目的:探讨1例表现为全血细胞减少、生长发育落后、肺部感染患儿可能的遗传学病因及其临床诊治。方法:采集患儿及其正常表型双亲的外周血样，提取基因组DNA，应用高通量测序的方法对患儿行血液系统相关疾病基因检测。结果:患儿 TCN2基因存在3个变异，分别是第5外显子上游c.581-8A>T，该变异患儿父母均携带；第6外显子c.924_927del，该变异来源于母亲；第7外显子c.973C>T，该变异为新发变异。经基因变异致病性分析结合患儿临床表现、三系减少、血甲基丙二酸及同型半胱氨酸增高，确诊其为转钴胺素Ⅱ缺乏症。该患儿出现呼吸道感染表现，经肺部影像学检查及肺泡灌洗液病原学高通量测序证实为耶氏肺孢子虫病，在给予肌注维生素B 12治疗过程中患儿出现急性呼吸窘迫综合征，经复方磺胺甲恶唑抗感染及对症支持治疗后好转。 结论:我们报道了1例转钴胺素Ⅱ缺乏症患儿，发现了该基因的新变异，分析了该基因3个变异的致病性。钴胺素治疗该病应个体化。

目的:探讨钴胺素转运蛋白1(TCN1)在肺腺癌中的表达及其与肺腺癌患者预后的关系，以及TCN1对肺腺癌细胞增殖和迁移侵袭能力的影响。方法:采用非随机抽样的方法选取2020年7月至2021年7月在成都医学院第一附属医院行肺腺癌切除术的患者20例，收集20对经组织病理学证实的肺腺癌样本和距离肿瘤组织至少5 cm的正常肺组织样本。免疫组织化学染色分析TCN1在肺腺癌组织及癌旁正常肺组织中的表达情况，实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blot)检测肺腺癌细胞系及正常肺上皮细胞系内TCN1表达情况。下载TCGA数据库中肺腺癌数据，分析TCN1与肺腺癌患者生存预后的关系，使用加权基因共表达网络分析与TCN1关系最密切的模块，用R 3.6.1软件对该模块内的基因进行基因本体注释(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析，以TCN1的中位值为截断值，将TCGA数据库中的肺腺癌样本分为TCN1高表达组和低表达组，采用GSEA 4.2.3软件分析预测高表达TCN1的肿瘤组织样本内基因富集的信号通路。选用A549肺腺癌细胞系为研究对象，运用噻唑蓝(MTT)和Transwell实验检测敲减TCN1后对A549细胞的增殖和迁移侵袭的影响，采用Western blot检测敲减TCN1后A549肺腺癌细胞内上皮间充质转化(EMT)相关蛋白的表达情况。结果:免疫组织化学染色显示肺腺癌患者肺腺癌组织中TCN1染色为阳性。RT-qPCR和Western blot结果显示，与正常肺上皮细胞系BEAS-2B相比，肺腺癌细胞系A549、LC-2、HCC515和PC14中TCN1普遍高表达( P值均<0.05)。对TCGA数据库中肺腺癌的生存资料进行分析显示TCN1高表达的患者总生存期更短( HR＝1.6， P＝0.002 6)。富集分析结果显示WGCNA筛选出的与TCN1表达最相关的模块内的基因主要涉及胞外基质组成、胞外结构组成、细胞基质黏附等生物学过程以及黏着斑、细胞外基质受体相互作用等相关通路。GSEA软件结果也显示高表达TCN1的肿瘤样本内的基因主要富集在EMT相关通路。MTT结果显示，敲减TCN1 96 h后，A549细胞的增殖能力受到抑制，差异有统计学意义( t＝4.657， P＝0.009)。Transwell实验结果显示，敲减TCN1后，A549细胞的迁移和侵袭能力均受到抑制，差异均有统计学意义( t值分别为10.502、9.604， P值均<0.05)。Western blot结果显示，敲减TCN1后A549细胞内N-cad、ASMA、Slug、Vimentin、Snail等EMT相关蛋白表达降低( P值均<0.05)。 结论:TCN1在肺腺癌组织中为高表达，且与不良预后密切相关。TCN1低表达可能通过抑制EMT影响肺腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭。

