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人蜕膜间充质干细胞来源外泌体对高糖老化人真皮成纤维细胞功能的影响及其可能机制
编辑人员丨1周前
目的:建立人真皮成纤维细胞(HDF)高糖老化模型,探讨人蜕膜间充质干细胞(dMSC)来源外泌体对高糖老化HDF增殖、迁移、凋亡的影响及其可能机制。方法:采用实验研究方法。收集2021年1—3月解放军总医院第四医学中心收治的4例男性包茎患者(18~22岁)环切术后废弃包皮组织,分离培养获取原代HDF。取第6代HDF,按照随机数字表法分为低糖组和高糖组,分别采用低糖完全培养基和高糖完全培养基进行每72小时换液、不传代培养,10 d后取细胞,于接种后24 h,采用β-半乳糖苷酶试剂盒检测细胞衰老情况;于接种后48 h,采用蛋白质印迹法检测细胞衰老相关蛋白p16、p53表达情况;于接种后24、48、72 h,采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)法检测细胞增殖情况;于接种后48 h,采用脱氧尿嘧啶核苷(EdU)染色法检测细胞增殖情况,采用流式细胞术检测细胞周期及凋亡情况;于接种后24 h,采用Transwell实验测定细胞迁移能力。取人dMSC培养48~72 h,采用差速高速离心法获取其外泌体,采用透射电子显微镜观察dMSC外泌体形态,采用纳米颗粒追踪分析法检测dMSC外泌体的粒径分布,采用蛋白质印迹法检测dMSC外泌体标志蛋白CD9、肿瘤易感基因101(TSG101)的表达。取dMSC外泌体及前述高糖完全培养基诱导老化的HDF共孵育24 h,采用PKH67试剂盒检测细胞摄取外泌体的情况。取前述高糖完全培养基诱导老化的HDF,同前分为单纯高糖组、高糖+低浓度外泌体组、高糖+高浓度外泌体组,分别于高糖完全培养基中加入等体积的磷酸盐缓冲液、终质量浓度为50 μg/mL dMSC外泌体、终质量浓度为100 μg/mL dMSC外泌体进行常规细胞培养。分组后同前于对应时间点采用CCK-8法和EdU染色法、流式细胞术、Transwell实验分别检测细胞增殖、细胞周期和凋亡及细胞迁移情况。根据前述结果,另取经高糖完全培养基诱导老化的HDF,分为单纯高糖组、高糖+高浓度外泌体组并同前处理。分组培养48 h,采用实时荧光定量反转录PCR法检测单纯高糖组和高糖+高浓度外泌体组细胞衰老相关的微小RNA-145-5p(miR-145-5p)、miR-498、miR-503-5p及其靶基因钙/钙调素依赖性蛋白激酶1D(CAMK1D)、人第10号染色体缺失的磷酸酶及张力蛋白同源的基因( PTEN基因)和细胞周期蛋白D1的mRNA表达情况。对数据行析因设计方差分析、单因素方差分析、LSD- t检验和独立样本 t检验。 结果:接种后24 h,高糖组HDF β-半乳糖苷酶阳性染色率为(38.4±4.2)%,明显高于低糖组的(16.5±2.2)%( t=4.65, P<0.01)。接种后48 h,高糖组HDF的衰老相关蛋白p16和p53的表达量均明显高于低糖组( t值分别为11.85、3.02, P<0.05或 P<0.01)。接种后24、48、72 h,高糖组HDF的增殖活性均明显低于低糖组( t值分别为4.13、9.90、15.12, P<0.01)。接种后48 h,高糖组HDF的EdU阳性染色率明显低于低糖组( t=3.83, P<0.05)。接种后48 h,高糖组HDF周期的G2/M+S亚群在3个亚群(G0/G1、S和G2/M)的占比明显低于低糖组( t=8.74, P<0.01)。接种后24 h,高糖组HDF穿过Transwell滤膜到达下室的细胞数量为(37±6)个,明显少于低糖组的(74±7)个( t=8.42, P<0.01)。接种后48 h,高糖组HDF凋亡率明显高于低糖组( t=8.48, P<0.01)。dMSC外泌体为边缘清晰、大小分布均匀的杯状或者圆形囊泡,粒径基本处于80~200 nm。dMSC外泌体标志性蛋白CD9、TSG101表达均呈阳性。共孵育24 h,外泌体被HDF摄入胞内,主要分布于细胞核周围。分组培养24、48、72 h,高糖+低浓度外泌体组和高糖+高浓度外泌体组HDF增殖活性均明显高于单纯高糖组( t值分别为6.36、6.10、7.76,8.92、12.17、10.74, P<0.01),高糖+高浓度外泌体组HDF增殖活性均明显高于高糖+低浓度外泌体组( t值分别为7.92、4.82、4.72, P<0.01)。分组培养48 h,与单纯高糖组比较,高糖+低浓度外泌体组和高糖+高浓度外泌体组HDF EdU阳性染色率均明显升高( t值分别为5.32、9.88, P<0.01);与高糖+低浓度外泌体组比较,高糖+高浓度外泌体组HDF EdU阳性染色率显著升高( t=5.27, P<0.01)。