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慢性鼻窦炎伴鼻息肉鼻黏膜上皮细胞基因转录组分析
编辑人员丨1周前
目的:通过研究基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)患者与对照组鼻黏膜上皮细胞差异表达基因并分析其功能,寻找参与调控CRSwNP鼻黏膜上皮屏障功能损伤的关键基因。方法:2018年6月至2020年5月,从可公开获得的GEO数据库下载编号为GSE107624(7例CRSwNP和7例对照)和GSE69093(13例CRSwNP和11例对照)的mRNA表达芯片数据,对两个数据集进行联合分析,筛选CRSwNP患者鼻黏膜上皮细胞差异表达基因,并对差异基因进行相互作用网络、功能注释和参与调控通路分析,根据基因注释结果筛选参与CRSwNP调控的重要基因。同期,收集首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科CRSwNP患者鼻息肉组织(14例,46.8±17.9岁)和鼻中隔偏曲患者的钩突黏膜组织(7例,23.4±2.3岁)作为对照组,对组织进行原代上皮细胞培养,并提取RNA进行实时荧光定量聚合酶链反应(Q-PCR)检测,对筛选出关键基因的mRNA表达水平进行验证。采用SPSS 22.0软件对数据进行统计学分析。结果:GSE107624数据库中CRSwNP患者与对照组上皮细胞中差异基因为3 856个,GSE69093数据库中为771个。在2个数据库中,CRSwNP患者鼻黏膜上皮细胞同时表达上调的基因共55个,表达下调的基因共3个。对这58个基因进行GO基因功能注释分析发现 SPTBN1、 FNBP1L、 VAPB、 SNX1参与细胞黏附功能, MAP1B参与微管相关复合体构成;京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析发现 BAMBI、 SIAH1参与调节果蝇无翅/整合素(Wingless/Integrated,Wnt)通路, COL6A1、 EIF4E参与调节磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(PI3K-AKT)通路;String蛋白相互作用网络分析发现微管相关蛋白1B(microtubule associated protein 1B,MAP1B)、VAMP相关蛋白B和C(VAMP associated protein B and C,VAPB)为核心功能蛋白。对筛选出差异倍数前3位基因( COL6A1、 MAP1B和 BAMBI)进行Q-PCR验证, MAP1B在CRSwNP患者鼻黏膜上皮细胞表达水平升高。 结论:CRSwNP鼻黏膜上皮细胞中表达水平升高的 MAP1B基因,以及相关的Wnt、PI3K-AKT信号通路调控异常可能介导了CRSwNP鼻黏膜上皮细胞屏障功能障碍。
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编辑人员丨1周前
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基于Hippo信号通路探究自噬在脓毒症ARDS肺损伤中的作用机制
编辑人员丨1周前
各种致病因素所致全身炎症反应是急性呼吸窘迫综合征(ARDS)发生发展的关键阶段,目前临床上抑制炎症反应和对症支持是治疗ARDS的主要方法。肺泡上皮细胞自噬在ARDS炎症反应中具有重要的调节功能,细胞自噬本身是体内正常的免疫机制,是吞噬细胞借助溶酶体降解细胞内成分维持胞内稳态的代谢过程。目前研究表明,肺内外致病因素可通过引发炎症反应促使肺泡上皮细胞形成缺氧、饥饿、感染甚至凋亡的不利内环境,导致自噬功能紊乱,而过度的自噬激活可继续加重炎症反应。自噬相关蛋白Beclin1、微管相关蛋白1轻链3(LC3)、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、p62等是目前研究中常见的自噬标志物,在调控自噬过程及肺损伤发展中起着至关重要的作用,因此细胞自噬基因表达可作为脓毒症ARDS肺损伤的早期标志物及重要机制。Hippo通路来源于果蝇中的蛋白激酶Hippo,Hippo和自噬这两条保守的通路对于维持体内平衡至关重要。Hippo信号通路与细胞自噬的相互调控是目前学术界的热门话题,本文对相关文献进行回顾,探讨Hippo信号通路是否能够通过调控细胞自噬来缓解脓毒症ARDS的炎症反应,从而为ARDS治疗提供更进一步的研究方向。
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编辑人员丨1周前
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胃腺癌组织中果蝇激酶、程序性死亡受体1、人表皮生长因子受体-2及基质金属蛋白酶-9的表达及意义分析
编辑人员丨1周前
