其包含潜在治疗靶点 235 个.通过 5 个数据平台共获得了 8 585 个肺癌相关靶点.药物潜在治疗靶点和数据平台的共享靶点为 215 个.从PPI核心网络中筛选核心靶点 18 个.GO功能富集分析结果显示,相关靶点在各种生物过程、细胞功能方面富集显著,靶点与肺癌信号通路关系密切.根据分子对接结果,紫杉叶素、槲皮素、柚皮素、木犀草素、甘草查尔酮A、山柰酚、异鼠李素、薯蓣皂苷元和刺槐素能够与肺癌通路相关的核心靶点紧密结合.结论:益金方的主要药物有效成分可能通过多个靶点和信号通路干预肺癌,这可能是该方产生治疗效果的机制之一.
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编辑人员丨2024/5/11
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薯蓣皂苷元滴丸制备工艺优化及其体内药动学研究
编辑人员丨2024/4/27
目的 优化薯蓣皂苷元滴丸制备工艺,并考察其体内药动学.方法 以成型率为评价指标,单因素试验考察基质种类、基质与药物比例、冷凝温度、滴距对成型率的影响,测定体外溶出速率和累积溶出度.HPLC法测定薯蓣皂苷元血药浓度,计算主要药动学参数.结果 最佳条件为基质PEG 4000,基质与药物比例 6 ∶ 1,冷凝温度 10℃,滴距 8 cm,成型率为95.68%,30 min内累积溶出度达95.68%.与原料药、物理混合物比较,滴丸tmax缩短(P<0.01),Cmax、AUC升高(P<0.01),相对生物利用度增加至 4.53 倍.结论 滴丸可提高薯蓣皂苷元溶出度和口服生物利用度.
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编辑人员丨2024/4/27