分组培养48 h,与单纯高糖组比较,高糖+低浓度外泌体组和高糖+高浓度外泌体组HDF中的G0/G1期亚群占比均显著降低( t值分别为3.81、4.31, P<0.05),G2/M+S亚群占比均明显升高( t值分别为3.81、4.31, P<0.05)。分组培养24 h,与单纯高糖组相比,高糖+低浓度外泌体组和高糖+高浓度外泌体组HDF穿过滤膜的数量均明显增多( t值分别为10.14、13.39 ,P<0.01);与高糖+低浓度外泌体组相比,高糖+高浓度外泌体组HDF穿过滤膜的数量明显增多( t=6.27 ,P<0.01)。分组培养48 h,与单纯高糖组比较,高糖+低浓度外泌体组和高糖+高浓度外泌体组HDF凋亡率均明显降低( t值分别为3.72、5.53, P<0.05或 P<0.01)。分组培养48 h,与单纯高糖组相比,高糖+高浓度外泌体组HDF的miR-145-5p、miR-498 mRNA表达量均明显上升( t值分别为13.03、8.90, P<0.01),miR-503-5p mRNA表达量明显下降( t=3.85, P<0.05);高糖+高浓度外泌体组中HDF的CAMK1D、 PTEN基因mRNA表达量均明显低于单纯高糖组( t值分别为8.83、5.97, P<0.01),细胞周期蛋白D1 mRNA表达量明显高于单纯高糖组( t=4.03, P<0.05)。 结论:人dMSC来源外泌体可显著提高高糖老化HDF的增殖和迁移能力,抑制其凋亡。这可能与HDF内miR-145-5p和miR-498表达增高抑制了CAMK1D和 PTEN基因的表达及miR-503-5p表达下降促进了细胞周期蛋白D1的表达有关。
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编辑人员丨1周前
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系统性红斑狼疮患者长链非编码RNA表达变化及其与调节性T细胞相关性的研究
编辑人员丨1周前
目的:通过检测SLE患者长链非编码RNA(lncRNA)的表达变化,初步探索差异表达的lncRNA与调节性T细胞(Treg)数量间的联系,分析Treg相关lncRNA与SLE患者临床特征间的相关性,预测lncRNA调节Treg分化发育的机制,为SLE的治疗提供新思路。方法:收取9例活动期SLE患者外周血,提取PBMCs,用全转录组测序分析PBMCs的lncRNA表达谱,以9名健康人作为对照组,筛选差异表达的lncRNA,采用Pearson检验分析lncRNA与Treg数的相关性,以及Treg相关lncRNA与SLE患者SLEDAI评分、ESR、C3、C4之间的相关性,用miRcode和Targetscan数据库及共表达网络预测Treg相关lncRNA的靶向基因。结果:与健康对照组相比,SLE患者有240个差异表达lncRNA,包括134个高表达的lncRNA( P<0.05),106个低表达的lncRNA( P<0.05),其中ANKRD44-AS1( r=0.74, P=0.022)、LINC00200( r=0.70, P=0.037)、AP001363.2( r=0.78, P=0.014)、LINC02824( r=0.79, P=0.011)的表达量与外周血Treg数目呈正相关,AP000640.1( r=-0.72, P=0.028)、AC124248.1( r=-0.77, P=0.016)、LINC00482( r=-0.83, P=0.005)、MIR503HG( r=-0.96, P<0.001)的表达量与外周血Treg数目呈负相关,在这8种Treg相关lncRNA中,LINC00482( r=-0.73, P<0.05)、MIR503HG( r=-0.76, P<0.05)的表达量与C3呈负相关。与Treg相关的LINC00200、ANKRD44-AS1、AP000640.1通过竞争性结合miRNA或反式调控机制调控信号传导及转录激活因子5(STAT5)、磷脂酶D1(PLD1)、单一顺式结构蛋白X(HOPX)、Runt相关转录因子3(RUNX3)的表达,进而调控Treg的分化发育。 结论:SLE患者lncRNA表达谱发生变化,差异表达的lncRNA与SLE患者Treg数量和功能异常有关,并且Treg相关lncRNA与SLE疾病活动相关,其可能通过竞争性结合miRNA或反式调控机制影响STAT5、PLD1、HOPX、RUNX3的表达,调节Treg功能,参与SLE的发病和疾病进展。
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编辑人员丨1周前
