目的:探讨同源盒家族中的人类同源盒C6(HOXC6)基因在前列腺癌中的表达情况及其对前列腺癌细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响及机制.方法:应用基于基因表达水平值的交互式分析平台(GEPIA)数据库中关于HOXC6 研究的数据,对其在前列腺癌中的表达水平变化进行分析.采用GEPIA数据库分析HOXC6 表达水平与前列腺癌患者生存预后之间的关系.通过Western印迹检测HOXC6 蛋白在前列腺癌组织、正常前列腺组织及不同前列腺癌细胞株 DU-145、PC-3 以及正常人前列腺上皮细胞 RWPE-1 中的表达情况.在人前列腺癌细胞DU145、PC-3 和正常人前列腺上皮细胞RWPE-1 中,利用siRNA质粒稳定干扰HOXC6 基因表达,采用CCK8、平板克隆、划痕、Transwell侵袭实验检测HOXC6 基因对前列腺癌细胞增殖、迁移、侵袭能力的影响.通过GEPIA数据库分析Wnt抑癌因子分泌型卷曲相关蛋白 1(SFRP1)基因与 HOXC6 的相关性,采用 Western 印迹检测 HOXC6-siRNA转染后PC-3 细胞中HOXC6、SFRP1、Wnt及β-catenin蛋白表达.结果:HOXC6 在前列腺癌组织中的表达高于正常前列腺组织(P<0.01),在前列腺癌细胞中的表达高于正常前列腺上皮细胞(P<0.01).结合生物信息学分析,HOXC6 高表达的PCa患者比低表达的生存率低(P=0.011).siRNA组HOXC6 蛋白相对表达量、吸光度值、克隆形成数、侵袭细胞数低于阴性对照组,差异有统计学意义(P<0.05).通过GEPIA数据库发现SFRP1 高表达的前列腺癌患者预后较好,在体外实验中,前列腺癌PC-3 细胞系中,Western印迹分析Wnt及β-catenin蛋白的表达均上升,SFRP1 蛋白表达明显下降(P<0.05);与siRNA-NC、前列腺癌PC-3 相比,siRNA-HOXC6 转染组中的Wnt及β-catenin蛋白的表达均明显下降,SFRP1 蛋白表达上升(P<0.05).结论:HOXC6 在前列腺癌组织中高表达,并与前列腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭有关;HOXC6 通过抑制 SFRP1/Wnt/β-catenin信号通路从而促进前列腺癌DU145、PC-3 细胞的生长,HOXC6 有可能是临床治疗前列腺癌的潜在靶标.

目的:对利用生物信息学方法筛选的肾上腺皮质癌（ACC）肿瘤微环境（TME）相关基因构建的预后模型进行验证，为ACC的诊疗提供临床指导和相关生物标志物。方法:从癌症基因组图谱（TCGA）数据库中收集79例ACC患者的转录组数据和临床病理数据。采用ESTIMATE算法计算免疫评分、基质评分（二者即反映TME）和ESTIMATE评分，应用VennDiagram包对免疫评分及基质评分高、低评分组（以中位值进行分组）间差异表达基因进行选择，采用基因本体（GO）数据库和京都基因与基因组百科全书（KEGG）数据库对选择的基因进行功能富集分析，探索基因潜在功能与通路。采用单因素Cox回归、lasso回归和多因素Cox回归分析筛选与ACC TME相关的基因，并建立ACC患者预后的风险评分（RS）模型，用受试者工作特征（ROC）曲线评价构建的模型预测ACC患者预后的价值。以基因表达综合（GEO）数据库的数据集GSE33371和GSE19750作为外部验证集，对建立的预后模型进行验证。从TCGA数据库中提取79例ACC患者资料，将临床病理因素与所构建预后模型的RS纳入Cox回归分析，获得ACC患者预后影响因素。结果:根据免疫评分和基质评分，用VennDiagram包筛选得到1 205个二者交集的差异表达基因，其中上调833个，下调372个。对差异表达基因进行各回归分析筛选后，最终构建成功包含9个TME相关基因（GREB1、POU4F1、HIC1、HOXC9、CACNB2、RAB27B、ZIC2、C3、CYP2D6）的ACC预后模型，即RS=GREB1×0.223 6+POU4F1×0.671 7+HIC1×0.167 5+HOXC9×0.211 3+CACNB2×0.156 0+RAB27B×0.956 5+ZIC2×0.582 7+C3×（-0.003 1）+CYP2D6×0.819 3。该模型在TCGA数据库中预测79例ACC患者1、3、5年总生存的ROC曲线下面积（AUC）分别为0.876、0.919、0.917，在GEO验证集中预测45例ACC患者1、3、5年总生存的AUC分别为0.689、0.704、0.708，表明模型对ACC患者生存具有较高的预测准确性。对TCGA数据库中79例ACC患者资料进行Cox回归分析显示，TME相关基因预后模型RS是ACC患者预后的独立影响因素（ HR=1.011，95% CI 1.005~1.016， P<0.01）。 结论:构建的ACC TME相关基因预后模型可用于预测ACC患者的预后。模型中包含的9个基因有可能作为研究ACC发病机制和免疫治疗的新靶点，值得进一步研究。

