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河南省抗病毒治疗失败的艾滋病患者耐药特征
编辑人员丨6天前
目的:对河南省艾滋病患者抗病毒治疗(ART)失败后的基因型耐药检测,分析ART失败的耐药特征。方法:研究对象为2018年1月至2021年5月河南省18个城市接受ART时间≥6个月且病毒载量≥1 000拷贝数/ml艾滋病患者,收集艾滋病患者血液样本、社会人口学特征和ART信息。采用In-house方法进行HIV-1基因型耐药检测,将基因序列提交到美国斯坦福HIV-1耐药数据库分析耐药突变位点和药物耐药情况。结果:在887例ART失败的艾滋病患者中,样本成功扩增率为91.54%(812/887),总耐药率为83.25%(676/812),其中核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)、蛋白酶抑制剂(PIs)和整合酶抑制剂(INSTIs)的耐药率分别为73.40%(596/812)、80.54%(654/812)、5.54%(45/812)和2.56%(17/663),4类药物的耐药率差异有统计学意义( χ2=1 686.34, P<0.001),对2类药物同时耐药率为66.38%(539/812),对3类药物同时耐药率为5.79%(47/812)。共检出9个HIV-1基因亚型,以B亚型为主(59.61%,484/812),其次是CRF01_AE亚型(22.17%,180/812)和CRF07_BC亚型(9.48%,77/812),不同基因亚型的耐药率差异有统计学意义( χ2=21.33, P=0.001)。NRTIs相关突变位点中,M184V/I突变率最高(63.42%,515/812),其次是K65R(27.46%,223/812);NNRTIs相关突变位点中,突变率位居前3位的是K103N/S(34.98%,284/812)、G190A/S(26.11%,212/812)和V106M/I(24.63%,200/812);PIs相关突变位点中,突变率位居前3位的是M46I(4.31%,35/812)、V82A/F(3.82%,31/812)和I54V/MV(3.69%,30/812);INSTIs相关突变位点中,E157Q/EQ突变率最高(3.47%,23/663),其次是R263K和G140A(均为0.75%,5/663)。在NRTIs中,拉米夫定和恩曲他滨以高度耐药为主(65.52%,532/812);在NNRTIs中,奈韦拉平(77.46%,629/812)和依非韦伦(71.18%,578/812)以高度耐药为主;在PIs中,洛匹那韦/利托那韦中/高度耐药占比仅为4.19%(34/812);在INSTIs中,艾维雷韦和拉替拉韦中、高度耐药分别占1.66%(11/663)和1.21%(8/663),未发现比克替拉韦和多替拉韦的高度耐药。 结论:河南省艾滋病患者ART失败的耐药率高,表现以NRTIs和NNRTIs耐药率高、耐药突变多样且复杂为特点。建议选择高耐药屏障药物,同时加强ART后病毒载量和耐药监测。
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编辑人员丨6天前
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重庆市2014年至2018年人类免疫缺陷病毒1型感染者的耐药突变分析
编辑人员丨6天前
目的:了解重庆市2014年至2018年接受高效抗反转录病毒治疗的人类免疫缺陷病毒1型(human immunodeficiency virus-1,HIV-1)感染者耐药突变情况。方法:收集2014年5月至2018年12月在重庆市公共卫生医疗救治中心进行高效抗反转录病毒治疗6个月以上的HIV-1感染者880例,采集其血浆标本,使用一步法反转录聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)和巢式PCR扩增HIV-1 pol基因区的蛋白酶及反转录酶区,获得的扩增序列与耐药数据库对比进行HIV-1基因型耐药分析。采用病毒基因分型工具软件分析HIV-1亚型分布。计数资料比较采用 χ2检验。 结果:880例患者中,血浆HIV-1病毒载量为(4.12±0.63) lg拷贝/mL;CD4 +T淋巴细胞计数为(251±124)/μL;抗病毒治疗中位时间为26个月。亚型分析中,重组型( circulating recombinant form, CRF)01-AE亚型在HIV-1亚型中占比最大,为38.9%(342/880),CRF07-BC亚型占28.5%(251/880),B+C亚型占16.2%(143/880)。