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基于加权基因共表达网络分析筛选卵巢上皮性癌预后相关关键基因并建立基因预后模型
编辑人员丨4天前
目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选卵巢上皮性癌(卵巢癌)预后相关关键基因,并建立基因预后模型。方法:(1)从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因表达综合(GEO)数据库下载基因表达谱数据集GSE26712,共有185份卵巢癌组织标本和10份正常卵巢组织标本的数据,采用limma软件包筛选出卵巢癌的差异表达基因,与WGCNA筛选出的卵巢癌预后相关模块基因绘制韦恩(Venn)图,取其交集,得到交集基因;再结合基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行信号通路富集分析,构建交集基因相应蛋白之间的相互作用网络。(2)在交集基因中,采用单因素及多因素Cox回归模型分析筛选出与卵巢癌患者总生存时间显著相关的关键基因,据此构建基因预后模型,预后模型风险评分为各关键基因的表达水平乘以相应权重值后求和,以风险评分的中位数为界分为高风险组和低风险组。使用癌症基因组图谱(TCGA)数据库(共有379份卵巢癌组织标本)进行验证;并对TCGA数据库中的高风险组、低风险组采用基因集富集分析(GSEA)进行KEGG信号通路富集、基因突变分析和免疫特征分析。结果:(1)数据集GSE26712筛选出的1 024个卵巢癌差异表达基因与WGCNA筛选出的523个卵巢癌预后相关模块基因绘制韦恩图,取其交集获得378个交集基因。(2)单因素及多因素Cox回归模型分析共筛选出6个与预后显著相关的关键基因,即BNC1、CERK、FOXO1、GALNT6、MRPL2、PRSS2基因,构建基因预后模型,风险评分=BNC1基因表达水平×0.06+CERK基因表达水平×0.24+FOXO1基因表达水平×0.14+GALNT6基因表达水平×(-0.22)+MRPL2基因表达水平×(-0.20)+PRSS2基因表达水平×(-0.07)。训练集(GSE26712数据集)和验证集(TCGA数据库)中低风险组总生存率均显著高于高风险组( P<0.001, P=0.003)。采用GSEA进行的KEGG信号通路富集发现,低风险组的基因在氧化磷酸化相关通路中富集,高风险组的基因在恶性肿瘤、钙离子等信号通路中富集;基因突变分析发现,TP53和TTN基因在高风险组(分别为82%、23%)和低风险组(分别为85%、24%)中的突变率均高于15%;免疫特征分析发现,低风险组浆细胞、滤泡辅助性T淋巴细胞、M1型巨噬细胞的浸润比例均显著高于高风险组( P均<0.05),而休眠记忆CD 4 T淋巴细胞的浸润比例显著低于高风险组( P<0.05)。 结论:基于WGCNA筛选的卵巢癌关键基因建立的基因预后模型能有效预测卵巢癌患者的预后,基因预后模型中的6个关键基因为研究卵巢癌的发生、发展及治疗靶点提供了参考依据。
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编辑人员丨4天前
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化疗引起原始卵泡过度激活的机制及相关治疗的新进展
编辑人员丨2024/7/6
女性在胚胎时期就已确定了反映卵巢储备功能的原始卵泡的数量,这对女性在育龄时期起着不可忽视的作用.随着癌症年轻化,许多女性在育龄期遭受了癌症与化疗的打击.因此,原始卵泡的激活与休眠的调节途径变的至关重要.当原始卵泡受到干扰时,引起原始卵泡异常的过度激活,最后导致女性卵巢早衰(POF).本文就化疗引起原始卵泡的过度激活的原因做出了概述,为女性化疗后的不孕症治疗提供了新的视野.并概述了聚焦在原始卵泡层面上的治疗方法,为女性的不孕不育提供了更多的选择.
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编辑人员丨2024/7/6
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卵泡发育的生物力学特性及其临床应用价值
编辑人员丨2024/6/8
卵泡发育过程中卵巢环境高度变化,从而为其提供一个生物力学上允许的环境.本文描述了原始卵泡池休眠及激活、卵泡生长和排卵等动态过程中卵巢生物力学特性、细胞外基质、卵泡的形态及功能的变化,从而影响信号转导的调节.此外,论述了生物机械微环境改变及机械信号转导失调在多囊卵巢综合征、早发性卵巢功能不全等卵巢生殖内分泌疾病发生中的关键病理作用.同时,探讨通过靶向改变卵巢生物力学环境从而恢复生育能力的治疗策略,旨在为临床研究及诊治提供参考.
