目的:探讨Toll样受体9（TLR9）信号通路激活对肾小管细胞转录组的影响。方法:提取并培养小鼠原代肾小管上皮细胞，在细胞融合度达80%时分为两组，分别加入10 μL磷酸盐缓冲液（PBS，PBS对照组）和终浓度为5 μmol/L的TLR9激活剂胞嘧啶-鸟嘌呤寡脱氧核苷酸（CpG-ODN，CpG-ODN处理组）。提取细胞RNA后在Illumina平台进行测序，使用差异基因分析软件DEGseq分析两组细胞中基因的差异表达情况，通过Goatools和KOBAS在线软件分析差异基因所参与的信号通路，应用Homer软件预测转录因子。结果:与PBS对照组相比，CpG-ODN处理后有584个显著的差异表达基因，其中102个基因表达上调，482个表达下调。差异表达基因富集最显著的基因本体（GO）为β-干扰素响应、病毒响应或防御等炎症反应相关条目；京都基因与基因组百科全书数据库（KEGG）信号通路富集结果显示，富集系数最显著的信号通路包括2'-5'-寡腺苷酸合成酶活性、核糖核酸酶活性的调节、病毒生命周期的负调控、β-干扰素响应和对原生动物的防御反应等。转录因子预测结果显示，干扰素调节因子3（IRF3）是差异基因启动子序列上富集最显著的转录因子；IRF3是TLR9下游表达差异最显著的转录因子，转录因子21（TCF21）、锌指蛋白135（ZNF135）和阳性调节域4（PRDM4）等转录因子可能是TLR9信号通路的新候选靶标。结论:CpG-ODN激活TLR9信号通路，原代肾小管上皮细胞能直接响应CpG-ODN的刺激并发生转录组学变化，为进一步探究TLR9信号通路在脓毒症相关性急性肾损伤中的分子机制研究提供了基础。

口腔微生物群落由多样化的细菌、病毒、真菌和原生动物群体构成，其稳定性、功能和组装过程受到宿主与微生物间复杂的相互作用调控。高通量测序技术为深入研究和认识口腔微生物群落在健康和疾病状态下的分类结构、基因组成、功能和动态变化途径提供了重要方法。本文系统介绍了口腔微生物群落的建立、稳态调控、常见口腔疾病相关的菌群失衡、影响因素。结合微生物学、免疫学和多组学的视角，可以深入探讨人体与微生物间的复杂分子对话。开展口腔微生态组装原理、细胞间信号、压力适应性以及引发菌群失衡触发因素的深入研究，对于开发新的诊断技术、治疗方案和定制益生菌至关重要。可以通过天然产物、小分子化合物、益生元、益生菌、噬菌体等方法调节口腔微生态并尽可能地减少对口腔微生态系统的破坏，为促进口腔和全身健康提供新的机遇。

人微生物菌群是指由寄生在人皮肤及黏膜等部位的细菌、病毒、真菌和原生动物组成的微生物群。通常情况下，微生物菌群同宿主之间保持稳态，共同参与人的生命活动，而当致病菌或机会致病菌异常侵入或富集时可引起菌群失调，从而引起疾病。近些年来，微生物菌群失调与疾病特别是恶性肿瘤的关系成为临床研究的热点。笔者根据国内外研究进展，就肝胆肿瘤与微生物菌群失调关系的研究进展进行综述。

1 概述肺孢子菌是一种专性的细胞外病原体,以滋养体和包囊形式存在.最初被归类为原生动物,直到1988年,通过检测核糖体RNA序列显示其是真菌的一员[1].肺孢子菌只感染哺乳动物,为种属特异性.不同肺孢子菌生物体具有特异性,感染人类的命名为耶氏肺孢子菌(Pneumocystis jirovecii),存在于大鼠的仍称为卡氏肺孢子菌.