目的:筛选系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus, SLE)与肺动脉高压(pulmonary arterial hypertension, PAH)患者外周血单个核细胞(peripheral blood monocyte，PBMC)中的共有差异表达基因并分析其功能。方法:在GEO数据库中筛选SLE数据集(GSE50772和GSE81622)和PAH数据集(GSE703和GSE131793)；筛选各数据集中的差异表达基因；筛选两组SLE数据集共有的差异表达基因，并利用DAVID进行功能分析；筛选PAH数据集共有差异表达基因并进行功能富集分析；筛选四组数据集中共有差异表达基因，并利用荧光定量PCR在临床样本中进行验证。结果:SLE数据集-GSE50772和GSE81622共筛选出232个共有表达差异基因，其中156个基因表达上调，76个基因表达下调。功能分析显示，差异基因主要参与Ⅰ型干扰素信号通路、病毒基因组复制调控、免疫应答等生物过程；主要分子功能与寡腺苷酸合成酶活性、丝氨酸型肽链内切酶活性、核糖核酸酶活性及蛋白结合相关。PAH数据集-GSE703和GSE131793共筛选出18个表达差异基因。功能分析显示，差异基因主要参与细胞粘附、细胞基质粘附、细胞迁移等生物过程；主要分子功能与锚定蛋白及蛋白结合相关。SLE与PAH数据集共筛选出3个共有差异表达基因：PLSCR1、TCN2、S100A12。荧光定量PCR鉴定结果显示，在SLE和PAH患者PBMC中，S100A12表达水平上调( W＝194.50， P<0.05)。 结论:转录组数据分析和临床样本的实验验证表明S100A12在SLE和PAH患者PBMC中表达升高，提示S100A12可能在SLE并发PAH的过程中发挥作用。

目的:研究2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus, T2DM)患者非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease, NAFLD)及进展纤维化与骨质疏松(osteoporosis, OP)的关系。方法:通过横断面研究方法，收集2019年9月至2020年9月于南京医科大学附属淮安第一医院内分泌及老年医学科住院的T2DM患者391例。根据肝脏B超分为T2DM合并NAFLD和T2DM未合并NAFLD组。根据肝纤维化指数分为肝脏纤维化低分险组及肝脏纤维化中高风险组。收集患者一般临床特征和病史、实验室及双能X线骨密度检查结果。多因素 logistic回归评估T2DM患者NAFLD及进展肝纤维化与OP的关系，最后根据年龄、性别、体重指数和糖尿病病程进行交互作用和分层分析。 结果:多因素 logistic回归显示T2DM患者罹患OP风险及骨密度下降与NAFLD发生无统计学意义上差异(所有 P>0.05)。调整年龄、性别、体重指数和糖尿病病程后，肝脏纤维化中高风险组T2DM患者髋部骨密度( β为－0.044，95% CI －0.087~－0.001， P＝0.046)和腰椎L 1-L 4骨密度( β为－0.044，95% CI －0.087~－0.002， P＝0.044)均显著减低，罹患OP的风险显著增加( OR为2.428，95% CI 1.124~5.244， P＝0.024)。最后亚组分析显示，肝脏纤维化中高风险组的T2DM超重患者罹患OP风险显著增加( OR为4.240，95% CI 1.637~10.987，交互作用 P＝0.018)。 结论:T2DM患者骨密度下降和罹患OP风险与NAFLD发生差异无统计学意义，但NAFLD相关进展肝性纤维化是T2DM超重患者骨密度下降和罹患OP的独立危险因素。

TCN1编码的蛋白是血清维生素B12（钴胺素）转运过程中重要的结合蛋白，可通过调控血清钴胺素浓度进而影响DNA合成，导致相关疾病的发生。近年来生物信息学分析和相关研究表明，TCN1在肿瘤组织中发挥着癌基因的作用。TCN1通过调控癌转录失调通路、NF-κB通路、TNF信号通路以及影响整合素β4（ITGB4）、丙酮酸脱氢酶复合物（PDHA1）、琥珀酸脱氢酶（SDH）和细胞色素c氧化酶等物质的活性，参与消化道肿瘤细胞的增殖、侵袭和免疫浸润等一系列生物学行为。因此，了解TCN1基因在消化道肿瘤中的作用机制对临床制定肿瘤的诊断和治疗策略具有重要意义。

In recent decades, regional and global climate change has increased the frequency of extreme weather events (e.g., hurricanes, cold spells, and heat waves). The diurnal temperature range (DTR) and temperature change between neighboring days (TCN), which are indicators of short-term temperature shifts, have been found to be significantly associated with cardiovascular morbidity or mortality[1]. A worldwide study on the effects of temporal changes on mortality burden in 10 countries found that a negative impact of high DTR on mortality in a short time and a 10 ℃ increment in DTR increased the risk of overall mortality by 3.10％[2].

