-
基于Olink蛋白质组学建立鼻咽癌患者重度急性放疗不良反应预测模型
编辑人员丨1周前
目的:探讨鼻咽癌患者放疗前血浆中炎性细胞因子水平与急性放疗不良反应的关系,初步建立放疗期间重度急性不良反应发生风险的预测模型。方法:横断面研究。回顾性选取2016年5月至2019年3月就诊于中国医学科学院肿瘤医院接受根治性放疗的85例鼻咽癌患者。按照美国肿瘤放疗协作组(RTOG)急性放射性损伤评价标准评估放疗期间放射性口腔黏膜炎、放射性皮炎和口干发生的最高等级不良反应,以其≥3级为重度。采用Olink蛋白质组学技术,检测患者首次放疗前血浆中92种炎性细胞因子水平(标准化的蛋白表达值)。采用单因素方差分析和独立样本 t检验分析炎性细胞因子与临床因素及与放疗期间3种急性不良反应的关系。基于炎性细胞因子和(或)临床因素,采用二元logistic回归构建重度急性放疗不良反应发生风险的预测模型。以美国RTOG急性放射性损伤评价标准评定的放疗期间最严重等级的不良反应是否重度为金标准,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析依据构建的各模型判断重度急性放疗不良反应发生的效能。 结果:85例患者中,男性68例,女性17例;中位年龄[ M( Q1, Q3)]49岁(43岁,60岁);所有患者均接受根治性放疗,其中64例联合化疗或靶向治疗。19例(22.1%)出现重度急性放疗不良反应。1、2、3级急性放射性口腔黏膜炎患者放疗前血浆白细胞介素22受体A1(IL-22RA1)、白细胞介素18受体1(IL-18R1)、嗜酸性粒细胞趋化因子(CCL11)、肿瘤坏死因子超家族成员14(TNFSF14)、酪氨酸激酶受体3配体(Flt3L)和单核细胞趋化蛋白2(MCP-2)水平差异均有统计学意义(均 P<0.05);1、2、3级急性放射性皮炎患者放疗前血浆CD244、CC趋化因子配体20(CCL20)、白血病抑制因子受体(LIF-R)和白细胞介素(IL)-4水平差异均有统计学意义(均 P<0.05);1级和2级口干患者放疗前血浆IL-12B、CXC型趋化因子配体11(CXCL11)、LIF-R和IL-33水平差异均有统计学意义(均 P<0.05)。单因素方差分析中,各临床因素与严重急性放疗不良反应均不相关(均 P>0.05),根据文献选取年龄、T分期、N分期、临床分期、是否接受化疗、是否患有糖尿病6个临床因素建立二元logistic回归模型M1。根据细胞因子功能和既往文献,在差异细胞因子中选取IL-22RA1、IL-18R1、MCP-2、CCL11、CD244、CCL20和IL-33建立二元logistic回归模型M2。结合上述临床因素和细胞因子建立二元logistic回归模型M3。ROC曲线分析显示,预测模型M1、M2和M3判断重度急性放疗不良反应发生的曲线下面积分别为0.787、0.841、0.868。 结论:不同等级急性放疗不良反应鼻咽癌患者间放疗前血浆中多种炎性细胞因子表达水平有差异,基于患者首次放疗前血浆炎性细胞因子水平结合临床因素构建模型能较好地预测重度急性放疗不良反应发生风险。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
人磷脂酰乙醇胺结合蛋白4在多发性骨髓瘤中的表达及其意义
编辑人员丨1周前
