目的:探讨克尔斯滕大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物(KRAS)突变亚型对非小细胞肺癌细胞程序性细胞死亡配体1(PD-L1)和2(PD-L2)的表达影响。方法:纳入2018年1月至2021年1月甘肃省肿瘤医院收治的KRAS阳性非小细胞肺癌患者95例，通过测序检测KRAS基因组序列，通过实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)和免疫印迹检测PD-L1和PD-L2的表达。使用成簇的规则间隔的短回文重复基因编辑(CRISPR/CAS9)技术构建KRAS缺失型A549细胞，在敲除株中过表达KRAS野生型和突变型，检测其对PD-L1和PD-L2的表达影响。将KRAS野生型和突变型过表达的KRAS敲除人肺泡上皮细胞549(A549)细胞株与树突状细胞和细胞因子诱导的杀伤细胞(DC-CIK)，通过流式细胞术检测群集行列式蛋白3阳性(CD3 +)细胞的凋亡水平。使用 t检验比较连续变量。使用Mann-Whitney检验分析KRAS突变型患者PD-L1和PD-L2。Chi-square检验分析非小细胞肺癌患者KRAS突变型和KRAS野生型的临床特征。 结果:纳入KRAS阳性非小细胞肺癌患者95例，KRAS野生型31例、KRAS突变型64例；其中KRAS第12位甘氨酸突变为天冬氨酸(G12D)13例、突变为缬氨酸(G12V)12例、突变为半胱氨酸(G12C)25例、突变为丙氨酸(G12A)14例。KRAS突变型患者PD-L1和PD-L2的mRNA表达水平(1.062比1.834， U＝38；1.062比1.668， U＝70；1.062比1.544， U＝111；1.062比1.479， U＝89， P<0.05；1.067比1.798， U＝68；1.067比1.595， U＝86；1.067比1.527， U＝171；1.067比1.680， U＝34， P<0.05)和蛋白表达水平均高于KRAS野生型患者，差异有统计学意义。在KRAS敲除A549细胞株中，相较于KRAS野生型，KRAS突变型更能够促进PD-1配体PD-L1和PD-L2的表达同时，将KRAS-G12D，KRAS-G12V，KRAS-G12C，KRAS-G12A质粒混合在一起作为RAS野生型(KRAS-MT)与KRAS突变型(KRAS-WT)分别转染KRAS敲除A549细胞株，KRAS-MT依旧可以促进PD-1配体PD-L1和PD-L2的表达。在KRAS敲除A549细胞株中过表达KRAS-MT与KRAS-WT后，KRAS突变亚型不能激活细胞外信号调节激酶(ERK)通路，但是可以激活丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶(AKT)通路。AKT抑制剂处理后，KRAS-MT与KRAS-WT转染KRAS敲除A549细胞株的PD-L1和PD-L2的表达差异无统计学意义。将转染了KRAS-MT或KRAS-WT的KRAS KO A549细胞株与DC-CIK以1∶1的比例共培养，随后检测DC-CIK细胞的凋亡水平，发现KRAS-MT能够显著增加DC-CIK细胞中CD3 +细胞亚群的凋亡( F＝12.5， P<0.05)，差异有统计学意义。 结论:KRAS突变亚型能够显著增强非小细胞肺癌细胞PD-1配体PD-L1和PD-L2的表达，并且能够促进免疫细胞DC-CIK细胞中CD3 +细胞亚群的凋亡。