目的:探讨胃腺癌组织中果蝇激酶(DEK)、程序性死亡受体1(PD-L1)、人表皮生长因子受体-2(Her-2)及基质金属蛋白酶-9(MMP-9)的表达及意义。方法:将厦门大学附属第一医院从2013年2月至2015年2月收治的胃腺癌患者112例纳入研究。分别采集胃腺癌组织以及癌旁正常组织,以免疫组织化学法检测不同胃组织中的DEK、PD-L1、Her-2及MMP-9表达。并分析上述各项蛋白表达和胃腺癌患者临床病理特征的关系。此外,将胃腺癌患者按照5年生存状况的差异分作死亡组32例和存活组80例,比较两组DEK、PD-L1、Her-2及MMP-9表达情况。并以受试者工作特征(ROC)曲线分析DEK、PD-L1、Her-2及MMP-9诊断胃腺癌的效能。组间比较采用 t或 χ2检验。 结果:胃腺癌组织中DEK、PD-L1、Her-2及MMP-9的阳性率分别为73.32%、59.82%、16.07%、73.21%,均明显高于癌旁正常组织的37.50%、26.79%、0.00%、39.29%,差异均有统计学意义( χ2=26.195, P<0.05)。胃腺癌分化程度为低分化、有淋巴结转移患者的DEK、PD-L1、Her-2及MMP-9阳性率均高于分化程度为中+高分化、无淋巴结转移患者,差异均有统计学意义( χ2=1.461, P<0.05)。胃腺癌死亡患者DEK、PD-L1、Her-2及MMP-9阳性率分别为87.50%、81.25%、46.88%、93.75%,均明显高于存活患者的66.25%、51.25%、3.75%、65.00%,差异均有统计学意义( χ2=9.634, P<0.05)。经ROC曲线分析可得,DEK、PD-L1、Her-2及MMP-9联合检测诊断胃腺癌的曲线下面积、灵敏度、特异度均高于上述各项指标单独诊断。 结论:胃腺癌组织中DEK、PD-L1、Her-2及MMP-9均存在异常高表达,且和分化程度以及淋巴结转移密切相关。
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编辑人员丨1周前
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Pax2基因异常参与孤独症谱系障碍发病的生物信息学分析
编辑人员丨1周前
目的:对配对盒2( Pax2)相关孤独症谱系障碍(ASD)易感基因进行生物信息学分析,探讨 Pax2基因参与ASD发病的可能机制。 方法:(1)将Pathway Commons数据库中与 Pax2基因相关的基因(606个)和Simons基金会孤独症研究计划(SFARI)数据库中ASD易感基因(1 023个)取交集得到65个 Pax2基因相关ASD易感基因。在基因功能分析网站Metascape对 Pax2基因相关ASD易感基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape软件cytoHubba插件的最大团中心度(MCC)算法,筛选前10个核心 Pax2基因相关ASD易感基因。(2)取3只13周龄雄性Pax2-nestin小鼠(实验组)及3只同龄雄性C57 BL/6J小鼠(对照组),采用Western blotting实验检测2组小鼠海马组织中谷氨酸受体2B亚基(GluN2B)蛋白的表达。 结果:(1)GO分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因在生物学过程(BP)本体主要富集于跨突触信号、行为、脑发育、化学突触传递的调节、胶质细胞再生、小脑形态发育、谷氨酸能突触传递、记忆等子集,在细胞组分(CC)本体主要富集于突触后、树突、β连环蛋白-T细胞因子(TCF)复合物、树突分支等子集,在分子功能(MF)本体主要富集于突触后密度蛋白95/果蝇圆盘大肿瘤抑制蛋白/紧密连接带-1蛋白(PDZ)结合结构域、转录因子结合、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活性、谷氨酸受体活性、微管蛋白结合等子集。KEGG通路富集分析显示 Pax2基因相关ASD易感基因主要分布在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、长时程抑制、谷氨酸能突触等通路。核心 Pax2基因相关ASD易感基因为 Gria1、 Dlg2、 Ntrk2、 Grid2、 Igf1、 Jmjd1c、 Ldb1、 Tcf4、 Tcf7l2、 Adrb2。(2)Western blotting实验显示,对照组、实验组小鼠海马组织中GluN2B蛋白的相对表达量分别为2.36±0.60、0.85±0.44,差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:Pax2基因异常可能导致 Pax2基因相关ASD易感基因的表达或功能异常,并通过多种机制参与ASD的发病。
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编辑人员丨1周前