目的:探讨多发性骨髓瘤(MM)患者血清人磷脂酰乙醇胺结合蛋白4(hPEBP4)等因子的表达情况及其临床意义。方法:以2016年9月至2018年9月北京朝阳医院西院收治的59例症状性MM患者作为研究对象。根据血钙升高、肾损害、贫血和骨损害(CRAB症状)将患者分为两组,其中具有活动性CRAB症状的44例为活动组,化疗后至少达到部分缓解且CRAB症状缓解的15例为反应组。活动组患者中,严重骨损害(SBL)组30例,非严重骨损害(NSBL)组14例;修订的国际预后分期系统(R-ISS)Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ期分别为26、11、7例。选取与患者年龄及性别匹配的健康体检者15名作为健康对照组。用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测hPEBP4、肿瘤坏死因子配体超家族成员14(LIGHT/TNFSF14)和激活素A在受试者中的表达水平。采用Pearson法分析活动组中各因子表达间的关系,依据受试者工作特征(ROC)曲线确定各因子诊断MM的最佳截断值,并依此分层,比较各分层患者间总生存(OS)差异。结果:活动组、反应组、健康对照组hPEBP4水平分别为(1.48±0.64)μg/L、(1.49±0.75)μg/L、(0.31±0.10)μg/L,LIGHT/TNFSF14分别为(169±112)ng/L、(256±132)ng/L、(44±27)ng/L,激活素A分别为(383±266)ng/L、(223±79)ng/L、(234±85)ng/L,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。活动组中,R-ISSⅠ、Ⅱ、Ⅲ期患者hPEBP4水平分别为(1.06±0.60)μg/L、(1.15±0.50)μg/L、(1.73±0.68)μg/L,差异有统计学意义( F=3.287, P=0.032);激活素A水平分别为(219±55)ng/L、(247±117)ng/L、(450±215)ng/L,Ⅲ期患者均高于Ⅰ、Ⅱ期(均 P<0.05)。活动组中,SBL患者的LIGHT/TNFSF14和激活素A水平均高于NSBL患者[(174±101)ng/L比(98±53)ng/L,(467±238)ng/L比(189±71)ng/L],差异均有统计学意义(均 P<0.05)。IgG型活动组患者hPEBP4水平与M蛋白水平( r=0.694, P<0.01)和激活素A水平( r=0.252, P<0.01)均呈正相关。经ROC曲线分析,hPEBP4、LIGHT/TNFSF14、激活素A诊断MM的最佳截断值分别为1.04 μg/L、97.0 ng/L、156.2 ng/L。hPEBP4>1.04 μg/L和≤1.04 μg/L患者中位OS时间分别为57个月(95% CI 22~92个月)和未达到,差异有统计学意义( P<0.05);激活素A≥156.2 ng/L和<156.2 ng/L患者的中位OS时间分别为61个月(95% CI 24~98个月)和未达到,差异有统计学意义( P<0.05)。 结论:hPEBP4高表达与MM进展有关,与M蛋白水平呈正相关,与OS呈负相关;其可能成为判断病情进展和肿瘤负荷的重要标志物。LIGHT/TNFSF14和激活素A协同hPEBP4可能参与MM肿瘤微环境的病理过程。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
先天性巨结肠lncRNA-mRNA共表达网络构建和分析
编辑人员丨1周前
目的:通过生物信息学的方法构建先天性巨结肠(Hirschsprung disease,HSCR)调控网络。方法:RNA测序检测HSCR组织和正常结肠组织中的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA表达谱。结合GSE96854数据库的mRNA表达谱数据,构建lncRNA-mRNA共表达网络。各选择3个lncRNA和mRNA,采用QPCR验证RNA测序结果。