目的:利用CRISPR/Cas9技术构建Crx-iCreERT2红色荧光报告人胚胎干细胞(ESCs)系及其3D视网膜类器官培养。方法:对H9细胞系靶位点序列进行PCR扩增并测序验证后，利用CRISPR/Cas9技术设计多条sgRNA并对其进行活性检测，根据活性、特异性等因素选择最合适的sgRNA。经酶切鉴定和测序确认打靶载体构建完成后，将打靶载体电转H9细胞系，在 hES-ZLM-001基因Exon4和3’-非翻译区之间终止密码子前插入P2A-tdTomato-P2A-iCreERT2，进行药物筛选、阳性克隆富集。设计引物对目标区域进行PCR扩增并测序，根据测序结果和测序峰图选出纯合去抗性敲进阳性细胞克隆。培养所得1-A07细胞系，通过流式细胞分析法检测OCT4阳性细胞比例，采用细胞爬片免疫荧光染色法观察干细胞标志物SOX2、NANOG和SSEA4表达情况。采用核型分析方法检测细胞核型。应用3D培养技术获得视网膜类器官，于分化后不同时间点行冰冻切片，免疫荧光染色法检测不同种类细胞分子标志物的表达分布情况。 结果:H9细胞系靶位点序列与Genebank和Ensembl所提供序列一致。根据H9细胞系靶位点序列共设计16条sgRNA，最终选择sgRNA8和sgRNA12作为sgRNA。电转后通过PCR筛选得到4个去抗性敲进阳性克隆，其中1-A07细胞系经流式细胞仪分析OCT4阳性细胞比例约为98.7%，所得细胞系外源性tdTomato-P2A-iCreERT2片段重组位置正确，正常表达干细胞标志物，核型分析结果正常。应用3D培养技术可定向诱导1-A07细胞系分化为表达tdTomato红色荧光的视网膜类器官。分化后30 d，出现BRN3A阳性神经节细胞、CALBINDIN阳性水平细胞、CHAT阳性无长突细胞，分化后45 d，出现RECOVERIN阳性光感受器细胞，分化后90 d出现PKCα阳性双极细胞。神经节细胞分布于视网膜类器官深层，水平细胞、无长突细胞、双极细胞分布于中深层，光感受器细胞主要分布于顶层。结论:成功构建Crx-iCreERT2红色荧光报告人ESCs系，该细胞系可经3D培养诱导分化为表达tdTomato红色荧光的视网膜类器官。得到的视网膜类器官同人类正常视网膜的神经细胞组成一致，且发育的时间和空间顺序接近于正常的人类视网膜。该细胞系是一种强大的工具，可帮助实现人类视网膜发育和疾病产生的相关研究，并促进致盲疾病治疗方法的开发。

目的:研究髓系Notch1特异性敲除抑制干扰素刺激基因（STING）信号调控肝细胞脂噬作用机制。方法:通过高脂饮食（HFD）构建小鼠非酒精性脂肪性肝炎（NASH）模型，分离小鼠骨髓来源巨噬细胞（BMMs）和原代肝细胞以构建共培养体系。12只Notch1 FL/FL小鼠随机分成2组：Notch1 FL/FL +正常饮食（NCD）组、Notch1 FL/FL + HFD组；12只Notch1 M-KO小鼠随机分成2组：Notch1 M-KO + NCD组、Notch1 M-KO + HFD组。分别留取小鼠血清标本进行血清丙氨酸转氨酶（ALT）、总胆固醇（TC）、甘油三酯（TG）检查，取肝组织样本进行HE染色、免疫荧光（IF）、免疫印迹、qRT-PCR检测，酶联免疫吸附法（ELISA）检测上清液肿瘤坏死因子（TNF）α水平。组间数据比较采用 t检验。 结果:成功构建小鼠NASH模型，及小鼠BMMs和原代肝细胞共培养体系。与Notch1 FL/FL + HFD组相比，Notch1 M-KO + HFD组血清ALT [（250.02±58.21）U/L与（370.70±54.57）U/L, t = 3.705， P = 0.004]、TG [（29.90±3.54）mg/g与（43.83±8.56）mg/g, t = 3.685， P = 0.004]和TC [（33.70±8.43）mg/g与（90.53±12.53）mg/g， t = 9.917， P < 0.001]，明显升高；肝组织HE染色显示肝细胞气球样变明显，IF染色显示巨噬细胞浸润增加（ t = 7.346， P < 0.001）。与Notch1 FL/FL BMMs共培养的肝细胞组相比，BODIPY探针显示，Notch1 M-KO组中肝细胞内脂滴（LDs）沉积明显增多（ t = 3.835， P < 0.001）；溶酶体相关膜蛋白1（LAMP1）和LDs共定位减少（ t = 7.103， P < 0.001），微管相关蛋白轻链3（LC3）-II/LC3-I:（ t = 5.0， P = 0.007)、自噬相关基因12（Atg12）（ t = 28.36， P < 0.001）表达下降，p-62表达上升（ t = 3.253， P = 0.03）；且LC3和LDs共定位减少（ t = 5.24， P = 0.000 3）。