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长链非编码RNA TUG1对宫颈癌细胞放射敏感性的影响
编辑人员丨2天前
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)通过调控自噬对宫颈癌细胞放射敏感性的影响及作用机制。方法:构建放射抵抗的宫颈癌细胞株HeLa/IR和SiHa/IR。用细胞克隆形成实验评估HeLa/IR和SiHa/IR细胞的放射敏感性;实时反转录PCR(RT-qPCR)检测各组细胞中lncRNA TUG1的表达;蛋白质印迹法(Western blot)检测各组细胞中自噬蛋白Beclin1、微管相关蛋白轻链3(LC3)Ⅱ/LC3Ⅰ、p62的表达。将NC-siRNA、TUG1-siRNA、TUG1-siRNA+雷帕霉素(自噬激活剂)转染至HeLa/IR和SiHa/IR细胞,分别命名为NC-siRNA组、TUG1-siRNA组、TUG1-siRNA+雷帕霉素组。用RT-qPCR检测lncRNA TUG1的转染效率;Western blot检测沉默lncRNA TUG1对自噬蛋白表达的影响;流式细胞术分别检测沉默lncRNA TUG1对HeLa/IR和SiHa/IR细胞增殖能力和凋亡的影响。采用 t检验分析两组之间的差异,单因素方差分析进行多组间的比较。 结果:与HeLa、SiHa细胞比较,HeLa/IR、SiHa/IR细胞的存活分数显著升高,细胞中lncRNA TUG1的表达均显著升高,自噬蛋白Beclin1和LC3Ⅱ/LC3Ⅰ蛋白表达均明显升高,p62蛋白表达明显降低,差异均有统计学意义( P<0.05)。与NC-siRNA组比较,TUG1-siRNA组HeLa/IR、SiHa/IR细胞中lncRNA TUG1的表达、细胞活力明显降低,细胞凋亡率明显升高,Beclin1和LC3Ⅱ/LC3Ⅰ蛋白表达明显降低,p62蛋白表达明显升高,差异均有统计学意义( P<0.05)。与TUG1-siRNA组比较,TUG1-siRNA+雷帕霉素组HeLa/IR细胞中Beclin1和LC3Ⅱ/LC3Ⅰ蛋白表达均明显升高,p62蛋白表达明显降低,细胞活力明显降低,细胞凋亡率明显升高,差异均有统计学意义( P<0.05)。 结论:沉默lncRNA TUG1可通过调节自噬增强宫颈癌细胞的放射敏感性。
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编辑人员丨2天前
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长链非编码核糖核酸牛磺酸上调基因1调控急性心肌梗死的研究进展
编辑人员丨2天前
越来越多的研究表明,长链非编码核糖核酸(LncRNA)在心血管疾病的基因编程和基因调控中起着重要作用。研究发现在急性心肌梗死后LncRNA牛磺酸上调基因1(TUG1)表达水平增高,提示其可以作为心肌梗死的临床诊断标志物及治疗靶点。本文主要综述了LncRNA TUG1基因信号通路调控急性心肌梗死发生发展的研究进展。
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编辑人员丨2天前
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长链非编码RNA牛磺酸上调基因靶向作用于微小RNA-145对甲状腺癌细胞侵袭的影响及其机制
编辑人员丨2天前
目的:观察甲状腺乳头状癌(PTC)细胞中长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因(TUG1)靶向作用于微小RNA(microRNA,miR)-145/锌指E-盒结合同源异形盒-1 (ZEB1)对细胞侵袭能力的影响。方法:实验标本选自2018年4月至2019年12月间河北医科大学第二医院甲状腺乳腺外科收集的甲状腺乳头状癌及癌旁标本共30例,采用实时荧光定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)的方法观察乳头状甲状腺癌及其癌旁组织中lncRNA TUG1及miR-145的表达水平;将lncRNA TUG1 shRNA和miR-145 mimics分别转染到甲状腺乳头状癌TPC-1细胞中,利用Transwell细胞侵袭实验观察lncRNA TUG1和miR-145对甲状腺癌细胞侵袭能力的影响。应用生物信息学及双荧光素酶报告基因分析lncRNA TUG1和miR-145的关系及miR-145的靶基因。同时,利用蛋白质印迹法(Western blot)实验检测lncRNA TUG1和miR-145对靶蛋白表达水平的影响。两组间统计学差异通过双尾 t检验进行分析。 结果:实时荧光定量PCR实验结果显示,lncRNA TUG1在甲状腺乳头状癌组织中的表达水平(4.43±0.07)高于癌旁组织(1.13±0.06),差异有统计学意义( t=3.124, P<0.05),miR-145的表达水平(0.39±0.08)低于癌旁组织(1.08±0.04),差异有统计学意义( t=2.937, P<0.05);甲状腺乳头状癌TPC-1细胞中转染lncRNA TUG1 shRNA组及miR-145 mimics组侵袭细胞数[(292.4±48.2)、(234.2±42.4)个]低于各自对照组侵袭细胞数[(452.9±50.8)、(439.4±39.8)个],差异有统计学意义( t=3.205, P<0.05; t=3.186, P<0.05);生物信息学及双荧光素酶报告基因分析结果显示,lncRNA TUG1可以与miR-145互补结合,ZEB1是miR-145的靶基因;lncRNA TUG1 shRNA组细胞ZEB1蛋白表达水平(0.33±0.12)低于lncRNA对照组细胞中ZEB1蛋白表达水平(1.17±0.12),差异有统计学意义( t=3.320, P<0.05),miR-145 mimics转染组细胞蛋白表达水平(0.46±0.11)低于miRNA对照组细胞中ZEB1蛋白表达水平(1.05±0.12),差异有统计学意义( t=3.450, P<0.05)。 结论:lncRNA TUG1能够靶向作用于miR-145/ZEB1调控甲状腺癌细胞的侵袭能力。