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LncRNA MIR503HG通过调控miR-224-5pCHSY1表达对结肠癌细胞放射敏感性的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨长链非编码RNA微小RNA-503宿主基因(LncRNA MIR503HG)通过调控miRNA-224-5p硫酸软骨素合酶1 (miR-224-5pCHSY1 )的表达对结肠癌细胞放射敏感性的影响。方法:选取2019年3月至2022年1月火箭军特色医学中心收治的48例结肠癌患者为组织样本获取对象,进行回顾性分析,其中男性28例、女性20例,年龄(57.43±5.28)岁。根据放疗后的病灶情况将患者分为放射抵抗组(23例)和放射敏感组(25例)。采用实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测2组患者结肠癌组织及各细胞株(CCD841、COLO320、SW480、RKO、HCT116)中LncRNA MIR503HG、miR-224-5pCHSY1的表达情况;构建放射抵抗的结肠癌细胞株HCT116R,将HCT116R细胞株分为过表达LncRNA MIR503HG(MIR503HG)组及其阴性对照组(mimiC-NC)、miR-224-5pCHSY1抑制组(anti-miR-224-5p)及其阴性对照组(anti-miR-NC)、过表达LncRNA MIR503HG+过表达miR-224-5pCHSY1组(MIR503HG+miR-224-5p)、过表达LncRNA MIR503HG+阴性对照组(MIR503HG+miR-NC);通过双荧光素酶报告验证LncRNA MIR503HG与miR-224-5pCHSY1的靶向作用;检测各组细胞的存活分数(SF)和凋亡率。两组间数据的比较使用 t检验。 结果:与放射敏感组相比,放射抵抗组结肠癌组织中LncRNA MIR503HG的相对表达量明显降低(1.40±0.36对0.72±0.17),miR-224-5pCHSY1的相对表达量明显升高(1.06±0.25对1.54±0.27 ),且差异均有统计学意义( t=8.247、6.529,均 P<0.05)。CCD841、COLO320、SW480、RKO、HCT116及HCT116R各细胞株LncRNA MIR503HG的相对表达量分别为2.38±0.06、1.03±0.05、0.87±0.03、0.86±0.02、0.77±0.04、0.54±0.09,miR-224-5pCHSY1的相对表达量分别为0.38±0.06、0.56±0.01、0.59±0.02、0.59±0.05、0.63±0.04、0.82± 0.06,与正常细胞株CCD841相比,结肠癌细胞株COLO320、SW480、RKO、HCT116的LncRNA MIR503HG相对表达量均明显降低( t=2.061、1.665、4.058、6.201,均 P<0.05),miR-224-5pCHSY1的相对表达量均明显增加( t=1.238、1.930、2.037、1.742,均 P<0.05 )。与HCT116细胞株相比,HCT116R的LncRNA MIR503HG相对表达量明显降低[(0.77±0.04)对(0.54±0.09)],miR-224-5pCHSY1的相对表达量明显增加[(0.63±0.04)对(0.82±0.06)],差异均有统计学意义( t=1.267、2.370,均 P<0.05 )。在照射剂量分别为4、6、8 Gy时,MIR503HG组的HCT116R细胞SF明显低于mimic-NC组[(7.25±1.11)%对(11.34±2.65)%、(2.85±0.58)%对(6.08±1.10)%、(0.58±0.05 )%对(3.08±0.84)%],且差异均有统计学意义( t=1.064、1.937、2.650,均 P<0.05 )。过表达LncRNA MIR503HG后,MIR503HG组HCT116R的放射增敏比(SER)为1.399。mimic-NC组、MIR503HG组、mimic-NC+4 Gy组、MIR503HG+4 Gy组的细胞凋亡率分别为(8.10± 0.23)%、(18.44±1.57)%、(17.33±2.35)%、(29.83±1.89)%,与mimic-NC组相比,MIR503HG组、mimic-NC+4 Gy组HCT116R细胞的凋亡率均明显升高,且差异均有统计学意义( t=2.003、1.475,均 P<0.05 )。