目的检测北方汉族孤独症谱系障碍(autism spectrum disorder , ASD)儿童转钴胺素蛋白Ⅱ(transcobalamin Ⅱ, TCN2)基因启动子区的甲基化水平和血清中 TCN2 酶的含量,为探讨叶酸代谢关键酶与 ASD 的发生提供参考依据.方法收集 30 例诊断明确的 ASD 儿童和30 例正常对照组儿童,应用焦磷酸测序方法检测 TCN2 基因启动子区 (chr22:30607227-30607240)的甲基化水平,同时应用 ELISA 试剂盒测定 TCN2 蛋白的含量.结果ASD 儿童组中 TCN2 基因甲基化水平高于正常对照组(P =9.986E-4),ASD 儿童血清中TCN2 含量低于对照组(P =1.162E-10),差异均有统计学意义.结论 ASD 儿童 TCN2 基因启动子区的甲基化水平存在异常,可能存在叶酸代谢异常.

To unravel the genetic mechanisms of disease and physiological traits,it requires comprehensive sequencing analysis of large sample size in Chinese populations.Here,we report the primary results of the Chinese Academy of Sciences Precision Medicine Initiative (CASPMI) project launched by the Chinese Academy of Sciences,including the de novo assembly of a northern Han reference genome (NH1.0) and whole genome analyses of 597 healthy people coming from most areas in China.Given the two existing reference genomes for Han Chinese (YH and HX1) were both from the south,we constructed NH1.0,a new reference genome from a northern individual,by combining the sequencing strategies of PacBio,10× Genomics,and Bionano mapping.Using this integrated approach,we obtained an N50 scaffold size of 46.63 Mb for the NH1.0 genome and performed a comparative genome analysis of NH1.0 with YH and HX1.In order to generate a genomic variation map of Chinese populations,we performed the whole-genome sequencing of 597 participants and identified 24.85 million (M) single nucleotide variants (SNVs),3.85 M small indels,and 106,382 structural variations.In the association analysis with collected phenotypes,we found that the T allele of rs1549293 in KAT8 significantly correlated with the waist circumference in northern Han males.Moreover,significant genetic diversity in MTHFR,TCN2,FADS1,and FADS2,which associate with circulating folate,vitamin B12,or lipid metabolism,was observed between northerners and southerners.Especially,for the homocysteine-increasing allele of rsl801133 (MTHFR 677T),we hypothesize that there exists a "comfort" zone for a high frequency of 677T between latitudes of 35-45 degree North.Taken together,our results provide a high-quality northern Han reference genome and novel population-specific data sets of genetic variants for use in the personalized and precision medicine.

转钴胺素Ⅰ (transcobalamin 1,TCNl)属于R-结合蛋白家族,TCN1蛋白在体内多处均有分布,如血清、粒细胞、食管、胃肠、唾液腺等部位.TCN1在人体中主要的生理功能是参与VB12的转运,促进甲硫氨酸循环等,以维持人体各种生理功能需求.作为逐渐受到研究者重视的肿瘤标记物,TCN1已被发现在多种肿瘤性疾病中表达异常,如粒细胞白血病、结直肠癌、胃癌、乳腺癌等.现将TCN1基因及其蛋白在肿瘤组织中的研究现状和进展做一综述.

[背景]在全球气候变暖的大背景下,温度变异对人体健康的影响受到关注.[目的]探讨隔日温差(TCN)对居民非意外死亡寿命损失年(YLL)的影响,定量评估可归因于TCN的人群寿命损失年百分比.[方法]收集云南省2013—2017年56个区县的每日非意外死亡数据与气象数据资料,根据寿命表计算YLL率(每10万人口YLL值),采用分布滞后非线性模型和meta分析结合的两阶段分析方法,以4—9月份为暖季,其余时间为冷季,分别建立冷、暖季TCN与人群YLL率的暴露反应关系,并计算归因分值(AF).[结果]冷、暖季TCN中位数均为0.1℃.与TCN=0℃相比:暖季TCN平均每降低1℃,YLL率及其95％CI降低2.00/10万(0.28/10万～8.71/10万);隔日升温1.4℃以内时可引起YLL率的增加,TCN=1.4℃时YLL率及其95％CI增加2.15/10万(0.04/10万～4.26/10万).冷季隔日降温9.2℃以内时可引起YLL率的降低,TCN=9.2℃时YLL率及其95％CI降低8.78/10万(0.64/10万～16.45/10万).老年人(≥65岁)较中青年人(0～64岁)更易受TCN的影响,暖季TCN平均每变化1℃,中青年和老年人的YLL率平均改变1.18/10万、5.18/10万,冷季则分别为0.79/10万和8.82/10万.暖季TCN下降对男性的作用大于女性,冷季TCN下降幅度超过7.61℃后对女性的影响更大.隔日降温引起可归因于TCN的YLL下降,隔日升温均引起归因YLL上升,中等降温(TCN为P2.5～0℃)的影响最大(暖季AF=-5.76％,95％CI:-7.10％～-4.49％;冷季AF=-3.98％,95％CI:-5.83％～-2.07％).[结论]隔日温度升高对居民寿命损失存在不良影响.