结果:RNA测序共筛选出224个lncRNA,其中上调和下调的lncRNA分别为108和116个;785个差异表达的基因(differentially expressed genes,DEGs),其中上调和下调的DEGs分别为82个和703个。DEGs主要富集在cGMP-PKG、NF-κB信号通路等KEGG通路上。在GSE96854数据中,显著上调和显著下调的DEGs分别为1 216个和1 376个。两个数据集中后共有的DEGs有178个,其中显著下调的DEGs有175个,而显著上调的DEGs仅有3个。蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)结果表明,SNAP25、SYP、ATP2B3和ZAP70位于网络中心的基因,与诸多基因尤其是SNAP25有互作关系。共筛选出146对lncRNA-mRNA调控网络。筛选出AC074286.1-ADRA2A-cGMP-PKG和DUX4L9-ATP2B3-NF-κB信号通路的lncRNA-mRNA通路调控网络。实时定量基因扩增荧光检测结果表明ADRA2A、ATP2B3、TNFSF14、AC074286.1、DUX4L9和REXO1L1P在HSCR中显著下调,且与RNA测序结果一致。结论:参与炎症反应、细胞凋亡和神经相关的lncRNA和mRNA分子标志物在HSCR中发挥着重要的作用。
...不再出现此类内容
编辑人员丨1周前
-
肿瘤坏死因子超家族成员14对小鼠银屑病样皮炎中角质形成细胞铁死亡的作用
编辑人员丨1个月前
目的 探讨肿瘤坏死因子超家族成员 14(tumor necrosis factor super family 14,TNFSF14)/LIGHT对小鼠银屑病样皮炎中角质形成细胞铁死亡的作用及机制.方法 动物实验中,将LIGHT+/+小鼠(C57BL/6 背景)和LIGHT-/-小鼠(C57BL/6 背景)分为4 组(每组5 只):LIGHT+/+小鼠凡士林(vaseline)组;LIGHT+/+小鼠咪喹莫特(imiquimod,IMQ)组;LIGHT-/-小鼠凡士林组;LIGHT-/-小鼠咪喹莫特组.凡士林或咪喹莫特涂抹背部皮肤,1 次/d,连续 5d后收集皮损组织样本.qRT-PCR检测酰基辅酶a合成酶长链家族成员4(ACSL4)、胱氨酸谷氨酸反向转运体(xCT)和谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)等铁死亡指标以及IL-23/IL-17 轴等炎症因子指标的表达;免疫组织化学检测ACSL4、xCT、GPX4 及角蛋白(KRT6)的表达.体外细胞实验中,将人永生化角质细胞系HaCaT细胞做以下处理:培养基(Medium)对照组、重组人 LIGHT 因子(recombinant human LIGHT,rhLIGHT)处理组、rh-LIGHT+PTL[(-)-Parthenolide,欧苷菊,NF-κB活化抑制剂]处理组.在处理2d和2.5d后收集细胞,分别提取总RNA 和蛋白.qRT-PCR 检测细胞中ACSL4、xCT、GPX4 和IL-23/IL-17 轴相关炎症因子以及KRT6 的表达;Western blot或细胞免疫荧光检测ACSL4、xCT、GPX4、P65、P-p65 和KRT6 的表达.结果 动物实验结果显示,在IMQ诱导的小鼠银屑病样皮炎模型中,TNFSF14/LIGHT基因敲除后细胞铁死亡水平下降、IL-23/IL-17 轴等相关炎症因子释放均显著减少.体外细胞实验结果显示,加入rhLIGHT刺激HaCaT细胞后,细胞铁死亡水平上升、IL-23/IL-17轴等炎症因子的表达均显著上调,NF-κB通路被激活;加入NF-κB活化抑制剂PTL后,可部分逆转rhLIGHT对HaCaT细胞的上述效应.结论 TNFSF14/LIGHT可能通过激活NF-κB通路促进角质形成细胞铁死亡,参与银屑病样皮炎的病理发生过程.
