新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)是禽类最重要的疫病病原之一,其中基因Ⅵ型NDV在鸽群广泛流行,给养鸽业造成了严重的经济损失.为深入了解基因Ⅵ型NDV在世界不同地理区域和宿主间的传播动态,本研究通过病毒分离鉴定、高通量测序、完整F基因系统发育树构建和贝叶斯系统动力学等方法进行综合分析,结果获得4株广西NDV分离株,均为基因Ⅵ型.进一步的时空分析显示,基因Ⅵ型NDV最近的共同祖先时间为1972年(95％置信区间:1965～1978),估计进化速率为1.43×10-3 substitution/site/year(95％置信区间:1.27×10-3～1.59×10-3);意大利是欧洲基因Ⅵ型NDV早期的外溢传播中心,该病毒从欧洲传播至我国,随后华东和华南成为我国的主要传播中心;病毒存在从鸽(Columba livia)到野鸟和鸡(Gallus gallus)、从野鸟到鹌鹑(Coturnix coturnix)等的跨物种传播,但病毒传播最重要的宿主是鸽.分析结果表明基因Ⅵ型NDV正快速进化,有作为突变库的潜在威胁.基于"One Health"理念,应在全球范围内加强主动监测,改善家禽管理策略,避免不同家禽之间及不同家禽与野鸟之间的直接和间接接触.这些信息有助于了解基因Ⅵ型NDV的起源、传播与进化,为制定相应防控策略提供科学依据.

禽流感是由正黏病毒科A型流感病毒属中的禽流感病毒（avian influenza virus，AIV）引起多种禽类及野鸟的一种感染和/或疾病综合征。自1997年香港报告全球首例H5N1亚型高致病性禽流感感染人病例，多种亚型AIV跨越种间屏障感染人事件层出不穷，对公共卫生安全造成持续威胁。回顾历次禽流感感染人案例发现，人类感染病例的源头主要为携带AIV的禽类，感染途径多为"禽-人"或"禽-环境-人"，感染症状因AIV致病力不同而有所差异。分子特征分析显示，当前流行于禽群中的AIV多数已发生促进跨种传播的关键变异。鉴于AIV对公共卫生的威胁性，一方面需持续开展AIV的流行病学调查工作，实时监测病毒流行动态；另一方面要深入开展病毒跨宿主感染机制研究，系统阐明决定病毒跨宿主感染的关键因素，从源头防控AIV对家禽养殖业和公共卫生的威胁。

自20世纪70年代以来，全球新发传染病超过40种，而其中动物源头的病毒感染超过70%。跨物种传播是病毒从动物宿主转移至人间流行的重要方式，也是病毒学家研究的热点。此文以近年新发传染病的研究为例，综述了病毒跨物种传播的特征和致病机制的研究进展，并提出了针对防控跨物种传播而导致新发传染病的建议。

冠状病毒(Coronavirus, CoV)是一类古老的、广泛存在的、对人类和其他动物健康构成严重威胁的传染病病原体。目前已鉴定能感染人的冠状病毒(human CoV, HCoV)共有7种。已证实：这些可感染人的冠状病毒均为动物源性的人畜共患病原体，通过跨越种间屏障，从自然宿主以直接或间接的方式"跳跃"到人群，并进一步造成人际间的传播和流行。冠状病毒刺突蛋白(Spike, S)S1亚基上的受体结合区(receptor binding domain, RBD)是决定冠状病毒跨种传播、侵入宿主的关键因素之一。本文就近年来7种HCoVs传播路径以及介导跨种传播的RBD结构研究进展进行总结和分析，以期获得对冠状病毒跨种传播机制的认识，为我们应对潜在的新型冠状病毒跨种传播事件，提供有效的防控和治疗策略。

