目的:基于非靶向尿液代谢组学探究前列金丹片对慢性非细菌性前列腺炎大鼠的作用机制.方法:将30 只8 周龄雄性SD大鼠按照体质量随机分为空白组、模型组和药物组,每组 10 只.模型组和药物组制备慢性非细菌性前列腺炎大鼠模型(大鼠前列腺两侧叶均注入0.2 ml弗氏完全佐剂).从造模的第4 天开始,空白组和模型组予生理盐水灌胃,药物组予前列金丹片混悬液灌胃,每日1 次,连续灌胃30 d.实验结束后用超高效液相色谱-串联静电场轨道阱质谱联用仪检测各组大鼠的代谢物变化,并通过多元统计分析等鉴定各组间的差异代谢物,然后对差异代谢物进行功能注释.结果:代谢组学分析得到 8 个共同代谢物,其中 5 个代谢物在模型组表达下降,在药物组表达升高(P<0.05);其他3 个代谢物在模型组表达升高,在药物组表达下降(P<0.05).其中肌酐和染料木黄酮是重要差异代谢物,精氨酸和脯氨酸代谢通路以及异黄酮生物合成通路是前列金丹片发挥治疗作用的主要通路.与空白组相比,模型组精氨酸和脯氨酸代谢通路上调,肌酐生成增多(P<0.05);异黄酮生物合成通路下调,染料木黄酮生成减少(P<0.05).与模型组相比,药物组逆转了上述变化.结论:前列金丹片通过调节精氨酸和脯氨酸代谢通路干预L-精氨酸代谢,以及调节异黄酮生物合成通路干预柚皮素代谢,发挥对慢性非细菌性前列腺炎大鼠的治疗作用.

随着人们生活水平的提高，非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的发病率逐年攀升，寻找干预NAFLD的有效药物显得尤为重要。柚皮素是一类重要的天然黄酮类化合物，广泛存在于柑橘类水果和茄科植物中。柚皮素已被证实在肥胖症和NAFLD的治疗方面具有显著的药理作用，包括减轻体重、改善氧化应激和胰岛素抵抗、减少炎症反应、调节脂质代谢、脂肪酸氧化和减少细胞凋亡等。笔者着重对柚皮素治疗NAFLD的效用及其分子机制进展进行综述，以期为柚皮素治疗NAFLD的临床应用提供良好的前景。

目的:探究柚皮素（naringenin）对缺血再灌注（ischemia-reperfusion，IR）致急性肾损伤（acute kidney injury，AKI）的预防作用及其机制。方法:为探究柚皮素的肾脏保护作用，大鼠经柚皮素预处理后，使用经典的双侧肾蒂夹闭法构建IR-AKI大鼠模型，HE染色检测大鼠病理损伤程度，苦味酸法检测肾功能，实时荧光定量PCR法检测炎症相关基因表达水平。进一步通过差异基因分析和蛋白质互作网络筛选IR-AKI过程中的枢纽基因，预测其转录因子并构建调控IR-AKI的转录因子蛋白库，经反向分子对接筛选可与柚皮素结合的转录因子并对其结合模式进行进一步分析以探究柚皮素对IR-AKI的保护机制。最后通过实验方法验证生物信息学结果。结果:与AKI组相比，柚皮素预处理组大鼠肾脏病理明显改善，肾小管损伤评分减少（ P<0.01），血肌酐水平及肾损伤分子1（KIM-1）mRNA表达明显下降（均 P<0.05），证实柚皮素对IR-AKI的预防作用。实时荧光定量PCR结果显示，柚皮素预处理可减轻IR-AKI后核因子κB（NF-κB）、肿瘤坏死因子α及白细胞介素1β的表达（均 P<0.05），即柚皮素对IR-AKI的炎症损伤具有抑制作用。对GSE98622数据集进行差异基因分析，得到359个差异基因。反向分子对接结果显示，在IR-AKI中，柚皮素可与NFKBIA、BCL3、NFKB2、RELA等主要富集在NF-κB相关炎症通路中的转录因子结合，且显著升高AKI后 BCL3的表达量（ P<0.05），抑制 RELA、 NFKB2表达（均 P<0.05）。 结论:柚皮素可预防由IR-AKI导致的炎性反应，其机制与促进BCL3表达从而抑制NF-κB通路有关。

