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恶性胸膜间皮瘤中差异表达基因的预后意义及免疫细胞浸润分析
编辑人员丨1周前
目的:基于生物信息学方法挖掘分析恶性胸膜间皮瘤(MPM)的差异表达基因,研究其在MPM中的预后价值及其在免疫治疗中的潜在作用。方法:于2022年1月,从GEO数据库下载数据集GSE51024,获得MPM(55例)和正常组织(41例)样本。利用R软件结合HMDD和miRNet数据库筛选MPM相关差异基因并确定共表达基因。对共表达基因进行富集和功能注释,使用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并确定关键基因。利用TRRUST、GEPIA数据库预测关键基因的转录因子及预后生存分析。使用TIMER分析关键基因和免疫细胞浸润程度的相关性。结果:共获得435个共表达基因,主要富集于细胞外基质组织、细胞黏附分子信号通路。结合PPI和TRRUST数据库,确定7个MPM预后相关的关键基因,其中细胞周期蛋白20(CDC20)、细胞周期检测点激酶1(CHEK1)、Zeste基因增强子同源物2(EZH2)、核糖核苷酸还原酶亚基M2(RRM2)、拓扑异构酶2A(TOP2A)、泛素样含植物同源结构域和环指域1(UHRF1)在MPM中的表达上调,周期调节蛋白A1(CCNA1)表达下调;CCNA1、CDC20、CHEK1、EZH2、RRM2、TOP2A、UHRF1基因表达与MPM总体生存率有明显关联( P<0.05)。CDC20、CHEK1、EZH2、RRM2、TOP2A基因表达与B细胞、树突状细胞均呈正相关( P<0.05),与中性粒细胞均呈负相关( P<0.05)。 结论:CCNA1、CDC20、CHEK1、EZH2、RRM2、TOP2A、UHRF1可能是MPM患者潜在的预后标志物,其表达可能与MPM肿瘤免疫相关。
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编辑人员丨1周前
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2019—2022年河南省肾综合征出血热宿主动物监测情况分析
编辑人员丨1周前
目的:分析2019—2022年河南省肾综合征出血热(HFRS)宿主动物分布及携带汉坦病毒(HV)情况。方法:在河南省HFRS监测点开展宿主动物监测,采用实时荧光定量PCR法检测鼠肺HV,分析河南省鼠类动物携带HV型别,对阳性样本进行测序,分析核苷酸序列的同源性及变异情况。结果:2019—2022年共捕鼠1 308只,16份鼠肺HV核酸阳性,鼠HV阳性率为1.22%(16/1 308)。按种类,黑线姬鼠HV阳性率最高(68.75%,11/16)。按分布地,野外鼠HV阳性率最高(2.50%,12/480),居民区鼠HV阳性率为0.53%(4/759)。16份阳性样本分型结果显示,所携带的病毒均属于Ⅰ型汉滩病毒。阳性样本测序后获得8条S基因片段(OQ681444~OQ681451)和6条M基因片段(OQ681438~OQ681443);S和M基因片段与陕西84FLi株、四川SN7 株相似性较高。S和M基因片段系统进化分析显示,均为汉滩病毒H5基因亚型。氨基酸序列分析显示,与汉滩病毒疫苗株84FLi相比,8条S片段编码氨基酸第74位由天冬酰胺替换为丝氨酸;XC2022047株在Gn区第14位由色氨酸替换为甘氨酸,XC2022022和XC2022024第359位由异亮氨酸替换为丙氨酸。结论:2019—2022年河南省宿主动物携带HV属于Ⅰ型汉滩病毒,黑线姬鼠仍然是汉滩病毒的优势宿主。同疫苗株比较,S和M基因片段的免疫表位区均有氨基酸位点替换。
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编辑人员丨1周前
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乙型肝炎疫苗加强免疫的影响因素分析
编辑人员丨1周前