其中534例患者存在耐药突变,总耐药率为60.7%。对核苷类反转录酶抑制剂(nucleoside reverse transcriptase inhibitor, NRTI)、非核苷类反转录酶抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor, NNRTI)和蛋白酶抑制剂(protease inhibitor, PI)的耐药率分别为51.0%(449/880)、58.6%(516/880)和1.7%(15/880)。对拉米夫定、恩曲他滨、依非韦仑和奈韦拉平的耐药较为严重,中高度耐药率分别为46.8%(412/880)、46.8%(412/880)、51.3%(451/880)和53.6%(472/880);而对齐多夫定(6.0%,53/880)、依曲韦林(9.0%,79/880)和PI类药物的耐药情况尚不严重。NRTI最常见的耐药突变位点为M184IV(47.3%)、K65R(22.2%)和K70RE(12.6%);NNRTI为K103NS (25.1%)、V106A(19.7%)和V179DE(14.4%);PI为L10FIV(7.4%)和A71IVT(6.5%)。CRF01-AE亚型的耐药率为69.3%(237/342)高于CRF07-BC亚型的49.8%(125/251)和B+C型的51.0%(73/143),差异均有统计学意义( χ2=22.6、14.6,均 P<0.05)。 结论:重庆市HIV-1感染者经高效抗反转录病毒治疗6个月后,耐药发生率高,以对NNRTI类药物耐药最为多见,其次为NRTI,PI较少耐药。耐药是HIV-1感染者病毒学突破的主要原因。
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编辑人员丨6天前
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江苏省艾滋病治疗后高/低病毒血症病人的基因型耐药特征分析
编辑人员丨6天前
目的:了解江苏省艾滋病抗病毒治疗高病毒血症(high-level viremia,HLV)与低病毒血症(low-level viremia,LLV)病人的基因型耐药特征。方法:收集2021年抗病毒治疗满6个月,血浆病毒载量≥50拷贝/毫升的样本,按50~999拷贝/毫升、≥1000拷贝/毫升分为LLV组和HLV组。In-house PCR方法扩增HIV-1 pol区蛋白酶和反转录酶区,并测序获取序列进行耐药突变分析和亚型鉴定。 结果:LLV组242人,耐药率为40.50%;HLV组598人,耐药率为51.34%。LLV组和HLV组亚型均以CRF01_AE和CRF07_BC为主,LLV组占比为38.84%和35.12%,HLV组占比为44.82%和22.75%,亚型构成有统计学差异。LLV组和HLV组蛋白酶耐药突变位点分别以M46(42.86%)和L33(28.57%)为主,核苷类反转录酶耐药突变位点均以M184(45.97%,31.92%)为主,非核苷类反转录酶耐药突变位点均以K103(26.14%%,23.56%)为主。两组耐药类别均以核苷类反转录酶抑制剂与非核苷类反转录酶抑制剂的复合型耐药为主,其次是非核苷类反转录酶抑制剂的单独耐药。结论:应增加对艾滋病抗病毒治疗低病毒血症病人的耐药检测,及时发现耐药并逆转抗病毒治疗失败,以遏制艾滋病毒传播。
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编辑人员丨6天前
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我国6个省19个城市男男性行为人群HIV-1 基因亚型及抗病毒治疗前耐药分析
编辑人员丨6天前
目的:分析我国6个省19个城市男男性行为人群(MSM)HIV-1基因亚型分布及抗病毒治疗前耐药情况。方法:2019年4-11月,在河北、山东、江苏、浙江、福建和广东6个省19个城市收集未接受抗病毒治疗MSM HIV-1感染者的血浆样本574份,提取RNA,反转录后经巢式PCR扩增HIV-1 pol 基因区片段。PCR 产物测序后进行序列分析,构建系统进化树判定病毒基因亚型,提交斯坦福耐药数据库分析耐药。 结果:有479份样本PCR扩增成功并获得核酸序列,检出的HIV-1基因亚型有9种,其中CRF01_AE(43.4%)和CRF07_BC(36.3%)所占比例较大,随后依次为B(6.3%)、CRF55_01B(5.9%)、CRF59_01B(0.8%)、CRF65_cpx(0.8%)、CRF103_01B(0.4%)、CRF67_01B(0.4%)和CRF68_01B(0.2%);另有26份(5.5%)样本的基因亚型为未知亚型。不同省份之间的基因亚型构成比差异有统计学意义( χ2=44.141, P<0.001)。总体抗病毒治疗前耐药率为4.6%(22/479),其中对非核苷类反转录酶抑制剂、核苷类反转录酶抑制剂和蛋白酶抑制剂的耐药率分别为3.5%(17/479)、0.8%(4/479)和0.2%(1/479)。新近感染者的抗病毒治疗前耐药率高于长期感染者,差异有统计学意义( χ2=4.634, P=0.031)。 结论:我国6个省19个城市MSM 的HIV-1感染者中HIV-1基因亚型多样化,不同省份之间的基因亚型构成比不同;整体抗病毒治疗前耐药率处于低水平,但新近感染者的耐药率较高,建议重点加强此类人群的耐药监测。
