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原发性胶质母细胞瘤瘤内细菌特征基因及其功能研究
编辑人员丨1天前
目的 分析原发性胶质母细胞瘤(GBM)患者肿瘤组织中细菌相关特征基因,并研究肿瘤内细菌相关特征基因在GBM中的功能及作用机制.方法 采用基于癌症基因组图谱(TCGA)数据分析得到的原发性GBM瘤内细菌相关特征基因的公开数据,共152例.根据GBM患者总生存时间的中位数,将其分为低生存组(78例)和高生存组(74例).使用秩和检验评估组间α多样性的差异;采用非度量多维尺度(NMDS)分析和主坐标分析(PCoA)评估组间β多样性的差异;采用线性判别分析(LDA)比较两组GBM样本中丰富度存在显著差异的细菌种类.分别根据各差异细菌相关特征基因的相对丰富度将152例患者分为高丰富度组和低丰富度组,采用Kaplan-Meier法分析高丰富度组与低丰富度组患者生存率的差异.对与良好预后相关的高丰富度细菌相关特征基因GBM样本中显著上调的基因进行基因本体论(GO)生物过程功能注释和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过TCGA转录组测序数据集分析肿瘤免疫微环境景观,应用曼特尔检验分析免疫细胞浸润含量与预后相关细菌特征基因的相关性.所有数据分析均采用R软件,以P<0.05为差异有统计学意义.结果 152例GBM组织中共鉴定出252种细菌相关特征基因,其中234种特征基因在低生存组与高生存组均存在,8种仅存在于低生存组,10种仅存在于高生存组.NMDS和PCoA结果显示,两组的β多样性的差异有统计学意义(P<0.05).LDA显示,高生存组与低生存组的肿瘤组织中细菌相关特征基因的丰富度存在差异(P<0.05),其中脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存组的丰富度较高(P<0.05),并与患者的总生存期呈正相关(x2=4.13,P<0.05).功能富集分析显示,肿瘤内脆弱拟杆菌相关特征基因丰富度较高的患者肿瘤组织中高表达与免疫途径相关的基因(P<0.05).曼特尔检验分析结果显示,原发性GBM肿瘤组织中脆弱拟杆菌相关特征基因的丰富度与M1巨噬细胞浸润呈正相关(P<0.05).结论 脆弱拟杆菌相关特征基因在高生存原发性GBM患者肿瘤组织中的丰富度较高,并影响肿瘤的免疫微环境.
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编辑人员丨1天前
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沙利度胺联合强的松治疗溃疡性结肠炎的临床疗效及对患者肠屏障功能、炎症指标的影响
编辑人员丨1天前
[目的]探讨沙利度胺联合强的松治疗溃疡性结肠炎(UC)的临床疗效及对患者肠屏障功能、炎症指标的影响.[方法]回顾性分析2021年4月至2023年3月本院收治的92例UC患者的临床资料,根据治疗方案不同将其分为对照组(在常规治疗的基础上给予强的松治疗)和观察组(在对照组的基础上给予沙利度胺治疗),每组46例.治疗8周后,比较两组疗效、病情相关评分[梅奥内镜(Mayo)评分、UC内镜严重程度指数(UCEIS)评分]、肠屏障功能相关指标[二胺氧化酶(DAO)、血乳酸(LAC)、细菌脂多糖(LPS)、D乳酸(D-LA)]、炎症相关指标[Toll样受体4(TLR-4)、核因子κB(NF-κB)、可溶性晚期糖化终末产物受体(sRAGE)]及不良反应发生率.[结果]观察组总有效率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).治疗后,两组Mayo评分、UCEIS评分均低于治疗前,且观察组低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);两组血清DAO、LAC、LPS、D-LA水平低于治疗前,且观察组低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);两组NF-κB、TLR-4、sRAGE低于治疗前,且观察组低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).两组不良反应发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05).[结论]沙利度胺联合强的松治疗UC效果较好,可减轻肠黏膜炎症,改善肠屏障功能,且安全性较高.