原生动物是土壤微生物群落的重要组成部分,在生态系统中扮演着分解者和还原者的双重角色,担负着维持生态系统平衡、健康以及能量流动枢纽等重要功能.研究不同植被类型下土壤原生动物群落特征及其构建过程,对认识各类生态系统中原生动物群落多样性维持机制及加强生物多样性保护有重要意义.本研究以芦芽山森林、灌丛、草地土壤为研究对象,采用高通量测序技术,探究不同植被类型下原生动物群落组成、多样性及构建机制.结果表明:芦芽山不同植被类型土壤原生动物群落分属于9界、23门、58纲、117目、215科、335属和1,979个可操作性分类单元.芦芽山土壤原生动物群落的α多样性在森林与草地、灌丛间没有显著差异.不同植被类型的原生动物群落结构具有差异.冗余分析结果发现,土壤总磷和含水量是决定不同植被类型原生动物群落结构的重要环境因子.零模型结果表明,芦芽山3种植被类型土壤原生动物群落构建过程均以随机性过程占主导.分子生态网络分析显示,土壤原生动物群落的复杂性从高到低依次为草地、灌丛和森林.研究结果揭示了影响芦芽山森林、草地和灌丛土壤原生动物群落在物种组成和多样性的关键生态因子,初步探明不同植被类型土壤原生动物群落的复杂性及其构建机制,为深入了解土壤各营养级生物类群落的相互关系及其构建机制提供理论依据和数据支持.

无菌动物是指通过现代技术手段在其体内外的任何部位均检测不出细菌、真菌、放线菌、支原体、衣原体、螺旋体、立克次氏体、病毒、原生动物和寄生虫的动物.无菌动物因其不携带任何微生物,可转化为携带特定微生物的动物,同时因其免疫系统处于休眠状态,对微生物感染异常敏感,可建立多种悉生动物模型,用于特定微生物感染实验和致病机制研究.此外,无菌动物作为关键工具,是研究菌群与疾病关系的核心,在微生物与宿主健康、疾病和感染机制研究过程中,起着不可替代的作用.本文将对无菌动物及其在微生物与宿主互作机制研究中的应用进行简要综述.

随着人们对高血压的深入了解,越来越多的证据表明高血压患者的血压水平与钠盐关系密切.肠道微生物群由细菌、古菌、真菌、原生动物和病毒等构成,也被称为肠道菌群,肠道菌群及其代谢产物作为当前高血压的热门研究方向,其在钠盐与血压之间扮演了重要的角色.过量钠盐能够改变肠道菌群类群和比例,影响机体炎症水平和代谢水平等因素可能是高血压的发生和发展的机制.控制钠盐摄入是一项低成本且有效的血压控制方式.本文就钠盐、肠道菌群和高血压之间的复杂关系进行综述,希望能够为高血压的预防、治疗和控制提供理论支持.

人体内存在庞大的生态系统,被认为是一个"超级生物体"[1-2].人类的胃肠道内有数万亿的微生物,包括细菌、病毒、真菌和原生动物[3]."肠道微生物群"是指定植在胃肠道中的微生物群落以及它们的全部基因组.肠道微生物群是一个复杂的群落,到目前为止,在很大程度上许多微生物的基本代谢机制和生物学属性是未知的[4].

脑寄生虫感染性疾病是原生动物或蠕虫感染所致的疾病,常见的有脑囊虫病、脑肺吸虫病、脑血吸虫病、脑裂头蚴病等[1-2].脑寄生虫病合并脑脓肿者目前少见报道.福州总医院第四七六临床部神经外科收治l例脑寄生虫病伴化脓性炎症患者,治疗效果良好,现报道如下.

肠道微生物是由存在于肠道部位的细菌、古菌、真菌、原生动物以及病毒所组成的群体.人们通过对细菌16S rRNA序列进行测序与分析,对动物及其在特定条件下的肠道菌群进行了相关方面的研究并取得了很大的进展.此外,由微生态原理发展而成的益生菌、益生元和合生元等微生态制剂,可维持机体肠道微生物的平衡、提高肠道屏障功能、增强机体免疫力.因此越来越多的微生态制剂应用于畜牧业、水产业中.论文综述了小鼠、犬、猪这三种动物的肠道菌群及其应用的研究进展,旨在为进一步深入了解动物肠道菌群的结构、功能以及促进微生态制剂的应用提供参考.