目的:探讨HOXC-AS3和YBX1在胃癌中表达水平与患者临床病理特征和预后的关系。方法:选取2019年6月至2022年6月南阳市中心医院收集的101例胃癌和癌旁组织作为研究对象，采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测胃癌组织和癌旁组织中HOXC-AS3表达水平；采用蛋白质印迹法(Western blot)分析胃癌组织和癌旁组织YBX1表达水平；相关性分析HOXC-AS3和YBX1表达的关系；分析不同性别、年龄、肿瘤大小、分化程度、临床分期和淋巴结转移等病理特征HOXC-AS3和YBX1表达水平。利用Kaplan-Meier法分析不同HOXC-AS3和YBX1水平与患者3年累积生存率的关系，采用多因素Cox回归风险模型分析胃癌患者的预后影响因素。结果:胃癌组织中HOXC-AS3表达水平(2.26±0.41)明显高于癌旁组织表达水平(1.19±0.23)，差异有统计学意义( t＝22.870， P<0.05)。胃癌组织中YBX1蛋白表达水平(2.17±0.46)明显高于癌旁组织表达水平(1.49±0.21)，差异有统计学意义( t＝213.680， P<0.05)。胃癌组织中HOXC-AS3表达水平与YBX1蛋白表达水平呈正相关，差异有统计学意义( r＝0.425， P<0.05)。低分化患者胃癌组织HOXC-AS3和YBX1表达水平(2.45±0.32、2.39±0.35)明显高于中高分化患者(2.02±0.37、1.91±0.43)，差异有统计学意义( t＝6.247、6.224， P<0.05)。转移患者胃癌组织HOXC-AS3和YBX1表达水平(2.45±0.31、2.35±0.43)明显高于癌旁组织表达水平(1.84±0.26、1.79±0.20)，差异有统计学意义( t＝9.603、6.923， P<0.05)。HOXC-AS3低表达组患者3年生存率累计生存率[61.54%(32/52)]明显高于高表达组患者[40.82%(20/49)]，差异有统计学意义(LogRank＝7.521， P<0.05)。YBX1低表达组患者3年累计生存率[68.00%(34/50)]明显高于高表达组患者[39.22%(20/51)]，差异有统计学意义(LogRank＝8.328， P<0.05)。Cox回归分析显示HOXC-AS3和YBX1表达水平是影响胃癌患者预后的危险因素( P<0.05)。 结论:HOXC-AS3和YBX1水平在胃癌组织中呈高表达，其表达水平与分化程度、淋巴结转移和预后密切相关。