目的:了解人群接受乙型肝炎疫苗加强免疫情况及其影响因素,为乙型肝炎疫苗加强免疫相关工作的开展提供参考。方法:以正定县乙型肝炎疫苗免疫效果观察监测点和定兴县为研究现场,1986—2011年出生且完成乙型肝炎疫苗全程基础免疫的人群为研究对象开展问卷调查,分析人群接受乙型肝炎疫苗加强免疫情况,采用Logistic回归分析法分析其影响因素。结果:最终纳入研究对象3 447人,加强免疫发生率32.93%(1 135人)。多因素分析结果显示,年龄在18~27岁、28~34岁以及本人文化程度为高中(中专)的人群加强免疫发生率高[ OR(95% CI)=1.485(1.173~1.879)、1.855(1.362~2.525)、1.500(1.234~1.825)];有婚史、居住地为城市、主动进行乙型肝炎方面检查的人群加强免疫发生率高[ OR(95% CI)= 1.636(1.277~2.097)、1.390(1.077~1.794)、1.201 (1.000~1.443)];未与乙型肝炎患者长期一起生活的人加强免疫发生率低[ OR(95% CI)=0.255(0.099~0.657)];不知道长期一起生活的人是否有HBV携带者加强免疫发生率低[ OR(95% CI)=0.186(0.062~0.552)];乙型肝炎知识≥16分组加强免疫发生率高于≤11分组[ OR(95% CI)=1.789(1.371~2.333)];风险态度为9~11分者加强免疫发生率高于5~8分者[ OR(95% CI)=1.472(1.149~1.886)];监测点人群加强免疫发生率低于非监测点[ OR(95% CI)=0.304(0.248~0.372)]。 结论:人群加强免疫行为的发生与多种因素有关,加强乙型肝炎及乙型肝炎疫苗相关知识的宣传可促进加强免疫行为的发生。
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编辑人员丨1周前
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纺锤体检测点蛋白BUB1B在三阴型乳腺癌中的表达及意义
编辑人员丨1周前
目的:高通量筛选三阴型乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)预后相关的重要分子标志物,探讨纺锤体检测点蛋白BUB1B表达与TNBC临床病理特征及预后相关性。方法:收集2009—2017年四川大学华西医院诊断TNBC的临床病理资料和预后信息。选取符合纳入标准的新鲜样本47例,肿瘤原发灶石蜡样本139例。对新鲜肿瘤样本进行转录组测序(RNA-seq)与基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)数据集GSE38959和GSE65194差异分析并取交集,进行富集分析和蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析。利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析目的基因的表达水平与TNBC预后的关系。采用免疫组织化学染色验证其在TNBC中的表达情况及与临床病理特征和预后的相关性。结果:利用edgeR对47例TNBC肿瘤组织与其中12例正常组织进行差异分析得到1 559个上调基因和1 376个下调基因,与GEO2R对GSE38959和GSE65194差异分析后的差异基因取交集后得到131个基因。富集分析主要富集在细胞周期、JAK-STAT信号通路、p53信号通路。利用Cytoscape分析得到Degree最高的10个基因:TOP2A、BUB1B、MKI67、PLK1、RRM2、PCNA、KPNA2、SMC4、PBK、IGF1。Kaplan-Meier Plotter数据库中分析发现BUB1B表达与TNBC预后显著相关[总生存期,HR=0.52,95% CI(0.35~0.77), P=0.001;无远处转移生存期,HR=0.72,95% CI(0.52~0.98), P=0.038]。139例肿瘤原发灶石蜡样本免疫组织化学的结果显示BUB1B低表达与TNBC预后不良具有显著相关性[HR=0.41,95% CI(0.18~0.95), P=0.024]。 结论:BUB1B蛋白低表达与TNBC预后不良相关,其预后相关分子机制和潜在治疗靶点有待进一步研究。
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编辑人员丨1周前
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2019—2020年江苏省健康人群脑膜炎奈瑟菌携带情况调查
编辑人员丨1周前