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编辑人员丨1天前
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3种消毒剂对超声洁牙机单元水路的消毒效果研究
编辑人员丨1天前
目的 评估 3 种临床常用消毒剂对超声洁牙机单元水路的消毒效果.方法 将 12 台牙周超声洁牙机按消毒方案随机分为 4 组:A组蒸馏水、B组 3%过氧化氢(H2O2)、C组 500 mg/L含氯消毒剂和D组 5%聚维酮碘.每台洁牙机用于日常牙周治疗,每天有效工作 6 h.分别在基线、消毒后即刻和消毒后 1~7 d收集水样.对可培养细菌进行计数、分离和纯化,通过 16S rRNA 基因测序进行鉴定,基因扩增子序列按操作分类单元(OTUs)进行聚类.扫描电子显微镜(SEM)观察消毒7 d后水路内壁生物膜的形态和厚度.结果 所有组别基线菌落总数均超过了 100 CFU/mL.但在消毒后,各组菌落总数均显著降低(P<0.05).3%H2O2 消毒后3 d内、500 mg/L含氯消毒剂消毒后 6 d内和 5%聚维酮碘消毒后 4 d内,菌落总数保持在 100 CFU/mL以下(P<0.05).在超声洁牙机单元水路中检测到了嗜麦芽窄食单胞菌(Stenotrophomonas maltophilia)等病原体.扫描电镜显示,与对照组相比,3%H2O2 组和5%聚维酮碘组生物膜厚度更薄(P<0.05).结论 牙科超声洁牙机单元水路中存在致病菌污染,对患者和医务人员构成潜在的感染风险.在日益严峻的感控背景下应根据临床实际制定适宜的消毒方案.
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编辑人员丨1天前
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血流感染患者营养状况与疾病负担调查研究
编辑人员丨1天前
目的 探讨与血流感染(bloodstream infection,BSI)疾病负担密切相关的营养筛查手段,为BSI患者的营养干预提供建议.方法 采用前瞻性横断面调查方法,纳入2021年1月1日~2023年10月31日在首都医科大学附属北京积水潭医院就诊的、符合纳入与排除标准的BSI确诊病例.收集变量包括年龄、性别、身高、体重等人口学信息,入院时体重指数(body mass index,BMI)、入院时营养风险筛查2002(nutrition risk screening 2002,NRS 2002)评分、入院时日常生活活动能力(Barthel index,BI)评分、血清白蛋白以及基础疾病、入院48h内序贯器官衰竭评估(sequential organ failure assessment,SOFA)评分、ICU住院天数、总住院天数、住院费用、健康结局等并进行分析.结果 350例BSI患者纳入分析,平均年龄为65.86±17.21岁,男性204例(58.29%),有基础疾病者279例(79.71%).感染来源为血管内导管的占8.57%(n=30),非导管相关的首位感染类型为肺炎(66.57%,n=233).血培养细菌类型为杆菌181例(51.71%)、球菌130例(37.14%)、真菌20例(5.71%)及混合感染19例(5.43%).350例患者入院时低BMI占6.86%(n=24)、NRS2002评分提示严重营养风险者占3.7%(n=13)、低白蛋白者占93.43%(n=327);入院时BI评分提示中重度依赖者占53.43%(n=187).入院48h SOFA评分为3(1,6)分;收住ICU 136例(38.86%),ICU住院天数为10.50(5.00,24.50)天;机械通气占9.43%(n=33),平均时长220(84,360)h;治疗结局治愈259例(74.00%),感染复发或放弃治疗28例(8.00%),死亡63例(18.00%);住院期间总治疗费用为54736.00(28721.22,98639.50)万元.多因素Logistic回归分析结果显示,与SOFA评分独立相关的变量为恶性肿瘤病史与BI评分,与健康结局独立相关的变量为入院时NRS2002评分,与医疗费用独立相关的为住院天数(P<0.05).结论 BSI多见于有基础疾病的老年人,入住ICU比例高.入院时进行NRS 2002评分及BI评分可以较好地评估BSI的疾病预后及疾病严重程度.进一步,临床医师需要根据上述评分进行分级干预,以降低该类患者的疾病负担.
