目的:探讨上海市浦东新区腹泻患者小肠结肠炎耶尔森菌的流行特征状况。方法:回顾性分析2013年1月至2019年12月，上海市浦东新区疾病预防控制中心所在区的3所三级医院、9所二级医院和2所社区卫生服务中心的腹泻病原主动监测情况，使用冷增菌法分离小肠结肠炎耶尔森菌，并分析菌株生物/血清型、毒力基因型和抗微生物药物敏感性。使用χ2检验或Fisher确切概率法进行率的比较。结果:2013年1月至2019年12月共纳入腹泻患者12 941例，0.7%（88/12 941）患者经确认感染小肠结肠炎耶尔森菌。67.0%（59/88）患者为单一感染，33.0%（29/88）患者为混合感染。年度病原检出率呈升高趋势（0.3%~1.2%）。<5岁年龄组（1.1%，37/3 218）和春季（1.1%，32/2 998）检出率最高（χ 2分别为18.64和9.76， P<0.05）。58.0%（51/88）患者的粪便性状为水样便，15.9%（14/88）患者有发热症状，14.8%（13/88）患者有呕吐症状。3/O：3型为优势菌型（53.4%，47/88），其次为1A/O：8型（15.9%，14/88）和1A/O：5型（6.8%，6/88）。3/O：3型在<5岁年龄组占比89.2%（33/37）。所有3/O：3型菌株4种致病性毒力基因（ ail、 ystA、 yadA、 virF）均阳性，11/14的1A/O：8型菌株和4/6的1A/O：5型菌株 ystB基因阳性。对氨苄西林（80.7%，71/88）和阿莫西林/克拉维酸（71.6%，63/88）的耐药率最高，63.6%（56/88）菌株为多重耐药。3/O：3型和非3/O：3型菌株间对氨苄西林、头孢西丁、萘啶酸、四环素、氨苄西林/舒巴坦耐药率比较，差异均有统计学意义（χ 2分别为14.68、43.80、41.86、30.54、5.07， P<0.05）。 结论:小肠结肠炎耶尔森菌在上海市浦东新区腹泻儿童中的检出率高于成人，优势菌型为致病性和多重耐药性的3/O：3型。

目的:了解甘肃喜马拉雅旱獭鼠疫疫源地夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物耶尔森菌感染状况，为探索该疫源地鼠疫流行状态提供依据。方法:2014 - 2018年，现场采集20世纪50 - 60年代鼠疫活跃疫源地甘肃夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物肠回盲部及内容物、咽拭子（或舌根部）、血液样本，分别进行耶尔森菌分离、毒力测定及鼠疫耶尔森菌F1抗体检测。结果:958份回盲部及内容物样本检出24株耶尔森菌，检菌率为2.51%，分别为13株小肠结肠炎耶尔森菌（ Yersinia enterocolitia，Y.e）、1株克氏耶尔森菌（ Yersinia kristensenii，Y.k）、2株弗氏/中间耶尔森菌（ Yersinia frederiksenii/intermedia，Y.f/i）、6株中间耶尔森菌（ Yersinia intermedia，Y.i）、1株奥氏耶尔森菌（ Yersinia aldouae，Y.a）、1株 Yersinia massiliensis（Y.m）。958份咽拭子（或舌根部）样本检出19株耶尔森菌，检菌率为1.98%，分别为8株Y.e、1株假结核耶尔森菌（ Yersinia pseudotuberculosis，Y.p）、4株Y.k、1株Y.f/i、4株Y.i、1株 Yersinia ruckeri（Y.r）。检出的21株Y.e均没有致病性，毒力型别有ail -ystA -ystB +yadA -virF -rfbc -、ail -ystA -ystB -yadA -virF -rfbc -两种，分别占9.52%（2/21）、90.48%（19/21）。1 079份血清样本F1抗体检测结果均为阴性。 结论:夏河、碌曲县鼠疫主要宿主动物咽部及肠道内广泛存在耶尔森菌群，检出的Y.e均为非致病性菌株。本次调查结果为进一步研究该疫源地鼠疫耶尔森菌在宿主动物和其生存环境中如何保存提供了线索。