与Notch1 FL/FL组相比，Notch1 M-KO组小鼠BMMs中p-STING（ t = 5.318， P = 0.006）、p-TANK1结合激酶1（TKB1）（ t = 6.467， P = 0.002）、p-干扰素调节因子3（IRF3）（ t = 14.61， P < 0.001）、p-P65（ t = 12.7， P = 0.002）蛋白表达上升，同时伴有干扰素（IFN）-β（ t = 7.978， P < 0.001）、TNFα（ t = 8.496， P < 0.001）、白细胞介素1β（IL-1β）（ t = 4.7， P < 0.001）、趋化因子配体-10（ t = 4.428， P = 0.001）炎性介质的mRNA表达明显上升。使用CRISPR/Cas9敲除Notch1 M-KO小鼠BMMs中STING基因，与CRISPR-Control组相比，STING-KO组BMMs中p-TKB1（ t = 2.909， P = 0.044）、p-IRF3（ t = 10.96， P < 0.001）、p-P65（ t = 7.091， P = 0.002）蛋白表达下降，上清液中TNFα[（732.3±129.35）pg/ml与（398.17±47.15）pg/ml， t = 4.204， P = 0.014]释放减少。而与STING-KO BMMs共培养的肝细胞中LC3-II/LC3-I（ t = 7.546， P = 0.001）上升，p-62（ t = 10.96， P < 0.001）表达下降，且LC3和LDs共定位增多。 结论:髓系Notch1特异性敲除通过激活巨噬细胞STING信号，增加炎性介质基因表达，抑制肝细胞自噬流及脂噬的发生，加重LDs沉积和促进NASH的进展。

目的:建立一种催化发夹自组装（CHA）联合成簇间隔的短回文重复序列及其关联蛋白12a（CRISPR-Cas12a）的传感技术，用于外泌体源性微小RNA-21（miR-21）的检测并分析其性能。方法:选取2023年9—10月在陆军军医大学第一附属医院确诊为乳腺癌的患者8例为乳腺癌组；选取同期健康体检者8名为健康对照组。采用试剂盒提取血浆外泌体及其miR-21。针对miR-21序列设计DNA发夹和CRISPR RNA序列。通过聚丙烯酰胺凝胶电泳和荧光分光光度计验证检测技术可行性。进一步优化发夹浓度、CHA反应时间、Cas12a蛋白浓度和Cas12a蛋白反应时间。在此基础上，检测不同浓度（0、0.1、0.5、1.0、2.5、5.0、7.5、10.0 nmol/L）的miR-21，收集荧光强度采用一元线性回归方法做线性分析以评价方法学的灵敏度，同时检测不同类型miRNA（miR-31、miR-26a、miR-192、miR-25-3p）及空白对照以评价方法学特异性。采用病例对照研究，用该检测技术和逆转录PCR方法检测乳腺癌组和健康对照组血浆外泌体源性miR-21的相对表达水平以评价其临床样本检测能力。结果:应用CHA联合CRISPR-Cas12a技术建立了外泌体源性miR-21的检测方法。该方法检测miR-21的浓度与荧光强度呈良好的线性关系（相关系数为0.966 7），线性检测范围为0.1~10.0 nmol/L，检测限为87.81 pmol/L。miR-21的检测荧光强度为450.27±23.96，高于miR-31、miR-26a、miR-192、miR-25-3p和空白对照组（分别为98.89±7.35、98.12±2.07、98.93±2.45、96.66±2.45、82.93±3.54），差异均有统计学意义（ P均<0.001）。逆转录PCR结果显示，乳腺癌组血浆外泌体源性miR-21相对表达水平高于健康对照组（1.83±0.27比0.93±0.12， P<0.001）；CHA联合 CRISPR-Cas12a检测技术结果显示，乳腺癌组血浆外泌体源性miR-21相对表达水平高于健康对照组（1.94±0.21比0.98±0.08， P<0.001）；CHA联合 CRISPR-Cas12a检测技术与逆转录PCR检测的乳腺癌组和健康对照组的血浆外泌体源性miR-21相对表达水平比较，差异无统计学意义（ P均>0.05）。 结论:建立了CHA联合CRISPR-Cas12a检测外泌体源性miR-21的高灵敏度与高特异性的传感技术，其检测血浆外泌体源性miR-21的结果与逆转录PCR结果一致，可用于乳腺癌患者筛查。