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编辑人员丨6天前
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2022—2023年西安市初始抗病毒治疗病例HIV-1基因耐药特征分析
编辑人员丨6天前
目的:分析2022—2023年西安市接受初始抗逆转录病毒治疗病例治疗前HIV-1基因耐药特征及亚型分布情况。方法:募集2022年5月至2023年3月西安市初始ART病例,采集静脉抗凝全血303份,提取病毒RNA,经反转录和巢式PCR扩增HIV-1 pol基因片段,进行Sanger测序。获得的 pol基因片段序列经COMET HIV-1判断亚型,并经Los Alamos国家实验室HIV BLAST和RIP工具验证亚型。用斯坦福大学HIV耐药数据库HIVdb Program工具对序列信息进行耐药解析。 结果:303例样本PCR扩增成功并获得 pol基因片段序列260例。共检测到10种亚型或流行重组型,以CRF07_BC为主(55.77%),其次为CRF01_AE(32.69%)、CRF55_01B(4.62%)和B亚型(2.69%)。20例存在治疗前耐药相关突变(DRMs)并对一线治疗药物存在低度到高度耐受,总体治疗前耐药率为7.69%。CRF01_AE毒株耐药占比最高(3.46%);其次是CRF07_BC(1.92%)和CRF55_01B(1.15%)。非核苷类逆转录酶抑制剂耐药发生率最高,以依非韦伦和奈韦拉平药物耐药发生最常见。 结论:西安市治疗前HIV-1基因型耐药发生水平较高(7.69%),应加强治疗前耐药监测检测,分析HIV-1耐药毒株传播来源,为临床用药和个体化治疗提供数据支持。
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编辑人员丨6天前
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台州市2016-2018年新报告HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药及亚型流行特征分析
编辑人员丨6天前
目的:了解台州市新报告HIV/AIDS抗病毒治疗(ART)前HIV-1耐药情况及亚型流行特点。方法:于2016年1月至2018年12月在台州市开展新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药的横断面调查,RT-PCR扩增获得HIV-1 pol基因片段并测序,提交序列至斯坦福大学耐药数据库,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,确定耐药突变位点以及HIV-1毒株对抗病毒药物的敏感性。 结果:2016-2018年台州市新报告HIV/AIDS中成功获得HIV-1 pol基因区序列的研究对象806例,ART前HIV-1耐药率为2.9%(23/806),其中,非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)和蛋白酶抑制剂(PIs)耐药率分别为1.9%(15/806)、0.6%(5/806)和0.0%。2016-2018年新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药率依次分别为1.6%、1.8%和4.8%。NNRTIs和NRTIs耐药突变位点以K103 N(0.7%)和M184I/V(0.5%)为主。HIV-1亚型以CRF01_AE(42.7%,344/806)、CRF07_BC(28.9%,233/806)和CRF08_BC(11.2%,90/806)为主。同性性传播者HIV-1亚型以CRF01_AE(53.3%,136/255)和CRF07_BC(32.2%,82/255)为主;异性性传播者HIV-1亚型以CRF01_AE(37.7%,203/539)、CRF07_BC(27.5%,148/539)和CRF08_BC(16.1%,87/539)为主。 结论:2016-2018年台州市新报告HIV/AIDS在ART前HIV-1耐药率处于低流行状态,但存在上升趋势,需加强对HIV-1耐药型毒株的监测工作。