目的:了解江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌的分布特点及分子特征。方法:2017-2021年，在小肠结肠炎耶尔森菌国家级主动监测点江苏省徐州市铜山区和盐城市东台市，采集腹泻患者粪便标本，进行耶尔森菌菌株分离；同时，收集全省哨点医院疑似耶尔森菌菌株。提取分离菌株DNA进行全基因组重测序，并上传至EnteroBase数据库进行耶尔森菌种型鉴定，原始数据经清洁和处理后进行16S核糖体RNA（16S rRNA）基因多态性分析；通过美国国家生物技术信息中心（NCBI）和病原菌毒力因子数据库（VFDB）扫描5种毒力基因（ail、ystA、ystB、yadA、virF）携带情况，同时构建K-mer树并进行基因组特征分析。结果:2017-2021年，共采集腹泻患者粪便标本2 058份，经分离鉴定，得到57株耶尔森菌；同时，通过哨点医院收集到2株耶尔森菌。经EnteroBase数据库比对，51株菌为小肠结肠炎耶尔森菌，4株菌为 Yersinia proxima，阿利克西奇耶尔森菌、马赛耶尔森菌、中间耶尔森菌及 Yersinia canariae各1株。16S rRNA基因多态性分析显示，全部菌株被聚类为3个大组，可区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌。51株小肠结肠炎耶尔森菌中，49株为毒力基因Ⅲ型（ail-、ystA-、ystB+、yadA-、virF-），2株为毒力基因Ⅱ型（ail+、ystA+、ystB-、yadA-、 virF-）；8株其他耶尔森菌均为毒力基因Ⅳ型（ail-、ystA-、ystB-、yadA-、virF-）。K-mer分析可区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌，JS-XZ-2020001菌株与其他小肠结肠炎耶尔森菌距离较远，血清型为O8的小肠结肠炎耶尔森菌分布较集中。 结论:江苏省腹泻患者临床分离耶尔森菌以小肠结肠炎耶尔森菌为主，其他耶尔森菌少量并存，同时发现了 Yersinia proxima和 Yersinia canariae两个耶尔森菌新种型。小肠结肠炎耶尔森菌的毒力基因携带以Ⅲ型为主。16S rRNA基因多态性分析和K-mer分析均可有效区分小肠结肠炎耶尔森菌和其他耶尔森菌。

目的:了解 2020-2021年山东省聊城市小肠结肠炎耶尔森菌（ Y.e）食品分离株分子特征。 方法:对聊城市市售生肉与肉制品中 Y.e开展分离培养、药敏试验、毒力基因检测、PFGE和全基因组测序（WGS）。利用微生物基因组注释系统对全基因组数据进行拼接组装，对组装基因组开展多位点序列分型（MLST）和核心基因组多位点序列分型（cgMLST），并应用基于WGS的单核苷酸多态性（wg-SNPs）分型方法与美国生物技术信息中心上获取的14株国内外 Y.e的基因组进行遗传进化分析。 结果:165份样品中共检出21株 Y.e，检出率为12.73%，20株 Y.e测序成功。 Y.e携带多种耐药基因和毒力基因，出现多重耐药现象，毒力基因PCR检测显示21株 Y.e呈现2种毒力基因特征；PFGE、MLST和cgMLST聚类分析显示，21株 Y.e呈高度多样性；wg-SNPs遗传进化分析显示20株 Y.e可分为2个进化主分支。 结论:聊城市生肉与肉制品中分离的 Y.e携带多种耐药基因和毒力基因，且分子分型呈现高度多样性，应加强生肉与肉制品中 Y.e分子生物学监测，开展基因组测序及分子分型检测工作，为预防由 Y.e引起的食源性疾病提供理论依据 。

