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山东汉族人群中发现一例罕见的血小板特异性抗原HPA-10bw等位基因
编辑人员丨6天前
目的:探讨山东汉族人群血小板抗原系统10(HPA-10w)的基因多态性,补充本地区血小板供者库数据。方法:应用PCR特异性引物分析法(PCR sequence specific primer)和直接测序方法对山东地区汉族血小板捐献者样本进行HPA-10等位基因分型。结果:在1401例山东汉族机采血小板捐献者中,发现一例罕见的HPA-10w(a+b+)杂合子携带者。HPA-10bw等位基因频率在山东汉族人群中约为0.035%。结论:山东汉族人群中HPA-10bw低频抗原的检出,对诊断和预防新生儿同种免疫血小板减少症(neonatal alloimmune thrombocytopenic purpura,NAIT)以及输血后紫癜(post-transfusion purpura,PTP)具有临床意义。
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编辑人员丨6天前
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微RNA单核苷酸多态性与慢性自发性荨麻疹发病风险的关联分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨微RNA(miRNA)单核苷酸多态性与慢性自发性荨麻疹(CSU)的风险关联。方法:采用病例对照研究,收集2019年1-6月在济宁医学院附属医院皮肤科诊治的98例CSU患者及同期148例健康对照,均为山东籍汉族,采集静脉血后提取基因组DNA,针对miRNA多态性位点rs2431697(miR-146a)、rs57095329(miRNA-146a)、rs3746444(miRNA-499)、rs11614913(miRNA-196a2)和rs895819(miRNA-27a)行多重PCR扩增反应和单碱基延伸反应,进行单核苷酸多态性(SNP)位点分型。采用 χ2检验分析组间等位基因、基因型及遗传模型分布差异,非条件Logistic回归分析基因SNP与疾病发生风险的关系。 结果:所有样本SNP均成功分型。miRNA-196a2 SNP位点rs11614913等位基因为T/C,病例组等位基因T频数110(56.1%),对照组131(44.3%),两组T/C频率分布差异有统计学意义( χ2 = 6.64, P = 0.010),该位点等位基因T可能是CSU发生的危险因素( OR = 1.61,95% CI:1.12 ~ 2.32)。病例组rs11614913基因型CC、CT、TT频数分别为16(16.3%)、54(55.1%)、28(28.6%),对照组为48(32.4%)、69(46.6%)、31(20.9%),两组基因型分布差异有统计学意义( χ2 = 8.16, P = 0.017);两组显性遗传模型(TT+CT与CC)分布差异亦有统计学意义( χ2=7.95, P = 0.005),显性遗传模型可能增加了CSU发病风险( OR=2.46,95% CI:1.30 ~ 4.65)。 结论:我国山东汉族人群miRNA-196a2 SNP与CSU风险可能存在关联,rs11614913可能会增加CSU发病风险。
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编辑人员丨6天前
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山东滨州地区汉族造血干细胞捐献志愿者 HLA- A、- B、- DRB1高分辨等位基因及其单体型多态性分析
编辑人员丨6天前
目的:探讨山东滨州地区汉族造血干细胞(HSC)捐献志愿者中人类白细胞抗原( HLA)- A、- B、- DRB1高分辨等位基因及其单体型的多态性分布特征。 方法:选择2010年1月至2018年12月,于滨州市中心血站行 HLA- A、- B、- DRB1高分辨基因分型的2 620例无亲缘关系健康汉族HSC捐献志愿者为研究对象。HSC捐献志愿者年龄为18~45岁;男性志愿者为1 482例,女性为1 138例。采用PCR-序列特异的寡核苷酸探针杂交(SSOP)法,对HSC捐献志愿者全血基因组DNA标本的 HLA- A、- B、- DRB1位点进行高分辨基因分型。采用直接计数法计算HSC捐献者 HLA- A、- B、- DRB1的基因频率和基因型频率。采用Arlerquin 3.5统计学软件计算 HLA- A、- B、- DRB1等位基因单倍型频率,并对 HLA- A、- B、- DRB1的基因分布进行Hardy-Weinberg平衡检验。滨州地区汉族HSC捐献志愿者与文献报道的中国其他地区汉族人群的 HLA- A、- B、- DRB1等位基因频率比较,采用 χ2检验。本研究遵循的程序符合2013年修订版《世界医学协会赫尔辛基宣言》要求,并且与所有受试者签署《中国造血干细胞捐献者资料库志愿捐献者同意书》。 