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微小RNA-146b-5p通过Robo1对胆囊癌细胞增殖和凋亡的影响
                                    编辑人员丨4天前
                                目的:探讨微小RNA(miRNA,miR)-146b-5p通过Robo1对胆囊癌细胞增殖和凋亡的影响。方法:选取郑州大学第一附属医院2017年1月到2021年12月手术切除的59例胆囊癌及其癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析肿瘤组织和癌旁组织miR-146b-5p表达水平;采用免疫组织化学分析两种组织Robo1蛋白表达水平。采用转染试剂转染miRNA对照和miR-146b-5p抑制剂至人胆囊癌细胞系GBC-SD,分别命名为miRNA对照组和miR-146b-5p KD组,采用噻唑蓝(MTT)和克隆形成实验分析两组细胞活力和增殖能力;采用划痕实验、Transwell和蛋白质印迹法(Western blot)分析两组细胞迁移、侵袭和上皮-间充质转化能力;采用生物信息学和荧光素酶报告基因分析miR-146b-5p的靶基因;采用Western blot分析靶基因表达水平。计量数据比较采用 t检验。 结果:胆囊癌组织miR-146b-5p表达水平(1.01±0.16)明显低于癌旁组织(1.94±0.30),差异有统计学意义( t=20.860, P<0.05)。miRNA对照组细胞吸光度值高于miR-146b-5p KD组(2.22±0.10比1.76±0.06, t=9.294, P<0.05),miRNA对照组细胞克隆形成率高于miR-146b-5p KD组[(85.75±5.16)%比(63.20±5.66)%, t=7.210, P<0.05],miRNA对照组细胞划痕愈合率高于miR-146b-5p KD组[(72.85±5.91)%比(55.56±6.53)%, t=4.806, P<0.05],miRNA对照组细胞迁移数量多于miR-146b-5p KD组[(110.83±16.18)个比(75.66±11.70)个, t=4.313, P<0.05],miRNA对照组细胞E-钙黏蛋白(E-cadherin)蛋白表达水平低于miR-146b-5p KD组(0.94±0.06比1.30±0.17, t=5.081, P<0.05),miRNA对照组细胞N-钙黏蛋白(N-cadherin)和SNAIL蛋白表达水平高于miR-146b-5p KD组(1.28±0.10、0.91±0.09比0.84±0.08、0.52±0.10, t=8.436、7.256, P<0.05),差异均有统计学意义。Robo1是miR-146b-5p的靶基因。miRNA对照组细胞Robo1蛋白表达水平(1.19±0.16)明显高于miR-146b-5p KD组(0.64±0.11),差异有统计学意义( t=6.881, P<0.05)。胆囊癌组织Robo1蛋白表达水平(1.06±0.13)明显高于癌旁组织(0.60±0.11),差异有统计学意义( t=21.000, P<0.05)。 结论:miR-146b-5p参与胆囊癌细胞的增殖和凋亡,主要通过靶向Robo1蛋白来实现的。
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                                    编辑人员丨4天前
                                 - 
                                
甲状腺癌中微小RNA-146b-5p表达上调通过靶向Smad4促进癌细胞增殖
                                    编辑人员丨4天前
