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蛋白重组技术在制备视黄醇结合蛋白质控品和候选参考物质中的方法研究
编辑人员丨4天前
目的:通过蛋白重组技术低成本、快速制备高浓度人视黄醇结合蛋白4(hRBP4)参考物质,解决临床hRBP4高值参考物质难以获取的需求。方法:在美国国立生物技术信息中心NCB查找hRBP4的互补DNA序列,经大肠埃希菌密码子优化后人工合成,然后将DNA片段克隆至原核表达质粒pET-28a(+)中,以构建重组hRBP4表达载体。将重组质粒转化至 E. coli BL21感受肽中,优化诱导表达条件(如温度、转速和异丙基硫代半乳糖苷IPTG浓度等)、诱导质粒表达并对重组蛋白进行His融合标签纯化,获取纯化后的hRBP4重组蛋白。 结果:DNAMAN软件对比显示编码hRBP4蛋白的碱基序列完全正确,成功构建重组hRBP4原核表达质粒;SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳结果显示亲和纯化产物中可清晰可见约相对分子质量26 000电泳条带;临床尿液和血清hRBP4常规检测系统均可检测到纯化的hRBP4蛋白,且稀释倍数与检测浓度间呈现良好线性关系。结论:成功构建重组hRBP4高水平表达系统,重组hRBP4蛋白纯度大、浓度高、生产周期短,有望在室间质量评价质控品和有证参考物质研制中发挥重要作用。
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编辑人员丨4天前
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基于TCGA数据库初步筛选预测胃癌生存期的基因
编辑人员丨4天前
目的:利用癌症基因组图谱(TCGA)中的大量胃癌基因组数据,在胃癌组织差异表达的基因中挖掘与预后相关的基因。方法:在TCGA数据库中下载胃腺癌相关基因芯片数据,经R语言数据预处理及用edgeR对基因表达数据进行差异表达分析,利用R语言对差异基因进行基因本体论(GO)富集及KEGG生物通路分析。多因素逐步回归Cox分析预测影响生存期的基因,利用Kaplan-Meier Plotter(http://Kaplan-Meier Plotter.com)网站对上述得到的基因进行在线生存分析。结果:TCGA数据库中共筛选胃癌标本305个,癌旁组织30个。得到3 231个胃癌差异基因,其中上调2 005个基因,下调1 226个基因。GO富集主要集中于抗原连接、丝氨酸水解酶活性、受体配体活性、丝氨酸型肽酶活性、丝氨酸型内肽酶活性、糖胺聚糖结合、细胞因子活性、激素活性、肽酶抑制剂活性、金属钛酶活性等分子功能。KEGG生物通路分析主要涉及化学致癌物、神经活性受体-配体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞色素P450对有害物质的代谢、蛋白质的消化与吸收、金黄色葡萄球菌感染、视黄醇代谢、药物代谢P450、类固醇激素生物代谢、胰液分泌等。Cox分析显示,基因GPX3和SERPINE1对胃癌患者生存期有显著影响。受试者工作特征曲线分析显示,GPX3和SERPINE1表达量的高低对胃癌患者生存期有一定的预测价值,二者临界值分别为0.46、0.68时,敏感性为60.35%,特异性为82.06%,曲线下面积为0.763(95% CI为0.828~0.936)。Kaplan-Meier分析发现,GPX3( P<0.001)和SERPINE1基因( P=0.001)高表达与胃腺癌不良预后有明显关系。 结论:SERPINE1、GPX3基因表达越高,胃癌患者生存期越短,二者可能作为胃癌预测预后的靶点。
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编辑人员丨4天前
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老年2型糖尿病患者血清视黄醇结合蛋白与代谢相关脂肪性肝病的关系研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨老年2型糖尿病(T2DM)患者血清视黄醇结合蛋白(RBP)与代谢相关脂肪性肝病(MAFLD)发病的关系及可能代谢机制。方法:回顾性分析2003年1月至2012年12月在上海交通大学附属第六人民医院内分泌代谢科住院且临床资料完整的老年T2DM患者3 384例。根据血清RBP水平四分位数分为4组:RBP<35 mg/L组844例、35 mg/L≤ RBP ≤41 mg/L组773例、42 mg/L≤ RBP ≤51 mg/L组902例和RBP>51 mg/L组865例。