与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组MIR503HG-Wt的荧光素酶活性明显增加(1.02±0.20对1.60±0.25 ),且差异有统计学意义( t=5.366, P<0.05);miR-224-5pCHSY1与LncRNA MIR503HG结合位点突变后,与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组MIR503HG-Mut的活性无明显变化(0.97±0.25对1.00±0.22),2组间的差异无统计学意义( t=0.291, P> 0.05 )。与mimic-NC组相比,MIR503HG组miR-224-5pCHSY1的表达水平明显降低(1.97±0.13对1.12±0.12),差异有统计学意义( t=3.915, P<0.05)。与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组中miR-224-5pCHSY1的表达水平明显降低(1.99±0.19对0.92±0.18 ),差异有统计学意义( t=2.664 , P<0.05 )。在照射剂量分别为4、6、8 Gy时,anti-miR-224-5p组HCT116R细胞的SF均明显低于anti-miR-NC组[(0.59±0.08 )%对(0.79±0.12)%、(0.39±0.06 )%对(0.67±0.07)%、(0.19±0.04 )%对(0.52±0.04)%],且差异均有统计学意义( t=1.281、2.034、2.911,均 P<0.05)。抑制表达miR-224-5pCHSY1后,anti-miR-224-5p组HCT116R细胞的SER为1.403。anti-miR-NC组、anti-miR-224-5p组、anti-miR-NC+4 Gy组、anti-miR-224-5p+4 Gy组的细胞凋亡率分别为(5.08±0.78)%、(14.48±1.21)%、(13.89±1.36)%、(23.64±1.03)%,与anti-miR-NC组相比,anti-miR-224-5p组与anti-miR-NC+4 Gy组的细胞凋亡率均明显增加,且差异有统计学意义( t= 2.067、1.934,均 P<0.05 );与anti-miR-NC+4 Gy组相比,anti-miR-224-5p+4 Gy组的细胞凋亡率明显增加,差异均有统计学意义( t=4.026 , P<0.05 )。照射剂量为4 Gy时,mimic-NC组、MIR503HG组、MIR503HG+miR-NC组、MIR503HG+miR-224-5p组的SF分别为(0.82±0.17)%、(0.53±0.12)%、(0.54±0.11)%、(0.78±0.15)%,照射剂量为6 Gy时,分别为(0.66±0.13)%、(0.38±0.09)%、(0.35±0.08)%、(0.57±0.10)%,照射剂量为8 Gy时,分别为(0.49±0.10)%、(0.15±0.06)%、(0.13±0.05)%、(0.43±0.11)%,与mimic-NC组相比,照射剂量≥4 Gy时,MIR503HG组HCT116R细胞的SF明显降低( t=1.609、1.533、1.927,均 P<0.05 ),MIR503HG+ miR-NC组HCT116R细胞的SF明显降低( t=1.294、1.490、1.825,均 P<0.05 );与MIR503HG+ miR-NC组相比,照射剂量≥4 Gy时,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R细胞的SF明显增加,且差异均有统计学意义( t=1.573、1.204、1.937,均 P<0.05 ),过表达miR-224-5pCHSY1后,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R细胞的SER为0.825,相比MIR503HG组明显降低。mimic-NC组、MIR503HG组、MIR503HG+miR-NC组、MIR503HG+miR-224-5p组的细胞凋亡率分别为(11.61±2.10)%、(24.97±0.91)%、(24.81±1.27)%、(16.15±1.10)%,与mimic-NC组比较,MIR503HG组和MIR503HG+miR-NC组HCT116R的细胞凋亡率明显增高,且差异有统计学意义( t=2.304、2.159,均 P<0.05 );与MIR503HG+miR-NC组比较,MIR503HG+miR-224-5p组HCT116R的细胞凋亡率明显降低,且差异有统计学意义( t=2.067, P<0.05)。 结论:过表达LncRNA MIR503HG可通过抑制miR-224-5pCHSY1表达增加结肠癌细胞的放射敏感性。
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编辑人员丨1周前
