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浙江金华发现暗褐彩蝠
编辑人员丨1周前
2023年5月在浙江省金华市永康市西溪镇寨口村附近林地中(120°17′02″E,28°58′09″N,海拔273 m)捕捉到2只雌性蝙蝠.它们体型较小,前臂长分别为30.66 mm和30.79 mm,无鼻叶,耳廓似漏斗,呈卵圆形,耳屏略呈披针形,较为细长.头骨颅全长分别是14.51 mm和14.67 mm,齿式:2.1.3.3/3.1.3.3=38,具有强壮的上颌犬齿.以上特征与暗褐彩蝠(Kerivoula furva)基本相符.基于线粒体COI基因部分序列的系统发育数据分析支持形态鉴定结果,故将这两个浙江样本鉴定为暗褐彩蝠,为浙江省翼手目分布新记录种.
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编辑人员丨1周前
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青海省自然疫源性病区小型兽类空间分布及分子鉴定研究
编辑人员丨1周前
目的:了解青海省自然疫源性病区小型兽类空间分布,并以线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(COI)基因作为分子标记,对捕获的小型兽类进行分子水平的物种鉴定。方法:2009 - 2016年,在青海省6个州的16个市(县),采集小型兽类标本为研究对象,分析小型兽类地区分布、不同海拔分布、生态环境类型分布;采用PCR扩增小型兽类的COI基因部分片段序列(长度约650 bp),并进行同源性比较、遗传距离和系统发育分析。结果:共捕获小型兽类1 631只,分别隶属于3目7科21属30种;其中啮齿动物926只,分别隶属于5科19属25种,占56.78%。格尔木市采集的小型兽类数量最多(313只),2 800 ~ < 3 000 m的海拔段为小型兽类分布最高峰(532只),沙地草原捕获数量最多(612只)。共成功扩增292只小型兽类COI基因,同源性比对与目标序列一致。种内遗传距离为0.01% ~ 2.90%,种间遗传距离为4.00% ~ 12.00%,种间遗传距离大于种内遗传距离;属间遗传距离为13.00% ~ 21.00%,科间遗传距离为22.00% ~ 25.00%。邻接法(NJ)系统发育树显示,同种个体聚为有很高支持度的单一分支共形成20个,置信度为98% ~ 100%。结论:青海省小型兽类空间分布受地区、海拔、生态环境等自然地理因素的综合影响,且分子鉴定法可弥补形态学鉴定中的不足。
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编辑人员丨1周前
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不同HBV基因型HIV/HBV合并感染者临床特征及抗病毒治疗效果比较
编辑人员丨1周前
目的:了解不同HBV基因型HIV/HBV合并感染者的临床特征及抗逆转录病毒治疗(antiretroviral therapy,ART)效果,探讨HBV基因型对HIV/HBV合并感染可能存在的影响。方法:以2009—2020年广州医科大学附属市八医院感染门诊HIV/HBV合并感染者为研究对象,比较B型和C型HBV感染者的临床特征及ART后病毒学、免疫学与临床应答。结果:患者纳入研究共722例,HBV分型:B型496例(68.70%)、C型220例(30.47%)、D型2例(0.28%)和I型4例(0.55%)。B型患者的基线HBV DNA载量和HBeAg阳性比例分别为6.29 lg IU/mL和36.49%(181/496),均低于C型患者;HBsAg定量水平为5 478.50 COI,高于C型患者( Z=-2.989, P=0.003; χ2=31.680, P<0.001; Z=-0.848, P<0.001)。两组患者使用包含替诺福韦和拉米夫定方案的比例均≥95%,平均ART治疗4.17年后,两组患者HIV和HBV病毒抑制率均>94%。B型患者在随访期间的HBsAg阴转率为7.25%(36/496),高于C型患者( χ2=5.291, P=0.021)。B型患者ART后HBsAg下降值为372.00 COI,高于C型患者( Z=-0.018, P=0.032)。 结论:广东省HIV/HBV合并感染者HBV基因型以B型和C型为主,接受ART后均可获得较好病毒抑制与免疫重建,但C型患者HBsAg转阴率低于B型,提示不同HBV基因型可能影响合并感染者的HBV治愈。
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编辑人员丨1周前
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职业性慢性苯中毒患者线粒体细胞色素c氧化酶亚单位I基因甲基化水平的研究
编辑人员丨1周前