收集患者临床资料、实验室检查结果,比较4组患者MAFLD的患病率,采用二元Logistic回归分析RBP与MAFLD的关系。结果:校正年龄、性别后,从RBP<35 mg/L组至RBP>51 mg/L组,老年T2DM患者的肥胖比例( χ2=15.222)、降脂药用药比例( χ2=88.552)、收缩压( F=12.002)、舒张压( F=6.872)、腰围( F=9.563)、腰臀比( F=7.972)、体质指数( F=9.057)、血肌酐( χ2=185.445)、血尿酸( χ2=314.691)、24 h尿白蛋白( χ2=91.012)、谷丙转氨酶( χ2=17.049)、γ-谷氨酰转肽酶( χ2=50.514)、总胆固醇( F=45.669)、三酰甘油( χ2=361.269)、低密度脂蛋白胆固醇( F=8.772)、空腹C肽( χ2=165.756)、餐后2 h C肽( χ2=120.690)、胰岛抵抗指数(HOMA2-IR)( χ2=148.884)均呈上升趋势(均 P<0.01),MAFLD患病率也逐渐升高,分别为26.5%(224/844)、30.1%(233/773)、36.6%(330/902)和41.8%(362/865)( χ2=52.526, P<0.01)。伴MAFLD的老年T2DM患者HOMA2-IR高于不伴MAFLD患者[2.0(1.31~2.8)比1.39(0.86~2.06), F=220.826, P<0.01]。校正其他混杂因素后,二元Logistic回归分析结果显示,血清RBP与MAFLD发生相关( β=0.209, OR=1.232,95% CI:1.079~1.408, χ2=9.441, P<0.01)。 结论:血清RBP水平升高是老年T2DM患者MAFLD发生的独立危险因素,其机制可能与RBP增加胰岛素抵抗有关。
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编辑人员丨4天前
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血清中CysC、RBP、Hcy、CRP水平与糖尿病肾病分期相关性研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨血清中胱抑素C(CysC)、视黄醇结合蛋白(RBP)、同型半胱氨酸(Hcy)、C反应蛋白(CRP)水平与糖尿病肾病分期的相关性。方法:选取2016年7月至2018年8月阜阳市人民医院468例糖尿病肾病患者作为研究对象,使用简化的MDRD公式计算肾小球滤过率(GFR),根据K/DOQI慢性肾脏病临床实践指南将患者分为Ⅰ~Ⅴ期,利用西门子2400全自动生化仪测定患者血清中CysC、RBP、Hcy、CRP水平,利用Graphpad 5.0统计学软件进行数据处理并作回顾性分析比较。结果:对468例糖尿病肾病患者根据血肌酐估算肾小球滤过率并利用其进行肾损伤分期,其中I期233例,II期70例,III期95例,IV期37例,V期33例。随后分别对肾损伤分期与CysC、RBP、Hcy、CRP相关性进行分析,结果显示,糖尿病肾病患者肾损伤程度与四个指标均具有相关性。其中肾损伤程度与CysC相关系数为0.5264( P<0.001);其与RBP和Hcy的相关系数分别为0.3355和0.2877( P<0.001);而肾损伤程度与CRP相关系数为0.0122( P=0.0168)。 结论:联合检测患者血清中CysC、RBP、Hcy、CRP水平与糖尿病肾病分期均有一定的临床价值,而CysC更能贴切的反应糖尿病肾损伤程度。
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编辑人员丨4天前
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以血清视黄醇结合蛋白为血液透析患者住院事件独立危险因素的研究
编辑人员丨4天前