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滤泡淋巴瘤分子靶向治疗的研究现状
编辑人员丨1周前
滤泡淋巴瘤(FL)是最常见的惰性非霍奇金淋巴瘤(NHL),该病进展缓慢,但绝大多数患者最终进展为复发/难治性(R/R)FL。近年,得益于各种新型靶向药物的出现,FL患者的预后获得明显改善。其中,CD20单克隆抗体和Bruton酪氨酸激酶(BTK)抑制剂已被广泛应用于FL患者的临床治疗,而磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)抑制剂、B细胞淋巴瘤/白血病(BCL)-2抑制剂和果蝇zeste基因增强子人类同源物(EZH)2抑制剂等,在临床试验中亦对FL患者显示出良好疗效。笔者拟就已获得批准用于临床和正在进行临床试验的多项分子靶向药物治疗FL的研究现状进行阐述,以期为FL的临床治疗提供参考。
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编辑人员丨1周前
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Hippo信号通路在免疫反应中的相关研究进展
编辑人员丨1周前
Hippo信号通路也称为Salvador/Warts/Hippo(SWH)通路,命名主要源于果蝇中的蛋白激酶Hippo(Hpo)。该通路由一系列保守激酶组成,主要是通过调控细胞的增殖和凋亡来调控器官的大小。近年来,研究Hippo信号通路在免疫系统以及癌症发生中的作用已成为热点,并且已有多项研究报道其可以调控免疫反应,包括先天性免疫系统和适应性免疫系统中各免疫细胞的功能,影响免疫应答的效果。文章总结了近年来Hippo信号通路在各种免疫细胞及一些免疫应答过程中发挥的作用,探讨了Hippo信号通路的治疗前景。
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编辑人员丨1周前
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黄酮类中药单体对肺纤维化信号通路调控作用的研究进展
编辑人员丨2023/10/28
肺纤维化是一种慢性、进行性、不可逆的间质性肺疾病,目前尚无治疗肺纤维化的特效药.许多中药单体表现出对肺纤维化具有潜在的治疗价值,其中以黄酮类化合物为主要代表.黄芪总黄酮、灯盏花乙素等可通过干预转化生长因子-β/果蝇MAD蛋白信号通路减轻炎症细胞浸润,减轻肺损伤和细胞外基质(ECM)沉积;镰形棘豆总黄酮、红景天苷可通过介导JAK/信号转导及转录激活因子信号通路抑制肺组织炎症反应,阻止上皮间质转化(EMT)进程;槲皮素、银杏叶提取物等可通过抑制核因子κB信号通路来减少巨噬细胞凋亡,发挥抗肺纤维化作用;漆黄素、原花青素可通过磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号通路,促使肌成纤维细胞形态学恢复,减少ECM沉积;柚皮素、木犀草素可通过NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3信号通路抑制巨噬细胞焦亡和炎症反应,改善肺功能及肺组织损伤;余甘子醇提物、毛蕊异黄酮可通过激活核转录因子红系2相关因子2/抗氧化响应元件信号通路,改善肺组织炎症损伤和纤维化;异甘草素则可通过抑制胞外信号调节激酶信号通路阻止上皮细胞表型转化,逆转EMT进展.后续学者可考虑开发适当的药物载体,提高其生物利用度,深入研究药物的作用靶点和途径,为黄酮类中药单体走向临床实践提供依据.
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编辑人员丨2023/10/28
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Hippo-Yap信号通路在肝脏疾病中的作用及其研究进展
编辑人员丨2023/9/2
河马(Hippo)信号通路最初作为一种抑制果蝇组织生长的通路被发现,主要由MST1/2、LATS1/2和Yap/TAZ三种激酶级联组成.随着研究的进展,在哺乳动物中Hippo信号通路的同源基因也得到了证实,并且在控制器官大小和其他生理功能当中也发挥着关键的作用.Hippo信号通路主要通过调控Yap的核移位发生相应的作用.当Hippo信号通路的上游激酶失活时,Yap/TAZ被去磷酸化并且能够作为转录共激活因子进入细胞核,与相应的转录因子结合发挥作用.既往Hippo-Yap信号通路研究主要集中于细胞命运、新陈代谢、肿瘤发生和免疫系统等方面.随着研究的逐步深入以及肝脏疾病的发生率逐步升高,Hippo信号通路在肝脏疾病的发生与发展过程中的相关研究取得一定的进展.笔者从多种临床常见相关肝脏疾病(胆汁淤积性肝损伤、肝缺血再灌注损伤、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病、对乙酰氨基酚诱导肝损伤、肝纤维化以及肝癌)阐述Hippo-Yap信号通路在其中所发挥作用.