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编辑人员丨6天前
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宁波市2022年新报告HIV-1感染者毒株基因型及耐药研究
编辑人员丨6天前
目的:了解宁波市2022年新报告HIV-1感染者毒株基因型特征和原发耐药情况。方法:收集2022年1—12月宁波市新报告HIV-1感染者ART治疗前血浆,提取RNA,反转录后巢氏PCR扩增HIV-1 pol基因片段,系统进化分析鉴定基因亚型,同时提交序列至斯坦福大学耐药数据库进行耐药分析。 结果:2022年宁波市新报告HIV-1感染者628例,成功获得426例序列,共检出15种基因亚型。CRF07_BC(42.0%,179/426)和CRF01_AE(30.5%,130/426)为两个优势基因亚型,随后依次为独特重组型(unique recombinant form,URF)(01_AE/07_BC) (7.0%,30/426)、CRF 08_BC(6.6%,28/426)、CRF 55_01B(4.9%,21/426)、CRF85_BC(2.3%,10/426)、B (2.1%,9/426)、C(1.9%,8/426)、URF(B/C) (0.7%,3/426)、URF (01_AE/C)(0.5%,2/426)、URF (01_AE/B)(0.5%,2/426)、CRF59_01B(0.2%,1/426)、CRF64_BC(0.2%,1/426)、CRF67_B(0.2%,1/426)和A1(0.2%,1/426)。治疗前耐药率为6.3%(27/426),其中非核苷类逆转录酶抑制剂、核苷类逆转录酶抑制剂和蛋白酶抑制剂耐药率分别为3.8%(16/426)、1.9%(8/426)和0.9%(4/426)。结论:2022年宁波市新报告HIV-1感染者毒株亚型复杂多样,有较高比例URF,治疗前处于中度耐药。
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编辑人员丨6天前
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艾滋病抗病毒治疗失败患者的耐药情况分析
编辑人员丨6天前
目的:了解艾滋病患者抗病毒治疗失败后的耐药状况。方法:纳入2017年10月至2018年12月于郑州市第六人民医院行抗病毒治疗失败的156例艾滋病患者。人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)-1耐药采用HIV-1 ViroSeq?基因型检测法,与斯坦福大学HIV耐药数据库(http:∥hivdb.stanford.edu/)比对检测结果。结果:156例抗病毒治疗失败的艾滋病患者中,有122例(78.21%)发生了耐药。106例(67.95%)对核苷类反转录酶抑制剂耐药,其中对拉米夫定、恩曲他滨、阿巴卡韦3种药物同时耐药的患者104例(66.67%); 118例(75.64%)对非核苷类反转录酶抑制剂耐药,对依非韦伦和奈韦拉平同时耐药118例(75.64%); 7例(4.49%)对蛋白酶抑制剂耐药。122例耐药患者中,核苷类反转录酶抑制剂耐药位点为16个,M184V/I位点突变次数最高,为87次(71.31%);非核苷类反转录酶抑制剂耐药位点13个,K103N/R位点突变49次(40.16%);蛋白酶抑制剂耐药位点11个,A71V/T位点突变49次(40.16%)。对拉米夫定、恩曲他滨中高度耐药者102例(83.61%),对依非韦伦、奈韦拉平中高度耐药者117例(95.90%),这些药物一旦发生耐药即呈现中度或高度耐药。对齐多夫定、替诺福韦、洛匹那韦/利托那韦中高度耐药者分别为29例(23.77%)、48例(39.34%)、5例(4.10%),这些药物耐药屏障相对较高。结论:抗病毒治疗失败的艾滋病患者的耐药发生率高,多重耐药现象严重,且耐药位点存在多样性。
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编辑人员丨6天前
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昆明市2018年男男性行为者HIV-1基因型及耐药特征分析
编辑人员丨6天前
