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重组酶聚合酶扩增技术原理及其在医学检验中的应用进展
编辑人员丨2天前
重组酶聚合酶扩增(RPA)技术是一种新型核酸恒温扩增检测技术。该技术可以在37~42 ℃条件下实现待测靶标的快速检测。它具有反应灵敏度高、特异性强、对仪器依赖程度低且可整合多种检测模式等优点,特别适用于基层和现场即时检测。本文从RPA技术的基础理论和实验要点出发概述了开展该项研究需要注意的要点,综述了RPA技术在医学检验领域的应用现状和相关问题,并展望了其未来发展的广泛前景。
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编辑人员丨2天前
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病理组织中的病原学检查对结核病的诊断价值
编辑人员丨2天前
目的:探讨病理组织中的病原学检查对结核病的诊断价值。方法:选择2016年5月至2019年5月深圳市第三人民医院收治的190例疑似或确诊为结核病患者的病理标本,将190份标本按照病理形态分为4组:组1为坏死性肉芽肿组(109份),组2为非坏死性肉芽肿组(20份),组3为普通炎症组(45份),组4为非结核病变组(16份)。比较各种病原学检测方法在4组病理标本中检出结核分枝杆菌( Mycobacterium tuberculosis,MTB)的阳性率,同时比较不同抗结核治疗时间对病原学检查结果的影响。统计学方法采用 χ2检验或Fisher确切概率法。 结果:在组1、组2、组3和组4患者的组织病理标本中抗酸染色的阳性率分别为17.4%(19/109)、5.0%(1/20)、4.4%(2/45)、0(0/16),MTB培养的阳性率分别为32.0%(32/100)、4/19、4.8%(2/42)、0(0/16),结核分枝杆菌/利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测体系( Mycobacterium tuberculosis/rifampin resistance real-time quantitative nucleic acid amplification detection system, Xpert MTB/RIF)检测的MTB阳性率分别为74.3%(81/109)、15.0%(3/20)、13.3%(6/45)、0(0/16),荧光定量聚合酶链反应(fluorescent quantitative polymerase chain reaction,FQ-PCR)检测的MTB阳性率分别为63.0%(58/92)、0(0/15)、2.6%(1/38)、0(0/10),实时荧光核酸恒温扩增检测(simultaneous amplification and testing, SAT)的MTB阳性率分别为32.4%(24/74)、0(0/10)、0(0/15)、0(0/10),各种病原学方法检测4组标本中的MTB阳性率差异均有统计学意义(均 P<0.05)。Xpert MTB/RIF检测组1标本中MTB的阳性率高于抗酸染色、MTB培养和SAT,差异均有统计学意义( χ2=71.016、37.162、35.679,均 P<0.01),但与FQ-PCR比较差异无统计学意义( χ2=2.517, P=0.112),联合病原学检查MTB的阳性率为85.3%(93/109),高于Xpert MTB/RIF的74.3%(81/109),差异有统计学意义( χ2=4.100, P=0.043)。各种病原学检查抗结核治疗时间≤1个月与>1个月的组1病理标本MTB阳性率分别为:抗酸染色为14.3%(7/49)比20.0%(12/60)( χ2=0.612, P=0.434),MTB培养为48.9%(22/45)比18.2%(10/55)( χ2=10.721, P=0.001),Xpert MTB/RIF为69.4%(34/49)比78.3%(47/60)( χ2=1.131, P=0.287),FQ-PCR为55.0%(22/40)比69.2%(36/52)( χ2=1.965, P=0.161),SAT为43.3%(13/30)比25.0%(11/44)( χ2=2.736, P=0.098)。 结论:MTB病原学检查结果与典型的结核病病理形态学存在一致性。病理组织的各种病原学检查方法中以Xpert MTB/RIF检出率最高,且不受早期抗结核治疗时间的影响,而联合病原学检查能提高检出率,可在标本量足够时采用。
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编辑人员丨2天前
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实时荧光逆转录重组酶介导的等温扩增技术检测寨卡病毒方法的建立
编辑人员丨2天前
目的:建立一种实时荧光逆转录重组酶介导的等温扩增(reverse transcription recombinase-aided amplification,RT-RAA)技术检测寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)的方法,以实现ZIKV的现场快速筛查及诊断。方法:通过基因组序列比对,选择ZIKV保守序列设计RT-RAA特异性引物和探针,并用系列稀释的ZIKV重组质粒与毒株核酸验证方法的灵敏性与重复性,通过检测登革病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒等其他虫媒病毒验证方法的特异性。结果:建立的RT-RAA方法可在39 ℃恒温条件下30 min内对ZIKV进行高效扩增,检测系列稀释的ZIKV重组质粒,其95%检测限可达到15拷贝/反应,特异性强,与登革病毒、基孔肯雅病毒、西尼罗病毒虫媒病毒无交叉反应,且重复性好。结论:本研究建立的ZIKV的RT-RAA等温扩增方法,具有反应迅速,无需精密仪器,操作简单等优点,适合于应急快速检测。