目的:探讨miR-497对糖尿病小鼠角膜上皮愈合的抑制作用及其可能机制。方法:取40只健康清洁级野生型C57BL/J6小鼠，采用随机数字表法平均分为空白对照组和模型对照组，另取CRISPR/Cas9介导的miR-497敲除小鼠和miR-497过表达小鼠各20只，分别作为miR-497敲除组和miR-497过表达组。对模型对照组、miR-497敲除组、miR-497过表达组小鼠连续腹腔注射链脲佐菌素(STZ)构建糖尿病模型，空白对照组小鼠注射等量枸橼酸钠缓冲液，正常饲养8周。糖尿病模型建立成功后通过刮除角膜中央直径2 mm上皮，进一步构建角膜上皮损伤模型。采用角膜荧光素钠染色观察角膜上皮损伤后0、12、24和36 h各组小鼠角膜上皮缺损面积。采用Western blot法检测各组小鼠角膜组织中wnt3a、β-catenin蛋白表达；采用实时荧光定量PCR法检测各组小鼠角膜组织miR-497以及细胞增生相关基因 CyclinD1、 c-Myc、 Ki-67 mRNA水平表达。采用双荧光素酶报告基因实验检测miR-497与wnt3a的靶向性关系。体外培养人角膜上皮细胞(HCEC)，通过Lipo8000分别转染miR-497 mimics、miR-497 mimics阴性对照、miR-497 inhibitor、miR-497 inhibitor阴性对照，作为miR-497 mimics组、mimics阴性对照组、miR-497 inhibitor组、inhibitor阴性对照组，并在含25%葡萄糖的高糖培养基中培养；另取2个组HCEC分别置于含5%及25%葡萄糖的培养基进行培养，作为正常对照组及高糖组。采用CCK8检测各组细胞增生活力。 结果:注射STZ后8周，各糖尿病模型组小鼠血糖浓度明显高于空白对照组，体质量明显低于空白对照组，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。模型对照组损伤角膜上皮后12、24和36 h角膜上皮缺损面积百分比明显高于相应时间点空白对照组和miR-497敲除组，低于miR-497过表达组，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。模型对照组角膜组织中wnt3a、β-catenin蛋白相对表达量明显低于空白对照组和miR-497敲除组，高于miR-497过表达组，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。模型对照组CyclinD1、c-Myc和Ki-67 mRNA相对表达量均低于miR-497敲除组，高于miR-497过表达组，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。模型对照组、miR-497敲除组和miR-497过表达组miR-497相对表达量分别为1.00±0.02、0.63±0.06和1.48±0.03，总体比较差异均有统计学意义( F＝19.62， P<0.01)。野生型Wnt3a转染细胞中miR-497-5p mimics组荧光素酶活性低于miR-497-5p阴性对照组和空载体组，差异均有统计学意义(均 P<0.05)；突变型wnt3a转染细胞中，各组荧光素酶活性比较差异无统计学意义( F＝0.73， P＝0.59)。高糖组细胞增生 A值为0.59±0.03，明显低于正常对照组的0.59±0.03和miR-497 inhibitor组的0.88±0.08，明显高于miR-497 mimics组的0.48±0.11，差异均有统计学意义(均 P<0.05)。 结论:沉默miR-497表达可能通过靶向激活wnt/β-catenin通路促进糖尿病小鼠角膜上皮缺损修复。