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编辑人员丨2024/6/8
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大型和小型萼花臂尾轮虫的遗传和生活史特征比较研究
编辑人员丨2023/8/19
近年来,有关生物个体大小变异规律的研究已经成为生活史对策研究的重要内容之一.研究发现,大小相似的萼花臂尾轮虫(Brachionus Calyciflorus)母体所产休眠卵孵化出的不同克隆后代个体大小变化显著,其中,最大个体是最小个体体积的6.25倍.推测种群内产生不同大小的后代个体是轮虫应对环境变化的一种适应性进化策略,然而目前对上述不同大小轮虫克隆的遗传和生活史特征的研究尚未见报道.以mtDNA COI基因和rDNA ITS序列作为分子标记,比较了个体大小差异显著的不同克隆萼花臂尾轮虫的遗传分化程度和分类地位,并在不同温度(20℃、25℃、30℃)和不同斜生栅藻(Scenedesmus obliquus)食物密度(1.0×106、3.0× 106、5.0× 106个/mL)下比较了它们的生活史特征.结果表明,萼花臂尾轮虫种群内个体大小变异并非由于遗传特征的明显分化所导致,大型和小型个体轮虫克隆在两种分子标记上并不构成姐妹种,且两种形态型间还存在共享单倍型.温度、食物密度、轮虫形态型,以及温度和食物密度各自与轮虫形态型之间的交互作用,均显著影响轮虫的生活史特征.小型轮虫在1.0×106个细胞/mL食物密度下显著延长了胚胎和幼体的发育时间,缩短了生殖期历时;大型轮虫在1.0×106个细胞/mL和3.0×106个细胞/mL食物密度下显著延长了幼体的发育时间,但是其用于胚胎发育和生殖的时间却不随食物密度的变化而变化.各温度和食物密度条件下,大型轮虫的生殖期历时、平均寿命和世代时间均显著延长,或有延长趋势;而两者的种群增长能力之间的差异却因温度和食物密度的不同而异.20℃、25℃以及3.0×106个细胞/mL和5.0× 106个细胞/mL食物密度下两种形态型轮虫的生殖能力相似;30℃条件下小型轮虫的生殖能力更强;1.0×106个细胞/mL食物密度下大型轮虫的生殖能力更强.小型轮虫在各温度和各食物密度下均未产生混交雌体后代,而大型轮虫在20℃低温下有较高的后代混交率.因此,大型和小型个体轮虫克隆具有显著不同的生活史策略,且利用有性生殖直接产生个体体积明显变异的不同克隆后代是萼花臂尾轮虫适应不可预测环境变化的一种"赌注策略".
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编辑人员丨2023/8/19
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储藏中药材龙眼肉孳生甜果螨的研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解储藏中药材龙眼肉中甜果螨孳生率和孳生密度等,为预防甜果螨为害中药材龙眼肉提供科学依据.方法 依据甜果螨孳生习性,选取中药店作为样本采集场所,采集库存时间≥6个月的龙眼肉进行甜果螨分离并制做标本,光镜下观察其形态特征鉴定螨种,并参照Hughes(1976)的分类依据进行分类.结果 本次采集的20份储藏龙眼肉样本中有4份检出了甜果螨,孳生率为20.0%;甜果螨的平均孳生密度184.95只/份;其不同发育期的构成比为成螨(含若螨)58.39%、幼螨30.41%、休眠体0.06%、螨卵11.14%.结论 储藏龙眼肉有甜果螨孳生,应防止甜果螨迁徙扩散为害其他干果和预防可能由其引起的人体肠螨病.
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编辑人员丨2023/8/6
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蚂蟥性腺及生殖细胞周年发育的组织学研究
编辑人员丨2023/8/6
采用组织切片和电镜技术,对蚂蟥生殖系统及生殖细胞的发生过程进行观察.结果表明:蚂蟥具有完全独立的雌雄生殖系统,11个月为1个生殖周期;精巢先于卵巢发育,当卵细胞仅为原始生殖细胞团时,精子已经初步具备了完整的形态,精细胞和卵细胞有序发育同步成熟;根据精细胞和卵细胞的发育情况,将精巢发育分为增殖期(1~3月龄)、生长期(4~5月龄)、休眠期(6~8月龄)、成熟期(9月龄)、排放期(10月龄)和退化期(11月龄)共6个时期,将卵巢的发育分为形成期(1~2月龄)、增殖期(3~4月龄)、生长期(5~8月龄)、成熟期(9月龄)、排放期(10月龄)、休止期(11月龄)共6个时期.结论:蚂蟥是“同步性雌雄同体”动物,精卵巢发育各有6个分期,精卵细胞有序发育同步成熟.