目的:探索转录因子（transcription factors, TFs）和结肠癌预后的联系，通过TCGA和GEO双数据库构建预后模型，从而量化患者的风险并指导临床治疗决策。方法:本研究运用TCGA和GEO数据库中结肠癌的转录组和临床数据，先将转录组数据进行基因注释并计算基因表达量，对TCGA和GEO中TFs行差异性分析（| log2FC| >1，P-Value（Fdr）<0.05）。取双数据交集的差异TFs行相关预后分析（ P<0.01）。利用COX多因素分析计算出预后相关TFs的风险系数和其风险值，应用"survival"和"glmnet"包进行COX模型构建TFs预后模型。绘制出序列集和验证集的生存曲线（ P<0.001）及ROC曲线（AUC>0.75），对风险值的分布进行可视化。按风险值分组后计算GSEA富集分析，构建基因集网格，进行靶基因预测，最后进行GO和KEGG的通路富集分析。 结果:取TCGA和GEO数据库两者交集的387个表达差异的TFs绘制热图，火山图及TFs相关的森林图，按照COX多因素分析构建出结肠癌预后模型=0.310×HSF4+0.137×IRX3-0.127× ATOH1+0.290×OVOL3+0.137×HOXC6+0.155×SIX2+0.092×ZNF556-0.444×CXXC5+0.429×TIGD1+0.413×TCF7L1。通过富集分析，结果显示这些预后因子可能直接或间接作用于癌通路，如基础细胞癌与癌症信号通路、局部组织与细胞黏附及细胞外基质等。结论:构建的TFs对结肠癌预后模型可量化结肠癌预后风险，其高风险组是结肠癌预后的独立风险因素，该模型是一种评估结肠癌预后的新方式。

目的:通过生物信息学方法挖掘与卵巢上皮性癌（卵巢癌）耐药相关的可作为竞争性内源RNA（ceRNA）的长链非编码RNA（lncRNA），并进行临床验证。方法:（1）挖掘与卵巢癌相关的lncRNA并构建ceRNA调控网络：综合应用文本挖掘、数据预测和网络构建等生物信息学方法，建立与卵巢癌耐药相关的潜在ceRNA调控网络，即lncRNA-微小RNA（miRNA）-mRNA调控网络。（2）临床验证：收集2008年6月至2016年10月在广西医科大学附属肿瘤医院行肿瘤细胞减灭术的卵巢癌患者共95例，其中铂类药物耐药患者54例（耐药组），铂类药物敏感患者41例（敏感组），采用实时荧光定量PCR技术检测两组卵巢癌组织中lncRNA的表达，分析lncRNA表达对卵巢癌患者预后的影响，并分析lncRNA表达对卵巢癌耐药的诊断效能。结果:（1）文本挖掘初步筛选出25个与卵巢癌发生、发展相关的差异表达lncRNA；亚细胞定位分析发现，有8个lncRNA存在于细胞质中；通过进一步数据挖掘、共线文献分析，预测其中的两个lncRNA分子［即生长阻滞特异性转录因子5（GAS5）和HOXC基因座转录因子（HOTAIR）］可作为关键ceRNA分子；构建ceRNA调控网络，GAS5与miRNA（即miR139-5p、miR-24-3p）及mRNA［即乳腺癌易感基因1（BRCA1）、肿瘤蛋白p53（TP53）、表皮生长因子受体（EGFR）、B细胞淋巴瘤2基因（BCL-2）、细胞癌基因（FOS）、H-Ras蛋白（HRAS）］组成ceRNA调控网络，HOTAIR与miRNA（即miR-30a-5p）及mRNA［即磷酸肌醇3激酶调控亚基2（PIK3R2）、TP53、丝蛋白（VIM）］组成ceRNA调控网络。（2）实时荧光定量PCR技术检测显示，与敏感组（设为1.0）比较，耐药组卵巢癌组织中GAS5的表达水平为2.1±1.6，HOTAIR的表达水平为3.5±1.9，两组分别比较，差异均有统计学意义（ P=0.011， P<0.01）；Cox回归模型多因素分析显示，GAS5、HOTAIR表达为影响卵巢癌患者无病进展生存率和总生存率的独立危险因素（ P<0.05）。GAS5与HOTAIR联合检测诊断卵巢癌的受试者工作特征（ROC）曲线下面积（AUC）为0.871，显著高于GAS5单独检测和HOTAIR单独检测（AUC分别为0.678、0.863），分别比较，差异均有统计学意义（ P均<0.05）。 结论:GAS5与HOTAIR高表达与卵巢癌耐药密切相关，可作为卵巢癌化疗反应的潜在预测指标；GAS5与HOTAIR联合检测对卵巢癌患者具有一定的诊断效能。这种利用ceRNA调控网络预测关键分子的方法，为卵巢癌的诊断和治疗提供了新的思路。

同源盒基因C6(HOXC6)是同源盒基因中的重要成员,是胚胎发育、细胞分化过程的调控基因.HOXC6在肺癌、结直肠癌、前列腺癌等恶性肿瘤中均发现有表达,在细胞增殖、转移、信号转导过程中发挥重要作用.HOXC6为肿瘤发生相关蛋白.本文就HOXC6在恶性肿瘤中的作用研究进展作一综述.