目的:利用纳米孔测序技术对新型重组H3N2禽流感病毒进行测序鉴定并分析病毒的基因特征。方法:对2021年广州市某农贸市场外环境H3N2禽流感阳性样本进行鸡胚培养，联合病毒全基因组序列靶向扩增和纳米孔测序技术进行病毒高通量测序。通过生物信息学软件，分析病毒基因特点。结果:系统发育进化树显示，该毒株各基因片段均属于欧亚进化分支，宿主来源均为禽源。其HA基因与我国H3N6禽流感病毒亲缘关系较近。NA基因与2017-2020年我国H3N2禽流感病毒亲缘关系较近。PB1基因与2016-2022年我国广西壮族自治区、福建省H5N6禽流感病毒亲缘关系较近，与广州市H5N6禽流感流行株PB1基因亲缘关系较远。其余内部基因片段来源复杂，具有明显的遗传多样性。分子特征显示，该毒株具有典型的低致病性禽流感病毒分子特征，倾向结合禽源受体。生物特性相关重要蛋白位点上，该毒株发生PB2-L89V、PB1-L473V、NP-A184K、M1-N30D/T215A、NS1-P42S/N205S等致病性增强突变。结论:本研究通过纳米孔测序鉴定一株新型重组H3N2禽流感病毒，分析发现该病毒与H5N6禽流感病毒发生了基因重组。目前该病毒跨种传播能力较低，但有必要密切关注H3亚型禽流感病毒的流行和变异。

病原体在多种宿主间跨种传播是一个复杂的动力学过程，对传染病早期预警系统的可靠性提出严峻挑战。本文通过介绍传染病生态学理论方法，回顾和总结了通过环境-宿主-传染病动态数学模型研究病原体、宿主以及环境的交互作用，量化环境对疫情趋势、传播媒介以及病原微生物影响的研究范式；并以我国姬鼠型肾综合征出血热研究为例，介绍了传染病数学模型在疫情实际预测预警中的应用，进一步发展了新的监测指标与预警方法。

伪狂犬病毒（PRV）是一种猪疱疹病毒，可感染多种动物，其中猪是PRV的天然宿主。PRV自发现以来已在全球范围内传播，对养猪业造成重大经济损失。近年来，人感染PRV的病例屡有报道，提示PRV存在跨种属感染人的风险。随着对PRV病原特征的进一步分析和对PRV致病机制的深入了解，避免PRV变成人类传染病成为当前研究和防控工作重点。为了解PRV变异特征，本研究从PRV变异特征、流行特征方面综述了最新研究进展，以期为更好地开展相关防控工作提供依据。

戊型肝炎是由HEV引起的常见传染病，它的动物宿主比较广泛，在散发性病例发生过程发挥重要作用。研究HEV动物宿主、实验感染动物模型，对戊型肝炎的防控、HEV致病机制、跨物种传播、疫苗及治疗方案评估等相关研究具有现实意义。本文将对HEV常见动物宿主、实验感染动物模型进行综述。

戊型肝炎是由戊型肝炎病毒（HEV）引起的一种重要的人畜共患性传染病。该病主要由被污染的水或食物经粪口传播途径扩散，且可跨种属间传播。该病致病原HEV为肝炎病毒科成员，是单正链RNA病毒。其7.2 kb基因组主要包含三个开放阅读框（ORF）：ORF1编码介导病毒复制和转录的非结构多聚蛋白；ORF2编码诱导中和抗体的衣壳蛋白和游离抗原；ORF3与ORF2部分重叠，编码参与病毒粒子形成和释放的多功能小蛋白。HEV具有独特的双重生命周期：以裸病毒粒子形式排入粪便，但以"准囊膜"粒子形式在血液中循环。两种病毒粒子以不同方式吸附、穿入宿主细胞，随后内化脱壳，进行基因组复制，产生更多病毒粒子释放至胞外，介导病毒扩散传播。现对HEV的病毒粒子形态特征、基因组结构、编码蛋白及其功能进行论述，以期为该病的基础研究和综合防控提供理论基础。

蝙蝠是唯一会飞行的哺乳动物，种类繁多，分布广泛，是多种病毒的自然储存宿主。2019年12月以来新型冠状病毒肺炎COVID-19以及其病原体SARS-CoV-2的发现，再次引发人们对蝙蝠冠状病毒的关注。本文对蝙蝠来源冠状病毒与人冠状病毒的关系进行综述。