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编辑人员丨2天前
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多色荧光探针的滚环扩增技术检测结核分枝杆菌耐药基因
编辑人员丨2天前
本研究旨在构建基于核酸滚环扩增(RCA)的简便快速、超灵敏的光学生物传感技术,并将其运用于结核杆菌耐药相关基因的多重检测。本研究在2020年2月至2021年5月期间,于陆军军医大学第一附属医院检验科,针对异烟肼、利福平和链霉素耐药的高频基因突变位点katG315(AGC?ACC)、rpoB531(CAC?TAC)和rpsL43(AAG?AGG),分别设计锁式探针(padlock probe,PLP)、引物和捕获探针,构建了基于磁珠的固相RCA恒温扩增反应体系,并进行了实验参数的优化。通过多色荧光探针(Cy3/Cy5/ROX)对RCA产物精准捕获与信号放大,实现了对3种突变基因的单管多重检测。进一步对该方法的灵敏度、特异性与线性范围等分析性能进行验证,结果显示同一反应体系中katG315的响应范围为1.0 pmol/L至0.1 nmol/L,rpoB531和rpsL43的响应范围为1.0 pmol/L至50.0 pmol/L和1.0 pmol/L至20.0 pmol/L,且该方法具有较好的特异度与灵敏度,在混合靶标中可精确识别单碱基突变,最低检出限低至1.0 pmol/L;在模拟血清样本的回收实验中,回收率可达95.0%~105.2%。综上,本研究构建的恒温扩增型多重检测方法可快速实现3种耐药突变位点的单管多重检测,该技术成本低廉、简便快速、不依赖大型设备,为病原体耐药基因检测提供了一种新的分析方法。
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编辑人员丨2天前
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RNA恒温扩增实时荧光检测在痰涂片阴性肺结核中的诊断价值
编辑人员丨2天前
目的:探讨应用结核分枝杆菌RNA恒温扩增实时荧光检测(SAT-TB)以及SAT-TB联合结核T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)对痰涂片阴性肺结核的诊断价值。方法:对2016年12月至2017年12月在四川大学华西医院就诊的101例疑似肺结核患者进行结核分枝杆菌快速培养(MGIT960)、T-SPOT.TB以及SAT-TB检测,分析应用SAT-TB技术以及SAT-TB联合T-SPOT.TB对检测痰涂片阴性肺结核的诊断价值。结果:101例疑似肺结核患者中84例临床确诊为肺结核,17例为非肺结核。SAT-TB和T-SPOT.TB检测的灵敏度分别为63.10%和68.42%,特异性分别为94.12%和63.64%,AUC值分别为0.79和0.66。SAT-TB和T-SPOT.TB联合检测的阳性预测值为100%。结论:SAT-TB对于痰涂片阴性肺结核的诊断价值较高,联合T-SPOT.TB检测时能有效减少肺结核的漏诊。
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编辑人员丨2天前
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儿童肺炎支原体感染咽拭子核酸检测方法的比较
编辑人员丨2天前
目的:探讨咽拭子核酸检测方法在儿童肺炎支原体(MP)感染病原学诊断中的应用价值。方法:选取2018年7至10月在浙江大学医学院附属儿童医院呼吸科住院的454例(男210例、女244例)肺炎患儿进行前瞻性研究,入院当天或第2天采集患儿的咽拭子和静脉血,分别采用DNA荧光定量扩增、RNA恒温扩增、MP培养和MP-IgM进行MP病原检测,以MP培养阳性或其余3项检测中2项阳性为MP感染诊断标准并进行二次检测,筛选出MP感染患儿于出院前再次采集咽拭子,采用DNA荧光定量扩增、RNA恒温扩增、MP培养3种方法再次进行MP病原学检测。比较3种检测方法随病情变化的检出率及MP菌量变化,组间比较采用χ 2检验。 结果:454例住院肺炎患儿采用DNA荧光定量扩增、RNA恒温扩增、MP培养和MP-IgM的检出率分别为43.6%(198/454)、43.2%(196/454)、40.0%(180/454)、30.6%(139/454),差异有统计学意义(χ 2=20.8, P<0.05)。DNA荧光定量扩增和RNA恒温扩增检出率差异无统计学意义(χ 2=0.018, P=0.900),较MP-IgM及MP培养高。以MP培养阳性或其余3项检测中2项阳性为MP感染诊断标准,筛选出MP感染患儿209例。209例MP感染患儿在出院前的第2次MP检验中,MP培养阳性率67.5%(141/209),39.4%(13/33)由阴性转为阳性,27.3%(48/176)由阳性转为阴性。RNA恒温扩增阳性率82.3%(172/209),16.2%(31/191)由阳性转为阴性,66.7%(12/18)由阴性转为阳性。DNA荧光定量扩增阳性率67.0%(140/209),52.9%(18/34)由阴性转为阳性,30.3%(53/175)由阳性转为阴性。DNA荧光定量扩增阳性检测标本中,141例(67.5%)二次检测菌量减少,68例(32.5%)菌量增加。4种方法在非重症组和重症组患儿中的检出率相近,各组间差异均无统计学意义( P均>0.05),在二次检测中,重症组转阳比例仅有RNA恒温扩增高于非重症组,差异有统计学意义(7比5例, P=0.038)。 结论:咽拭子核酸检测方法在儿童MP感染急性期病原学诊断中具有较高的敏感性和应用价值,DNA荧光定量扩增、RNA恒温扩增的检测结果具有高度一致性,较MP-IgM检测更具优势。急性期重复检测有助于检出第一次检测结果为阴性的MP感染患儿。急性期部分患儿经抗感染治疗后MP菌量未下降。