目的 调查居民家用冰箱冷藏室微生物污染状况,并评价专业冰箱清洗对冰箱内微生物污染的改善效果.方法 在清洗前后,分别对成都市15台社区居民家用冰箱冷藏室的食物隔板、蔬菜框和门封条无菌采样,获得样品90份;检测样品细菌总数、真菌总数和大肠菌群以反映冰箱内卫生状况,同时进行大肠菌群、金黄色葡萄球菌、沙门菌、单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌的分离培养以反映致病菌污染状况;依据清洗前后微生物检出情况和清除率综合分析冰箱清洗效果.结果 清洗前,冰箱内细菌总数范围为2.4×103～1.4×105 CFU/cm2,清洗后细菌总数范围为0～230 CFU/cm2;食物隔板、蔬菜框和门封条的细菌清除率分别达到99.90％、99.89％、99.81％.清洗前,冰箱内真菌总数范围为0～750 CFU/cm2,清洗后真菌总数范围为0～58 CFU/cm2;食物隔板、蔬菜框和门封条的真菌清除率分别为99.40％、96.99％、99.41％.清洗前,冰箱冷藏室内大肠菌群平均检出率为64.44％,金黄色葡萄球菌平均检出率为13.33％,沙门菌平均检出率为2.22％,未检出单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌;清洗后,大肠菌群检出率为13.33％,均未检出金黄色葡萄球菌、沙门菌、单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌.结论 本研究的家用冰箱冷藏室清洗前细菌和真菌数量较大,且存在金黄色葡萄球菌和沙门菌污染,专业清洗后冰箱卫生状况明显改善,极大地降低了食品安全隐患.

目的 了解四川省生肉中常见致病菌污染水平,为食品安全监管提供参考.方法 2017-2022年在四川省采集生禽肉和生畜肉共1763份,按照食品安全国家标准方法检测沙门菌、单核细胞增生李斯特菌、空肠弯曲菌、小肠结肠炎耶尔森菌和致泻大肠埃希菌,利用x2检验(或Fisher精确检验)进行率的差异比较,以P＜0.05为差异有统计学意义.结果 沙门菌、单核细胞增生李斯特菌、空肠弯曲菌、小肠结肠炎耶尔森菌和致泻大肠埃希菌总检出率分别为26.65％、9.95％、7.66％、0.40％和1.24％.沙门菌在生禽肉和生畜肉的检出率分别为27.40％和24.11％,鸭肉检出率(36.00％)高于(x2=11.711,P=0.008)鸡肉(25.70％),猪肉检出率(30.77％)高于(x2=8.746,P=0.026)牛肉(13.75％);单核细胞增生李斯特氏菌在羊肉中的检出率(30.77％)高于(x2=13.611,P=0.002)猪肉(5.59％),在冷却肉(13.95％)和冷冻肉(22.48％)的检出率高于(x2=50.632,P＜0.001)鲜肉(6.78％),在超市的检出率(17.00％)高于(x2=16.723,P=0.004)农贸市场(8.62％);空肠弯曲菌在生禽肉中的检出率(12.60％)高于(x2=84.318,P＜0.001)生畜肉(0.81％),且在生禽肉中的检出率较稳定,为12.22％～13.53％,空肠弯曲菌在鲜肉中的检出率(9.46％)高于(x2=30.667,P＜0.001)冷却肉(0.76％)和冷冻肉(0.85％).结论 四川省生肉中常见致病菌污染较为严重,需连续监测,加强监管.

目的 分析上海市市售生禽肉和调理肉制品中沙门菌、单核细胞增生李斯特菌及小肠结肠炎耶尔森氏菌等食源性致病菌的污染情况.方法 2022年1～8月,从上海市农贸市场、超市、餐饮店等环节采集样品348份,其中生禽肉240份,调理肉制品108份.按照食品安全国家标准分别对样品中的沙门菌、单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌的检测.采用VITEK2全自动微生物鉴定仪对可疑菌株进行生化鉴定,并对沙门菌分离株进行血清学分型.结果 生禽肉中沙门菌、单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌的检出率分别为28.33％(68/240)、5.00％(12/240)和0.83％(2/240);调理肉制品中沙门菌、单核细胞增生李斯特菌和小肠结肠炎耶尔森氏菌的检出率分别为5.56％(6/108)、28.70％(31/108)和1.85％(2/108);血清学分型结果显示,生禽肉中68株沙门菌分布于14种不同血清型,其中科瓦利斯沙门菌(35.29％)、鼠伤寒沙门菌(16.18％)和肠炎沙门菌(13.24％)占比较高,调理肉制品中6株沙门菌分布于3种不同血清型,分别为肠炎沙门菌(66.67％)、肯塔基沙门菌(16.67％)和鼠伤寒沙门菌(16.67％).结论 上海市市售生禽肉和调理肉制品中沙门菌和单核细胞增生李斯特菌污染率较高,存在引发食源性疾病的风险,在后续的监管中应予以重点关注.

