目的:了解2008年至2017年河南省睢县5岁以下腹泻患儿粪便标本中志贺菌的血清型分布和耐药情况。方法:采集2008年至2017年河南省睢县豆付元卫生室的4 721份5岁以下腹泻患儿粪便标本，细菌培养分离出志贺菌株。采用玻片凝集试验进行血清学分型。按比例选取271株志贺菌株，采用多重梯度聚合酶链反应检测毒力基因，Kirby-Bauer琼脂法进行药物敏感试验。采用趋势性卡方检验分析耐药性年度变化趋势。结果:4 721份粪便标本中志贺菌检出率为20.69%(977/4 721)。977株志贺菌共分为2群13种血清型，福氏志贺菌占77.79%(760/977)，宋内志贺菌占22.21%(217/977)，每年最常见的3种血清型呈交替变化。271株志贺菌中，福氏志贺菌优势基因携带模式为志贺菌肠毒素( Shigella enterotoxin, shET) -1＋、 shET-2＋、侵袭性质粒H抗原(invasion plasmid antigen H， ipaH)＋、侵袭相关毒力基因(invasion-associated locus, ial)＋，占84.04%(179/213)；宋内志贺菌为 shET-1－、 shET-2＋、 ipaH＋、 ial＋，占46.55%(27/58)。志贺菌对氨苄西林、萘啶酸、四环素的耐药率均>90%，对头孢吡肟和头孢他啶较敏感；对头孢噻肟、头孢吡肟、环丙沙星、氯霉素和复方磺胺甲 唑的耐药率逐年上升，差异有统计学意义( χ2＝24.027、7.232、6.039、4.764、6.809，均 P<0.05)。98.52%(267/271)的菌株对3种以上抗菌药物耐药，福氏志贺菌对环丙沙星、诺氟沙星、氯霉素的耐药率均高于宋内志贺菌；对庆大霉素和复方磺胺甲 唑的耐药率均低于宋内志贺菌，差异均有统计学意义( χ2＝31.866、14.868、83.036、68.534、14.738，均 P<0.01)。 结论:2008年至2017年睢县5岁以下腹泻患儿志贺菌每年主要流行的血清型不断发生变化，不同血清分型的优势基因携带模式不同。大多数分离菌株产生了多重耐药，且不同血清型的志贺菌耐药谱不同。

目的:分析北京批发市场肉类食品中沙门菌的表型和基因组特征。方法:对分离自北京市批发市场的336株肉类食品来源沙门菌，采用微量肉汤稀释法对25种抗菌药物进行耐药性测试，开展全基因组测序并使用SeqSero2、SISTR软件分析血清型和ST型，使用Abricate软件的CARD、VFDB模块预测菌株的耐药基因和毒力因子，使用沙门菌分子血清分型试剂盒和血清凝集法验证部分疑难菌株血清型。结果:336株沙门菌菌株对萘啶酸、氨苄西林的耐药率分别为62.5%（210/336）和55.1%（185/336），对替加环素、头孢西丁和碳青霉烯类抗菌药物均敏感；207株（61.6%，207/336）为多重耐药株，最高可同时耐受10类药物，最常见耐药谱为NAL-AMP-SAM。共检出24种血清型，主要型别为肠炎（34.5%，116/336）、德尔卑（17.3%，58/336）和印第安纳（10.4%，35/336）；共检出27种ST型，主要型别为ST11，ST型与血清型较为相符。氨基糖苷类、氟喹诺酮类、β-内酰胺类、磺胺类、四环素类耐药基因的携带率均超过48%，耐药基因预测与耐药表型结果一致性较高；共预测出122种毒力基因，其中74种携带率达100%。结论:北京市批发市场肉类食品中沙门菌中多重耐药比例较高、耐药谱复杂，血清型和ST型种类多样，耐药基因和毒力基因携带率较高，耐药表型和基因型较为一致。

