葡萄糖磷酸异构酶(GPI)缺乏症是一种罕见的常染色体隐性遗传病， GPI突变造成的酶结构异常及活性缺乏是其主要的致病原因。该病的临床表现包括新生儿高胆红素血症、先天性非球形红细胞溶血性贫血等，在感染等诱因下可发生急性溶血危象，部分病例伴有神经系统症状。GPI缺乏症的实验室检查方法主要包括GPI活性测定和 GPI基因检测。笔者拟就GPI缺乏症的发病机制、临床特征、实验室检查、治疗及预后的研究现状进行总结，旨在为该病的临床诊疗提供参考。

目的:基于生物信息学方法筛选胶质瘤中协同调控免疫和线粒体能量代谢的关键基因，探讨这些基因与免疫浸润的关系。方法:从癌症基因组图谱（TCGA）数据库中收集671例胶质瘤样本（肿瘤组）和5例非肿瘤脑组织样本（对照组），数据下载时间为2023年11月13日。检索GeneCards数据库和已发表文献中免疫相关基因（IRG）和线粒体能量代谢相关基因（MEMRG），经合并去重复后，对IRG和MEMRG取交集共得到76个免疫和线粒体能量代谢共相关基因（IR&MEMRG）。使用R软件limma包，筛选肿瘤组和对照组中的差异表达基因（DEG），与IR&MEMRG取交集得到胶质瘤中免疫和线粒体能量代谢共相关差异表达基因（IR&MEMRDEG）。采用R软件中clusterProfiler包对IR&MEMRDEG进行基因本体（GO）及京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。使用STRINGv12.0在线数据库（https：//cn.string-db.org/），利用获得的IR&MEMRDEG构建蛋白质互作网络，获得排名前5位的关键核心基因。采用单样本基因集富集分析（ssGSEA）分析所有样本中各免疫细胞浸润的相对丰度，得出样本中免疫细胞浸润矩阵。利用R软件中ggplot2包分析免疫细胞浸润丰度在肿瘤组和对照组间的差异；R软件pheatmap包绘制相关性热图展示免疫细胞自身的相关性，基于Spearman算法并利用R软件ggplot2包计算蛋白质互作网络内排名前5位的关键核心基因与免疫细胞的相关性。结果:TCGA数据库中，肿瘤组和对照组有3 623个DEG；其中上调表达基因1 711个，下调表达基因1 912个。对DEG与获得的IR&MEMRG取交集，得到11个IR&MEMRDEG，分别为EIF4EBP1、TP53、IDH1、PRCKZ、CD200、GPI、PGM2、PKLR、AK2、ATP4A和ALDH3B1。GO富集分析结果显示，11个IR&MEMRDEG在生物过程层面主要富集在ATP代谢和ADP代谢、嘌呤核苷二磷酸代谢、嘌呤核糖核苷二磷酸代谢和核糖核苷二磷酸代谢；细胞成分层面主要富集在纤维胶凝蛋白-1富集颗粒、分泌颗粒腔、细胞质囊泡腔、囊泡腔和核基质中；分子功能层面主要富集于镁离子结合、钾离子结合和碱金属离子结合。KEGG富集分析结果显示，11个IR&MEMRDEG主要富集在糖酵解/糖异生、碳代谢、胰岛素信号通路、磷酸戊糖通路、淀粉和蔗糖代谢信号通路中。采用STRING在线数据库对11个IR&MEMRDEG进行分析，得到前5个得分最高的节点蛋白，分别为EIF4EBP1、TP53、IDH1、PRKCZ和AK2。通过ssGSEA算法计算28种免疫细胞的免疫浸润丰度，肿瘤组15种免疫细胞浸润丰度均高于对照组，差异均有统计学意义（均 P<0.05）。15种免疫细胞间均呈正相关，其中效应记忆性CD8 + T细胞与髓源性抑制细胞的相关性最强；EIF4EBP1、TP53、IDH1和AK2与较多免疫细胞之间均呈正相关（均 P<0.05）；PRKCZ与较多免疫细胞均呈负相关（均 P<0.05）。 结论:胶质瘤中PRKCZ、AK2和EIF4EBP1可能是胶质瘤免疫治疗新靶点。

葡萄糖磷酸异构酶（glucose phosphate isomerase，GPI）缺乏症是一种常染色体隐性遗传病，可引起遗传性非球形红细胞性溶血性贫血，严重可致胎儿宫内死亡。本文报道1例以皮肤黄染起病的新生儿GPI缺乏症，基因检测发现两个新发位点，予及时干预后，随访至16个月，智力运动发育正常。

