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系统性红斑狼疮患者长链非编码RNA表达变化及其与调节性T细胞相关性的研究
编辑人员丨2天前
目的:通过检测SLE患者长链非编码RNA(lncRNA)的表达变化,初步探索差异表达的lncRNA与调节性T细胞(Treg)数量间的联系,分析Treg相关lncRNA与SLE患者临床特征间的相关性,预测lncRNA调节Treg分化发育的机制,为SLE的治疗提供新思路。方法:收取9例活动期SLE患者外周血,提取PBMCs,用全转录组测序分析PBMCs的lncRNA表达谱,以9名健康人作为对照组,筛选差异表达的lncRNA,采用Pearson检验分析lncRNA与Treg数的相关性,以及Treg相关lncRNA与SLE患者SLEDAI评分、ESR、C3、C4之间的相关性,用miRcode和Targetscan数据库及共表达网络预测Treg相关lncRNA的靶向基因。结果:与健康对照组相比,SLE患者有240个差异表达lncRNA,包括134个高表达的lncRNA( P<0.05),106个低表达的lncRNA( P<0.05),其中ANKRD44-AS1( r=0.74, P=0.022)、LINC00200( r=0.70, P=0.037)、AP001363.2( r=0.78, P=0.014)、LINC02824( r=0.79, P=0.011)的表达量与外周血Treg数目呈正相关,AP000640.1( r=-0.72, P=0.028)、AC124248.1( r=-0.77, P=0.016)、LINC00482( r=-0.83, P=0.005)、MIR503HG( r=-0.96, P<0.001)的表达量与外周血Treg数目呈负相关,在这8种Treg相关lncRNA中,LINC00482( r=-0.73, P<0.05)、MIR503HG( r=-0.76, P<0.05)的表达量与C3呈负相关。与Treg相关的LINC00200、ANKRD44-AS1、AP000640.1通过竞争性结合miRNA或反式调控机制调控信号传导及转录激活因子5(STAT5)、磷脂酶D1(PLD1)、单一顺式结构蛋白X(HOPX)、Runt相关转录因子3(RUNX3)的表达,进而调控Treg的分化发育。 结论:SLE患者lncRNA表达谱发生变化,差异表达的lncRNA与SLE患者Treg数量和功能异常有关,并且Treg相关lncRNA与SLE疾病活动相关,其可能通过竞争性结合miRNA或反式调控机制影响STAT5、PLD1、HOPX、RUNX3的表达,调节Treg功能,参与SLE的发病和疾病进展。
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编辑人员丨2天前
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LncRNA MIR503HG通过调控miR-224-5pCHSY1表达对结肠癌细胞放射敏感性的影响
编辑人员丨2天前
目的:探讨长链非编码RNA微小RNA-503宿主基因(LncRNA MIR503HG)通过调控miRNA-224-5p硫酸软骨素合酶1 (miR-224-5pCHSY1 )的表达对结肠癌细胞放射敏感性的影响。方法:选取2019年3月至2022年1月火箭军特色医学中心收治的48例结肠癌患者为组织样本获取对象,进行回顾性分析,其中男性28例、女性20例,年龄(57.43±5.28)岁。根据放疗后的病灶情况将患者分为放射抵抗组(23例)和放射敏感组(25例)。采用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测2组患者结肠癌组织及各细胞株(CCD841、COLO320、SW480、RKO、HCT116)中LncRNA MIR503HG、miR-224-5pCHSY1的表达情况;构建放射抵抗的结肠癌细胞株HCT116R,将HCT116R细胞株分为过表达LncRNA MIR503HG(MIR503HG)组及其阴性对照组(mimiC-NC)、miR-224-5pCHSY1抑制组(anti-miR-224-5p)及其阴性对照组(anti-miR-NC)、过表达LncRNA MIR503HG+过表达miR-224-5pCHSY1组(MIR503HG+miR-224-5p)、过表达LncRNA MIR503HG+阴性对照组(MIR503HG+miR-NC);通过双荧光素酶报告验证LncRNA MIR503HG与miR-224-5pCHSY1的靶向作用;检测各组细胞的存活分数(SF)和凋亡率。两组间数据的比较使用 t检验。 