目的:了解儿童肺炎链球菌脑膜炎(PM)的临床特点、细菌耐药情况及部分菌株的血清型情况。方法:回顾性分析2012年1月至2017年12月首都医科大学附属北京儿童医院住院PM患儿72例的临床资料、随访结果、分离菌株药物敏感性及血清型分型结果，分析PM死亡的危险因素。结果:72例患儿中男46例，女26例；年龄1个月～9岁；住院天数1～363 d，中位数22.0 d。社区获得性感染71例(98.6%)。有明确基础疾病患儿28例(38.9%)，其中前3位为脑脊液鼻漏(6例)、头外伤(4例)和免疫缺陷病(4例)。临床症状以发热为最常见(72例，100.0%)，其次为精神萎靡(60例，83.3%)、意识改变(46例，63.9%)、呕吐(45例，62.5%)、抽搐(42例，58.3%)、前囟张力增高(27例，37.5%)及头痛(17例，23.6%)等。神经系统并发症44例(61.1%)，以硬膜下积液最多见[29例(40.3%)]。再发细菌性脑膜炎2例，均为反复肺炎链球菌感染。脑膜炎和脑膜脑炎占比分别为43.1%(31/72例)和56.9%(41/72例)。脑膜炎菌株对青霉素的不敏感率为74.3%，对红霉素、克林霉素、四环素的耐药率分别为95.7%、95.7%、89.1%；对左氧氟沙星、万古霉素、利奈唑胺均敏感。24例(33.3%)患儿有菌株分型结果，其中19F型8株(33.4%)，14型5株，23F型4株，6A型3株，19A型2株，1型和15B型各1株。13价肺炎链球菌结合疫苗(PCV13)覆盖率达95.8%(23/24株)。随访72例，其中好转51例，死亡21例(病死率为29.2%)，遗留后遗症患儿21例(29.2%)。多变量 Logistic回归分析显示，呼吸衰竭和外周血白细胞数<4×10 9/L为PM患儿死亡的独立危险因素(均 P<0.05)。 结论:本中心儿童PM病例多发生于5岁以下，脑脊液鼻漏、头外伤和免疫缺陷病是儿童PM常见的基础疾病，病程中有呼吸衰竭或外周血白细胞数减少者可能提示预后不良。

目的:研究浙江省临床分离沙门菌的血清型分布、耐药状况和携带毒力基因的特征。方法:收集2010年至2017年浙江省9个地区临床分离的463株沙门菌，依据沙门菌属Kauffmann-White抗原表对比确定沙门菌属的血清型。采用K-B纸片扩散法进行药物敏感试验。采用聚合酶链反应检测菌株的11种毒力基因。结果:463株沙门菌共检出35种血清型，其中优势血清型为鼠伤寒沙门菌[41.90%(194/463)]和肠炎沙门菌[22.25%(103/463)]。对氨苄西林的耐药率[66.52%(308/463)]最高，其次为氨苄西林/舒巴坦[46.87%(217/463]；对哌拉西林/他唑巴坦的耐药率[3.24%(15/463)]较低；无亚胺培南和美罗培南耐药株；多重耐药菌株188株(40.60%)。毒力基因 hilA、 ssrB、 marT、 siiD、 sopB、 pagN在所有沙门菌株中都存在。毒力基因 vexA只在伤寒沙门菌和都柏林沙门菌中检出；毒力基因 icmF主要存在于肠炎沙门菌中；毒力质粒基因 spvB和 pefA表现为成对出现，且主要分布于猪霍乱沙门菌、肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌中；毒力基因 cdtB则主要分布于伤寒沙门菌和甲型副伤寒沙门菌中。 结论:浙江省临床分离的沙门菌以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主，多重耐药形势严峻，且携带多种毒力基因。

目的:报告1例类孟买血型并探讨其分子机制。方法:对1例ABO血型常规检测正反定型不相符的就诊者，采用吸收放散试验检测红细胞弱表达的ABH血型抗原，唾液酸实验检测唾液中血型物质。采用PCR产物直接测序法进行 ABO基因第6、7外显子和 FUT1和 FUT2基因序列分析。 结果:ABO血型正定型为O型，反定型为AB型，唾液中检测到有H和A、B物质，直接测序发现先证者 FUT1基因存在c.35C>T、c.328G>A、c.504delC复合杂合变异，单倍型序列分析表明先证者的 FUT1基因型为h 328A/h 35T+504delC，已上传NCBI，序列号为MW323551。 结论:本研究发现了1例由 FUT1基因复合杂合新变异c.504delC引起的类孟买表型AB mh，该变异可能影响糖基转移酶的活性，导致其酶的功能缺陷。

目的:分析山东省健康人群脑膜炎奈瑟菌（ Nm）的携带特征。 方法:于2008年4月至2020年4月，以济南市历下区、潍坊市高密市、济宁市嘉祥县、威海市文登区、临沂市郯城县、德州市临邑县6个地区为研究现场，招募16 848名健康人群为研究对象开展调查。采集研究对象咽拭子标本，对 Nm进行分离培养鉴定，分析不同特征研究对象的 Nm携带特征。 结果:16 848名研究对象中男性占51.86%（8 737名）；共分离到 Nm菌株136株，携带率为0.81%。136株 Nm菌株以B群（60.29%）和不可分群菌株（23.53%）为主；临沂（1.39%）和济南市（1.14%）的健康人群 Nm菌株携带率较高；13~16岁（1.60%）、17~19岁（1.10%）年龄组人群的 Nm菌株携带率较高；男性携带率（1.02%）较高。 结论:山东省健康人群 Nm携带率相对较低，B群和不可分群 Nm的占比较高。