目的:初步探究鲍曼不动杆菌对不动杆菌属细菌的生长抑制现象。方法:2020年12月10日自河南省省立医院神经内科1例危重患者的肺泡灌洗液标本中分离到1株可抑制其他鲍曼不动杆菌生长的鲍曼不动杆菌分离株，命名为SL- A.baumannii。为进一步探究该抑制现象，收集40株不动杆菌分离株，比较抑制作用的发生率、分离株的同源性关系、药敏特征、蛋白质聚类分析等。 结果:对SL- A.baumannii进行多位点序列分型（MLST），等位基因gltA、gyrB、gdhB、recA、cpn60、gpi和rpoD编号为33、12、40、26、48、54和5，将其原始数据上传到PubMLST数据库后，获得了新的型别号ST-2442。该新型别鲍曼不动杆菌分离株SL- A.baumannii对36株不动杆菌（其中鲍曼不动杆菌30株、皮特不动杆菌3株、洛菲不动杆菌2株、沃森不动杆菌1株）的生长有明显的抑制作用，抑制率达90%（36/40）；受其抑制的这36株分离株中全敏感型18株（50%）、多重耐药菌16株（44.44%，含全耐药菌2株、泛耐药菌11株）、其他耐药型2株（5.56%）。 结论:SL- A.baumannii（PubMLST/鲍曼不动杆菌分离株数据库/编号：6942）这一新型别（ST-2442）的鲍曼不动杆菌野生分离株对不同耐药表型的不动杆菌属细菌生长有显著的抑制作用。

目的 建立一种基于缺氧基因模型来评估皮肤黑色素瘤(skin cutaneous melanoma,SKCM)预后和免疫微环境.方法 自 2023 年 3-7 月,河西学院附属张掖人民医院公卫科通过检索公共数据库(TCGA、GEO、GTEx)查找SKCM病例,Cox回归分析筛选缺氧相关性状的基因.构建了一个包含 7 个缺氧基因的风险模型.GSEA用于比较两组的富集差异,使用CIBERSORT工具研究免疫细胞和基因特征之间潜在的相关性.结果 发现SKCM缺氧模型含有的 7 个基因(FBP1、GPI、BGN、SERPINE1、SDC4、PGM1、EGFR)高风险组患者的存活率低于低风险组.此外,9 种免疫细胞在高、低风险组患者的组织中有明显的浸润差异.结论 缺氧与SKCM患者的预后和免疫细胞浸润的发生率相关,这为个性化治疗的发展提供了免疫学视角.

目的:采用mRNA高通量测序技术筛选高磷诱导下肢血管平滑肌细胞(VSMCs)钙化差异表达基因(DEGs),分析VSMCs钙化的关键基因及信号通路.方法:将人VSMCs分为对照组和模型组,模型组细胞中加入高磷培养基,对照组细胞采用含10%胎牛血清的DMEM培养基于相同条件下培养.调整 2组稳定转染VSMCs的状态,培养 12 d,倒置显微镜下观察细胞形态表现并拍照.采用Hisat2软件筛选DEGs,采用Stringtie软件从生物过程(BP)、分子功能(MF)和细胞成分(CC)3个方面进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析.Von Kossa染色法观察各组细胞钙化情况,实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测2组细胞中碱性磷酸酶(ALP)、骨形态发生蛋白2(BMP2)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、肿瘤蛋白53(Tp53)、谷胱甘肽过氧化物酶 4(GPX4)、铁蛋白轻链 1(Ftl1)和糖基磷脂酰肌醇特异性磷脂酶D1(GPLD1)mRNA表达水平.结果:与对照组比较,模型组共2 524个DEGs,其中1 368个DEGs表达上调,1 156个DEGs表达下调;2组细胞DEGs聚类分离明显.GO功能和KEGG信号通路富集分析表达上调的DEGs主要参与微管细胞骨架组织的调节、细胞极性、蛋白质定位和细胞周期调控等BP,构建细胞膜部分、微管组织、染色体和着丝粒区等CC,发挥与磷脂酰肌醇磷酸盐、Rho鸟苷酸三磷酸酶(GTPase)蛋白结合、参与跨膜转运和调节蛋白激酶活性等MF;表达下调的DEGs主要参与细胞质翻译、蛋白质膜定位、mRNA代谢和蛋白质内质网定位等BP,构建核糖体亚单位、细胞膜和自噬体等CC,发挥与单链DNA、核糖核蛋白复合物、生长因子结合、调节蛋白激酶活性和催化作用等MF.差异表达上调的基因富集7条信号通路,其中最为显著的是糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定的生物合成;差异表达下调的基因富集 18条信号通路,其中最为显著的是铁死亡.RT-qPCR法,与对照组比较,模型组细胞中GPX4、Ftl1和Tp53 mRNA表达水平明显降低(P<0.01),GPLD1 mRNA表达水平明显升高(P<0.01);与对照组比较,模型组细胞中α-SMA mRNA表达水平明显降低(P<0.01),ALP和BMP2 mRNA表达水平明显升高(P<0.01).结论:钙化的VSMCs与正常细胞存在DEGs,铁死亡和GPI锚定的生物合成信号途径是高磷诱导下肢VSMCs钙化的关键信号通路,主要由GPX4、Ftl1、Tp53和GPLD1共同介导完成.

丝状真菌表面展示技术是将表达的目的蛋白固定在丝状真菌细胞表面的一项新兴基因工程技术.丝状真菌具有极强的蛋白质分泌能力和良好的蛋白质翻译后加工能力,因而越来越多的丝状真菌表面展示技术得到开发和应用.本文就丝状真菌表面展示系统的研发和应用进展进行综述,并介绍与该系统构建密切相关的丝状真菌的细胞壁组成、锚定蛋白和遗传转化方法等技术.