结果:与放射敏感组相比,放射抵抗组结肠癌组织中LncRNA MIR503HG的相对表达量明显降低(1.40±0.36对0.72±0.17),miR-224-5pCHSY1的相对表达量明显升高(1.06±0.25对1.54±0.27 ),且差异均有统计学意义( t=8.247、6.529,均 P<0.05)。CCD841、COLO320、SW480、RKO、HCT116及HCT116R各细胞株LncRNA MIR503HG的相对表达量分别为2.38±0.06、1.03±0.05、0.87±0.03、0.86±0.02、0.77±0.04、0.54±0.09,miR-224-5pCHSY1的相对表达量分别为0.38±0.06、0.56±0.01、0.59±0.02、0.59±0.05、0.63±0.04、0.82± 0.06,与正常细胞株CCD841相比,结肠癌细胞株COLO320、SW480、RKO、HCT116的LncRNA MIR503HG相对表达量均明显降低( t=2.061、1.665、4.058、6.201,均 P<0.05),miR-224-5pCHSY1的相对表达量均明显增加( t=1.238、1.930、2.037、1.742,均 P<0.05 )。与HCT116细胞株相比,HCT116R的LncRNA MIR503HG相对表达量明显降低[(0.77±0.04)对(0.54±0.09)],miR-224-5pCHSY1的相对表达量明显增加[(0.63±0.04)对(0.82±0.06)],差异均有统计学意义( t=1.267、2.370,均 P<0.05 )。在照射剂量分别为4、6、8 Gy时,MIR503HG组的HCT116R细胞SF明显低于mimic-NC组[(7.25±1.11)%对(11.34±2.65)%、(2.85±0.58)%对(6.08±1.10)%、(0.58±0.05 )%对(3.08±0.84)%],且差异均有统计学意义( t=1.064、1.937、2.650,均 P<0.05 )。过表达LncRNA MIR503HG后,MIR503HG组HCT116R的放射增敏比(SER)为1.399。mimic-NC组、MIR503HG组、mimic-NC+4 Gy组、MIR503HG+4 Gy组的细胞凋亡率分别为(8.10± 0.23)%、(18.44±1.57)%、(17.33±2.35)%、(29.83±1.89)%,与mimic-NC组相比,MIR503HG组、mimic-NC+4 Gy组HCT116R细胞的凋亡率均明显升高,且差异均有统计学意义( t=2.003、1.475,均 P<0.05 )。与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组MIR503HG-Wt的荧光素酶活性明显增加(1.02±0.20对1.60±0.25 ),且差异有统计学意义( t=5.366, P<0.05);miR-224-5pCHSY1与LncRNA MIR503HG结合位点突变后,与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组MIR503HG-Mut的活性无明显变化(0.97±0.25对1.00±0.22),2组间的差异无统计学意义( t=0.291, P> 0.05 )。与mimic-NC组相比,MIR503HG组miR-224-5pCHSY1的表达水平明显降低(1.97±0.13对1.12±0.12),差异有统计学意义( t=3.915, P<0.05)。与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组中miR-224-5pCHSY1的表达水平明显降低(1.99±0.19对0.92±0.18 ),差异有统计学意义( t=2.664 , P<0.05 )。在照射剂量分别为4、6、8 Gy时,anti-miR-224-5p组HCT116R细胞的SF均明显低于anti-miR-NC组[(0.59±0.08 )%对(0.79±0.12)%、(0.39±0.06 )%对(0.67±0.07)%、(0.19±0.04 )%对(0.52±0.04)%],且差异均有统计学意义( t=1.281、2.034、2.911,均 P<0.05)。抑制表达miR-224-5pCHSY1后,anti-miR-224-5p组HCT116R细胞的SER为1.403。anti-miR-NC组、anti-miR-224-5p组、anti-miR-NC+4 Gy组、anti-miR-224-5p+4 Gy组的细胞凋亡率分别为(5.08±0.78)%、(14.48±1.21)%、(13.89±1.36)%、(23.64±1.03)%,与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组与anti-miR-NC+4 Gy组的细胞凋亡率均明显增加,且差异有统计学意义( t= 2.067、1.934,均 P<0.05 );与anti-miR-NC+4 Gy组相比,anti-miR-224-5p+4 Gy组的细胞凋亡率明显增加,差异均有统计学意义( t=4.026 , P<0.05 )。