目的:研究职业性慢性苯中毒患者线粒体细胞色素c氧化酶亚单位I(mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I,MT-COI)基因甲基化水平,探讨职业性慢性苯中毒患者有效的分子生物标志物。方法:于2020年3月,选择2018年1月至2019年12月在深圳市职业病防治院就诊的轻度苯中毒患者38人作为病例组,并选择46名同期进行健康体检者作为对照组。采用焦磷酸测序法检测甲基化位点,采用流式细胞法检测外周血细胞计数水平,采用非参数检验统计分析。结果:与对照组比较,病例组MT-COI位点平均甲基化水平[(2.26±0.75)%]、MT-COI位点1甲基化水平[(2.21±0.81)%]、MT-COI位点2甲基化水平[(2.31±0.96)%]较低,差异有统计学意义( P<0.05)。白细胞计数和血小板计数随MT-COI甲基化程度的增高有增高的趋势,呈明显正相关( r=0.254、0.280, P<0.05)。 结论:职业性慢性苯中毒患者MT-COI基因甲基化水平可能与职业性慢性苯中毒的存在相关性,其可作为潜在的职业性慢性苯中毒的效应生物标志物。
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编辑人员丨1周前
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基于种特异性COI引物(SS-COI)的桉树枝瘿姬小蜂A、B隐种快速鉴定技术
编辑人员丨1个月前
隐种A和隐种B是桉树枝瘿姬小蜂Leptocybe invasa两种重要的全球入侵隐种,对多国林业生产造成了严重危害.由于桉树枝瘿姬小蜂体型微小,且无法从形态上区分隐种类型,给该害虫的防治造成困难.本研究基于线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基1(mtDNA COI)基因序列的种特异性(species-specific COI,SS-COI)PCR方法,研究桉树枝瘿姬小蜂隐种快速分子检测技术.基于隐种A、B的COI序列分别设计特异性SS-COI引物各1对(AF/AR和BF/BR).使用这两对引物扩增同一桉树枝瘿姬小蜂样品DNA,即可有效进行隐种鉴定,同时两对引物也能互相验证鉴定结果.引物鉴定灵敏性检测结果显示,AF/AR与BF/BR均具有较高的鉴定灵敏性,其对DNA的有效鉴定浓度阈值分别为11.42 pg/μL和28.32 pg/μL.本研究开发的桉树枝瘿姬小蜂隐种A、B的快速鉴定方法解决了桉树枝瘿姬小蜂入侵地区隐种鉴别的难题,极大缩短鉴定时间、降低鉴定费用,为进一步探究桉树枝瘿姬小蜂隐种A、B的生物学差异以及它们对不同抗性品种桉树的适应能力提供技术参考.
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编辑人员丨1个月前
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龟甲配方颗粒的高分辨熔解曲线技术鉴别研究
编辑人员丨2024/7/13
目的 建立一种龟甲配方颗粒高分辨熔解曲线(HRM)技术鉴别方法.方法 根据乌龟Chinemys reevesii及其混伪品的细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidase subunitⅠ,COI)基因序列上的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点设计鉴别引物,扩增产物直接进行HRM分析,并优化反应体系,根据最佳条件进行适用性验证.结果 在模板DNA质量浓度为0.62~374.88 ng/μL、引物浓度为0.1~0.4 μmol/L、退火温度为62℃、循环数为45个的条件下,龟甲饮片和配方颗粒的熔解曲线为单峰,其Tm均值分别为(82.39±0.09)、(82.38±0.05)℃,而混伪品和醋龟甲配方颗粒未有扩增.结论 该研究建立的高分辨熔解曲线鉴别方法可快速鉴别龟甲原料和配方颗粒的真伪,以及区分其生品和炮制品配方颗粒,为龟甲配方颗粒的质量标准研究提供了理论依据.
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编辑人员丨2024/7/13
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绿带闭目天蛾和构月天蛾在海南岛及周边大陆的遗传分化
编辑人员丨2024/7/13
海南岛是与周边大陆存在地理隔离的大陆性岛屿,探索该岛屿与邻近大陆上生物的遗传分化有助于理解地理隔离对生物遗传分化的影响.在海南岛及其周边大陆 15 个地点采集两种鳞翅目天蛾科(Lepidoptera:Sphingidae)昆虫(绿带闭目天蛾Callambulyx rubricosa 88 头和构月天蛾Parum colligata 57 头),选择线粒体基因COI、Cytb和核基因 EF-1α作为分子标记开展遗传多样性研究.基于COI-Cytb分析的结果表明,两物种的核苷酸多样性均较低(分别为 0.00434 和 0.00818),且均在广东广西、越南和海南岛群体之间存在明显的谱系地理结构.两个物种在三个群体间均检测出低水平的基因流(Nm分别为0.09-1.22 和0.18-0.57)和高水平的遗传分化(FST分别为 0.29-0.84 和 0.47-0.73).两个物种最高的遗传分化都发生在海南岛与大陆群体之间,且海南岛群体的单倍型数量少于周边大陆群体.Mantel检验结果表明遗传距离与地理距离之间存在显著正相关关系,中性检验结果表明两个物种均未经历显著的种群扩张.综上,研究认为绿带闭目天蛾(C.rubricosa)和构月天蛾(P.colligata)的海南岛群体与邻近大陆群体间的基因交流较少,遗传分化程度较高,推测地理隔离可能是其产生遗传分化的重要原因之一,这一结果将为海南岛生物多样性的保护提供宝贵的建议.