目的:根据中医“异病同治”理论，运用网络药理学方法探讨参苓白术散治疗T2DM与溃疡性结肠炎的分子关联规律。方法:采用TCMSP、ETCM中药化学成分数据库获取参苓白术散的化学成分并预测其作用靶点；结合OMIM、GeneCards、DrugBank、TTD疾病数据库获取T2DM与溃疡性结肠炎的靶点，利用微生信平台获取参苓白术散化学成分、T2DM、溃疡性结肠炎的交集靶点，应用Cytoscape 3.8.2软件绘制“中药-化学成分-靶点”网络及“有效成分-交集靶点”网络。借助STRING数据库对交集靶点进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析。应用STRING数据库构建交集靶点PPI网络，应用Cytoscape 3.8.2软件的CytoNCA插件获取核心靶点。采用分子对接技术检验复方的核心成分与靶点的效应关系。结果:获得参苓白术散化学成分176个，对应靶点226个，T2DM靶点11 478个，溃疡性结肠炎靶点4 857个，药物化学成分与疾病交集靶点162个。GO功能及KEGG通路富集分析获得相关生物过程1 789个、分子功能163个、细胞组分92个，获得192条通路，主要涉及AGE-RAGE、TNF、IL-17、MAPK、PI3K-Akt信号通路等。参苓白术散核心成分主要为谷固醇、木犀草素、山柰酚、柚皮素、β-胡萝卜素等，核心靶点包括EGFR、ALB、IL1B、CASP3、ESR1、VEGFA、PTGS2、TNF、IL6、MYC、AKT1、JUN、TP53等。分子对接结果显示，核心化学成分与核心靶点具有较好的结合活性。结论:参苓白术散通过作用于TNF、IL1B、IL6、AKT1、VRGFA、PTGS2、MYC、JUN、TP53等核心靶点，调节IL-17信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路、AGE-RAGE信号通路等，改善组织炎症损伤、黏膜屏障损伤、免疫调节失衡、肠道菌群失调、胰岛素抵抗、细胞凋亡、氧化应激等生物进程，异病同治T2DM与溃疡性结肠炎。

目的:探讨柚皮素（NGN）对创伤性脊髓损伤后运动功能修复的作用及其机制。方法:选取36只6～8周龄的雄性C57BL/6小鼠，按照随机数字表法分为假手术组、生理盐水组和NGN组，每组12只。假手术组小鼠仅行椎板切除术，不损伤脊髓；生理盐水组和NGN组小鼠利用钳夹法进行脊髓损伤手术。3组小鼠均从术前3 d开始每天灌胃给药（假手术组和生理盐水组小鼠给予生理盐水灌胃，NGN组小鼠给予50 mg/kg NGN灌胃给药），手术当天不给药，术后第1天恢复灌胃给药，1次/d，持续7 d，之后隔天灌胃给药，持续28 d。采用BMS评分法评估小鼠运动功能的恢复情况。冰冻切片行HE和尼式染色评估脊髓组织学改变。Western blotting和免疫荧光染色实验检测组织自噬蛋白的表达水平。体外培养小鼠小胶质细胞BV2，分为NGN组（NGN处理）与对照组（空白溶剂处理），采用CCK-8法检测细胞活性，利用腺病毒荧光示踪体系评估自噬流情况。与神经元细胞N2a建立共培养体系后，采用CCK-8法检测细胞活性，采用细胞划痕实验检测细胞迁移愈合能力。结果:给予同等护理条件及康复活动下，损伤后第14、21、28天，NGN组小鼠BMS评分明显优于生理盐水组小鼠（ P<0.05）。NGN可改善脊髓损伤后神经元数量和形态，并减少损伤组织中LC3B和p62的蓄积（ P<0.05或 P<0.001）。体外实验表明NGN呈剂量依赖性（6.25、12.5、25、50 mmol/L）增加BV2细胞活性（ P<0.01），同时促进BV2细胞自噬发生和自噬溶酶体形成。细胞共培养条件下，NGN组BV2细胞可明显提高N2a细胞活性（ P<0.05）并促进细胞迁移（ P<0.01）。 结论:NGN可促进脊髓损伤后运动功能修复，其可能的机制是NGN通过提高小胶质细胞的自噬作用，促进神经元修复。