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编辑人员丨2023/8/6
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卵巢上皮性癌移植瘤中休眠细胞的干细胞样属性
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨卵巢癌移植瘤中休眠的肿瘤细胞是否具有干细胞属性.方法:将PKH26荧光标记的人卵巢癌SKOV3细胞接种于裸鼠皮下,按保留的PKH26荧光强度,应用FCM法将移植瘤细胞分为3组:PKH26荧光高保留细胞群(PKH26hi细胞)、PKH26荧光低保留细胞群(PKH26low细胞)和PKH26荧光完全淬灭细胞群(PKH26neg细胞).应用FCM法检测pKH26hi、PKH26low和PKH26neg SKOV3细胞的细胞周期分布,实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测PKH26hi、PKH26low和PKH26neg SKOV3细胞中干细胞标志物八聚体集合蛋白3/4 (octamer-binding protein 3/4,OCT3/4)、CD133、CD117、Nanog mRNA和蛋白的表达水平,应用平板克隆形成实验和裸鼠皮下成瘤实验观察PKH26hi、PKH26low和PKH26negSKOV3细胞的体外克隆形成能力和体内成瘤能力.结果:PKH26hi SKOV3细胞中G0/G1期细胞所占百分比均高于PKH261ow和PKH26low细胞(P值均<0.05).PKH26hi SKOV3细胞中干细胞标志物OCT3/4、CD133、CD117和Nanog mRNA和蛋白的表达水平均高于PKH26low和PKH26neg细胞(P值均<0.05).PKH26hi SKOV3细胞的体外克隆形成能力和裸鼠体内成瘤能力均显著高于PKH26low细胞和PKH26neg细胞(P值均< 0.05).结论:裸鼠卵巢癌SKOV3细胞移植瘤中PKH26hi细胞具有干细胞属性.
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编辑人员丨2023/8/6
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促排卵过程中妊娠3例报告及文献复习
编辑人员丨2023/8/6
诱导排卵是治疗排卵障碍的主要手段,但在促排卵过程中出现阴道出血较为少见.本文介绍了3例行促排卵治疗的患者,促排卵过程中出现阴道出血后确认妊娠,包括生化妊娠、异位妊娠和正常妊娠各1例.通过分析和总结此3例患者的病例资料,提示临床上在促排卵前需常规排除妊娠,在促排卵过程中出现异常出血,亦应首先排除妊娠可能.
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编辑人员丨2023/8/6
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枯水期鄱阳湖子湖轮虫休眠卵空间分布特征
编辑人员丨2023/8/6
为了研究枯水期鄱阳湖子湖泊轮虫休眠卵空间分布的差异,于2015年1月份,在鄱阳湖南矶山湿地自然保护区的南深湖和白沙湖2个子湖泊进行取样调查.研究发现,不同生境类型中轮虫休眠卵的密度具有显著差异俨<0.05),轮虫休眠卵的分布具有明显的梯度性,在洲滩植被区、泥滩区和积水区中轮虫休眠卵的密度逐渐减少.南深湖植被区中轮虫休眠卵的密度最高,为(3.34±1.28) ind./cm3,茭白中密度高达5.45 ind./cm3.不同水生植被生境中轮虫休眠卵的密度趋势为:挺水植物>洲滩植物>浮叶植物>沉水植物.不同水深区轮虫休眠卵的分布不具有明确的规律性.此外,研究还发现轮虫休眠卵的密度与底泥的软硬程度具有一定相关性,泥质越软,轮虫休眠卵的密度越低.
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编辑人员丨2023/8/6
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储藏小米孳生害嗜鳞螨调查
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解储藏小米孳生害嗜鳞螨(Lepidoglyphus destructor)情况,并对害嗜鳞螨进行形态学观察. 方法 随机选择安徽省临泉县农户30家,每家采集储藏小米1份,每份10 g,用直接镜检法进行粉螨分离和标本制备,于光学显微镜下观察螨的形态特征. 结果 共采集储藏小米30份(300 g),其中3份检出害嗜鳞螨,检出率为10%;检获害嗜鳞螨共9 858只,平均孳生密度为328.6只/g,且各发育阶段(成螨、第三若螨、休眠体、第一若螨、幼螨、卵)的害嗜鳞螨均有检获.此外,还分离出马六甲肉食螨(Cheyletus malaccensis)和网真扇毛螨(Eucheyletia reticulata).上述3种螨分别隶属于粉螨亚目(Acaridida)、食甜螨科(Glycyphagidae)嗜鳞螨属(Lepidoglyphus)的1种及前气门亚目(Trombidiformes)、肉食螨科(Cheyletidae)中的肉食螨属(Cheyletus)和真扇毛螨属(Eucheyletia). 结论 安徽临泉县农户储藏小米有害嗜鳞螨孳生,可能与小米营养价值高及储藏环境温湿度适宜等有关.害嗜鳞螨有一定危害性,应采取有效措施防止该螨的扩散污染.
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编辑人员丨2023/8/6