目的 通过研究表型分布和分子特征的关联性,了解辽宁省小肠结肠炎耶尔森菌(Yersiniaenterocolitica,YE)的流行趋势,为辽宁省YE病的监测和防控提供数据支撑.方法 对2020-2023年辽宁省60株YE分离株进行血清分型、生物分型、毒力基因检测和PFGE、MLST分子分型研究.结果 60株YE分离株可分为4个血清型、2个生物型、8个毒力基因型和29种ST型.2023年40株YE分离株分为8组PFGE优势带型A-G,A组为2023年沈阳市地区流行分子型.PFGE的分辨力(DI)为0.954,MLST分辨力(DI)为0.948.ST3、ST252位于树状图核心位置向四周发散.PFGE较MLST方法分辨力稍高.结论 2020-2023年辽宁省YE分离株流行致病血清型是O:3,毒力基因型和ST型均呈现多样化状态.沈阳市YE污染较严重.应重点加强对于生物1A型菌株的研究工作.猪是辽宁省地区重要的宿主和传染源.PFGE和MLST对YE分离株分型均是可行的,ST分型与PFGE分型具有一致性.

目的 了解温州市食源性小肠结肠炎耶尔森氏菌的毒力基因分布及遗传多样性特征.方法 对温州市食品及食源性疾病腹泻病人中分离得到的小肠结肠炎耶尔森氏菌进行生物型、血清型和耐药性分析,并基于全基因组测序进行菌株的毒力基因、多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)分析.结果 71株食源性小肠结肠炎耶尔森氏菌,94.4％(67/71)的分离株为生物1A型,生物血清型以1A/O:5占比最高(29.6％,21/71).分离株对14种抗菌药物的敏感率达到95.8％以上.共获得了 16种126个毒力基因,其中2株菌株携带pYV质粒和染色体相关毒力基因.分离株以ST3型最常见(31.6％,12/38),cgMLST分析显示除具有相同ST型的菌株外,菌株无明显基因型簇形成.结论 温州市食源性小肠结肠炎耶尔森氏菌存在致病性菌株,菌株呈高度遗传多态性,需加强此类菌株的监测,以预防其引起食源性疾病的暴发.

目的 采用两种微量法检测青海高原野生型鼠疫噬菌体的宿主谱,为今后噬菌体生态学研究和基于宿主范围噬菌体分类研究提供科学依据.方法 基于OmniLogTM微生物鉴定系统微量法和微量点滴法,检测3株鼠疫噬菌体对2株鼠疫耶尔森菌(鼠疫疫苗株EV76、614F)和4株非鼠疫耶尔森菌(假结核耶尔森菌PTB3、PTB5、大肠杆菌V517、小肠结肠炎耶尔森菌52302-2)的裂解情况.结果 476号、087号和072204号鼠疫噬菌体均能成功感染鼠疫疫苗株EV76、614F并依赖其生长繁殖,且基于OmniLogTM系统33 ℃培养48 h也能够观察到试验孔中四唑类染料颜色随着噬菌体数量的增加和宿主菌数量的减少而变淡.利用微量点滴法检测3株鼠疫噬菌体对4株非鼠疫耶尔森菌敏感性结果显示,28 ℃和37 ℃时476号鼠疫噬菌体对假结核耶尔森菌PTB5敏感,而087号和072204号对其不敏感;476号、087号和072204号鼠疫噬菌体对假结核耶尔森菌PTB3、大肠杆菌V517、小肠结肠炎耶尔森菌52302-2这3株非鼠疫耶尔森菌均不敏感,且基于OmniLogTM系统观察到试验孔与对照孔中细菌生长曲线和四唑类染料颜色分别呈现相似对应的结果.然而,以鼠疫疫苗株EV76、614F为宿主菌,37℃时072204号鼠疫噬菌体微量点滴于固体培养基上不显示噬菌斑.结论 基于OmniLogTM检测系统的噬菌体宿主范围测定法可以作为一种替代传统检测宿主谱的测定方法,在噬菌体与宿主菌相互作用研究中具有较好的应用价值.