                                目的:探讨微小RNA(miR)-146b-5p对甲状腺癌细胞增殖的影响及其作用机制。方法:收集河南科技大学第一附属医院2018年1月至2020年10月72对病理确诊为甲状腺癌患者手术标本,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测miR-146b-5p在甲状腺癌及癌旁组织、正常人甲状腺上皮细胞TEC、甲状腺癌细胞TPC-1、FTC133中的表达。双荧光素酶报告实验验证miR-146b-5p对靶基因Smad4的直接靶向调控作用;甲状腺细胞中过表达或沉默miR-146b-5p表达,细胞计数试剂盒(CCK-8)、蛋白质印迹法(Western blot)实验检测miR-146b-5p的不同表达对甲状腺癌细胞TPC-1、FTC133细胞增殖能力的影响及细胞核增殖抗原(Ki-67)、Smad4蛋白表达变化。两组间比较采用独立样本 t检验、 χ2检验,多组间差异检验采用方差分析。 结果:状腺癌组织中miR-146b-5p表达明显高于癌旁组织( t=5.028, P<0.05),并与性别、肿瘤大小、TNM分期显著相关( χ2=5.445、4.531、4.589, P<0.05)。miR-146b-5p在甲状腺癌细胞TPC-1、FTC133中表达明显高于正常人甲状腺上皮细胞TEC( t=3.723、5.332, P<0.05)。双荧光素酶实验结果显示,Smad4是miR-146b-5p的靶基因。CCK-8、Western blot实验结果显示,miR-146b-5p mimic组的细胞增殖能力、Ki-67蛋白表达水平明显高于mimic-NC组,Smad4蛋白表达水平明显低于mimic-NC组;而miR-146b-5p inhibitor处理的细胞增殖能力、Ki-67蛋白表达水平明显低于inhibitor-NC组,Smad4蛋白表达水平明显高于inhibitor-NC组( F=6.202、5.324, P<0.05)。 结论:miR-146b-5p在甲状腺癌组织及细胞中表达上调,且其可能通过靶向Smad4促进甲状腺癌细胞增殖。
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                                    编辑人员丨4天前
                                 - 
                                
非酒精性脂肪性肝病患者血清外泌体miRNAs表达谱的初步分析和功能研究
                                    编辑人员丨4天前
                                目的:鉴定非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者和健康对照组人血清外泌体微小RNAs(microRNAs)差异表达谱,探索miRNAs在NAFLD发病、诊断及治疗中的价值。方法:各取4例人口学特征、个人史相近的S2~3级NAFLD患者和健康对照者进行血清外泌体miRNAs高通量测序,对差异表达最显著的4条miRNAs按S1组、S2~3组、对照(Control)组每组各20例行qRT-PCR验证,并进行靶基因预测,对靶基因进行GO和KEGG富集分析。正态分布的计量资料使用 t检验或方差分析,等级资料和非正态分布资料使用秩和检验,计数资料使用Pearson χ2检验或Fisher精确检验。 结果:初步鉴定出差异有统计学意义( P < 0.05)且差异表达在2倍以上的血清外泌体miRNAs共19条,hsa-miR-122-5p、hsa-miR-146b-5p、hsa-miR-197-3P的相对表达关系为:S2~3组>S1组>Control组,hsa-miR-483-3p的相对表达关系为:NAFLD组(S1或S2~3)>Control组。GO分析显示靶基因在分子功能、细胞组分、生物过程均有广泛的注释,靶基因显著富集的通路共84条,从20条与NAFLD最密切的通路中筛选出与至少10条通路都相关的靶基因共5个,即PIK3R2、AKT2、AKT3、MAPK1、NFKB1。 结论:初步分析了NAFLD患者和健康对照组血清外泌体miRNAs差异表达谱,研究了4条miRNAs对于判断肝脂肪变性程度的价值,预测了数以千计的靶基因及其参与的复杂信号通路,为寻找无创诊断NAFLD的生物标志物和特异性治疗的新靶点提供了新的参考。
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                                    编辑人员丨4天前