照射剂量为4 Gy时,mimic-NC组、MIR503HG组、MIR503HG+miR-NC组、MIR503HG+miR-224-5p组的SF分别为(0.82±0.17)%、(0.53±0.12)%、(0.54±0.11)%、(0.78±0.15)%,照射剂量为6 Gy时,分别为(0.66±0.13)%、(0.38±0.09)%、(0.35±0.08)%、(0.57±0.10)%,照射剂量为8 Gy时,分别为(0.49±0.10)%、(0.15±0.06)%、(0.13±0.05)%、(0.43±0.11)%,与mimic-NC组相比,照射剂量≥4 Gy时,MIR503HG组HCT116R细胞的SF明显降低( t=1.609、1.533、1.927,均 P<0.05 ),MIR503HG+ miR-NC组HCT116R细胞的SF明显降低( t=1.294、1.490、1.825,均 P<0.05 );与MIR503HG+ miR-NC组相比,照射剂量≥4 Gy时,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R细胞的SF明显增加,且差异均有统计学意义( t=1.573、1.204、1.937,均 P<0.05 ),过表达miR-224-5pCHSY1后,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R细胞的SER为0.825,相比MIR503HG组明显降低。mimic-NC组、MIR503HG组、MIR503HG+miR-NC组、MIR503HG+miR-224-5p组的细胞凋亡率分别为(11.61±2.10)%、(24.97±0.91)%、(24.81±1.27)%、(16.15±1.10)%,与mimic-NC组比较,MIR503HG组和MIR503HG+miR-NC组HCT116R的细胞凋亡率明显增高,且差异有统计学意义( t=2.304、2.159,均 P<0.05 );与MIR503HG+miR-NC组比较,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R的细胞凋亡率明显降低,且差异有统计学意义( t=2.067, P<0.05)。 结论:过表达LncRNA MIR503HG可通过抑制miR-224-5pCHSY1表达增加结肠癌细胞的放射敏感性。
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编辑人员丨2天前
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miR503宿主基因通过调控hsa-miR-503信号通路促进食管鳞癌细胞增殖侵袭和迁移
编辑人员丨2天前
目的:探讨miR503宿主基因(MIR503HG)在食管鳞癌细胞中的功能及机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)的3个食管鳞癌数据集GSE53622、GSE53624、GSE130078中分别提取60例、119例和23例食管鳞癌及其配对癌旁组织的MIR503HG表达资料,从癌症基因组图谱数据库与基因型-组织表达数据库的组合数据集(TCGA+GTEx)中提取81例食管鳞癌组织、271例非配对正常食管组织的MIR503HG表达资料。构建MIR503HG敲降质粒,包装成慢病毒,感染食管鳞癌细胞系KYSE30和KYSE510,筛选出稳定敲降MIR503HG的细胞系。对食管鳞癌细胞KYSE30瞬时转染miRNA的模拟物,以过表达hsa-miR-503-3p和hsa-miR-503-5p。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测MIR503HG、hsa-miR-503-3p和hsa-miR-503-5p的表达水平,细胞计数试剂盒8法和克隆形成实验检测细胞的增殖能力,Transwell实验检测细胞的侵袭、迁移能力,流式细胞术检测细胞周期。裸鼠皮下移植瘤实验检测MIR503HG对食管鳞癌增殖的影响。结果:GEO和TCGA+GTEx数据库资料显示,食管鳞癌组织中MIR503HG的表达高于癌旁组织和正常食管组织(均 P<0.01)。