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编辑人员丨2023/9/2
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莫特塞尼与EZH2抑制剂GSK126联合应用对肝癌Huh7细胞增殖和凋亡的影响及其机制
编辑人员丨2023/8/26
目的:探讨多激酶抑制剂莫特塞尼联合果蝇zeste基因增强子的人类同源物2(EZH2)抑制剂GSK126对肝癌Huh7细胞体外增殖和凋亡的影响,初步阐明其相关机制.方法:不同浓度(0、1、5、10、20、40和60 μmol·L-1)莫特塞尼处理Huh7细胞,采用CCK-8法检测各组Huh7细胞增殖率,采用Western blotting法检测不同浓度(0、2.5、5.0、10.0和20.0 μmol·L-1)莫特塞尼组Huh7细胞中EZH2和磷酸化EZH2(p-EZH2)蛋白表达水平.莫特塞尼和GSK126联合作用于Huh7细胞,采用CCK-8法和克隆形成实验确定后续实验合适的药物浓度.Huh7 细胞分为对照组、莫特塞尼(10 μmol·L-1)组、GSK126(5 μmol·L-1)组和联合组(莫特塞尼+GSK126),采用 5-乙炔基-2'脱氧尿嘧啶核苷(EdU)荧光染色法检测各组Huh7细胞增殖率,流式细胞术检测各组Huh7细胞凋亡率,Western blotting法检测各组Huh7细胞中细胞外信号调节激酶(ERK)、磷酸化ERK(p-ERK)、蛋白激酶B(AKT)和磷酸化AKT(p-AKT)蛋白表达水平.结果:CCK-8法检测,不同浓度莫特塞尼组Huh7细胞存活率随着药物浓度升高逐渐降低,与 0 μmol·L-1 莫特塞尼组比较,20、40 和60 μmol·L-1 莫特塞尼组Huh7细胞增殖率明显降低(P<0.05或P<0.01);Western blotting法检测,与0 μmol·L-1莫特塞尼组比较,5.0、10.0和20.0 μmol·L-1莫特塞尼组Huh7细胞中EZH2和p-EZH2蛋白表达水平明显升高(P<0.01).通过 CCK-8 法和克隆形成实验确定10 μmol·L-1 莫特塞尼和5 μmol·L-1 GSK126用于后续实验.与对照组比较,莫特塞尼组、GSK126组和联合组Huh7细胞增殖率明显降低(P<0.01),细胞凋亡率明显升高(P<0.05或P<0.01);与莫特塞尼组和GSK126组比较,联合组Huh7细胞增殖率明显降低(P<0.01),细胞凋亡率明显升高(P<0.01).与对照组、莫特塞尼组和GSK126组比较,联合组Huh7细胞中p-AKT和p-ERK蛋白表达水平明显降低(P<0.05或P<0.01).结论:单独应用莫特塞尼抑制肝癌Huh7细胞增殖和促进凋亡效果不明显,可能与EZH2升高导致细胞耐药有关.莫特塞尼与GSK126联合应用可通过抑制AKT和ERK信号通路,增强莫特塞尼对肝癌Huh7细胞的增殖抑制和促凋亡作用.
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编辑人员丨2023/8/26
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FOXM1、PLK1、HIF-1α及EZH2在乳腺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨叉头框转录因子M1(FOXM1)、Polo样激酶1(PLK1)、缺氧诱导因子1α(HIF-1α)及果蝇Zeste基因增强子人类同源物2(EZH2)在乳腺癌组织中的表达及临床意义.方法 采用免疫组化法检测FoxM1、PLK1、HIF-1α及EZH2蛋白在803例乳腺浸润性导管癌和癌旁乳腺组织中的表达情况及其与乳腺癌组织临床病理特征间的关系.结果 FOXM1、PLK1、HIF-1α及EZH2在乳腺浸润性导管癌组织中的阳性表达率分别为59.78%、27.90%、43.96%和60.40%,显著高于其在癌旁乳腺组织中的表达(29.89%、0%、3.86%、20.92%),差异具有统计学意义(P<0.05).FOXM1、PLK1、HIF-1α及EZH2的表达与乳腺癌的组织学分级、淋巴结转移及临床分期相关,与患者年龄、是否绝经及肿瘤大小无关(P>0.05).PLK1、HIF-1α和EZH2蛋白的表达均与ER呈负相关关系,FOXM1和EZH2蛋白的表达与HER-2呈正相关关系(P<0.01).FOXM1、PLK1、HIF-1α和EZH2蛋白的表达均具有正相关关系(P<0.01).结论 FOXM1、PLK1、HIF-1α及EZH2可能协同参与了乳腺癌的发生、发展,并可能成为乳腺癌预后评估的重要指标.
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编辑人员丨2023/8/6