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编辑人员丨1天前
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儿童神经外科术后细菌性脑膜炎临床分析
编辑人员丨1天前
目的:了解儿童神经外科术后细菌性脑膜炎特征。方法:回顾性队列研究。选取2016年1月至2022年12月就诊上海儿童医学中心神经外科术后脑脊液细菌培养阳性的64例脑膜炎患儿为研究对象,分析患儿的临床特征、发病时间、抗感染治疗前脑脊液常规生化指标、脑脊液培养细菌学特征、对抗菌药物的敏感性。根据脑脊液结果将患儿分为革兰阳性菌感染组和革兰阴性菌感染组,采用 t检验或Wilcoxon秩和检验及 χ2检验比较两组患儿的临床特征。 结果:64例患儿中男42例、女22例,起病年龄0.83(0.50,1.75)岁。64例患儿共发生70次术后细菌性脑膜炎。春季15例次(21%)、夏季23例次(33%)、秋季19例次(27%)、冬季13例次(19%)。发病时间为术后3.5(1.0,10.0)个月。患儿于术后≤1个月发病15例次(21%),患儿于术后>1个月发病55例次(79%)。38例(59%)患儿出现明显异常临床表现,发热36例(56%),呕吐11例(17%)。48例次(69%)术后细菌性脑膜炎系革兰阳性菌感染引起(革兰阳性菌感染组),其中表皮葡萄球菌24例次;22例次(31%)系革兰阴性菌感染引起(革兰阴性菌感染组),其中鲍曼不动杆菌7例次。革兰阳性菌感染组夏季发生率高于革兰阴性菌感染组[20例次(42%)比3例次(14%), χ 2=5.37, P=0.020],革兰阴性菌感染组秋季及术后1个月内的发生率明显高于革兰阳性菌感染组[11例次(50%)比8例次(17%),15例次(67%)比5例次(33%), χ 2=8.48、9.02,均 P<0.05]。未培养出对万古霉素耐药的革兰阳性细菌及对多黏菌素耐药的鲍曼不动杆菌。鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类抗菌药物敏感率为45%(10/22)。 结论:儿童神经外科手术后脑膜炎临床表现不典型,革兰阳性菌是引起神经外科术后细菌性脑膜炎的主要病原菌,革兰阴性菌脑膜炎更易发生在秋季及术后1个月内。鲍曼不动杆菌对碳青霉烯类耐药率较高,需引起警惕。
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编辑人员丨1天前
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坏死梭杆菌导致Lemierre综合征1例
编辑人员丨1天前
患者男性,21岁,主因"间断发热、寒战伴头晕头痛2周"于2021年11月18日急诊收入院。患者诉2周前进食烧烤后出现发热,体温最高可达42℃,伴畏寒、寒战、咽痛、头晕、头痛、乏力,就诊于本院耳鼻喉科后,查体见扁桃体有脓点,快测降钙素原(procalcitonin,PCT)为37.27 ng/mL,胸部CT检查未见异常,考虑诊断为"急性化脓性扁桃体炎",先后给予左氧氟沙星、阿奇霉素抗感染及甲泼尼龙控制炎症后上述症状未见明显好转,为进一步治疗,收入急诊病房治疗,既往体健,入院时查体:体温41℃,脉搏98次/min,呼吸频率23次/min,血压120/60 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa),患者神志清楚,急性病容,精神较差,颈部浅表淋巴结触及肿大,右侧较大约2.0 cm ×0.5 cm,左侧较大约1.3 cm×0.7 cm,质软,活动度好,界限清楚,有压痛,表面皮肤无红肿,无破溃,双肺呼吸音清,未闻及干湿性啰音,心脏听诊无杂音,腹软,无压痛及反跳痛,双下肢无水肿。血常规检查白细胞计数10.49×10 9/L,中性粒细胞百分比94.6%,血红蛋白120 g/L,血小板计数107×10 9/L,PCT 42.83 ng/mL,白介素6(interleukin, IL-6)980.30 pg/mL,C反应蛋白211 mg/L,G试验、GM试验阴性。