敲降MIR503HG后与shNC组比较,KYSE30和KYSE510细胞的增殖速率均明显受到抑制(均 P<0.001),克隆形成数均降低[shMIR503HG1组和shMIR503HG2组KYSE30细胞的克隆形成数分别为(2.00±1.41)个和(1.33±0.47)个,均 P=0.002;shMIR503HG1组和shMIR503HG2组KYSE510细胞的克隆形成数分别为(174.67±15.97)个和(80.33±6.34)个,均 P<0.001],使KYSE30细胞的侵袭细胞数减少[shMIR503HG1组和shMIR503HG2组侵袭细胞数分别为(75.33±6.02)个和(45.67±7.59)个,均 P<0.001],迁移细胞数减少[shMIR503HG1组和shMIR503HG2组细胞迁移数分别为(244.00±10.23)个和(210.67±13.52)个,均 P<0.001],细胞周期阻滞在G 0/G 1期。皮下移植瘤实验显示,shMIR503HG组小鼠皮下移植瘤明显小于shNC组,shMIR503HG组肿瘤重量为(0.097±0.026)g,低于shNC组[(0.166±0.021)g, P<0.001]。敲降MIR503HG后,shMIR503HG1组和shMIR503HG2组KYSE30细胞中hsa-miR-503-3p的相对表达水平分别为0.66±0.02和0.58±0.00,hsa-miR-503-5p的相对表达水平分别为0.64±0.00和0.68±0.03,均低于shNC组(均 P<0.01)。在敲降MIR503HG后,过表达hsa-miR-503-3p和hsa-miR-503-5p能减弱敲降MIR503HG对KYSE30细胞增殖(均 P<0.001)、侵袭(均 P<0.01)和迁移(均 P<0.001)的抑制作用。 结论:MIR503HG通过调控hsa-miR-503信号通路促进食管鳞癌细胞的增殖、侵袭和迁移,在食管鳞癌中发挥癌基因的功能,可以作为食管鳞癌靶向治疗的一个新的潜在靶点。
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编辑人员丨2天前
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LncRNA MIR503HG靶向miR-32-5p调控ITGA6表达对非小细胞肺癌增殖与迁移的影响
编辑人员丨2024/4/27
目的 探讨长链非编码RNA(LncRNA)MIR503HG、微小RNA(miRNAs)-32-5p、整合素α(ITGA)6在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达及其对NSCLC细胞增殖和迁移的影响.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中提取273例NSCLC患者癌组织及其对应癌旁组织的LncRNA、miRNA及转录组mRNA的芯片数据,R软件中MAX STAT函数包统计分析LncRNA MIR503HG、miR-32-5p、ITGA6在NSCLC中的表达.实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测80例NSCLC患者癌组织标本和NSCLC细胞系中LncRNA MIR503HG、miR-32-5p、ITGA6 mRNA表达.双荧光素酶实验证明LncRNA MIR503HG、miR-32-5p、ITGA6 的关系.依次以 LncRNA MIR503HG-mimic-NC、LncRNA MIR503HG-mimic、miR-32-5p-agomir-NC、miR-32-5p-agomir、LncRNA MIR503HG-mimic+miR-32-5p-agomir、LncRNA MIR503HG-mimic+miR-32-5p-agomir+pcDNA3.1-ITGA6、miR-32-5p-agomir+pcDNA3.1-ITGA6 转染 H1299 细胞,另设定正常(Normal)组细胞.EDU 染色实验与 Transwell 小室实验检测各组细胞体外增殖与转移活性;裸鼠体内皮下种植肿瘤模型检测细胞体内生长与转移能力.Western印迹检测ITGA6、E-钙黏蛋白(cadherin)和波形蛋白(Vimentin)表达.结果 在线分析结果显示,与癌旁组织和BEAS-2B细胞相比,LncRNA MIR503HG、ITGA6 mRNA在NSCLC组织和NSCLC细胞表达升高,miR-32-5p mRNA下降,差异具有统计意义(均P<0.05).双荧光素酶实验证实LncRNA MIR503HG靶向miR-32-5p表达,miR-32-5p靶向ITGA6表达.过表达LncRNA MIR503HG可增强H1299细胞的体外增殖与转移及体内生长与转移能力,ITGA6和Vimentin表达升高,E-cadherin表达降低,miR-32-5p-agomir可部分逆转这一作用,而pcDNA3.1-ITGA6可部分修复这一逆转作用,差异均具有统计意义(P<0.05).结论 下调LncRNA MIR503HG表达能降低H1299细胞增殖与转移能力,发挥抑癌效应,其机制可能与靶向miR-32-5p调控ITGA6表达水平有关,为NSCLC的治疗提供靶点.