目的:了解2018年昆明市MSM的HIV-1基因型及耐药特征。方法:收集昆明市2018年1-12月新报告HIV-1感染的MSM的血浆样品193份,提取病毒RNA,采用巢式PCR扩增 gag、 pol和 env区基因片段,进行基因分型和耐药分析,通过Bayesian Markov Chain Monte Carlo(MCMC)方法分析昆明市MSM感染者中CRF55_01B和CRF68_01B的进化特征。 结果:193份样品中发现多个HIV-1基因型,包括CRF07_BC(39.4%,76/193)、CRF01_AE(34.2%,66/193)、独特型重组(20.2%,39/193)、CRF08_BC(3.1%,6/193)、CRF55_01B(1.6%,3/193)、B亚型(1.0%,2/193)和CRF68_01B(0.5%,1/193)。Bayesian进化分析结果显示CRF55_01B从外省进入昆明市后已开始在本地传播,而CRF68_01B可能来自于我国东部地区。2018年昆明市MSM抗病毒治疗前的HIV-1耐药株流行率为2.6%(5/190),对非核苷类反转录酶抑制剂的耐药突变发生率最高(2.1%,4/190)。结论:昆明市MSM的HIV-1基因型多样性逐年增加。MSM未接受抗病毒治疗HIV-1感染者耐药发生率虽然较低,但存在抗病毒治疗一线药物的多重耐药株。
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编辑人员丨6天前
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2020—2023年安徽省新报告HIV/AIDS人群病毒基因亚型及耐药监测结果的分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨安徽省2020—2023年新报告人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者/艾滋病(AIDS)病毒基因亚型及耐药监测情况。方法:采用观察性设计研究,收集2020年1月至2023年12月安徽省疾病预防控制中心艾滋病防治科确诊为HIV/AIDS的病例血样。采用反转录-巢式PCR技术扩增HIV-1 pol基因,采用MEGA 7.0软件构建系统进化树分析确认基因亚型,耐药突变位点采用美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析。多因素logistic分析治疗前耐药的影响因素。 结果:共收集335份病例血浆样本,成功获得332条HIV-1 pol 区基因序列,基因亚型以CRF01-AE型为主,占35.55%(118/332),其次为CRF07-BC型、B型、B+C型,分别占29.22%(97/332)、11.74%(39/332)、9.93%(33/332)。治疗前总耐药率为30.12%(100/332),其中治疗前HIV-1中蛋白酶抑制剂(PIs)类药物耐药率为6.33%(21/332);治疗前核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)类药物耐药率为6.33%(21/332);治疗前非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)类药物耐药率为17.47%(58/332)。不同药物类型耐药率对比,差异有统计学意义( χ2=30.435, P<0.05)。100例耐药病例中,HIV-1蛋白酶抑制剂耐药突变点以Q58E为主[占21.00%(21/100)],核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变点以M184V/I为主[占6.00%(6/100)];非核苷类逆转录酶抑制剂耐药突变点以K103N为主[22.00%(22/100)]。不同抗病毒治疗起始时间、基线CD4 +T细胞数、基因亚型的耐药率对比,差异有统计学意义( χ2分别为24.152、32.516、11.652, P<0.05);多因素logistic分析结果显示,基线CD4 +T 细胞数<200个/μl、B亚型、B+C亚型、CRF01-AE亚型、CRF55-01B亚型及01-BC亚型是治疗前耐药的影响因素( χ2分别为4.577、8.202、4.416、5.206、7.603、4.804, P<0.05)。 结论:安徽省2020—2023年新报告HIV/AIDS人群病毒基因亚型多样,治疗前耐药基因突变主要以NNRTIs类为主,应重点关注基线CD4 +T 细胞数、抗病毒治疗时间、基因亚型分布情况,以降低HIV/AIDS患者治疗前耐药。
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编辑人员丨6天前