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编辑人员丨2天前
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酶促重组等温扩增实时荧光法快速检测基孔肯雅病毒方法的建立
编辑人员丨2天前
目的:建立一种快速、准确、高灵敏度检测基孔肯雅病毒(chikungunya virus,CHIKV)的逆转录-酶促重组等温扩增(reverse transcription enzymatic recombinase amplification,RT-ERA)的基因检测技术方法。方法:以CHIKV非结构蛋白1(non-structural protein 1,NSP1)基因的保守序列为靶标,根据RT-ERA反应原理设计、合成荧光探针及对应引物,以pUC18为载体构建靶标质粒并在体外转录后作为阳性对照品,将阳性对照品倍比稀释后筛选出扩增效率最高的探针引物组合。利用筛选的探针引物组合,对不同拷贝数的CHIKV进行荧光RT-ERA法扩增,评价该方法的最低检出限;再分别以森林脑炎病毒、登革热病毒、寨卡病毒、乙型脑炎病毒、新布尼亚病毒的RNA为模板进行荧光RT-ERA法扩增,评价该方法的特异性。结果:在40 ℃恒温条件下,利用荧光RT-ERA法10 min内可以完成CHIKV核酸扩增,该方法最低检出限可达10拷贝/μL,且当CHIKV核酸扩增为阳性时,其他病毒检测结果为阴性。结论:成功建立一种可用于检测CHIKV NSP1基因的荧光RT-ERA法,该方法操作简便、检测限低且特异性好。
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编辑人员丨2天前
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河北省儿童医院1 927例儿童呼吸道感染病原谱流行病学分析
编辑人员丨2天前
目的:分析河北省儿童医院儿童呼吸道感染病原谱的流行病学特点。方法:选取2018年1-12月河北省儿童医院呼吸道感染患儿1 927例进行回顾性研究,标本为鼻拭子、痰液或支气管肺泡灌洗液。采用恒温扩增技术完成靶基因的扩增和检测。对检测结果进行统计学分析。结果:肺炎支原体检出率为21.1%(406/1 927),肺炎链球菌检出率为13.1%(253/1 926),耐甲氧西林金黄色葡萄球菌检出率为10.7%(206/1 927)。肺炎链球菌在>1~3岁年龄段、第二季度检出率最高。金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌在0~1岁年龄段检出率最高。鲍曼不动杆菌在0~1岁、>8~14岁年龄段检出率较高。流感嗜血杆菌在>1~3岁年龄段、第二季度检出率最高。肺炎支原体在女性、>3~8岁年龄段、第四季度检出率最高。结论:检出率排名前三位的病原体依次是肺炎支原体、肺炎链球菌、耐甲氧西林葡萄球菌。在0~1岁病原体检出率较高,检出种类较多。病原体的检出率与性别、年龄和季节因素存在一定相关性。
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编辑人员丨2天前
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重组酶聚合酶扩增技术的应用新进展与思考
编辑人员丨2天前
重组酶聚合酶扩增技术作为一种新型的核酸恒温扩增检测技术,近年来已经展现出其巨大的应用潜力和发展前景。高敏感度、高特异度、对仪器依赖程度低以及可整合多种检测模式等独特的优势,使其在多个领域,特别是基层和现场即时检测中具有广泛的应用价值。本文对重组酶聚合酶扩增技术的发展历程、检测原理、研究动态及应用进展进行综述,并对其未来发展进行展望,以期为基于重组酶聚合酶扩增技术的病原体快速检测方法的研发和临床应用提供有益参考。
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编辑人员丨2天前
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幽门螺杆菌的感染诊断及环介导等温扩增技术在该领域的研究进展
编辑人员丨2天前
幽门螺杆菌( Helicobacter pylori, Hp)与很多胃肠道疾病甚至是胃肠外疾病密切相关。目前幽门螺杆菌的常规检测技术包括快速尿素酶试验、病理组织学检查、血清抗体检测、粪便抗原检测、尿素呼气试验等,随着在临床应用中发现这些技术均存在不同程度的缺陷,因此需要探索新技术来弥补。恒温核酸扩增技术中的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术近年发展迅速,具有快速、特异、敏感、简便等特点,使该技术在核酸检测领域得到了广泛的应用。文章就Hp感染诊断及LAMP技术在诊断、毒力分型领域内的研究进展进行综述,期望为后续研究者们提供更多信息。
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编辑人员丨2天前