目的:运用网络药理学方法预测苏子降气汤治疗COPD的有效成分和作用靶点，探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在分子作用机制。方法:依据TCMSP和UniProt软件对苏子降气汤组方中药的有效成分及靶点进行搜集、筛选和预测；在GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、TTD数据库查询COPD相关基因靶点；使用Veen图在线软件得到中药复方成分靶点与疾病靶点的交集靶点，采用Cytoscape软件构建药物有效成分-靶点-疾病网络并进行分析，使用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络(PPI)；借助Metascape在线工具对共有靶点进行GO和KEGG通路富集分析。结果:筛选出163个苏子降气汤化学成分，预测到283个靶点，涉及COPD的治疗靶点有159个。其中，槲皮素、山柰酚、柚皮素、木犀草素等为关键有效成分。IL6、TNF、MAPK3、JUN、CASP3、CXCL8、CXCL10、MMP-9和MAPK1为重要基因靶点。富集的关键基因靶点涉及的生物学过程包括对细菌的反应、细胞因子介导信号通路、细胞对无机物的反应、对氧化应激的反应和对脂多糖的反应等。富集的关键信号通路包括TNF信号通路、IL-17信号通路、细胞周期、甲型H1N1流感、HTLV-I感染、AGE-RAGE信号通路、结核病和疱疹病毒感染等通路。结论:苏子降气汤可通过抗炎、抗感染、调节免疫等多靶点、多通路机制治疗COPD，为其分子机制的研究奠定基础。

目的:运用网络药理学和分子对接技术探究苓桂术甘汤异病同治高血压病和肥胖症的物质基础和作用机制。方法:通过TCMSP检索并筛选苓桂术甘汤组方药物的主要有效成分及作用靶点。运用GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET、DrugBank数据库筛选高血压病、肥胖症相关靶点；应用Cytoscape 3.9.0绘制“中药-有效成分-交集靶点-疾病”网络；通过STRING 11.5数据库构建PPI网络；运用cytoNCA插件筛选核心成分及靶点；应用R4.1.2中的Bioconductor程序包进行GO功能及KEGG通路富集分析，并绘制“中药-交集靶点-通路”网络；利用PyMOL、AutoDockTools 1.5.7对活性成分和核心靶点进行分子对接。结果:获得苓桂术甘汤潜在有效成分共102个、交集靶点62个，筛选出8个活性成分和7个核心靶点；富集分析显示，关键靶点主要富集在通过流体剪切应力与动脉粥样硬化通、脂质和动脉粥样硬化、AGE-RAGE等信号通路，涉及对营养水平的反应、小分子代谢的调节等生物进程。分子对接显示，结合能<-7 kcal/mol的组合有37组。结论:苓桂术甘汤的主要活性成分为槲皮素、山柰酚、柚皮素等，可能通过AKT1、EGFR、IL1B等靶点，作用于流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、脂质与动脉粥样硬化通路、AGE-RAGE信号通路发挥作用。

目的:探讨柚皮素调节酪氨酸蛋白激酶2（janus kinase 2，JAK2）/信号转导与转MCP-1录激活因子3（signal transducer and activator of transcription 3，STAT3）/细胞因子信号转导抑制因子-1（suppressor of cytokine signaling 1，SOCS1）信号通路对糖尿病视网膜病变（diabetes retinopathy，DR）大鼠的治疗作用。方法:构建DR大鼠模型，并随机分为DR组、柚皮素组、激活剂组、柚皮素+激活剂组，以正常大鼠为对照组，各组按照相应分组干预后，检测大鼠血糖、糖化血红蛋白；分离视网膜组织，检测白细胞介素（interleukin-6，IL）-6、IL-1 β、谷胱甘肽（glutathione，GSH）、过氧化氢酶（catalase，CAT），检测大鼠病理变化及血视网膜血管屏障通透性，并对视网膜组织黏附因子（vascular cell adhesion molecule 1，VCAM-1）、抗血管内皮生长因子（vascular endothelial growth factor，VEGF）mRNA及JAK2/STAT3/SOCS1通路相关蛋白进行检测。 结果:对照组血糖为（5.16±0.53）mmoL、糖化血红蛋白为（4.26±0.45）%、IL-6为（63.11±6.35）pg/mL、IL-1 β为（23.11±2.38）pg/mL、伊文思蓝（EB）含量为（4.72±0.49）ng/mg、VCAM-1为1.02±0.11、VEGF mRNA表达为0.93±0.10、p-JAK2/JAK2为（0.24±0.03）、p-STAT3/STAT3为（0.19±0.02）、GSH为（17.62±1.81）nmoL/mg、CAT为（11.68±1.19）IU/mg、SOCS1为1.44±0.16，DR组血糖为（18.85±1.89）mmoL、糖化血红蛋白为（11.62±1.18）%、IL-6为（89.17±8.99）pg/mL、IL-1 β为（52.11±5.28）pg/mL、EB含量为（10.24±1.08）ng/mg、VCAM-1为1.56±0.16、VEGF mRNA表达为1.61±0.18、p-JAK2/JAK2为0.55±0.06、p-STAT3/STAT3表达为0.47±0.05，均较对照组降低（ P<0.05）；DR组GSH为（8.27±0.88）nmoL/mg）、CAT为（6.85±0.71）IU/mg、SOCS1为0.86±0.09，均较对照组增加（ P<0.05）。柚皮素组血糖为（13.11±1.34）mmoL、糖化血红蛋白为（7.36±0.76）%、IL-6为（67.08±6.75）pg/mL、IL-1 β为（31.61±3.22）pg/mL、EB含量为（6.15±0.63）ng/mg、VCAM-1为1.15±0.12、VEGF mRNA表达为1.17±0.12、p-JAK2/JAK2为0.29±0.03、p-STAT3/STAT3为0.21±0.03，均较DR组降低（ P<0.05），GSH为（15.22±1.59）nmoL/mg、CAT为（10.95±1.11）IU/mg、SOCS1表达为1.37±0.15，均较DR组升高（ P<0.05）；激活剂逆转了柚皮素对DR大鼠的保护作用。 结论:柚皮素调节JAK2/STAT3/SOCS1信号通路可改善DR大鼠损伤。