目的:筛选导致门诊血液透析患者住院事件的危险因素,评价血清视黄醇结合蛋白(RBP)水平与透析患者住院事件的关系。方法:病例对照研究。选取2017年12月1日起在复旦大学附属华山医院北院血透室进行门诊透析的患者80例,其中男47例(58.8%),年龄(60.9±11.7)岁,中位透析龄为43.6个月。收集透析相关数据,检测生化指标,ELISA法检测患者血清RBP水平,随访至2019年6月30日,记录患者19个月以来的各种住院事件。采用 t检验、Mann-Whitney U检验、卡方检验比较住院事件组与非事件组各项指标的差异,采用多变量Logistic回归的方法分析住院事件的相关危险因素,生存资料采用Kaplan-Meier法、Log-rank检验及Cox比例风险回归模型进行分析。 结果:在19个月的随访期内,80例患者共有26例(32.5%)发生了各种住院事件67次。发生住院事件的患者在年龄、性别组成、透析龄、糖尿病/高血压比例、透析间期体重平均增幅、透析前收缩压/舒张压、kt/v、URR等方面与未发生住院事件组的患者差异均无统计学意义( P>0.05)。B型钠尿肽、肌酸激酶同工酶(CK-MB)、肌钙蛋白(TnT)、C反应蛋白(CRP)、全段甲状旁腺素(iPTH)、白蛋白、β-微球蛋白、血红蛋白、红细胞计数、血清铁、铁蛋白、转铁蛋白饱和度、总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇等差异均无统计学意义( P>0.05),但发生住院事件的患者血清RBP水平高于对照组(189.16 mg/L>163.82 mg/L, P=0.028)。通过获得最高的Youden指数来计算血清RBP的截止点,按照165.34 mg/L水平将患者分为高RBP组( n=44)和低RBP组( n=36),高RBP组住院事件发生率明显增加(45.45%>16.67%, P=0.006)。应用多变量Logistic回归模型,在校正了性别、年龄、白蛋白和总胆固醇后,只有RBP水平与患者住院事件独立相关,RBP高水平组较低水平组发生住院事件的优势比( OR)为3.64(95 %CI,1.14~11.58; P=0.029)。发生住院事件的Kaplan-Meier生存分析结果提示,高RBP组的住院事件发生率明显高于低RBP组( P=0.005 8)。多变量Cox比例风险回归模型检验结果发现对于血液透析患者而言,升高的血清RBP水平是住院事件的独立危险因子。 结论:升高的血清RBP水平与血液透析患者住院事件相关,RBP是门诊血液透析患者发生住院事件的独立危险因素。
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编辑人员丨4天前
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基于SYNTAX评分评价RBP4、miR-1-3p、VDBP与STEMI病情严重程度的相关性及对其的诊断价值
编辑人员丨1周前
目的:基于SYNTAX评分分析人视黄醇结合蛋白4(RBP4)、miR-1-3p、重组人维生素D结合蛋白(VDBP)与ST段抬高型心肌梗死(STEMI)病情严重程度的相关性及对其的诊断价值.方法:选择2020年1月至2021年6月入住我院接受治疗的162例STEMI患者(STEMI组),另选取同期在我院接受体检的67例健康受试者作为健康对照组.根据SYNTAX评分,STEMI组被进一步分为低危组(68例,<22分)、中危组(53例,23分≤SYNTAX评分≤32分)和高危组(41例,>33分).比较上述各组RBP4、VDBP水平和miR-1-3p表达水平,分析上述指标单独及联合检测对STEMI患者病情严重程度的诊断价值,分析STEMI患者SYNTAX评分与上述指标的相关性.结果:与健康对照组比较,STEMI组RBP4[(47.18±5.24)μg/L比(81.40±6.11)μg/L]、VDBP[(2.36±0.75)μg/ml 比(3.55±1.04)μg/ml]水平显著升高,miR-1-3p 表达[(1.18±0.13)比(0.72±0.07)]显著降低(P均<0.001).与低危组比较,中危组和高危组的RBP4[(69.97±2.98)μg/L比(85.23±3.76)μg/L 比(95.41±3.16)μg/L]、VDBP[(3.19±0.50)μg/ml 比(3.55±0.52)μg/ml 比(4.16±0.64)μg/ml]水平显著升高,miR-1-3p 表达[(0.80±0.05)比(0.70±0.04)比(0.61±0.03)]显著降低,且高危组的RBP4和VDBP水平显著高于中危组,miR-1-3p表达显著低于中危组(P均<0.001).ROC曲线分析显示上述指标联合检测的曲线下面积(AUC)为0.892,显著高于各单独检测(Z=4.787、3.078、2.495,P<0.05或<0.01).Spearman相关分析显示,STEMI病情严重程度与RBP4、VDBP水平呈显著正相关(r=0.849、0.776,P 均<0.001),与 miR-1-3p 呈显著负相关(r=-0.790,P<0.001).结论:RBP4、VDBP 水平及miR-1-3p表达水平能够反映STEMI患者的病情严重程度,三项联合检测对病情严重程度具有较高的诊断效能,可作为临床重要的观察指标来评估患者病情.