目的 探讨高血压并发冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)患者血清微小核糖核酸-27a-3p(miR-27a-3p)和同源异型盒C6(homeobox C6,HOXC6)水平表达与冠状动脉病变的相关性,为高血压并发冠心病的防治提供一定参考.方法 选取北大荒集团总医院2021年6月～2023年6月接诊的246例高血压患者为研究对象,其中129例高血压并发冠心病患者作为并发组,117例单纯高血压患者作为未并发组.采用实时荧光定量PCR(quantitative real time PCR,qRT-PCR)检测血清miR-27a-3p和HOXC6表达水平;运用Spearmian法分析高血压并发冠心病患者血清miR-27a-3p和HOXC6水平与冠状动脉病变的相关性;多因素Logistic回归分析高血压并发冠心病的影响因素;受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析血清miR-27a-3p,HOXC6水平对高血压并发冠心病的预测价值.结果 并发组高血压病程(6.69±1.35年)、总胆固醇(total cholesterol,TC)(5.96±0.86mmol/L)、低密度脂蛋白-胆固醇(low-density lipoprotein cholesterol,LDL-C)(3.36±0.51mmol/L)均显著高于未并发组(5.87±1.32 年,5.42±0.67mmol/L,2.98±0.48mmol/L),并发组血清 miR-27a-3p(1.35±0.34),HOXC6(1.29±0.33)水平均显著高于未并发组(1.06±0.23,1.03±0.25),差异具有统计学意义(t=4.808,5.454,6.001,7.755,6.911,均 P＜0.05);轻度组、中度组、重度组患者血清 miR-27a-3p(0.54±0.13,1.19±0.31,2.18±0.55)和 HOXC6(0.47±0.12,1.12±0.31,2.13±0.52)表达水平逐渐升高,差异具有统计学意义(F=191.026,191.026,均P＜0.05).高血压并发冠心病患者血清miR-27a-3p,HOXC6与SYNTAX评分具呈正相关性(r=0.563,0.517,均P＜0.05);血清miR-27a-3p[OR(95％CI:1.627(1.177～2.248)]、HOXC6[OR(95％CI):1.715(1.069～2.750)]是影响高血压并发冠心病的独立危险因素(P＜0.05);血清miR-27a-3p和HOXC6联合预测高血压并发冠心病的AUC为0.896(95％CI:0.851～0.931),优于各自单独诊断(Z=2.133,2.815,均P＜0.05).结论 高血压并发冠心病患者血清miR-27a-3p,HOXC6水平均显著升高,且与冠状动脉病变密切相关,二者联合对高血压并发冠心病具有较高的预测价值.

探讨同源异型盒C6(HOXC6)在乳腺癌组织中的表达及临床意义.收集2020年1月至2022年1月经临床病理学确诊的99例乳腺癌患者(乳腺癌组)以及同期经病理确诊的100例乳腺良性病变患者(良性病变组)的病例资料,qRT-PCR法检测血清HOXC6 mRNA水平,免疫组化法分析乳腺癌组织中HOXC6表达情况,与肿瘤标志物指标糖类抗原153(CA153)、癌胚抗原(CEA)对乳腺癌的诊断价值做比较,分析HOXC6表达与CA153、CEA的相关性.体外培养人乳腺癌细胞MCF-7,分为对照组、pcDNA3.1组、pcDNA3.1-HOXC6组,分析HOXC6过表达对MCF-7细胞增殖抑制率、侵袭细胞数、凋亡率的影响.与良性病变组相比,乳腺癌组患者血清HOXC6 mRNA、CA125、CEA水平和组织HOXC6阳性率升高(P＜0.05);乳腺癌组织HOXC6表达与患者病理分期、淋巴结转移有关(P＜0.05);血清HOXC6 mRNA、CA125、CEA诊断乳腺癌的曲线下面积(AUC)为0.844、0.855、0.836;乳腺癌患者血清HOXC6 mRNA与CA125、CEA 均正相关(P＜0.05);与对照组、pcDNA3.1组相比,pcDNA3.1-HOXC6组MCF-7细胞侵袭细胞数升高,增殖抑制率、凋亡率降低(P＜0.05).HOXC6高表达与乳腺癌的发生、发展、预后相关;HOXC6过表达可促进乳腺癌细胞MCF-7增殖,并抑制细胞凋亡.