...不再出现此类内容
编辑人员丨1个月前
-
染色质调节因子相关的lncRNA肾透明细胞癌预后模型的构建和验证
编辑人员丨2024/3/30
目的 构建染色质调节因子(CR)相关长链非编码RNA(lncRNA)的肾透明细胞癌(ccRCC)预后模型,提高ccRCC的预后管理.方法 从TCGA数据库下载ccRCC的转录组数据和临床数据,并通过"caret"R包将ccRCC样本以 7∶3 的比例分为训练集(166 例)和验证集(71 例).基于"DESeq2"R包筛选出差异表达的CR及相关的lncRNA.构建CR与lncRNA的共表达网络,并筛选出相关系数|rs|>0.3且P<0.05的差异lncRNA.利用单因素Cox、Lasso和多因素逐步Cox回归分析,构建CR相关的lncRNA预后模型.计算训练集和验证集样本的风险评分,根据风险评分的中位数将ccRCC患者分为高、低风险组.K-M曲线和受试者操作特征(ROC)曲线评价模型,单因素和多因素Cox回归分析评估风险评分的独立预测性能."DynNom"和"shiny"R包开发在线预测工具.单样本基因集富集分析探索风险评分与免疫微环境及免疫检查点的关系.结果 本研究最终纳入 237 个肿瘤样本和72 个癌旁正常组织样本,鉴定了 1 025 个CR相关的lncRNA,最终筛选得到 7 个CR相关lncRNA(DUXAP8、AC026462.3、LINC01460、AL592494.1、AL353804.2、AC012462.1、AC009518.1)构建预后模型,并将其开发成在线工具(https://xzlmodelshiny.shinyapps.io/DynNomapp/).高危组患者的生存率低于低危组(P<0.05),ROC曲线表明模型预测效能较好,单因素分析和多因素分析中风险评分的HR值分别为 4.058(95%CI:2.530~6.508,P<0.001)和3.096(95%CI:1.887~5.080,P<0.001).高风险组MDSC和Tregs细胞等免疫抑制细胞的浸润比例高于低风险组,趋化因子、免疫检查点及副炎症等通路的富集水平高于低风险组(P<0.05).此外,风险评分与免疫检查点TNFRSF25和TNFSF14呈正相关(r>0.3,P<0.05).结论 本研究构建的CR相关的lncRNA风险模型可独立有效地预测ccRCC患者的预后.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2024/3/30
-
儿童病毒性肺炎血清肿瘤坏死因子超家族成员14、甲壳质酶蛋白40、可溶性白细胞介素2受体水平变化与短期预后的相关性
编辑人员丨2023/11/25
目的 探讨儿童病毒性肺炎血清肿瘤坏死因子超家族成员14(TNFSF14)、甲壳质酶蛋白40(YKL-40)、可溶性白细胞介素2受体(sIL-2R)水平变化与短期预后的关系.方法 选取2019年1月—2020年6月在西安国际医学中心医院儿科接受治疗的病毒性肺炎患儿120例(观察组).另选取这一时期在该院体检健康儿童80例(对照组).采用酶联免疫吸附法检测血清TNFSF14、YKL-40、sIL-2R水平,并分析其与患者病情程度及预后的关系.采用受试者工作特征(ROC)曲线,分析TNFSF14、YKL-40、sIL-2R对病毒性肺炎患儿临床预后的诊断效能.结果 观察组血清TNFSF14、YKL-40、sIL-2R水平分别均高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).重度组血清TNFSF14、YKL-40、sIL-2R水平分别高于轻度组,差异有统计学意义(P<0.05).预后不良组血清TNFSF14、YKL-40、sIL-2R水平分别高于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05).Pearson相关性分析结果显示,血清TNFSF14、YKL-40、sIL-2R分别与急性生理学和慢性健康状况评价Ⅱ(APACHE Ⅱ)的评分呈正相关(P<0.05).ROC曲线结果示:血清TNFSF14、YKL-40、sIL-2R联合检测预测患儿不良预后的AUC为0.921(95%CI:0.867~0.984,P<0.001),灵敏度和特异度分别为0.905和0.816.多因素logistic回归分析结果示:APACHE Ⅱ 评分(95%CI:1.001~3.268,P=O.005)及血清 CRP(95%CI:1.755~6.143,P=0.001)、TNFSF14(95%CI:1.427~5.619,P=0.001)、YKL-40(95%CI:1.109~3.525,P<0.001)、sIL-2R(95%CI:1.265~4.173,P=0.002)是病毒性肺炎患儿不良预后的独立危险因素.结论 血清TNFSF14、YKL-40、sIL-2R水平变化与病毒性肺炎患儿的病情严重程度及临床预后密切相关,也是影响患儿不良预后的重要危险因素,且对评估患儿的临床结局有较高参考价值.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/11/25