目前核酸检测技术已被广泛应用于临床实验室诊断，常规检测技术如实时荧光定量PCR技术耗时长且依赖特定的仪器设备。成簇规律间隔短回文重复序列（CRISPR）/CRISPR相关蛋白（Cas）系统是细菌和古细菌在与病毒斗争过程中获得的适应性免疫防御机制，已被发展成强大的基因组编辑技术。最近CRISPR领域的先驱团队基于Cas13a、Cas12a和新发现的Cas14蛋白开发出SHERLOCK、DETECTR等新型核酸检测工具，在传染性疾病的快速诊断、癌症中基因突变的检测和基因分型等方面意义重大，其灵敏度高、特异性强且快速经济，在临床分子诊断领域具有巨大潜力。本文综述了CRISPR/Cas系统的作用机制及新型诊断平台的原理和应用进展，总结了新型检测技术的优缺点并对其发展前景进行展望。

目的:为在疫情现场和基层医疗卫生机构实现对A、B型流感病毒的快速检测，而建立一种快速流感病毒诊断方法。方法:将等温扩增技术与CRISPR-Cas12b系统联用，结合侧层析技术，建立基于LAMP-CRISPR-Cas12b-侧层析技术检测A、B型流感病毒的方法。设计A、B型流感病毒的特异性LAMP引物组及crRNA。采用梯度稀释法验证该方法的灵敏度；利用其他4种呼吸道病毒验证该方法的特异性；应用该方法对52例ILI监测样本进行检测，验证该方法的实用性。结果:成功建立了LAMP-CRISPR-Cas12b-侧层析检测A、B型流感病毒的方法，最低检测极限为10 copies/μL；该方法特异性强，与其他4种呼吸道病毒无交叉反应；52例ILI监测样本结果与qRT-PCR一致，一致性好（ kappa=1）。 结论:建立了一种适用于疫情现场和基层医疗卫生单位对流感病毒快速检测的方法。

目的 开发一种基于CRISPR/Cas12a技术的叶酸代谢位点c.677(MTHFR C677T)的高效检测方法,以实现对C677T多态性的快速、准确分析.方法 采用重组酶聚合酶扩增(RPA)结合CRISPR/Cas12a建立单管检测反应体系,建立人MTHFR基因C677T基因分型策略;测试200例孕妇人群样本MTHFR基因C677T多态性,并与常规PCR产物测序结果进行一致率比较.结果 基于CRISPR/Cas12a检测人MTHFR基因C677T多态性的检测方法结果准确、特异性好,与PCR产物测序结果具有高度一致性.结论 建立的基于CRISPR/Cas12a检测技术的人MTHFR C677T基因分型方法简单、快捷、精准,为叶酸代谢位点MTHFR C677T基因型检测提供了新的途径,具有潜在的临床应用前景.

目的 开发基于PCR结合簇状规则间隔短回文重复序列及相关蛋白Cas12a(CRISPR/Cas12a)快速检测华支睾吸虫囊蚴的方法.方法 使用内转录间隔区(ITS)引物以华支睾吸虫基因组DNA为模板进行PCR扩增,取PCR扩增产物、Cas12a蛋白、crRNA、单链DNA(ssDNA)报告分子和焦碳酸二乙酯水,选择其中1～5个试剂,分别制备5个CRISPR反应体系,在紫外光下观察反应结果,验证PCR-CRISPR/Cas12a检测系统的可行性.设计5个浓度梯度(100、200、300、400、500 nmol/L)优化ssDNA报告分子浓度;保持 crRNA 浓度为 50 nmol/L,设计 5 个比例梯度(1.0∶1、1.5∶1、2.0∶1、2.5∶1、3.0∶1)优化 Cas12a/crRNA比例,荧光定量PCR仪检测荧光信号.将重组质粒梯度稀释为10个不同浓度(10-2～107拷贝/μl),PCR扩增、CRISPR反应后检测荧光信号,评价检测系统的灵敏度.提取华支睾吸虫囊蚴、东方次睾吸虫囊蚴、猬迭宫绦虫裂头蚴、派氏异尖线虫和亚洲带绦虫节片基因组DNA,PCR扩增、CRISPR反应后检测荧光信号,评价检测系统的特异性.