胸部CT检查示右肺上叶可见一单发实变影,其内可见空洞(图1)。根据病史、查体和辅助检查考虑诊断为肺脓肿,给予注射用哌拉西林钠他唑巴坦4.5 g Q8h治疗,入院第2天,患者仍有发热,体温最高38.7℃,给予对症处理,入院第3天患者体温峰值有所下降,体温维持在37~38℃,考虑抗炎有效,痰培养结果回报为纹带棒杆菌,草绿色链球菌(奈瑟菌属),考虑这2种细菌为皮肤或口腔的正常菌群,为条件致病菌,该细菌导致发热的可能性较小,继续给予哌拉西林钠他唑巴坦治疗。入院第5天血培养回报血液中找到坏死梭杆菌,考虑为血流感染。加用甲硝唑1 g每8 h一次抗感染治疗,复查血常规白细胞计数8.14×10 9/L,中性粒细胞百分比81.5%,血红蛋白120 g/L,血小板计数246×10 9/L,PCT 3.43 ng/mL,IL-6 13.04 pg/mL,C反应蛋白5 mg/L,炎性指标较前明显下降,考虑抗炎治疗有效,继续目前抗生素治疗。入院第10天患者体温仍有低热,体温36.5~37.5 ℃,复查胸部CT见双肺多发小结节,双肺多发空洞病变,考虑炎性可能(图2)。颈静脉超声检查提示患者左侧颈内静脉血栓形成,给予依诺肝素0.4 mL每12 h一次抗凝治疗,根据血培养结果、胸部CT表现和颈静脉超声结果,考虑该患者诊断为坏死梭杆菌导致Lemierre综合征(Lemierre syndrome, LS)。用哌拉西林钠他唑巴坦联合甲硝唑治疗后仍有低热,化验检查PCT为0.30 ng/mL,IL-6为3.52 pg/mL,C反应蛋白为3 mg/L,胸部CT示肺部空洞较前增加,考虑感染未完全控制,改为调整抗生素为比阿培南0.6 g每12 h一次联合甲硝唑1g每8 h一次抗感染治疗,治疗1周后患者体温恢复正常,CT检查示双肺多发空洞消失,残留少量索条影(图3),患者病情好转出院,出院带药给予口服甲硝唑联合阿莫西林抗感染治疗,利伐沙班抗凝治疗,随诊2周后复查胸部CT正常。
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编辑人员丨1天前
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致关节感染皮疽诺卡菌的耐药表型及全基因组测序分析
编辑人员丨1天前
目的:对临床分离的致关节感染的两株皮疽诺卡菌( Nocardia farcinica)进行全基因组测序并分析其耐药性。 方法:2020年1月收集两株导致老年患者膝关节感染的皮疽诺卡菌菌株,采用全基因组测序对细菌进行鉴定,根据CLSI M24推荐的微量肉汤稀释法和E-test法进行药物敏感性分析,通过ABRicate工具比对获得性耐药和毒力基因,Snippy等生物信息学工具进行同源性等基因特征分析。结果:本研究的临床分离株均为皮疽诺卡菌,对头孢曲松、头孢吡肟、头孢噻肟、甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲噁唑(TMP/SMX)耐药,对亚胺培南、利奈唑胺和含有酶抑制剂类抗生素阿莫西林/克拉维酸敏感。携带A类β内酰胺酶基因 far-1、RNA聚合酶结合蛋白基因 RbpA、多耐药外排泵转录激活因子基因 MtrA和调节转录因子基因 vanR-O,分别介导对β内酰胺抗生素、利福平、大环内酯类药物和万古霉素的耐药性。不含有获得性TMP/SMX耐药基因,二氢叶酸还原酶家族基因存在多个错义突变,均携带与结核分枝杆菌同源的 icl、 mbtH、 phoP、 relA毒力基因,SNP同源分析表明两株皮疽诺卡菌具有很近的亲缘关系,两株菌仅存在10个SNP位点、6个复合基因和1段基因缺失变异。 结论:全基因测序技术有助于研究诺卡菌的分子特征和耐药机制;皮疽诺卡菌对TMP/SMX耐药现象需要重视,参与二氢叶酸代谢途径的酶基因突变有可能是TMP/SMX耐药的原因之一。