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miR-503靶向调控CBX2改善乳腺癌MDA-MB-231细胞耐药性
编辑人员丨1周前
目的:探讨miR-503靶向调控色素框同源蛋白(chromobox2,CBX2)对乳腺癌MDA-MB-231细胞耐药性的影响及潜在的作用机制。方法:实验设置miR-con组、miR-503组、si-con组、CBX2组、anti-miR-con组、anti-miR-503组、miR-503+pcDNA组、miR-503+pcDNA-CBX2组;采用实时荧光定量聚合酶链反应(quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测miR-503和CBX2 mRNA的表达水平;Western blot实验检测蛋白表达;MTT法检测细胞活性;双荧光素酶实验检测其靶向调控关系。结果:与正常乳腺细胞HBL-100(1.02±0.09)相比,乳腺癌细胞MCF-7(0.41±0.05)、MDA-MB-231(0.25±0.03)和BT474(0.35±0.04)中miR-503的表达水平显著降低;乳腺癌细胞MCF-7、MDA-MB-231、BT474细胞中CBX2 mRNA的表达量分别为(4.02±0.35)、(4.62±0.36)、(3.47±0.33);乳腺癌细胞MCF-7、MDA-MB-231、BT474细胞中CBX2蛋白的表达量分别为(0.64±0.07)、(0.74±0.05)、(0.68±0.06);正常乳腺细胞HBL-100中CBX2 mRNA和蛋白含量分别为(1.01±0.08)(0.40±0.04),乳腺癌细胞中CBX2的表达较于正常乳腺细胞明显升高( P<0.05);过表达miR-503(3.64±0.30)、沉默CBX2均可抑制MDA-MB-231细胞增殖、迁移和侵袭,抑制CBX2(0.26±0.03)、细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent kinases,CDK)4(0.32±0.03)、细胞周期蛋白(Cyclin,CCN)D1(0.58±0.03)、基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMP)-2(0.32±0.03)、MMP-9(0.32±0.04)的表达( P<0.05)。miR-503靶向调控CBX2的表达,过表达CBX2(0.75±0.03)能逆转miR-503对乳腺癌细胞MDA-MB-231增殖与耐药性。 结论:miR-503可能通过下调CBX2表达抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭。
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编辑人员丨1周前
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不同细胞来源外泌体对眼表的作用研究进展
编辑人员丨1周前
外泌体是由细胞分泌的一种膜性囊泡,可广泛参与细胞间通讯、抗炎、免疫调节等。眼表相关的外泌体来源细胞有间充质干细胞(MSC)、调节性T细胞(Treg)、未成熟树突状细胞(imDC)和髓源性抑制细胞(MDSC)。不同细胞来源的外泌体通过递送不同的生物分子给受体细胞而发挥作用。MSC来源的外泌体通过抑制T细胞增生、转换巨噬细胞表型、调控辅助性T(Th)细胞分化、上调Treg表达等机制对眼表炎症与免疫相关疾病有积极作用,同时可减少新生血管和炎症反应,培育了一个可促进角膜损伤修复的微环境。Treg来源外泌体内含微小RNA(miRNA)(miR-503、miR-330和miR-9)和诱导型NO合成酶,可通过干扰细胞周期进程,诱导凋亡和其他T细胞分化为Treg表型,抑制T细胞的同种异体排斥反应从而诱导免疫耐受。imDC来源外泌体通过递送miR-682抑制角膜植片免疫排斥。MDSC来源外泌体在体内外促进Treg扩增,抑制活化T细胞的增生和细胞毒性反应,还表达miR-29a-3p和miR-93-5p,可抑制Th1和Th17细胞分化。鉴于上述外泌体的抗炎及免疫抑制作用,本文就其对眼表炎症与免疫相关疾病如角膜损伤、黏多糖贮积症、干眼、干燥综合征和眼部移植物抗宿主病等的研究进行综述。
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编辑人员丨1周前
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miR503宿主基因通过调控hsa-miR-503信号通路促进食管鳞癌细胞增殖侵袭和迁移