                                 - 
                                
miR-146a对糖尿病视网膜病变炎症反应的抑制作用
                                    编辑人员丨4天前
                                目的:研究微小RNA-146a(miR-146a)对高糖诱导的人视网膜内皮细胞炎症反应的调控作用及其机制。方法:收集2013年10—12月在南京医科大学附属无锡人民医院就诊的单纯糖尿病患者57例和糖尿病视网膜病变(DR)患者40例。另选取41名健康者作为正常对照。收集受检者的一般检查结果,并采集受检者静脉抗凝血各5 ml。体外培养人视网膜内皮细胞(HREC)系,分为高糖组和正常对照组,分别采用含30 mmol/L葡萄糖的DMEM培养液和正常DMEM培养液培养。采用荧光定量PCR法分别检测各组受检者外周血和体外培养HREC中miR-146a的表达水平。分别用lipofectamine2000装载50 nmol/L miR-146a模拟物、模拟物对照剂和miR-146a抑制物、抑制物对照剂转染HREC。采用荧光定量PCR法检测各转染组细胞中miR-146a和细胞间黏附分子-1(ICAM-1)mRNA的表达水平。采用Western blot法检测核因子кB(NF-кB)p65和NF-кB p65 Ser536蛋白相对表达量。 结果:糖尿病组和DR组miR-146a相对表达量分别为0.36±0.08和0.27±0.08,明显低于正常对照组的1.00±0.16,差异均有统计学意义(均 P<0.01)。在高糖组HREC细胞中miR-146a相对表达量为0.37±0.11,明显低于正常对照组的1.00±0.18,差异有统计学意义( t=5.57, P<0.01)。miR-146a模拟物组miR-146a mRNA的相对表达量为2 540.00±105.00,明显高于模拟物对照组的61.00±17.90;miR-146a抑制物组miR-146a mRNA的相对表达量为0.04±0.01,明显低于抑制物对照组的0.88±0.04,差异均有统计学意义( t=23.23、17.12,均 P<0.01)。miR-146a模拟物组ICAM-1 mRNA的相对表达量为0.35±0.12,明显低于模拟物对照组的1.00±0.13;miR-146a抑制物组ICAM-1 mRNA的相对表达量为2.74±0.48,明显高于抑制物对照组的1.00±0.16,差异均有统计学意义( t=3.58、3.37,均 P<0.05)。miR-146a模拟物组NF-кB p65 Ser536蛋白相对表达量为0.43±0.03,明显低于模拟物对照组的1.07±0.09,差异有统计学意义( t=6.74, P<0.01)。miR-146a抑制物组NF-кB p65 Ser536蛋白相对表达量为2.08±0.12,明显高于抑制物对照组的1.00±0.01,差异有统计学意义( t=8.76, P<0.01)。 结论:miR-146a能够通过抑制NF-кB磷酸化水平和ICAM-1的表达,减轻DR的炎症反应。
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                                    编辑人员丨4天前
                                 - 
                                
消化性溃疡合并幽门螺杆菌感染患者血清微小RNA-155和135b-5p表达变化及临床意义
                                    编辑人员丨4天前