为了解江苏省健康人群脑膜炎奈瑟菌带菌情况及菌群分布特征,采用横断面研究、按随机抽样的方法,于2019年10—11月份和2020年11—12月份在江苏省内选取4个县区作为监测点,采集辖区内不同年龄组健康人群咽拭子样本进行分离培养以及荧光定量PCR分群鉴定。采用 χ 2检验对脑膜炎奈瑟菌阳性率进行比较,采用多因素logistic回归模型对脑膜炎奈瑟菌带菌率的影响因素进行分析。结果显示,采集到健康人群咽拭子标本1 512份,检出脑膜炎奈瑟菌菌株57株,总体带菌率为3.77%。其中B群为主(36.84%,21/57),不可分群次之(33.33%,19/57),C群第三(17.54%,10/57),W135群和A群分别为7.02%(4/57)和5.26%(3/57)。15~20岁组的带菌率(8.60%)明显高于其他年龄组(1.77%~3.74%)(Pearson χ 2=18.211, P<0.05)。地区、年龄和免疫史是影响脑膜炎奈瑟菌带菌率的危险因素。综上,江苏省健康人群的总体带菌率水平较低,预示江苏省的流行性脑脊髓膜炎病例未来可能将持续以零星散发为主。但应加强校园流行性脑脊髓膜炎疫情防控工作,并保持对已成为主要流行株的B群脑膜炎奈瑟菌的持续监测。
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编辑人员丨1周前
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河北省1~29岁人群乙型肝炎血清流行病学调查
编辑人员丨1周前
目的:了解2014年河北省1~29岁人群HBV感染流行特征,为评估乙型肝炎防控策略提供依据。方法:2014年,采用分层二阶段整群随机抽样方法,抽取河北省8个疾病监测点1~29岁人群进行问卷调查,调查信息包括出生日期、年龄、民族、性别等。采集血液样本检测HBV血清标志物,分析不同特征人群的HBsAg阳性率、抗-HBs阳性率和抗-HBc阳性率。结果:2014年调查分析1~29岁人群1 015名,HBsAg阳性率、抗-HBs阳性率和抗-HBc阳性率分别为1.08%、53.50%和6.60%。不同年龄组(1~4岁组、5~14岁组和15~29岁组)的HBsAg、抗-HBs和抗-HBc阳性率比较差异有统计学意义( χ 2=14.43、59.62和43.23, P均<0.01)。抗-HBs阳性率在汉族中为51.98%,在满族中为68.18%,在其他民族中为58.82%,差异有统计学意义( χ 2=59.62, P<0.05)。乙型肝炎疫苗纳入免疫规划后出生人群(即2002—2013年出生)HBsAg阳性率、抗-HBs阳性率、抗-HBc阳性率分别为0.29%、57.65%和3.38%,三项血清标志物在不同时期人群中比较差异均有统计学意义( χ 2趋势=13.12、14.43和52.58, P均<0.05)。本次调查共检出8种组合模式,其中检出率最高的模式是抗-HBs单项阳性和5项指标全阴性,检出率分别为49.06%和44.34%。 结论:河北省1~29岁人群HBsAg阳性率处于较低水平,尤其是乙型肝炎疫苗纳入免疫规划后出生的人群HBsAg阳性率已降至1%以下,表明国家实施的乙型肝炎免疫预防策略是有效的。
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编辑人员丨1周前
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2012—2018年免疫策略调整前后北京市Ⅰ和Ⅲ型脊髓灰质炎疫苗免疫效果及疫苗效价监测分析
编辑人员丨1周前
目的:分析脊髓灰质炎(脊灰)疫苗免疫程序策略调整前后北京市2012、2014、2016和2018年脊灰疫苗免疫效果和疫苗效价。方法:按照方便抽样的方法,于2012年选择朝阳区和延庆区,2014选择丰台区和大兴区,2016年选择通州区和平谷区,2018年选择东城区和顺义区的预防接种门诊作为监测点,选取在监测点内完成3剂脊灰疫苗基础免疫后4~8周的儿童为监测对象,共292名,其中2012和2014年为策略调整前,免疫程序为3剂3价脊灰病毒减毒活疫苗(tOPV)全程免疫;2016和2018年为策略调整后,免疫程序为1剂脊灰病毒灭活疫苗(IPV)与2剂2价脊灰病毒减毒活疫苗(bOPV)序贯免疫。采集1.0 ml静脉血,检测Ⅰ和Ⅲ型脊灰病毒中和抗体滴度。采用随机数字法,从监测点随机抽取疫苗标本,每年9份(2012年为8份),检测疫苗效价并进行比较。结果:292名儿童的年龄[ M( P25, P75)]为5(5,6)月龄,男女比为1.04(149/143)。2012、2014、2016和2018年监测对象分别为66、72、68和86名,基础免疫后,除2014年Ⅰ型脊灰病毒中和抗体阳性率为98.61%(71名),其余年份Ⅰ和Ⅲ型均为100%;2016和2018年Ⅰ和Ⅲ型脊灰病毒中和抗体滴度整体高于2012和2014年( P值均<0.001)。2012和2014年tOPV的效价为(6.05±0.15)和(6.16±0.12)lgCCID 50/粒,2016和2018年bOPV的效价为(6.88±0.21)和(6.26±0.14)lgCCID 50/100 μl( P<0.001)。 结论:北京市脊灰疫苗免疫策略调整前后,tOPV全程免疫和IPV-bOPV序贯免疫程序的疫苗基础免疫抗体阳性率相当,IPV-bOPV序贯免疫程序产生的脊灰抗体水平更高,调整后2016年bOPV效价高于调整前tOPV效价,但2018年bOPV效价下降。