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编辑人员丨1天前
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泌尿男生殖系统淋巴瘤的临床特征及预后分析
编辑人员丨1天前
目的:探讨泌尿男生殖系统淋巴瘤患者的临床特征,并对其预后进行分析。方法:回顾性分析2014年8月至2019年8月北京友谊医院收治的9例泌尿男生殖系统淋巴瘤患者的临床资料。男5例,女4例。平均年龄62(50~69)岁。肿瘤位于肾脏3例,膀胱2例,睾丸4例。首发症状:肾肿瘤3例中2例为发热(1例伴腹痛及体重减轻),1例为体检发现肾盂占位;膀胱肿瘤1例为肉眼血尿伴腹痛,1例为尿急、尿痛;4例睾丸肿瘤均为睾丸无痛性肿大。5例行CT检查见低密度肿物伴轻中度强化,4例睾丸肿瘤行B超检查提示不规则、不均质肿块内见血流信号。术前诊断均为泌尿男生殖系统肿瘤。6例接受手术,3例行病灶穿刺获取病理。9例中4例接受手术治疗联合化疗,2例仅接受化疗,2例仅接受手术治疗,1例未治疗。肾肿瘤3例中,1例行B超引导下病灶穿刺活检术,术后予环磷酰胺+阿霉素+长春新碱+泼尼松+利妥昔单抗(R-CHOP)方案静脉化疗;1例肾盂占位性病变者行腹腔镜肾输尿管全长切除术,术后予R-CHOP方案静脉化疗;1例行B超引导下病灶穿刺活检术,术后患者拒绝进一步治疗。2例膀胱肿瘤者均行TURBT,术后均拒绝放化疗。4例睾丸肿瘤者中,3例行患侧睾丸切除术,1例行B超引导下病灶穿刺活检术;3例行R-CHOP方案化疗,1例于外院行化疗及对侧睾丸放疗,具体方案不详;4例均行鞘内注射化疗药物(甲氨蝶呤15 mg+阿糖胞苷50 mg+地塞米松5 mg)预防中枢神经系统浸润。结果:本组9例术后恢复顺利,无手术及穿刺相关并发症发生。术后病理诊断均为非霍奇金淋巴瘤,其中8例为弥漫性大B细胞淋巴瘤,1例睾丸淋巴瘤为间变性大细胞淋巴瘤。按照Ann Arbor分期标准进行临床分期,确诊时Ⅰ~ⅡE期4例,ⅢE~ⅣE期5例。国际预后指数(IPI)评分0~2分6例,≥3分3例。随访时间平均18(6~66)个月。7例存活,其中3例完成化疗者中,2例完全缓解(睾丸淋巴瘤ⅡE期IPI评分1分和ⅣE期IPI评分2分各1例),1例部分缓解(肾盂淋巴瘤ⅣE期IPI评分3分);3例拒绝化疗者未见肿瘤复发或进展(膀胱淋巴瘤2例和肾盂淋巴瘤1例,均为ⅠE期IPI评分1分);1例化疗2个周期后因出现细菌真菌混合感染性肺炎停止化疗(睾丸淋巴瘤ⅢE期IPI评分3分)。肾淋巴瘤ⅢE期IPI评分3分1例和睾丸淋巴瘤Ⅲ期IPI评分2分1例,分别于确诊后6个月、17个月因肿瘤进展死亡。结论:泌尿男生殖系统淋巴瘤以弥漫大B细胞淋巴瘤为主,临床表现特异性差,诊断时应根据症状及影像学表现与其他常见肿瘤进行鉴别,避免误诊误治。组织病理学是诊断的金标准,R-CHOP方案化疗为首选治疗手段。
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编辑人员丨1天前
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供肺和受者气道病原微生物检出情况及其对肺移植预后的影响分析
编辑人员丨1天前
目的:探讨肺移植术后肺部感染的病原学特点及供肺来源的微生物与移植预后的相关性。方法:回顾性分析2015年1月至2019年12月同济大学附属上海市肺科医院完成肺移植手术的88例受者的临床资料及肺部感染病原学资料,对气道内病原微生物的种类、检出比例和耐药性变迁进行分析。根据是否检出耐药菌,将受者分为耐药菌阳性组(71例)和耐药菌阴性组(17例),对比分析术后3年存活率,并用Log-rank法进行统计学分析。前瞻性分析2020年4月11日至2020年9月5日完成的14例肺移植供肺气道菌群和受者预后,用单因素方差分析和Pearson卡方检验,对供肺和受者的气道菌群多样性、受者术后1年间的血常规和生化指标及肺功能指标等进行统计学分析。