编辑人员丨1周前
目的:探讨miR503宿主基因(MIR503HG)在食管鳞癌细胞中的功能及机制。方法:从基因表达综合数据库(GEO)的3个食管鳞癌数据集GSE53622、GSE53624、GSE130078中分别提取60例、119例和23例食管鳞癌及其配对癌旁组织的MIR503HG表达资料,从癌症基因组图谱数据库与基因型-组织表达数据库的组合数据集(TCGA+GTEx)中提取81例食管鳞癌组织、271例非配对正常食管组织的MIR503HG表达资料。构建MIR503HG敲降质粒,包装成慢病毒,感染食管鳞癌细胞系KYSE30和KYSE510,筛选出稳定敲降MIR503HG的细胞系。对食管鳞癌细胞KYSE30瞬时转染miRNA的模拟物,以过表达hsa-miR-503-3p和hsa-miR-503-5p。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测MIR503HG、hsa-miR-503-3p和hsa-miR-503-5p的表达水平,细胞计数试剂盒8法和克隆形成实验检测细胞的增殖能力,Transwell实验检测细胞的侵袭、迁移能力,流式细胞术检测细胞周期。裸鼠皮下移植瘤实验检测MIR503HG对食管鳞癌增殖的影响。结果:GEO和TCGA+GTEx数据库资料显示,食管鳞癌组织中MIR503HG的表达高于癌旁组织和正常食管组织(均 P<0.01)。敲降MIR503HG后与shNC组比较,KYSE30和KYSE510细胞的增殖速率均明显受到抑制(均 P<0.001),克隆形成数均降低[shMIR503HG1组和shMIR503HG2组KYSE30细胞的克隆形成数分别为(2.00±1.41)个和(1.33±0.47)个,均 P=0.002;shMIR503HG1组和shMIR503HG2组KYSE510细胞的克隆形成数分别为(174.67±15.97)个和(80.33±6.34)个,均 P<0.001],使KYSE30细胞的侵袭细胞数减少[shMIR503HG1组和shMIR503HG2组侵袭细胞数分别为(75.33±6.02)个和(45.67±7.59)个,均 P<0.001],迁移细胞数减少[shMIR503HG1组和shMIR503HG2组细胞迁移数分别为(244.00±10.23)个和(210.67±13.52)个,均 P<0.001],细胞周期阻滞在G 0/G 1期。皮下移植瘤实验显示,shMIR503HG组小鼠皮下移植瘤明显小于shNC组,shMIR503HG组肿瘤重量为(0.097±0.026)g,低于shNC组[(0.166±0.021)g, P<0.001]。敲降MIR503HG后,shMIR503HG1组和shMIR503HG2组KYSE30细胞中hsa-miR-503-3p的相对表达水平分别为0.66±0.02和0.58±0.00,hsa-miR-503-5p的相对表达水平分别为0.64±0.00和0.68±0.03,均低于shNC组(均 P<0.01)。在敲降MIR503HG后,过表达hsa-miR-503-3p和hsa-miR-503-5p能减弱敲降MIR503HG对KYSE30细胞增殖(均 P<0.001)、侵袭(均 P<0.01)和迁移(均 P<0.001)的抑制作用。 结论:MIR503HG通过调控hsa-miR-503信号通路促进食管鳞癌细胞的增殖、侵袭和迁移,在食管鳞癌中发挥癌基因的功能,可以作为食管鳞癌靶向治疗的一个新的潜在靶点。
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编辑人员丨1周前
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不同腹膜转运特性患者腹膜透析滤出液外泌体miR-503表达差异及生物信息学分析
编辑人员丨1周前
目的:比较腹膜透析滤出液(PDE)外泌体微RNA(microRNA,miR)-503在不同腹膜转运特性患者中的表达差异,并预测miR-503的靶基因及其可能的生物学作用,为其在腹膜转运特性方面的研究提供生物信息学数据。方法:选取24例稳定维持性腹膜透析(PD)患者,根据腹膜平衡试验(PET)结果分为高转运(高/高平均转运组, n=12)和低转运(低/低平均转运组, n=12)两组。收集患者留腹过夜的PDE 500 ml,利用超滤杯进行浓缩后,超速离心法提取外泌体,重悬于磷酸盐缓冲液(PBS),通过透射电镜(TEM)、纳米粒子跟踪分析(NTA)、Western印迹和荧光染色鉴定外泌体的形态结构和功能。提取PDE外泌体miR,实时荧光定量PCR法检测两组PDE外泌体miR-503的表达水平,并分析miR-503的相对表达量与PET值和24 h超滤量的相关性。