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编辑人员丨1周前
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2015 - 2020年甘肃省陇南市流行性乙型脑炎流行特征及健康人群抗体水平分析
编辑人员丨1周前
目的:了解甘肃省陇南市流行性乙型脑炎(乙脑)流行特征及健康人群抗体水平,分析和评价其流行危险度,为今后的乙脑防控工作提供科学依据。方法:采用回顾性分析,自"中国疾病预防控制信息系统"中的"乙脑监测信息报告管理系统"收集2015 - 2020年陇南市乙脑病例数据,对病例的三间分布情况(时间、地区、人群分布)进行统计学描述与分析。2018年,采用整群分层抽样方法,选择陇南市乙脑发病率较高的礼县、西和县和发病率较低的武都区、徽县为监测点,各抽取3个行政村(社区)采集健康人群血样,检测乙脑IgG抗体水平。结果:2015 - 2020年陇南市共报告乙脑病例261例,年均发病率为1.66/10万;其中,2017、2018年报告病例数占总病例数的82.38%(215/261)。乙脑病例的发病时间主要集中在8月,占72.03%(188/261);陇南市9个县(区)均有乙脑病例报告,发病数前5位的县(区)依次为礼县(68例)、西和县(64例)、武都区(40例)、康县(33例)、成县(18例),占总报告病例数的85.44%(223/261);发病年龄主要集中在40 ~ < 60岁,占40.23%(105/261);男女性别比为1.00 ∶ 1.14(122 ∶ 139);职业以农民为主,占75.86%(198/261)。共检测健康人群血清887份,抗体阳性率为91.09%(808/887);不同年龄组间抗体阳性率比较差异有统计学意义(χ 2 = 5.77, P < 0.05);不同性别、地区间抗体阳性率比较,差异均无统计学意义(χ 2 = 0.45、2.06, P均> 0.05)。 结论:陇南市乙脑发病以中年农民为主,每年8月高发。2017、2018年陇南市乙脑疫情暴发,后呈低流行态势,健康人群乙脑抗体阳性率高。建议定期开展健康人群乙脑免疫水平监测,适时加强重点人群免疫。
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编辑人员丨1周前
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ATR/CHK1通路在卵巢上皮癌发生发展中的作用机制研究
编辑人员丨1周前
目的:探讨共济失调毛细血管扩张突变基因Rad3相关激酶(ATR)/沉默细胞周期检测点激酶1(CHK1)信号通路在卵巢上皮癌发生、发展过程中的作用。方法:体外培养人卵巢上皮癌细胞OVCAR3,分为空白对照组(NC组)、siRNAsc组(转染siRNAsc的OVCAR3细胞)、siRNAATR组(转染siRNAATR的OVCAR3细胞)、VE822组(加入1μmol/L的ATR抑制剂VE822)、和siRNAATR+VE822组。采用siRNA技术和VE822干扰OVCAR3细胞中的ATR,通过实时荧光定量PCR(qRTPCR)和蛋白免疫印迹法(Western blot)检测细胞中ATR的表达确定干扰有效后,CCK8法检测各组细胞增殖抑制情况,流式细胞术(FCM)检测细胞周期和凋亡情况,qRTPCR检测卵巢上皮癌细胞中凋亡相关基因半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3(Caspase3)、B细胞淋巴瘤2(Bcl2)、Bcl2相关X蛋白(Bax)mRNA的表达,蛋白免疫印迹法(Western blot)检测ATR/CHK1通路相关蛋白的表达。