目的:基于网络药理学及分子对接方法探讨消痈散结方对非哺乳期乳腺炎（non-puerperal mastitis，NPM）的作用靶点及机制。方法:检索TCMSP中消痈散结方组方药物的有效成分及各成分相应的作用靶点信息，检索GeneCard、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库中NPM相关基因，将消痈散结方核心靶点及疾病相关基因数据取交集，利用STRING数据库对交集基因进行蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，借助Cytoscape 3.8.0建立消痈散结方治疗NPM活性成分-作用靶点-通路调控网络。利用R语言包对作用靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析，采用vina进行分子对接验证。结果:获得消痈散结方组方药物47个有效成分，1 692个NPM相关潜在靶点，筛选获得消痈散结方治疗NPM核心靶点235个，消痈散结方治疗NPM关键成分包括槲皮素、柚皮素、山柰酚、薯蓣皂苷元、木犀草素等，核心靶点为细胞间黏附分子-1（ICAM-1）、血管内皮生长因子（VEGFA）、TNF、IL-6、表皮生长因子受体（EGFR）、IL-1B、趋化因子-8（CXCL8）、趋化因子-2（CCL2）等。GO富集得到1 492个生物过程条目，KEGG通路富集得到105个通路，主要包括TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、IL-17信号通路、C-型凝集素受体信号通路等。分子对接验证消痈散结方的关键活性成分与潜在核心靶点有较好的结合性。结论:消痈散结方治疗NPM具有多成分、多靶点的特点，主要通过免疫炎症反应、药物代谢、细胞适应性应激反应、血管机能调节等信号通路发挥对NPM的治疗作用。

目的:基于网络药理学方法分析中药抗卡波西肉瘤血管生成的潜在有效成分及分子作用机制，预测中药在抗卡波西肉瘤血管生成中的关键靶点和信号通路。方法:根据既往网络药理学研究结果，利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取虎杖、桑白皮、土茯苓、紫苏子的主要化学成分和靶点；通过GeneCard、OMIM、DrugBank、TTD数据库检索获取血管生成及卡波西肉瘤治疗靶点，构建韦恩图，得到卡波西肉瘤与抗血管生成药物成分相互作用的靶点；利用STRING 11.5平台构建蛋白质互作模型；应用Cytoscape3.6.0软件构建成分-靶点网络，并进行可视化。同时利用Metascape平台对核心靶点进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后将得到的主要活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:抗卡波西肉瘤血管生成药物的核心成分为白藜芦醇[连接度（degree）142]、槲皮素（degree：141）、山柰酚（degree：56）、木樨草素（degree：56）、β谷甾醇（degree：37）、花生四烯酸（degree：36）、柚皮素（degree：36）等，核心靶点是前列腺素内过氧化物合酶2（PTGS2）。利用KEGG分析筛选出抗卡波西肉瘤血管生成相关的重要通路为癌症信号通路；GO分析显示在生物学过程中靶点主要集中在细胞迁移的正调控。分子对接结果显示白藜芦醇、槲皮素、山柰酚和木樨草素与PTGS2均有较好的亲和力，其中槲皮素和木樨草素与PTGS2结合能力最高，结合能分别为-9.4、-9.5 kcal/mol。结论:本研究表明中医药百科全书数据库所录入的4种中药可能通过调控癌症信号通路，作用于PTGS2等靶点发挥抗血管生成作用，从而预测了中药抗卡波西肉瘤血管生成的可能作用机制。