-
卵巢癌超声造影参数与血管新生、癌细胞生长的相关性研究
编辑人员丨2023/8/6
目的:研究卵巢癌超声造影参数与血管新生、癌细胞生长的相关性.方法:选择2015年2月~2017年6月期间在四川省凉山州第二人民医院接受手术切除的卵巢肿瘤患者作为研究对象,根据术后病理结果分为肿瘤性质为卵巢癌的卵巢癌组以及肿瘤性质为良性肿瘤的对照组.术前进行超声造影检查并测定达峰时间TTP、增强强度EI;术后收集肿瘤病灶并测定血管新生分子、细胞增殖分子、细胞侵袭分子的蛋白含量.结果:卵巢癌组卵巢癌病灶组织的EI显著高于对照组良性肿瘤病灶组织(P<0.05),TTP显著低于对照组良性肿瘤病灶组织(P<0.05);卵巢癌病灶组织中VEGFR1、Tie-2、CGB5、NFATc1、CyclinD1、FUNDC1、IGFBP2、IGFBP3、ZEB1的蛋白含量显著高于良性肿瘤病灶组织且与EI水平呈正相关(P<0.05),与TTP水平呈负相关(P<0.05);TNFSF15、Fibulin-5、ELF5、p27Kip1、p21、FN14、E-cadherin的蛋白含量显著低于良性肿瘤病灶组织(P<0.05),EI水平呈负相关(P<0.05),与TTP水平呈正相关(P<0.05).结论:卵巢癌超声造影参数能够反应病灶内血管新生的程度及癌细胞浸润性生长的活力.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
LIGHT在低氧性肺动脉高压形成中的作用及机制
编辑人员丨2023/8/6
目的 初步探讨LIGHT在低氧性肺动脉高压(hypoxic pulmonary hypertension,HPH)形成中的作用及其机制.方法 将20只8周龄雌性C57BL/6J小鼠[体质量(17.90 ±0.91)g]和20只8周龄雌性LIGHT-/-C57BL/6J小鼠[体质量(17.55 ±0.93)g]分为4组(n=10):①野生小鼠常氧组(WT-C组)、②野生小鼠低氧组(WT-H组)、③LIGHT KO小鼠常氧组(LIGHT KO-C组)、④HGHT KO小鼠低氧组(LIGHT KO-H组).WT-H组和LIGHT KO-H组小鼠置于模拟6000 m低压舱内连续低氧饲养30 d,WT-C组和LIGHT KO-C组小鼠舱外(海拔308 m)常规饲养.检测右心室收缩压(right ventricular systolic pressure,RVSP)和右心肥厚指数(right ventricular hypertrophy index,RVHI);HE染色观察肺小动脉结构;免疫组化检测LIGHT及其受体HVEM、LTβR表达;荧光定量PCR和Western blot检测肺组织LIGHT、HVEM和LTβR、IL-6的mRNA和蛋白水平.流式细胞术检测肺组织中各类炎症细胞的比例.结果 与WT-C组相比,WT-H组肺组织中LIGHT的mRNA和蛋白水平均显著增高(P<0.05),WT-H组RVSP和RVHI明显升高(P<0.05),肺小动脉明显增厚;与HGHT KO-C组相比,LIGHT KO-H组小鼠的RVSP、RVHI和肺小动脉厚度显著增加(P<0.05),但与WT-H组相比,LIGHTKO-H组的RVSP、RVHI和肺小动脉增厚程度明显降低(P<0.05).与WT-C组相比,WT-H组LIGHT受体HVEM表达增加,LTβR表达降低,差异具有统计学意义(P<0.05).LIGHT KO-H组与WT-H组相比,肺组织IL-6mRNA和蛋白水平显著降低(P<0.05).流式细胞检测发现,与WT-C组相比,WT-H组小鼠肺组织中单核细胞比例降低[(3.88±0.87)% vs (11.03±1.71)%,P <0.05],间质巨噬细胞比例升高[(15.56±2.69)% vs (8.57±2.17)%,P <0.05];与WT-H组相比,LIGHT KO-H组的肺组织单核细胞增加[(6.55±1.01)% vs (3.88±0.87)%,P <0.05],而间质巨噬细胞的比例降低[(10.87±1.68)%vs.(15.56±2.69)%,P <0.05].结论 慢性低氧诱导肺组织中HGHT表达增加与HPH发病机制密切相关.LIGHT可能通过HVEM信号途径促进细胞增殖、上调肺组织IL-6表达、促进肺间质巨噬细胞产生,参与HPH的形成.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
Increased levels of miR-3099 induced by peripheral nerve injury promote Schwann cell proliferation and migration
编辑人员丨2023/8/6