结果:①本组2 620例HSC志愿捐献者的 HLA- A、- B、- DRB1基因分布的Hardy-Weinberg平衡检验结果显示,各基因位点基因频率的观察值与期望值分别比较,差异均无统计学意义( P>0.05),即本组HSC捐献志愿者 HLA- A、- B、- DRB1基因分布,符合Hardy-Weinberg平衡定律。②本组2 620例HSC捐献者DNA标本中,检出的 HLA- A、- B、- DRB1等位基因分别为52、89和52种,多态性最高基因组分别为 A*02组(11种), B*15组(20种)和 DRB1*14组(11种)。2 620例志愿者的血样DNA标本中,检出 HLA- A- B- DRB1单倍型为2 604种,其中频率>0.10%的单倍型为133种,频率>1.00%的单倍型为 A*30:01- B*13:02- DRB1*07:01(1.77%)和 A*02:01- B*13:02- DRB1*07:01(1.13%)。③本组2 620例志愿者的血样DNA标本中,检出等位基因频率>1.00%的 HLA- A、- B、- DRB1等位基因共计65个,并且在文献报道的广西、上海、江苏、河南、黑龙江、陕西等地区人群中亦均被检出,但是各地区 HLA基因高频基因型(基因频率>5.00%)的分布比较,差异均有统计学意义( P<0.05)。 结论:滨州地区HSC捐献汉族志愿者的 HLA- A,- B,- DRB1基因单体型分布具有高度的遗传多态性和地域分布特点。阐明滨州地区HSC捐献汉族志愿者的 HLA- A,- B,- DRB1高分辨等位基因及其单体型多态性,有助于寻找HLA相合的HSC捐献者,并且可对进一步进行本地区人群的人类学及免疫遗传学研究提供参考。
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编辑人员丨6天前
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Fcγ受体ⅢB基因多态性与系统性红斑狼疮易感性及临床表型的相关性研究
编辑人员丨6天前
目的:研究Fcγ受体ⅢB基因多态性在黄河三角洲汉族人群中的分布,探讨其多个位点的基因多态性与SLE易感性及临床表型的相关性。方法:选择2017年1月至12月于山东省滨州医学院附属医院就诊的144例SLE患者作为试验组,同期健康志愿者150名作为对照组,收集全血标本和临床资料、试验室检查资料,采用单碱基延伸法PCR技术提取基因组脱氧核糖核酸(DNA),采用质谱法进行单核苷酸多态性(SNP)分型检测,应用SPSS 25.0软件进行 χ2检验,分析Fcγ受体ⅢB基因各位点基因多态性与SLE易感性及临床表型的关系。 结果:①在试验组和对照组中,rs115878669 CT、TT基因型频率分别为50.7%、64.0%,23.6%、10.0%,差异有统计学意义( χ2=5.3, P=0.021; χ2=9.8, P=0.002);rs147574249 TT基因型频率分别为17.4%、8.0%,差异有统计学意义( χ2=5.9, P=0.016);rs199705513 GG、GA基因型频率分别为20.8%、10.0%,59.0%、70.0%,差异有统计学意义( χ2=6.7, P=0.010; χ2=3.9, P=0.049);rs77717968 CA基因型频率分别为30.6%、46.0%,差异有统计学意义( χ2=7.4, P=0.007)。②在试验组中,rs115878669位点杂合子CT基因型频率在血液系统受累和不受累组分别为37.2%、56.4%,差异有统计学意义( χ2=4.5, P=0.035);在血小板减少组与血小板正常组中,rs114531649位点AG基因型频率分别为79.2%、50.0%,差异有统计学意义( χ2=6.8, P=0.009),GG基因型频率分别为4.2%、25.8%,差异有统计学意义( χ2=4.3, P=0.039),rs147574249位点CC基因型频率分别为4.2%、25.8%,差异有统计学意义( χ2=5.4, P=0.020),CT基因型频率分别为79.2%、56.7%,差异有统计学意义( χ2=4.2, P=0.040),rs115878669位点CT基因型频率分别为70.8%、46.7%,差异有统计学意义( χ2=4.7, P=0.031),rs199705513位点AA基因型频率分别为4.2%、23.3%,差异有统计学意义( χ2=4.6, P=0.033),rs77717968位点AA基因型频率分别为4.2%、26.7%,差异有统计学意义( χ2=4.5, P=0.033),TT基因型频率分别为25.0%、9.2%,差异有统计学意义( χ2=4.8, P=0.028),其他比较无统计学意义( P>0.05)。