                                目的:探讨消化性溃疡合并幽门螺杆菌( Hp)感染患者血清微小RNA(miR)-155和miR-135b-5p表达水平及其临床意义。 方法:采用前瞻性研究的方法,连续选取济宁医学院附属医院2021年7月至2023年2月消化性溃疡患者263例。其中,经 14C呼气试验确定为 Hp感染146例( Hp感染组),未合并 Hp感染117例(非 Hp感染组);免疫印迹法确定Ⅰ型 Hp感染110例,Ⅱ型 Hp感染36例。采用实时荧光定量聚合酶链反应法检测血清miR-155和miR-135b-5p表达水平,放射免疫法检测血清胃泌素水平,酶联免疫吸附法检测血清胃蛋白酶原(PG)Ⅰ和PG Ⅱ水平;记录患者基本临床资料。采用多因素Logistic回归分析影响消化性溃疡患者发生 Hp感染的独立危险因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-155和miR-135b-5p对消化性溃疡患者发生 Hp感染的诊断价值。 结果:Hp感染组胃泌素、PG Ⅰ、PG Ⅱ、溃疡出血率和复发比例明显高于非 Hp感染组[(108.47 ± 15.35)ng/L比(79.63 ± 10.58)ng/L、(295.41 ± 37.26)pg/L比(236.75 ± 29.17)pg/L、(44.08 ± 8.52)pg/L比(39.29 ± 6.74)pg/L、25.34%(37/146)比15.38%(18/117)和21.92%(32/146)比11.97%(14/117)],差异有统计学意义( P<0.01或<0.05)。 Hp感染组血清miR-155和miR-135b-5p明显高于非 Hp感染组(1.94 ± 0.63比0.95 ± 0.29和1.86 ± 0.57比1.03 ± 0.31),差异有统计学意义( P<0.01)。Ⅰ型 Hp感染患者血清miR-155和miR-135b-5p明显高于Ⅱ型 Hp感染患者(2.05 ± 0.66比1.60 ± 0.54和1.97 ± 0.61比1.52 ± 0.45),差异有统计学意义( P<0.01)。多因素Logistic回归分析结果显示,血清miR-155、miR-135b-5p、胃泌素、PG Ⅰ是影响消化性溃疡患者发生 Hp感染的独立危险因素( OR = 1.443、1.436、1.452和1.438,95% CI 1.165~1.787、1.146~1.799、1.187~1.777和1.150~1.798, P<0.01)。ROC曲线分析结果显示,血清miR-155和miR-135b-5p联合诊断消化性溃疡患者发生 Hp感染的曲线下面积明显大于血清miR-155和miR-135b-5p单独诊断(0.907比0.839和0.836, Z = 2.57和2.81, P = 0.010和0.005)。 结论:消化性溃疡合并 Hp感染患者血清miR-155和miR-135b-5p水平较高,两者联合检测对消化性溃疡患者发生 Hp感染具有较高的诊断价值。
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                                    编辑人员丨4天前
                                 - 
                                
基于微小核糖核酸筛选和竞争性内源核糖核酸网络构建的尿酸盐肾沉积机制研究
                                    编辑人员丨2周前
                                目的:构建竞争性内源核糖核酸(ceRNA)以揭示尿酸盐肾沉积分子调控机制.方法:复制尿酸盐肾沉积大鼠模型,采用高通量核糖核酸(RNA)测序技术分析尿酸盐肾沉积大鼠肾组织中微小核糖核酸(miRNA)的表达,并筛选出差异表达的 miRNA.利用 TargetScan、StarBase、miRDB、miRWalk 4 个数据库预测 miRNA 的靶基因,通过 DAVID 和 Metascape 数据库对靶基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.运用Cytoscape构建主要信号通路的ceRNA调控网络.结果:测序共检测到14个差异miRNA(均为上调),该差异miRNA的靶基因主要富集在细胞衰老和癌症相关信号通路;构建获得的ceRNA调控网络含47个长链非编码RNA(lncRNA)节点、10个miRNA节点、27个信使RNA(mRNA)节点,该调控网络中 miR-155-5p、miR-132-3p、miR-503-5p、miR-146b-5p 和 miR-212-5p 为排名前 5 的 HUB 基因.结论:本研究通过筛选尿酸盐肾沉积差异miRNA,构建了尿酸盐肾沉积ceRNA网络,为尿酸盐肾沉积机制探讨提供了新思路.