目的:探讨细胞周期蛋白依赖性激酶抑制蛋白2A(CDKN2A)基因在胰腺癌中的拷贝数变异(CNV)情况及其与胰腺癌患者预后的关系.方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库CNV与RNA Seq V2数据分析CDKN2A基因CNV与其mRNA表达水平的相关性,以及CDKN2A基因CNV对其他基因表达的影响.通过比对TCGA数据库及GTEx数据库比较CDKN2A基因在正常人与胰腺癌患者的表达差异,并分析CDKN2A基因CNV与胰腺癌患者预后的关系.应用DIVAD中基因本体分析(GO分析)联合KEGG对CDKN2A和其相关共表达基因进行功能基因富集分析.结果:通过对TCGA数据库挖掘发现,CDKN2A基因CNV与其mRNA表达呈正相关(Pearson:r=0.102,Spearman:r=0.257).CDKN2A基因CNV胰腺癌中HOXC6、SLC2A1 mRNA表达水平明显升高,GGA2、MTAP mRNA表达水平明显降低(均P<0.05).相关性研究发现,CDKN2A基因与MTAP mRNA呈明显正相关(Pearson:r=0.42,Spearman:r=0.55).通过对GTEx数据库分析,发现CDKN2A基因在胰腺癌组织中表达明显高于正常胰腺组织(P<0.05).携带CDKN2A基因CNV的胰腺癌患者总生存率与无瘤生存率均明显低于不携带该基因CNV的胰腺癌患者(均P<0.05).通过对包括CDKN2A相关共表达基因功能富集分析发现,这些共表达基因的功能主要集中于细胞周期的信号通路.结论:CDKN2A基因CNV在胰腺癌中是一种不良预后因素,可作为预测胰腺癌预后的指标.

目的:胚胎生育过程中因肢体发育异常造成的出生缺陷比率不低, 其相关基因表达模式尚不明确.本实验通过建立实时定量PCR芯片 (Real-time quantitative polymerasechain reaction array, qPCR array) 检测方案, 研究C57BL/6品系小鼠后肢发育相关基因的表达谱.方法:以同源异形盒基因家族 (Hox) 、Wnt5a、配对同源结构域基因 (Pitx1) 、成纤维生长因子 (Fgf8) 、音猬因子 (Shh) 等小鼠肢体发育相关的重要基因制作基因检测表达谱, 以C57BL/6品系怀孕雌鼠为材料, 取胚胎肢芽发育的四个关键时期 (E10.5, E11.5, E12.5, E13.5) 的胎鼠后肢, 利用qPCR array方案检测表达谱中基因的相对表达水平差异.结果:通过已建立的qPCR array检测了C57BL/6品系小鼠胚胎后肢发育时期Hox家族、Wnt5a、Pitx1、Fgf8、Shh等基因的表达差异.以E10.5为对照, 检测出在后肢发育时期基因呈三种表达模式, 即Hoxb6、Hoxb8、Hoxc8、Hoxc9、Hoxc10、Hoxd9和Shh基因的表达水平呈上调;Hoxa11、Hoxa13、Hoxc12、Hoxc13、Hoxd13等基因表达出现下调;Hoxc9、Hoxc10、Hoxc11、Hoxd9、Hoxd12、Fgf8和Pitx1等基因的相对表达量呈先上调后下调的曲线表达模式, 且有少部分基因在小鼠后肢发育时期表达水平无明显变化.结论:Hox家族、Wnt5a、Pitx1、Fgf8、Shh等基因在小鼠后肢发育时期表达, 并且表达模式存在明显差异.