[背景]慢性过量氟暴露会导致中枢神经系统出现损伤,造成一定程度的学习记忆功能损害,然而其损伤机制尚不明确,仍需进一步探究.[目的]应用 4D非标记定量蛋白质组学技术探究慢性过量氟暴露致大脑损伤的差异表达蛋白及其潜在的作用机制.[方法]选取SPF级成年SD大鼠 24只,雌雄各半,采用随机数字表法分为对照组与染氟组,每组 12只.其中,对照组饮用自来水(氟含量<1 mg·L-1),染氟组饮用氟化钠溶液(氟含量10 mg·L-1),两组均饲以普通鼠饲料(氟含量<0.6 mg·kg-1).饲养 180 d后称SD大鼠的体重,随后取部分脑组织分别行苏木素-伊红(HE)染色和尼氏体染色的病理学检查,其余脑组织速冻后于-80℃保存.每组脑组织样本随机挑选 3份进行蛋白质组学检测,筛选出差异表达蛋白并进行亚细胞定位分析,随后进行基因本体(GO)功能分析、京都基因和基因百科全书(KEGG)通路分析、聚类分析及蛋白相互作用网络分析获得关键蛋白.最后选用脑组织样本提取蛋白行蛋白免疫印迹实验检测关键蛋白的表达水平.[结果]饲养 180 d后,染氟组SPF级成年SD大鼠的体重较对照组明显降低(P<0.05).HE染色结果显示染氟组大鼠脑皮质未见明显形态变化,海马区见神经元丢失、神经元排列层次不整齐、部分神经元嗜酸性变和胞体固缩.尼氏染色结果显示染氟组大鼠脑皮质及海马区神经元染色变浅(尼氏体减少).蛋白质组学检测共鉴定出 6927个蛋白,经过筛选在对照组与染氟组中获得差异表达蛋白 206个,包括 96个表达上调蛋白和 110个表达下调蛋白,差异蛋白主要定位于细胞质(30.6%)、细胞核(27.2%)、线粒体(13.6%)、质膜(13.6%)和胞外(11.7%).GO分析结果显示差异表达蛋白主要参与铁离子运输、多巴胺神经元分化的调控和炎症反应中呼吸爆发的负调控等生物过程,行使亚铁结合、铁氧化酶活性、细胞因子活性等分子功能,位于滑面内质网膜、膜的固定成分、氯化物通道复合体等细胞组分.KEGG显著富集通路为次级代谢产物的生物合成、碳代谢和多样环境中的微生物代谢等.差异蛋白相互作用网络分析结果显示葡萄糖-6-磷酸异构酶(Gpi)连接度最高.经蛋白免疫印迹实验检测,Gpi在染氟组成年SD大鼠脑组织中表达水平较对照组降低(P<0.05).[结论]慢性氟中毒大鼠脑组织中存在多种差异表达蛋白,其功能与次级代谢产物的生物合成、碳代谢和多样环境中的微生物代谢有关;Gpi可能参与慢性过量氟暴露致脑神经损伤.

阵发性睡眠性血红蛋白尿(PNH)是一种获得性造血干细胞克隆性疾病,因造血干细胞Xp22.2上发生磷脂酰肌醇聚糖-a(PIGA)基因突变,导致糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定蛋白表达受损,增加细胞膜(红细胞、粒细胞、血小板、淋巴细胞)对补体介导破坏的敏感性,引起血管内溶血性贫血、血栓形成、感染及骨髓衰竭[1-2].

目的 探究乳腺癌术后切口感染病原学特点及哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTORC1)和缺氧诱导因子1α(HIF1α)通路相关因子的诊断价值.方法 收集2018年1月-2020年12月四川省肿瘤医院收治的乳腺癌合并术后切口感染患者80例为感染组、未并发感染患者45例为非感染组,80名体检健康女性为对照组.分析感染组切口感染病原学特点,采用PCR法检测外周血mTORC1/HIF1α通路相对表达量,受试者工作特征(ROC)曲线评估mTORC1/HIF1α相关因子对切口感染的诊断价值.结果 80例乳腺癌术后切口感染患者共分离出127株病原菌,其中革兰阴性菌78株占61.42％,革兰阳性菌46株占36.22％,真菌3株占2.36％;与对照组比较,感染组和非感染组患者mTORC1、HIF1α、葡萄糖转运蛋白1(Glut1)、M2-型丙酮酸激酶(PKM2)、糖基磷脂酰肌醇(GPI)和肌钙蛋白(TPI)相对表达量上调,且感染组患者上述各指标表达高于非感染组(P＜0.05);ROC曲线结果显示,mTORC1、HIF1α、Glut1、PKM2、GPI和TPI诊断术后切口感染的曲线下面积(AUC)均＞0.7,具有较好的预测价值.结论 乳腺癌术后切口感染患者mTORC1/HIF1α通路的表达水平显著升高,且各指标对术后感染具有诊断价值.