使用Targetscan和miRDB数据库预测miR-503的靶基因,运用富集分析工具DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路分析。 结果:PDE中提取到的外泌体透射电镜下呈杯状,直径100 nm左右,表达特异性表面标志CD63、CD81和热休克蛋白-70(HSP-70),可被间皮细胞内化吞噬。与低转运组相比,高转运组PDE外泌体miR-503的相对表达量较高( P=0.002),且PDE外泌体miR-503的相对表达量与PET值呈正相关( r=0.547, P=0.006),但与24 h超滤量无相关性( r=-0.297, P=0.159)。miR-503共有156个靶基因可通过2个不同数据库同时预测出,156个靶基因的GO分析显示主要富集在与蛋白激酶结合、调节蛋白修饰和代谢过程以及调控上皮细胞增殖方面。KEGG通路则富集了许多肿瘤相关和经典的信号传导通路,包括转化生长因子-β(TGF-β)通路和血管内皮生长因子(VEGF)信号通路,同时血管内皮生长因子A(VEGFA)也是miR-503的直接靶基因,与许多纤维化机制中的蛋白相关。 结论:PDE外泌体miR-503在高转运组中明显升高,并与PET值呈正相关。生物信息学分析提示其可能通过靶向VEGFA调控腹膜血管新生。
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编辑人员丨1周前
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基于微小核糖核酸筛选和竞争性内源核糖核酸网络构建的尿酸盐肾沉积机制研究
编辑人员丨1个月前
目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制.方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的 miRNA.利用 TargetScan、StarBase、miRDB、miRWalk 4 个数据库预测 miRNA 的靶基因,通过 DAVID 和 Metascape 数据库对靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.运用Cytoscape构建主要信号通路的ceRNA调控网络.结果:测序共检测到14个差异miRNA(均为上调),该差异miRNA的靶基因主要富集在细胞衰老和癌症相关信号通路;构建获得的ceRNA调控网络含47个长链非编码RNA(lncRNA)节点、10个miRNA节点、27个信使RNA(mRNA)节点,该调控网络中 miR-155-5p、miR-132-3p、miR-503-5p、miR-146b-5p 和 miR-212-5p 为排名前 5 的 HUB 基因.结论:本研究通过筛选尿酸盐肾沉积差异miRNA,构建了尿酸盐肾沉积ceRNA网络,为尿酸盐肾沉积机制探讨提供了新思路.
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编辑人员丨1个月前
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血清miR-503、miR-520h对妊娠期糖尿病患者并发子痫前期的诊断价值
编辑人员丨2024/8/10
目的 探讨血清微小核糖核酸-503(miR-503)和微小核糖核酸-520h(miR-520h)对妊娠期糖尿病(GDM)患者并发子痫前期(PE)的诊断价值.方法 选取2019年12月至2021年12月于唐山中心医院产科定期产检并建档的GDM患者102例作为研究对象,根据疾病类型分为GDM+PE组(53例)、GDM组(49例).另选取同期于唐山中心医院进行定期产检并分娩的57例健康孕妇作为正常妊娠组.比较3组糖脂代谢相关指标[甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、游离脂肪酸(FFA)、空腹胰岛素(FINS)、空腹血糖(FBG)、餐后2 h血糖(2 h PG)]水平及血清miR-503、miR-520h表达水平、血清胱抑素C(CysC)、同型半胱氨酸(Hcy)水平;比较3组不良妊娠结局.采用多因素Logistic回归分析GDM患者并发PE的危险因素;绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析miR-503、miR-520h单独及2项指标联合检测对GDM并发PE的诊断价值.