MicroRNAs (miRNAs) can regulate the modulation of the phenotype of Schwann cells. Numerous novel miRNAs have been discovered and identified in rat sciatic nerve segments, including miR-3099. In the current study, miR-3099 expression levels following peripheral nerve injury were measured in the proximal stumps of rat sciatic nerves after surgical crush. Real-time reverse transcription-polymerase chain reaction was used to determine miR-3099 expression in the crushed nerve segment at 0, 1, 4, 7, and 14 days post sciatic nerve injury, which was consistent with Solexa sequencing outcomes. Expression of miR-3099 was up-regulated following peripheral nerve injury. EdU and tran-swell chamber assays were used to observe the effect of miR-3099 on Schwann cell proliferation and migration. The results showed that increased miR-3099 expression promoted the proliferation and migration of Schwann cells. However, reduced miR-3099 expression sup-pressed the proliferation and migration of Schwann cells. The potential target genes of miR-3099 were also investigated by bioinformatic tools and high-throughput outcomes. miR-3099 targets genes Aqp4, St8sia2, Tnfsf15, and Zbtb16 and affects the proliferation and mi-gration of Schwann cells. This study examined the levels of miR-3099 at different time points following peripheral nerve injury. Our results confirmed that increased miR-3099 level induced by peripheral nerve injury can promote the proliferation and migration of Schwann cells.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
-
LIGHT/TNFSF14减轻顺铂诱导的小鼠急性肾损伤及机制
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究与单纯疱疹病毒糖蛋白 D竞争结合疱疹病毒侵入介体的淋巴毒素类似物(LIGHT)即肿瘤坏死因子超家族蛋白 14(TNFSF14)在顺铂诱导的急性肾损伤(Cis-AKI)中的作用并初步探讨其机制.方法 选取雄性野生型(WT)和 LIGHT敲除(LIGHT-/-)C57BL/6小鼠,分为WT小鼠生理盐水组、WT小鼠顺铂组、UGHT-1-小鼠生理盐水组和 LIGHT-1-小鼠顺铂组.其中顺铂组予以单次腹腔注射顺铂(20 mg/kg,200μL),生理盐水组以等体积生理盐水替代.72h后,处死小鼠,眼球取血,同时收集肾脏组织.全自动生化分析仪检测血尿素氮(BUN)及血清肌肝(Scr)水平;HE染色检测肾组织病理学改变,实时定量PCR检测小鼠肾组织中 UGHT、肾损伤分子 1(阻M-I)、白细胞介素 6(IL-6)、单核细胞趋化蛋白 1(MCP-l)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)的mRNA水平;免疫组织化学染色法检测肾组织中LIGHT的表达;Western blot法检测肾组织 LIGHT、Bc12、BAX 、细胞色素 C的蛋白水平.结果 与生理盐水处理的WT小鼠相比,顺铂处理WT小鼠肾组织LIGHT表达明显升高.与顺铂处理的WT小鼠相比,LIGHT-/-小鼠顺铀诱导的肾损伤更为严重 BUN、Scr升高和肾脏组织损伤更严重;且肾组织 IL-6、MCP-1和TNF-α的 mRNA以及 BAX、细胞色素 C的蛋白水平增加,Bc12蛋白水平降低.结论 LIGHT在 Cis-AKI中具有保护作用,可能与降低炎症因子分泌及减少细胞凋亡有关.
...不再出现此类内容
编辑人员丨2023/8/6