在关节受累组与关节未受累组中,rs114531649位点纯合子GG基因型频率分别为31.2%、15.7%,差异有统计学意义( χ2=4.9, P=0.027),rs147574249位点纯合子CC基因型频率分别为31.2%、15.7%,差异有统计学意义( χ2=4.9, P=0.027),rs199705513位点纯合子AA基因型频率分别为29.5%、13.2%,差异有统计学意义( χ2=5.8, P=0.016),rs61803007位点纯合子CC基因型频率分别为32.8%、16.9%,差异有统计学意义( χ2=4.9, P=0.026),杂合子TC基因型频率分别为67.2%、83.1%,差异有统计学意义( χ2=4.9, P=0.026),rs77717968位点纯合子AA基因型频率分别为31.2%、16.9%,差异有统计学意义( χ2=4.1, P=0.044),其他比较差异无统计学意义( P>0.05)。rs146653557位点杂合子TC基因型基因型频率在有浆膜炎组和无浆膜炎组分别为39.4%、75.0%,差异有统计学意义( χ2=4.3, P=0.037),其他比较差异无统计学意义( P>0.05)。在RF升高组与RF未升高组中,rs428194位点CG基因型频率分别为53.8%、22.9%,差异有统计学意义( χ2=12.7, P=0.000 4),GG基因型频率分别为46.2%、77.1%,差异有统计学意义( χ2=12.7, P=0.000 4),rs61803004位点GG基因型频率分别为46.2%、78.1%,差异有统计学意义( χ2=13.7, P=0.000 2),GT基因型频率分别为46.2%、21.0%,差异有统计学意义( χ2=9.0, P=0.002 7),TT基因型频率分别为7.7%、1.0%,差异有统计学意义( χ2=4.8, P=0.029),rs61803008位点CT基因型频率分别为46.2%、23.8%,差异有统计学意义( χ2=6.8, P=0.009 2),TT基因型频率分别为46.2%、74.3%,差异有统计学意义( χ2=10.1, P=0.001 5)。 结论:Fcγ受体Ⅲ B基因相关位点可能与SLE的疾病易感性及临床表型有关。
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编辑人员丨6天前
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大连汉族群体遗传结构及系统关联性的研究
编辑人员丨2024/4/27
目的 结合大连汉族人群与32个国内外群体的Y-STR单倍型遗传信息,研究其群体遗传结构和系统关联性.方法 采集大连市958位汉族男性志愿者血液样本,应用Y-STR荧光检测试剂盒和毛细管电泳分型技术完成42个基因座的基因分型,计算相关的法医学参数.并基于17个Y-STR基因座计算33个人群间的Nei氏标准遗传距离,绘制主坐标分析图,构建系统发生树.结果 针对42个Y-STR基因座的遗传多态性分析,发现了 10个基因座30种非常规的等位基因.对17个Y-STR基因座的群体遗传学分析证实大连与鞍山汉族人群遗传距离最近,其次为河南、黑龙江、吉林、山东和重庆汉族人群.此外,大连汉族与北川羌族和贵州苗族人群遗传距离相对较近,反而与同居住于辽宁的满族人群遗传距离相对较远.结论 大连汉族与其他人群的遗传距离不完全与民族和地域远近成正比,人口迁徙和民族融合与隔离都会对其产生影响.
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编辑人员丨2024/4/27
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何首乌致肝损伤标志物HLA-B∗35:01等位基因的汉族人群分布
编辑人员丨2023/10/21
目的 调查山东地区及中国部分省市汉族人群HLA-B?35:01 等位基因的携带率和等位基因频率的分布,为临床医师在开具何首乌及其制剂药方之前,选择是否需要进行基因筛查提供依据.方法 检索山东省骨髓库 2007 至 2021 年入库且具有HLA-B位点高分辨数据的山东籍汉族志愿者样本,并按照志愿者所在地市进行分组.进一步通过文献检索,收集中国部分省市汉族人群HLA-B?35:01 等位基因分布的数据,计算HLA-B?35:01 等位基因的携带率和基因频率,并进行统计学分析.结果 纳入研究的山东13 个地市共计22 661 例汉族志愿者,其HLA-B?35:01 的基因携带率为6.06%;基因频率为3.05%,其中,滨州、聊城、泰安三地携带率较高,分别为 6.68%、6.65%和 6.64%,而日照、枣庄两地携带率较低,仅为 4.67%和 3.76%.纳入研究的中国其他 16 个省市中,分布在北方的河南汉族、陕西汉族人群的携带率均达到 7.34%,其余北方汉族人群均达到6%.而分布于南方的汉族人群中,除上海和云南汉族人群的携带率达到 6%之外,其余人群携带率均较低,广西南宁汉族人群仅为 1.42%.中国北方汉族人群HLA-B?35:01 等位基因分布显著高于南方汉族人群.结论 应重视对中国汉族人群(尤其是北方汉族人群)中何首乌用药前HLA-B?35:01 等位基因的筛查,以减少药物性肝损伤的发生.