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                                    编辑人员丨2周前
                                 - 
                                
影响扩张型心肌病干细胞移植疗效的差异miRNA表达分析
                                    编辑人员丨2024/3/30
                                目的 基于生物信息学分析探索影响扩张型心肌病(DCM)干细胞移植疗效的差异表达微小RNA(miRNAs)及其靶基因.方法 本研究筛选术前基线特征相似的DCM患者,以干细胞移植术后左心室射血分数改善>5%为标准,分为治疗良好组和无效组.通过对两组患者的骨髓间充质干细胞样本进行miRNAs高通量测序,运用edgeR筛选出两组间的差异表达miRNAs,并使用MiRanda、TargetScan和RNAhybrid数据库进行靶基因预测,对预测得到的靶基因进行GO、KEGG及Reactome富集分析.使用STRING数据库和Cytoscape软件,并参考紧密度、介数中心性、度三种拓扑分析方法和韦恩图筛选关键基因.两组间比较采用t检验.结果 本研究共筛选出44个差异表达miRNAs,其中23个上调,21个下调.上调的差异表达miRNAs靶基因有908个,下调的差异表达miRNAs靶基因835个.GO分析结果显示靶基因在生物过程中主要富集在细胞代谢过程的调节,分子功能主要富集在离子结合,细胞组分则主要与细胞膜相关.KEGG通路和Reactome分析发现靶基因主要与调节干细胞多能性的信号通路、RIG-I样受体信号通路和RNA聚合酶Ⅱ转录等相关.此外,韦恩图共筛选出4个关键基因,分别为 MED1、SMAD2、TRAF6、GSK3B,其中 GSK3B 和TRAF6分别为上调的 hsa-miR-1304-3p和下调的hsa-miR-146a-3p靶基因,MED1和SMAD2为下调的hsa-miR-1299靶基因.结论 本研究提供了hsa-miR-1304-3p、hsa-miR-1299、hsa-miR-146a-3p 3 个可能用于提示 DCM 患者干细胞移植预后的差异表达miRNAs,其调控的关键基因MED1、SMAD2、TRAF6、GSK3B及所在通路可能是提高干细胞移植治疗DCM的潜在作用靶点.
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                                    编辑人员丨2024/3/30
                                 - 
                                
基于生物信息学分析溃疡性结肠炎的差异表达基因和相关微小RNA
                                    编辑人员丨2024/3/30
                                目的 基于生物信息学分析溃疡性结肠炎(UC)中具有诊断和治疗潜力的差异表达基因以及潜在的微小RNA(miRNA).方法 采用加权基因共表达网络分析法对GEO数据库中的芯片原始数据进行筛选.获取UC相关差异表达基因进行富集分析.根据关键基因,预测与差异表达基因相关的潜在miRNA,并构建基因-miRNA调控网络.结果 共筛选出277个差异表达基因,其中有200个基因上调,77个基因下调.基因集富集分析(GSEA)显示,主要富集通路是神经活性配体受体相互作用、利什曼原虫感染、朊病毒病害以及心电图受体相互作用等通路.基因本体论(GO)分析结果显示,主要参与趋化因子活性、肝素结合、趋化因子受体结合等条目.京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示,主要富集通路为细胞因子受体相互作用通路、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路、趋化因子信号通路、核转录因子kappa B(NF-κB)信号通路富集通路等.筛选出10个枢纽基因,分别是C-X-C趋化因子配体8(CXCL8)、Toll样受体2(TLR2)、细胞间黏附分子1(ICAM1)、选择素L(SELL)、趋化因子受体4(CXCR4)、细胞毒性T淋巴细胞相关抗原(CTLA4)、细胞分化抗原69(CD69)、双糖链蛋白多糖(BGN)、C-X-C趋化因子配体13(CXCL13)、金属蛋白酶抑制剂1(TIMP1).鉴定出12个潜在的关键miRNAs,分别为 hsa-mir-335-5p、hsa-mir-146a-5p、hsa-mir-92a-3p、hsa-mir-155-5p、hsa-mir-26b-5p、hsa-mir-4426、hsa-mir-4462b、hsa-mir-4647、hsa-mir-32-5p、hsa-mir-92b-3p、hsa-mir-98-5p和hsa-mir-93-5p.结论 本研究共筛选出277个差异表达基因可能参与UC的发生发展,鉴定出10个枢纽基因和12个miRNAs或可作为UC的生物标志物.