结果:回顾性分析的88例肺移植受者,5年间共检出992株菌,包括细菌796株,其中革兰氏阴性菌占88.4%(704/796);真菌196株。2019年革兰氏阳性球菌、肺炎克雷伯菌、鲍曼不动杆菌、嗜麦芽窄食单胞菌和念珠菌属的检出比例均高于2015年(8.2%比5.3%,13.6%比13.2%,33.2%比17.5%,6.5%比5.3%,26.6%比20.2%)。革兰氏阴性菌对亚胺培南耐药情况分析结果显示,肺炎克雷伯菌在2019年耐药率最高,为68.18%,同年鲍曼不动杆菌的耐药率为98.44%。耐药菌阳性组与耐药菌阴性组术后3年存活率分别为46.3%和35.3%,组间比较,差异无统计学意义( P=0.410)。前瞻性分析的14例肺移植受者的供肺气道分泌物经二代测序均检出细菌。其中5例受者在移植后1个月内在气道分泌物中检测出与供肺相同的细菌,随访1年,死亡2例;余9例未检出与供肺相同的细菌,随访1年,死亡2例。Pearson卡方检验显示,气道菌群多样性Shannon指数与肺移植后1年的预后情况无明显相关。 结论:移植术后肺部感染的病原体仍然是革兰氏阴性菌占主导,并且耐药比例始终居于高位,供肺病原微生物对肺移植受者的短期预后无明显影响。
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编辑人员丨1天前
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抗中性粒细胞胞质抗体相关性血管炎并发感染的临床特点及危险因素
编辑人员丨1天前
目的:分析抗中性粒细胞胞质抗体(antineutrophil cytoplasmic antibody,ANCA)相关性血管炎(ANCA-associated vasculitis,AAV)初诊患者的临床特点及发生感染的危险因素。方法:回顾性收集2012年9月至2020年9月在青岛大学附属医院初诊AAV患者(随访至少6个月)的临床资料。根据随访过程中是否发生感染,分为感染组和非感染组,分析两组患者的临床特点及感染情况,并进一步采用Cox回归模型分析发生感染的影响因素。结果:共236例AAV患者被纳入本研究,女性128例(54.2%),男性108例(45.8%),中位年龄为66.00(59.76,71.99)岁。髓过氧化物酶(myeloperoxidase,MPO)-ANCA阳性者202例(85.6%),蛋白酶3(proteinase 3,PR3)-ANCA阳性者34例(14.4%)。其中感染组77例,非感染组159例。77例感染组患者共发生121次感染,54次感染(44.6%)发生在初诊后6个月内。感染组合并高血压病史、肺部基础疾病及接受激素冲击治疗和血浆置换的患者比例,肺部、肾脏、心脏、胃肠道受累率,及初诊时血肌酐、五因子评分(five factors score,FFS)显著高于非感染组,而估算肾小球滤过率(estimated glomerular filtration rate,eGFR)显著低于非感染组,差异均有统计学意义(均 P<0.05)。肺部(73.6%)是AAV患者的主要感染部位,最常见的病原微生物是细菌(64.0%),以铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌为主;其次是真菌(33.7%,以白念珠菌为主)。多因素Cox回归分析显示肺部受累( HR=1.682,95% CI 1.034~2.734, P=0.036)、胃肠道受累( HR=2.976,95% CI 1.219~7.267, P=0.017)是AAV患者发生感染的独立影响因素。 结论:AAV患者在初诊后6个月内感染的发生率较高。AAV患者最常见的感染部位是肺部,常见的病原微生物是铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌、白念珠菌。肺部受累、胃肠道受累是AAV患者发生感染的独立危险因素。
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编辑人员丨1天前