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编辑人员丨2023/10/21
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基于二代测序平台的261plex微单倍型检测体系的研究
编辑人员丨2023/9/2
目的 建立基于二代测序平台的 261plex微单倍型检测体系,进行遗传学调查和法医物证检验,评价该体系的法医学应用价值.方法 以人类基因组GRCh38 为参考序列,使用dbSNP数据库以千人基因组计划中东亚人群为目标人群,等位基因频率介于 0.1~0.5 之间筛选SNP位点,使用Ion AmpliSeq Designer设计引物.调查山东汉族 200 名无关个体的 261plex遗传多态性,并对该体系进行性能评价.结果 本文建立的 261plex微单倍型检测体系片段短、灵敏度高、稳定性好、特异性强、个体识别率高、混合及降解检材适用性好.结论 该检测体系在法医个体识别和亲权鉴定,特别是混合及降解检材检验方面有很高的应用价值.
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编辑人员丨2023/9/2
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安徽地区汉族孕妇人群MTHFR基因多态性研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨安徽地区孕妇编码叶酸代谢通路中关键酶的基因亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T位点的基因型及等位基因的频率分布,以指导孕妇孕期合理补充叶酸.方法 采用PCR-芯片杂交法,对2016 ~2017年采集的484例安徽地区孕妇外周血样本进行基因型测定,并与其他地区人群的数据进行比较.结果 安徽地区汉族孕妇 MTHFR C677T 的3种基因型 CC、TC 和 TT 频率分别为 25.2 % 、49.2 % 和 25.6 % ,与山东、四川、云南、广东以及海南地区女性人群等位基因频率的差异有统计学意义(P<0.05).结论 MTHFR 基因 C677T 多态性分布具有地区差异,安徽地区50%以上的育龄女性携带高风险基因,基于C677T多态性检测的孕期叶酸个体化用药指导将是进一步降低出生缺陷的重要方法.
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编辑人员丨2023/8/6
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山东地区汉族儿童先天性甲状腺功能减低症NNT基因突变筛查研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨山东地区汉族儿童先天性甲状腺功能减低症(CH)烟酰胺核苷酸转氢酶(NNT)基因突变情况及其与CH的关系,为CH的诊断提供理论依据.方法 对50例来自山东地区的汉族CH患儿进行NNT基因编码区筛查.提取血液基因组DNA,PCR扩增NNT基因全部编码区后进行Sanger测序,将测序结果与NCBI中NNT基因编码区原序列(NM_012343.3)进行比对,检测这些患儿是否携带NNT基因突变并对发现的突变进行生物信息学分析.结果 2 例患儿中发现了NNT基因c.1475C>T(p.A492V)突变,1例患儿中发现NNT基因c.2704C>A(p.P902T)突变,Polyphen值显示前者几乎无蛋白危害性,可能不是致病突变,而后者蛋白危害性较大,应为致病突变.结论 NNT基因突变可能不是山东汉族人群CH的主要病因,仍需扩大样本量进行研究.
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编辑人员丨2023/8/6
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TGF-β1基因多态性与妊娠期糖尿病遗传易感性关系
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨转化生长因子-β1(TGF-β1)基因rs4803455和rs2241715位点单核苷酸多态性(SNP)与山东汉族人群妊娠期糖尿病(GDM)遗传易感性的关系.方法 选取山东汉族GDM孕妇561例,随机选取同期健康孕妇642例作为对照组.采用TaqMan探针荧光定量PCR技术和DNA测序技术,检测TGF-β1基因rs4803455和rs2241715位点SNP基因型频率及等位基因频率,并比较两组基因型构成及等位基因频率的差异.结果GDM组和对照组TGF-β1基因rs4803455和rs2241715位点基因型及等位基因频率分布比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 TGF-β1 基因 rs4803455 和 rs2241715 位点多态性与山东汉族人群 GDM 遗传易感性不相关 .
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编辑人员丨2023/8/6