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编辑人员丨1周前
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冠心病患者血清perilipin-5、RBP-4、FGF-23水平变化及其与冠状动脉狭窄程度的相关性
编辑人员丨1周前
[目的]探讨冠心病患者血清脂滴蛋白-5(perilipin-5)、视黄醇结合蛋白-4(RBP-4)、成纤维细胞生长因子-23(FGF-23)水平变化及其与冠状动脉狭窄程度的相关性.[方法]选取2020年5月至2023年1月两院收治的142例冠心病患者(观察组),另选取100例同期体检的健康志愿者作为对照组.比较两组血清perilipin-5、RBP-4、FGF-23水平,比较不同冠心病类型、病变支数、狭窄程度患者血清perilipin-5、RBP-4、FGF-23水平,分析血清peril-ipin-5、RBP-4、FGF-23与病变支数、狭窄程度的相关性及对狭窄程度的诊断价值.[结果]观察组血清RBP-4、FGF-23 水平高于对照组,血清perilipin-5水平低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).稳定性心绞痛患者血清perilipin-5水平高于不稳定型心绞痛、急性心肌梗死患者,血清RBP-4、FGF-23水平低于不稳定型心绞痛、急性心肌梗死患者,差异有统计学意义(P<0.05).轻度狭窄患者血清perilipin-5水平高于中度狭窄、重度狭窄患者,血清RBP-4、FGF-23水平低于中度狭窄、重度狭窄患者,差异有统计学意义(P<0.05).单支病变患者血清perilip-in-5 水平高于双支病变、多支病变患者,血清RBP-4、FGF-23水平低于双支病变、多支病变患者,差异有统计学意义(P<0.05).Spearman相关性分析,血清perilipin-5与病变支数、狭窄程度呈负相关,RBP-4、FGF-23与病变支数、狭窄程度呈正相关.受试者工作特征曲线分析显示,血清perilipin-5、RBP-4、FGF-23联合诊断冠心病狭窄程度的AUC为0.819,优于各单一指标诊断(P<0.05).[结论]血清perilipin-5、RBP-4、FGF-23水平变化与冠心病患者病情显著相关,三者联合诊断有助于实现疾病危险分层.
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编辑人员丨1周前
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基于TCGA数据库分析乳腺癌组织RBP7 mRNA表达与肿瘤免疫细胞浸润及预后的相关性
编辑人员丨2024/4/27
目的 通过生物信息学的方法探讨视黄醇结合蛋白 7(retinol binding protein 7,RBP7)在乳腺癌中的作用.方法 使用R语言基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库和人类蛋白质图谱(the human protein at-las,HPA)数据库探索基因RBP7在乳腺癌组织中的差异表达.通过Kaplan-Meier生存分析和受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线,评估RBP7 与乳腺癌临床数据的关系.基于TCGA数据库分析RBP7 高低表达分组与不同肿瘤浸润免疫细胞(tumor-infiltrating immune cells,TIICs)的相关性.基因组富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)评估RBP7 在与表型相关度排序的基因表中的分布趋势.结果 与癌旁组织相比,乳腺癌中RBP7 mRNA表达水平下调,该分子表达在细胞核中.ROC曲线分析显示RBP7诊断乳腺癌的曲线下面积(area under curve,AUC)是 0.943(95%CI:0.926~0.960),RBP7 的最佳截断值是 6.29,敏感度和特异度分别为 82.32%,93.69%.Kaplan-Meier生存分析显示RBP7低表达与乳腺癌患者的总生存率相关(HR=0.68,95%CI:0.49~0.93,P=0.017),RBP7是乳腺癌发生的独立危险因素.Spearman相关性揭示RBP7与乳腺癌中pDC细胞和NK细胞呈正相关(r=0.290,0.253,均P<0.05),与Th2 细胞呈负相关(r=-0.217,P<0.05).GSEA表明RBP7 富集在脂肪生成、核糖体、肽配体结合受体、钙信号途径等通路中(均P<0.001).结论 RBP7 影响乳腺癌的发生发展,可能成为乳腺癌潜在生物标志物和治疗靶点.