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                                    编辑人员丨2024/3/30
                                 - 
                                
血清miR-155-5p和miR-146b-5p与继发性急性髓系白血病染色体畸变及预后的关系
                                    编辑人员丨2024/3/16
                                目的 探究血清微小RNA(miR)-155-5p和miR-146b-5p与继发性急性髓系白血病(sAML)染色体畸变及预后的关系.方法 选择 2017-05 至 2020-04 空军军医大学第二附属医院血液内科收治的sAML患者 26 例,另外纳入同期在医院进行体检的健康人 25 名作为健康对照组.根据国际人类细胞遗传命名系统,将sAML患者分为染色体畸变组和染色体正常组.采用实时荧光定量PCR法检测血清miR-155-5p和miR-146b-5p水平,并记录患者随访期间的总生存期.结果 与健康对照组相比,sAML组患者血清miR-155-5p显著升高[4.69(1.87,30.83)vs.1.13(0.79,1.78),Z=-4.070,P<0.001],而miR-146b-5p显著降低[1.79(1.55,2.44)vs.3.02(2.58,3.43),Z=-4.561,P<0.001].二者联合诊断sAML的曲线下面积为0.922(95%CI:0.846~0.997).与染色体正常组相比,染色体畸变组 sAML患者血清 miR-155-5p明显升高[19.26(4.45,46.65)vs.1.51(0.79,3.27),Z=-3.585,P<0.001],miR-146b-5p明显降低[1.55(1.50,1.97)vs.2.16(1.79,3.00),Z=-2.954,P=0.003].血清miR-155-5p和miR-146b-5p水平识别染色体畸变的 AUC分别为 0.925(95%CI:0.826~1.000)、0.850(95%CI:0.703~0.997),联合AUC可提高至 0.919(95%CI:0.812~1.000).血清miR-155-5p和miR-146b-5p是染色体畸变的独立影响因素(P<0.05).血清miR-155-5p高表达(≥4.27)和miR-146b-5p低表达(<1.62)患者的总生存率更低,中位生存时间更短(P<0.05).Cox回归分析结果表明,血清miR-155-5p高表达和miR-146b-5p低表达是sAML患者死亡的独立危险因素(P<0.05).结论 血清miR-155-5p高表达和miR-146b-5p低表达与sAML患者染色体畸变和预后不良密切相关,二者有希望成为sAML染色体畸变和预后不良的风险预测指标.
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                                    编辑人员丨2024/3/16
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子宫内膜息肉组织中miR-152和miR-146b-5p的表达及意义
                                    编辑人员丨2024/3/2
                                目的 探讨微小RNA(miR)-152和miR-146b-5p在子宫内膜息肉中的表达,及其对术后复发的预测价值.方法 收集2021年1月至2022年10月在石家庄市第六医院接受宫腔镜息肉切除术的196例子宫内膜息肉患者作为子宫内膜息肉组,根据患者术后6个月的复发情况分为复发组(53例)和未复发组(143例),另选取同期因不孕症进行宫腔镜检查的196例患者作为对照组.采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测子宫内膜息肉组织和正常子宫内膜组织中miR-152、miR-146b-5p相对表达水平,并进行组间比较;采用多因素Logistic回归分析子宫内膜息肉患者术后复发的影响因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析子宫内膜息肉中miR-152、miR-146b-5p相对表达水平对子宫内膜息肉患者术后复发的预测价值.结果 复发组miR-152、miR-146b-5p相对表达水平、孕激素受体(PR)水平明显低于未复发组和对照组(P<0.05),血管内皮生长因子(VEGF)、雌激素受体(ER)水平明显高于未复发组和对照组(P<0.05);未复发组 miR-152、miR-146b-5p相对表达水平、PR水平明显低于对照组(P<0.05),VEGF、ER水平明显高于对照组(P<0.05).进一步研究显示,miR-152、miR-146b-5p、VEGF、ER、PR是子宫内膜息肉患者术后复发的影响因素(P<0.05).miR-152、miR-146b-5p二者联合预测子宫内膜息肉患者术后复发的曲线下面积(AUC)为0.949,灵敏度为96.23%,特异度为74.02%,优于二者各自单独预测(Z联合检测-miR-152=4.854、Z联合检测-miR-146b-5p=3.431,P<0.001).结论 子宫内膜息肉组织中miR-152、miR-146b-5p表达明显下调,二者联合对预测子宫内膜息肉患者术后复发有较好的参考价值.
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                                    编辑人员丨2024/3/2