结果:siRNA-ATR转染和VE-822干预后,与NC组和siRNA-sc组相比,siRNA-ATR组、VE-822组、siRNA-ATR+VE-822组OVCAR3细胞中ATR的mRNA[(1.55±0.12)、(1.51±0.13)、(0.71±0.11)、(0.73±0.12)、(0.49±0.09)]表达水平显著降低( P<0.05),细胞增殖抑制率[(0.00±0.00)%、(0.00±0.00)%、(32.84±1.08)%、(30.75±1.44)%、(43.90±1.57)%]、细胞G0/G1期的比例[(40.08±2.57)、(36.35±3.44)、(53.28±4.34)、(56.37±5.03)、(70.63±3.81)]、细胞凋亡率[(4.28±0.67)%、(5.35±0.94)%、(23.63±1.13)%、(24.57±1.20)%、(35.86±1.09)%]、Caspase-3、Bax mRNA表达明显升高( P<0.05),S期[(32.93±3.02)、(35.35±2.82)、(25.79±3.61)、(23.74±3.54)、(18.04±2.37)]和G2/M期[(26.99±2.84)、(28.30±2.72)、(20.93±3.01)、(19.98±2.87)、(11.33±2.11)]的细胞比例、Bcl-2 mRNA、ATR、p-CHK1/CHK1、细胞分裂周期蛋白25C(CDC25C)、细胞周期蛋白B1(cyclin B1)蛋白表达显著降低( P<0.05);与siRNA-ATR组相比,siRNA-ATR+VE-822组细胞中ATR的mRNA表达水平进一步降低( P<0.05),细胞增殖抑制率、细胞凋亡、Caspase-3、Bax mRNA表达进一步增加( P<0.05),Bcl-2 mRNA、ATR、p-CHK1/CHK1、CDC25C、cyclin B1蛋白表达持续降低( P<0.05)。 结论:ATR/CHK1信号通路在卵巢上皮癌OVCAR3细胞增殖过程中被激活,抑制ATR/CHK1信号通路,可抑制卵巢上皮癌细胞增殖,诱导其G1/S细胞周期阻滞和细胞凋亡。
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编辑人员丨1周前
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DNA损伤修复相关通路的合成致死靶点研究及其在卵巢癌中的应用和前景
编辑人员丨1个月前
DNA损伤引发细胞启动一系列DNA损伤应答(DNA damage response,DDR),包括DNA损伤修复、细胞周期检查点激活、细胞周期阻滞、各种细胞内信号转导途径的活化和细胞凋亡等.DNA损伤修复(DNA damage repair)是细胞维持基因组稳定性的重要机制,于2015年获得诺贝尔化学奖.DNA损伤修复途径主要包括:碱基切除修复(base-excision repair,BER)、核苷酸切除修复(nucleotide excision repair,NER)、错配修复(mismatch repair,MMR)、同源重组(homologous recombi-nation,HR)和非同源末端连接(non-homologous end joining,NHEJ)等,分别在DNA单链断裂(sin-gle-strand break,SSB)或双链断裂(double-strand break,DSB)等损伤修复中发挥重要作用.DNA损伤修复缺陷与肿瘤发生发展密切相关,同时也是肿瘤治疗的重要靶点.DNA损伤修复通路的多聚ADP核糖聚合酶(poly-ADP-ribose polymerase,PARP)与乳腺癌易感基因BRCA1/2等存在合成致死(synthetic lethality)作用,使PARP抑制剂(PARP inhibitor,PARPi)成为第一个也是目前唯一上市的肿瘤治疗合成致死靶药.PARPi在卵巢癌及多种实体瘤治疗中疗效良好,使DNA损伤修复及相关DDR通路的合成致死靶药研发成为热点,其他在研靶点主要包括:共济失调毛细血管扩张突变蛋白(ataxia telangiectasia-mutated protein,ATM)、共济失调毛细血管扩张与 RAD3 相关蛋白(ataxia telangiectasia and Rad3 related protein,ATR)、DNA 依赖性蛋白质激酶催化亚单位(DNA-dependent protein kinase catalytic subunit,DNA-PKcs)、细胞周期检测点激酶 1(checkpoint kinase1,CHK1)、细胞周期检测点激酶2(checkpoint kinase 2,CHK2)、阻止有丝分裂的蛋白质激酶WEE1等.PARPi与其他DDR靶药、抗血管生成药物及免疫检查点抑制剂的联用,有可能成为克服PARPi耐药、提高疗效的有效手段和发展前景.本文针对DNA损伤修复及相关DDR通路的关键分子和潜在肿瘤治疗靶点进行综述,阐述了 DNA损伤修复相关通路的合成致死靶点研究及在卵巢癌的应用和前景,为基础研究及临床应用提供指导.
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编辑人员丨1个月前