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编辑人员丨2024/4/27
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长链非编码RNA miR503HG在肝细胞癌患者预后评估中的价值研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探究长链非编码RNA miR503HG在肝细胞癌患者预后评估中的价值研究.方法 选择2013年4月-2016年8月在本院就诊的89例肝细胞癌(HCC)患者作为研究对象.采用RT-qPCR法检测肿瘤组织中miR503HG的表达水平.分析miR503HG的表达水平与HCC患者预后的关系.结果 miR503HG在HCC组织的相对表达量为(4.33±1.25),低于癌旁组织(P<0.05).HCC患者3年生存率为47.19%(42/89),病死率为52.81%(47/89).miR503HG在HCC生存组患者中的相对表达量为(5.04±1.08),高于死亡组(P<0.05).miR503HG诊断HCC患者预后的ROC曲线下面积AUC为0.835(95%CI:0.742~ 0.906).miR503HG≤4.41的HCC患者平均无瘤生存时间低于miR503HG>4.41的HCC患者平均无瘤生存时间(P<0.05).miR503HG≤4.41的HCC患者平均总生存时间低于miR503HG>4.41的HCC患者平均总生存时间(P<0.05).Cox单因素及多因素分析结果显示血管侵犯和miR503HG水平与HCC患者无瘤生存时间和总生存时间密切相关.结论 miR503HG与HCC患者预后密切相关.检测miR503HG表达量有助于了解HCC患者预后.
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编辑人员丨2023/8/6
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佛手苷内酯下调miR-503表达抑制高糖诱导的肾小管上皮细胞炎性因子表达和细胞凋亡
编辑人员丨2023/8/5
目的 考察佛手苷内酯(bergapten,BG)是否通过下调miR-503表达抑制高糖(high glucose,HG)诱导的肾小管上皮细胞炎性因子表达和细胞凋亡.方法 将肾小管上皮细胞分为正常对照(Con)组、高糖(HG)组、高糖+BG低、中、高浓度(HG+BG-L、-M、-H)组、HG+inhibitor-NC组、HG+miR-503 inhibitor组、HG+BG+miR-NC组、HG+BG+miR-503组.利用酶联免疫吸附测定法(ELISA)测定炎性因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)表达,流式细胞术测定细胞凋亡,Western印迹测定凋亡蛋白裂解天冬氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶(cleaved-caspase)3、cleaved-caspase 9表达,qRT-PCR测定miR-503表达.结果 HG组肾小管上皮细胞的TNF-α、IL-6表达、凋亡率、cleaved-caspase 3、cleaved-caspase 9蛋白、miR-503表达量均比Con组增加(P均<0.05).HG+BG-L组、HG+BG-M组、HG+BG-H组肾小管上皮细胞的TNF-α、IL-6表达、凋亡率、cleaved-caspase 3、cleaved-caspase 9蛋白、miR-503表达量均比HG组减少(P均<0.05),且BG的抑制作用呈现浓度依赖性.干扰miR-503表达后,HG+miR-503 inhibitor组肾小管上皮细胞的miR-503表达量、TNF-α、IL-6表达、凋亡率、cleaved-caspase 3蛋白、cleaved-caspase 9蛋白均比HG+inhibitor-NC组降低(P均<0.05).HG+BG+miR-503组肾小管上皮细胞的miR-503表达量、TNF-α、IL-6表达、凋亡率、cleaved-caspase 3蛋白、cleaved-caspase 9蛋白表达量均高于HG+BG+miR-NC组(P均<0.05).结论 BG通过下调miR-503的表达,以浓度依赖方式抑制高糖诱导的肾小管上皮细胞炎性因子表达和细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/8/5