压片镜检华支睾吸虫病流行区捕获的小型淡水鱼鱼肉,分别挑选出华支睾吸虫囊蚴、东方次睾吸虫囊蚴和其他囊蚴(未鉴定出虫种)等3种囊蚴混合感染,华支睾吸虫和东方次睾吸虫囊蚴的混合感染,华支睾吸虫和其他囊蚴的混合感染,东方次睾吸虫和其他囊蚴的混合感染,单华支睾吸虫囊蚴感染,单东方次睾吸虫囊蚴感染,单其他囊蚴感染和无囊蚴感染等8种鱼肉样品组织,提取DNA后进行PCR-CRISPR/Cas12a检测,在紫外光下观察反应结果.使用GraphPad prism 9.0软件对数据进行单因素方差分析,两两比较采用图基多重检验.结果 完整的PCR-CRISPR/Cas12a检测系统能够在紫外光下产生荧光信号.ssDNA报告分子浓度为400nmol/L时,反应体系的荧光值为(40 786±1 758)AU,高于300nmol/L的(32 029±2 651)AU(P＜0.05),与 500 nmol/L 的(42 698±4 260)AU 差异无统计学意义(P＞0.05),选取ssDNA报告分子浓度为400 nmol/L.Cas12a/crRNA比例为2.0∶1时,反应体系的荧光值为(48 950± 3 723)AU,高于 1.5:1的(37 700±3 887)AU(P＜0.05),与 2.5∶1 的(55 630±3 110)AU 差异无统计学意义(P＞0.05),选取Cas12a/crRNA比例为2.0∶1.灵敏度检测结果显示,重组质粒的浓度为10-1拷贝/μl时,反应体系的荧光值为(39 336±7 231)AU,与阴性对照的(2 216±743)AU差异有统计学意义(P＜0.05);当浓度降至10-2拷贝/μl时,荧光值为(5 451±1 957)AU,与阴性对照的差异无统计学意义(P＞0.05).特异性检测结果显示,ITS引物能同时PCR扩增华支睾吸虫、东方次睾吸虫、猬迭宫绦虫、派氏异尖线虫和亚洲带绦虫等5种基因组DNA;相同扩增产物的CRISPR检测结果显示,仅以华支睾吸虫基因组DNA为模板的反应体系在紫外光下产生了荧光信号.PCR-CRISPR/Cas12a效果评价检测结果显示,8种不同囊蚴感染的鱼肉样品反应体系中,含有华支睾吸虫囊蚴的4管出现荧光信号.结论 本研究建立了华支睾吸虫囊蚴的PCR-CRISPR/Cas12a检测方法,该方法灵敏度高、特异性好、高度模块化,具有较好的现场应用潜力.

目的:利用CRISPR/Cas9技术构建稳定敲除Lrtm1 (leucine-rich repeats and transmenbrane domains 1)基因的C2C12细胞系,为研究Lrtm1基因的作用提供实验基础.方法:设计3对针对Lrtm1基因的向导RNA(sgRNA),将sgRNA插入载体pCRISPR-LvSG06中;利用慢病毒包装系统包装含有sgRNA的重组质粒pCRISPR-LvSG06;将病毒感染C2C12细胞,并加入嘌呤霉素筛选,将筛选嘌呤霉素阳性的细胞提取RNA,逆转录成cDNA;设计Cas9引物,利用cDNA为模版,PCR验证C2C12细胞中Cas9的表达,确认慢病毒成功感染C2C12细胞;利用96孔板挑选单克隆细胞的方法筛选得到单克隆细胞;将扩增的单克隆细胞提取基因组DNA,测序Lrtm1基因相关序列并与野生型Lrtm1基因进行对比,确认敲除成功的克隆细胞株;诱导敲除Lrtm1稳定细胞株成肌分化,检测成肌分化标志因子Myosin的蛋白表达,RT-PCR检测转录因子PAX7的mRNA表达,Western blot检测H3K27me3蛋白水平.结果:测序结果显示向导RNA(sgRNA)成功插入载体质粒;将单克隆细胞DNA测序结果显示A和C克隆成功敲除Lrtm1基因;敲除Lrtm1基因后成肌分化标志因子Myosin蛋白表达降低,成肌转录因子PAX7 mRNA的表达降低,在分化72和96 h组,H3K27me3蛋白水平较野生型组增高.结论:利用CRISPR/Cas9技术成功敲除Lrtm1基因,稳定敲除Lrtm1基因的C2C12细胞系构建成功;敲除Lrtm1后能抑制C2C12细胞成肌分化,并且抑制成肌转录因子PAX7的mRNA表达,PAX7mRNA表达降低的原因可能为H3K27me3水平增高.