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编辑人员丨2024/7/13
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基于mtDNA COI基因序列的山香圆平背粉虱遗传多样性分析
编辑人员丨2024/5/11
为探究茶树害虫山香圆平背粉虱(Crenidorsum turpiniae)的遗传多样性,掌握山香圆平背粉虱的遗传分化现状及精准防控提供理论依据,通过基因组DNA提取、PCR扩增与测序,测定贵州省 11 个不同地理区域的山香圆平背粉虱种群mtDNA COI基因序列片段,开展基因序列特征、单倍型及遗传多样性、遗传分化与基因交流、分子变异和单倍型系统发育分析.结果表明,山香圆平背粉虱mtDNA COI基因序列片段扩增长度均为 658 bp,序列具有明显的A+T偏倚性,共定义 10 个单倍型.贵州茶园山香圆平背粉虱总群体遗传多样性较高,表现出高单倍型多样性(Hd=0.800)和高核苷酸多样性(Pi=0.0670).11 个地理种群的山香圆平背粉虱总群体遗传分化程度高(Fst = 0.9203),基因交流水平低(Nm= 0.04).AMOVA 分析显示,山香圆平背粉虱的遗传变异主要来自组间(FCT= 0.9129);中性检验与错配分布分析综合表明,山香圆平背粉虱近期未发生过明显扩张现象;单倍型系统发育分析及中介网络图聚类结果均表明,山香圆平背粉虱聚为 3 分支,分化枝可能已达物种水平.
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编辑人员丨2024/5/11
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基于COI基因的赣北地区小泡巨鼠的鉴定
编辑人员丨2024/4/27
目的 以线粒体细胞色素C氧化酶亚基(COI)基因为目的基因,利用DNA条形码技术对未知鼠样本进行鉴定.方法 采用夹夜法对九江市武宁县宋溪镇某村的鼠密度进行调查,经形态学初步鉴定后,以捕获的 1 只无法明确鉴定的大型鼠样本为对象,提取基因组DNA并采用COI基因通用引物BatL5310 和R6036R进行PCR扩增及测序,将测序结果在NCBI网站进行BLAST比对,采用MEGA7 软件选择最大似然法构建系统发育树.结果 共捕获小型兽类7 只,密度为3.38%,经形态学鉴定有褐家鼠2 只,黑线姬鼠2 只,臭鼩鼱2只,形态学初步鉴定为青毛巨鼠或小泡巨鼠的未知鼠1 只,提取的未知鼠样本DNA通过PCR成功扩增出COI基因目的条带,与NCBI基因库中小泡巨鼠(KP995219)序列同源性高达 100%,系统发育树显示该鼠样本与小泡巨鼠(KP995219、KP995203)处于同一分支,遗传距离分别为 0、0.0016,而青毛巨鼠(NC_036730)单独处于另一分支,遗传距离较远.结论 赣北地区首次报道小泡巨鼠,采用COI基因的DNA条形码技术可快速、准确的进行鼠种鉴定,有助于弥补非常见鼠形态学鉴定困难的不足.
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编辑人员丨2024/4/27
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SOX9调控肝星状细胞活化与增殖促进肝纤维化进展
编辑人员丨2024/4/13
目的 探究SOX9基因对肝星状细胞活化与增殖的影响.方法 通过每周三次腹腔注射15%的四氯化碳或玉米油构建肝纤维化及对照小鼠模型.HE染色、Masson染色观察小鼠肝纤维化造模情况,qPCR检测小鼠肝脏SOX9、α-SMA、Col1基因表达.用TGFβ1细胞因子诱导LX2细胞活化,qPCR检测LX2细胞活化状态及敲减SOX9基因后SOX9、α-SMA、Coi1、CyclinD1、PCNA基因mRNA表达.结果 HE、Masson染色表明肝纤维化模型成功构建.qPCR结果表示肝纤维化标志基因α-SMA(造模组:2.568±0.726,对照组:1.000±0.272,t=4.518,P=0.002)与Col1表达明显上升(造模组:3.125±0.775,对照组:1.000±0.398,t=5.454,P=0.001).SOX9基因在纤维化的小鼠肝脏中也显著上升(造模组:1.986±0.634,对照组:1.000±0.288,t=3.126,P=0.014).在活化的LX2细胞中SOX9基因表达显著上调(活化组:1.718±0.395,对照组:1.000±0.155,t=3.783,P=0.005),敲减 SOX9 基因后胶原合成基因 α-SMA(敲减组:0.621 ±0.142,对照组:1.000±0.188,t=3.590,P=0.007)与 Col1(敲减组:0.558±0.170,对照组:1.000±0.130,t=4.608,P=0.002)以及增殖相关基因 CyclinD1(敲减组:0.614±0.106,对照组:1.000±0.166,t=4.392,P=0.002)和 PCNA(敲减组:0.525±0.138,对照组:1.000±0.234,t=3.897,P=0.005)表达明显下降,肝星状细胞活化与增殖被明显抑制.结论 SOX9基因在肝纤维化小鼠肝脏中表达明显上升,敲减SOX9基因可以明显减轻肝星状细胞的活化,可能成为治疗肝纤维化的靶点.
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编辑人员丨2024/4/13