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编辑人员丨2024/4/27
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血清基质交感分子1、视黄醇结合蛋白4水平对高血压肾病患者的诊断价值研究
编辑人员丨2024/3/23
目的 探讨基质交感分子 1(matrix sympathetic molecule 1,STIM1)、视黄醇结合蛋白4(retinol binding protein 4,RBP4)在高血压肾病患者血清中的表达水平,分析其诊断价值.方法 选取2020年 3月至 2021年 3月三二O一医院收治的高血压肾病患者 88例为高血压肾病组,单纯高血压患者 88例为高血压组,另外选取同期体检健康者 88名为健康组.采用酶联免疫法检测血清STIM1和RBP4水平;Pearson法分析血清STIM1和RBP4水平的相关性及其与血压、肾功能指标的相关性;Logistic回归分析高血压肾病的影响因素;受试者工作特征曲线分析血清STIM1、RBP4水平对高血压肾病的诊断价值.结果 高血压肾病组尿素氮[(8.26±3.37)mmol/L比(5.46±2.31)mmol/L、(5.63±2.54)mmol/L]、尿酸[(375.53±71.41)μmol/L比(342.80±59.75)μmol/L、(352.68±65.24)μmol/L]、血肌酐[(105.34±34.19)μmol/L比(68.31±20.19)μmol/L、(71.63±22.55)μmol/L]显著高于健康组和高血压组(P<0.05),估算肾小球滤过率(estimated glomerular filtration rate,eGFR)显著低于健康组和高血压组(P<0.05);健康组、高血压组、高血压肾病组血清STIM1[(30.61±6.25)μg/L、(36.63±8.27)μg/L、(48.10±11.06)μg/L]、RBP4[(42.26±5.23)ng/mL、(51.98±8.70)ng/mL、(66.61±13.79)ng/mL]水平显著依次增高,两两比较差异有统计学意义(P<0.05);高血压肾病组血清中STIM1、RBP4的水平呈正相关;高血压肾病组血清STIM1、RBP4水平与尿素氮、尿酸、血肌酐呈正相关,与eGFR呈负相关(P均<0.05);Logistic多因素回归分析得知STIM1高表达、RBP4高表达、血肌酐、eGFR是影响高血压患者发生高血压肾病的独立危险因素(P<0.05);血清STIM1、RBP4诊断高血压患者发生高血压肾病的曲线下面积为 0.798、0.744,二者联合诊断高血压肾病的曲线下面积为0.852,灵敏度为 75.29%,特异度为 88.21%,二者联合优于血清STIM1、RBP4各自单独诊断(Z联合vsSTIM1 = 2.219、Z联合vsRBP4 = 3.385,P均<0.05).结论 血清STIM1、RBP4水平在高血压肾病患者中呈现高表达,二者联合对于高血压肾病具有一定诊断价值.
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编辑人员丨2024/3/23
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血清Omentin-1、Bax和RBP4在非创伤性股骨头坏死病情评估及诊断中的价值
编辑人员丨2024/3/2
目的 探讨血清网膜素(Omentin-1)、Bcl2-相关X蛋白(Bax)、视黄醇结合蛋白4(RBP4)在非创伤性股骨头坏死(NTONFH)病情评估及诊断中的价值.方法 采用回顾性研究方法,选取2020年2月至2022年12月徐州医科大学附属医院经影像学检查确诊为NTONFH的患者100例作为病例组,另外选取100名健康体检志愿者作为对照组.检测对比两组患者血清O mentin-1、Bax和RBP4水平.并按照是否存在股骨头塌陷、国际骨循环研究会(ARCO)分期标准、患侧分布进行分层分析NTONFH患者血清Omentin-1、Bax和RBP4水平,确定其与患者病情的关系.通过受试者工作特征(ROC)曲线分析Omentin-1、Bax和RBP4诊断NTONFH的价值.结果 病例组患者的血清Bax水平显著高于对照组,血清Omentin-1、RBP4水平均显著低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05).股骨头塌陷患者的血清Bax水平显著高于非股骨头塌陷患者,Omentin-1、RBP4水平均显著低于非股骨头塌陷患者,差异均有统计学意义(P<0.05).ARCO Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期患者的血清Bax水平逐渐升高,ARCO Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期患者的血清O mentin-1、RBP4水平逐渐降低,组间两两比较,差异均有统计学意义(P<0.05).双侧股骨头坏死患者血清Bax水平显著高于单侧患者,血清Omentin-1、RBP4水平均显著低于单侧患者,差异均有统计学意义(P<0.05).Omentin-1诊断股骨头坏死的敏感度为84.66%,特异度为77.20%,曲线下面积(AUC)值为0.872;Bax诊断股骨头坏死的敏感度为90.17%,特异度为83.75%,AUC值为0.780;RBP4诊断股骨头坏死的敏感度为70.57%,特异度为74.95%,AUC值为0.917.结论 NTONFH患者Bax水平显著升高,Omentin-1、RBP4水平均显著降低,并且与患者股骨头塌陷与否、患侧分布、ARCO分期有关,在患者病情评估中具有重要参考价值.另外,Omentin-1、Bax、RBP4对NTONFH均有较好的诊断价值.
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编辑人员丨2024/3/2