目的:研究杭州市儿童流感样病例中肠道病毒(enterovirus，EV)病原谱构成及特征。方法:收集2019年杭州市1 060份儿童流感样病例咽拭子样本，实时荧光RT-PCR方法对流感病毒和EV进行筛查，采用SPSS16.0软件卡方(χ 2)检验对春夏秋冬四季的流感病毒和EV检测阳性率进行比较。EV阳性的标本用PCR方法扩增VP1序列进行血清型分型，并对VP1序列进行BLAST比对和进化关系分析。同时对EV阳性病例的临床诊断进行分类分析。 结果:1 060份流感样病例中，检出流感病毒283例，阳性率为26.70%；检出EV 75例，阳性率为7.08%；检出流感病毒和EV均阳性3例，阳性率为0.28%。春夏秋冬四季检测阳性率比较发现，流感病毒主要在冬、春季流行；而EV主要在夏季流行。51例肠道病毒VP1序列扩增阳性，BLAST序列分析结果显示分属10个血清型，包括5种EV-A、4种EV-B和1种EV-D。10个血清型分别是CVA2、CVA4、CVA5、CVA6、CVA9、CVA10、ECHO7、ECHO11、ECHO18、EV-D68，阳性构成比分别为16.00%、16.00%、5.33%、12.00%、5.33%、1.33%、1.33%、5.33%、4.00%和1.33%。EV VP1序列遗传进化关系分析显示51株杭州市EV株相比参考株均存在不同程度的变异。EV阳性患儿的临床诊断主要以急性上呼吸道感染为主，有44例占58.67%；其次是急性扁桃体炎14例占18.67%。接下来依次为疱疹性咽峡炎、急性支气管炎、哮喘性支气管炎、肺炎，分别占12.00%、8.00%、1.33%、1.33%。结论:引起杭州市儿童流感样病例的EV有10个血清型，CVA2和CVA4为主要流行血清型，且夏季EV阳性率较高。

患者男，19岁，2023年9月因连续腹泻3 d就诊上海市杨浦区某社区医院，发病前1天夜晚有烧烤店就餐史，病例符合腹泻病监测定义、采集患者粪便拭子运送公共卫生实验室分离病原为“非A~F群沙门菌”，菌株经参比实验室血清分型、耐药表型、全基因组测序和中国沙门菌区域血清型数据库比对鉴定为厄班纳沙门菌ST512型。患者口服左氧氟沙星3 d后康复。

目的:对2021年云南省昆明市及曲靖市手足口病(hand, foot and mouth disease, HFMD)病例中非肠道病毒A组71型(enterovirus A71, EVA71)和非柯萨奇病毒A组16型(coxsackie-virus A16, CVA16)的其他肠道病毒进行VP4/VP2区及VP1区基因测序检测，并对检测到的CVA2 VP1区基因进行基因进化分析，为CVA2的预防及控制提供实验室证据。方法:按《手足口病实验室手册(2018年版)》，对2021年昆明市和曲靖市送到云南省疾病预防控制中心HFMD实验室的标本进行前处理，提取病毒RNA后，先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒VP4/VP2结合区基因并测序，编辑后的序列在GenBank上搜索确定病毒型别，再用肠道病毒A组引物分两段扩增CVA2 VP1区基因完整序列并测序，通过肠道病毒在线定型工具(Enterovirus Genotyping tool Version 0.1)进行病毒型别确认。按文献下载CVA2 VP1区基因型/亚型代表株序列，Mega5.2软件构建基因进化树，分析病毒基因特征。结果:共检测749份非EVA71和非CVA16的肠道病毒标本，两地皆以A组肠道病毒为主，B组肠道病毒有少量报告，CVA16居病原谱第一位。其中CVA2 5份，检出率为0.67%(5/749)，为HFMD的稀有病原。VP4/VP2和VP1两个基因片段的测序检测、定型结果一致。基因特征分析表明，昆明市3株为基因型A，曲靖市2株为基因型D。结论:2021年云南省HFMD监测网络中昆明市和曲靖市CVA2的检出率为0.67%，CVA2在这两个市是HFMD的稀有病原。基因进化分析表明，两个基因型分别在昆明市和曲靖市传播但尚未引起流行。昆明市CVA2基因型A为国内首次报道。加强云南省CVA2的实验室监测特别是分子流行病学监测，对追踪和分析病毒传染来源具有重要意义。

肺炎球菌的血清型已超过100种，对众多血清型肺炎球菌进行分型和鉴定是肺炎球菌研究领域长期以来的“卡脖子”环节，建立准确、快速和高效的肺炎球菌血清型分型技术是疾病诊断、疾病监测、疫苗研发和疫苗效果评价的前提和基础。目前肺炎球菌血清分型和鉴定技术主要包括抗血清表型分型、荚膜多糖生化分型及荚膜多糖基因簇分型三种。本文将综述肺炎球菌血清分型技术的研究进展，阐述和分析不同分型技术的适宜应用场景，为肺炎球菌血清分型的实际工作提供指导。