结果 3组孕周、年龄、孕前体质量指数、LDL-C水平比较,差异均无统计学意义(P>0.05).GDM+PE组TC、TG、FFA水平均明显高于GDM组和正常妊娠组,HDL-C水平明显低于GDM组和正常妊娠组,差异均有统计学意义(P<0.05).GDM组TC、FFA水平均明显高于正常妊娠组,差异均有统计学意义(P<0.05).GDM+PE组和GDM组FINS、FBG、2 h PG、HbA1c水平均明显高于正常妊娠组,差异均有统计学意义(P<0.05).GDM+PE组血清miR-503、miR-520h表达水平、CysC和Hcy水平均明显高于GDM组和正常妊娠组,差异均有统计学意义(P<0.05),GDM组血清miR-503、miR-520h表达水平及CysC和Hcy水平均明显高于正常妊娠组,差异均有统计学意义(P<0.05).GDM+PE组不良妊娠结局总发生率为62.26%(33/53),GDM 组为40.82%(20/49),正常妊娠组为10.53%(6/57),GDM+PE组不良妊娠结局总发生率明显高于GDM组和正常妊娠组,差异均有统计学意义(x2=4.692、32.125,P<0.05),GDM组不良妊娠结局总发生率明显高于正常妊娠组,差异有统计学意义(x2=13.059,P<0.05).3组孕妇不良妊娠结局中产后出血、早产或过期产、胎盘早剥、新生儿窒息、宫内生长受限的发生率比较,差异均有统计学意义(P<0.05).多因素Logistic回归分析结果显示,CysC水平升高、Hcy水平升高、miR-503表达水平升高和miR-520h表达水平升高均为GDM并发PE的危险因素(P<0.05).ROC曲线分析结果显示,血清miR-503、miR-520h单独及2项指标联合检测诊断GDM 并发PE的曲线下面积(AUC)分别为0.755、0.847、0.935,2 项指标联合检测的 AUC 大于 miR-503、miR-520h 单独检测(Z2项联合miR503=4.210、Z2项联合-miR-520h=2.708,P<0.001、0.007).结论 GDM 并发 PE 患者血清 miR-503、miR-520h 表达水平升高,与妊娠不良结局呈正相关,二者联合检测对诊断GDM并发PE具有重要意义.
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编辑人员丨2024/8/10
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右归丸对激素型肾阳虚证miRNA表达谱的影响及其靶基因功能分析
编辑人员丨2024/6/22
目的 探讨微小RNA(miRNA)在右归丸对激素型肾阳虚证肾组织与正常肾组织中的表达差异,并用生物信息学方法分析其意义,为右归丸干预肾阳虚证的进一步机制研究奠定基础.方法 15只SD大鼠随机分为正常组(5只)和造模组(10只),正常组注射2 mL生理盐水,造模组后肢肌注氢化可的松注射液.成模后将造模组随机分为模型组和右归丸组,每组5只.右归丸组给予右归丸汤剂灌胃,模型组和正常组给予生理盐水灌胃.麻醉处死后使用TRIzol法提取肾组织中RNA,使用NanoDrop ND-1000对总RNA进行质量检测,用标记后的RNA与Agilent Rat 8 ×60k miRNA芯片进行杂交.收集原始数据进行标准化处理,进行聚类分析和火山图分析.利用生物信息学方法,预测差异miRNA富集的基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路.结果 筛选出右归丸干预肾阳虚证相关差异表达miRNA 18 条(|log2FC|≥ 1.5,P≤0.05),其中包括 5 条上调 miRNA,分别是 rno-miR-149-3p、rno-miR-188-5p、rno-miR-221-5p、rno-miR-762、rno-miR-877;13 条下调 miRNA,分别是 rno-miR-101b-5p、rno-miR-125a-3p、rno-miR-125b-2-3p、rno-miR-3085、rno-miR-344a-5p、rno-miR-347、rno-miR-34b-3p、rno-miR-351-3p、rno-miR-3573-3、rno-miR-370-3p、rno-miR-409a-3p、rno-miR-448-3p、rno-miR-503-3p.GO分析显示差异表达miRNA主要参与DNA、RNA转录的正调控进程且与ATP的结合显著相关.KEGG分析显示差异表达miRNA显著富集于cAMP通路和FoxO信号通路,这两条通路与线粒体功能密切相关.结论 右归丸通过干预miRNA的表达,改善肾阳虚证大鼠线粒体功能,调节能量代谢异常,进一步为右归丸干预肾阳虚证的机制研究提供理论依据.
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编辑人员丨2024/6/22