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编辑人员丨2天前
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支气管肺发育不良新生大鼠长链非编码RNA Tug1的表达及其作用
编辑人员丨2天前
目的:研究长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(taurine upregulation gene 1,Tug1)在新生大鼠支气管肺发育不良(bronchopulmonary dysplasia,BPD)模型中的表达,并从肺组织形态学及肺泡发育成熟度两方面探究长链非编码RNA Tug1与肺发育的相关性,为阐明BPD中肺发育障碍的病理机制奠定基础。方法:采用高氧诱导新生SD大鼠制备BPD模型(氧浓度为85%, n=40),对照组为空气环境正常生长的新生SD大鼠(氧浓度21%, n=40)。每组分别于生后1、3、7、14 d随机取10只采集肺组织样本。通过苏木精-伊红染色观察肺组织形态学改变,应用辐射状肺泡计数法(RAC)评估肺泡发育成熟度,利用实时荧光定量PCR(RT-PCR)检测肺组织中长链非编码RNA Tug1及血小板源性生长因子受体α(platelet derived growth factor receptor alpha,Pdgfra)的基因水平,用蛋白免疫印迹技术检测Pdgfra的蛋白表达情况。 结果:在对照组,Tug1及Pdgfra的mRNA表达随日龄增加呈递增趋势,且Tug1的表达与RAC值呈显著正相关( r=0.648, P=0.007),与Pdgfra的mRNA表达呈正相关( r=0.572, P=0.021),与Pdgfra蛋白表达也呈正相关( r=0.755, P=0.001)。模型组中,Tug1表达从7 d开始显著低于对照组(0.78±0.20比1.68±0.20, P=0.04),趋势持续至14 d;Pdgfra的mRNA表达从7 d开始显著低于对照组(1.04±0.25比1.62±0.37, P=0.002),趋势持续至14 d。Pdgfra蛋白表达在对照组随日龄增加呈递增趋势,模型组7 d开始显著低于对照组(1.04±0.13比1.62±0.09, P=0.04),趋势持续至14 d。 结论:长链非编码RNA Tug1与肺发育成熟度密切相关,其表达在正常发育肺组织中呈递增趋势,新生大鼠BPD模型肺组织中Tug1表达下调可能是BPD肺泡发育障碍的发生机制之一。
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编辑人员丨2天前
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胃肠神经内分泌肿瘤及其肝转移相关差异表达蛋白的蛋白质组学分析
编辑人员丨2天前
目的:探究胃肠神经内分泌肿瘤(GI-NENs)原发灶与相应瘤旁组织及肝转移灶中的蛋白表达差异。方法:选取2015年7月至2019年4月于中国医学科学院肿瘤医院手术治疗的9例GI-NENs伴肝脏转移患者的原发灶、肝转移灶组织及相应瘤旁组织,采用数据非依赖性采集(DIA)技术检测其蛋白表达,以 P<0.05且|log 2FC|>0.5(FC为差异倍数)作为判定标准,明确原发灶与相应瘤旁组织、原发灶与肝转移灶、不同分化程度原发灶、不同分化程度肝转移灶的差异表达蛋白。对差异表达蛋白进行火山图分析、聚类分析、基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。 结果:相对于瘤旁组织,胃NENs原发灶中有85种蛋白表达下调,42种蛋白表达上调,差异表达蛋白主要富集在三磷酸鸟苷酶活性调控和脱氧核糖核苷单磷酸盐分解代谢相关的生物过程、糖胺聚糖生物合成-硫酸软骨素/硫酸皮肤素和泛酸盐与CoA生物合成信号通路。肠NENs原发灶中有114种蛋白表达下调,155种蛋白表达上调,差异表达蛋白主要富集在谷胱甘肽代谢和硫化合物代谢相关的生物过程、收集导管酸分泌和牛磺酸、次牛磺酸代谢信号通路。相对于神经内分泌癌(NECs)原发灶,G1~2分化原发灶中有168种蛋白表达下调,278种蛋白上调,差异表达蛋白显著富集在DNA代谢和DNA复制的生物学过程,以及复制和错配修复等通路。相对于NECs转移灶,G1~2分化转移灶中有95种蛋白表达下调,97种蛋白表达上调,差异表达蛋白显著富集到转录共激活子的活性和催化活性功能、碱基切除修复和蛋白外排通路。相对于G1分化的原发灶,G1分化的转移灶中有530种蛋白表达下调,211种蛋白表达上调。相对于G2分化的原发灶,G2分化的转移灶中有53种蛋白表达下调,96种蛋白表达上调。相对于NECs原发灶,NECs转移灶中有109种蛋白表达下调,92种蛋白表达上调。G1和G2分化的GI-NENs原发灶与转移灶差异表达蛋白富集的信号通路中有多条相似,而GI-NECs原发灶与转移灶差异表达蛋白富集的信号通路中只有1条与GI-NENs原发灶与转移灶差异表达蛋白富集的信号通路相同,即药物代谢信号通路。G1分化的原发灶与转移灶差异表达蛋白主要表达于细胞质(20.26%)、线粒体(18.67%)和细胞核(15.48%)。G2分化的原发灶与转移灶差异表达蛋白主要表达于细胞质(20.24%)、细胞核(18.25%)和细胞膜(15.08%)。NECs原发灶与转移灶差异表达蛋白主要表达于细胞核(23.78%)、细胞质(22.7%)和细胞膜(11.35%)。结论:不同部位和分化程度的GI-NENs原发灶、瘤旁组织及转移灶中蛋白表达差异明显。
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编辑人员丨2天前
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血清LncRNA Dlx6os1、LncRNA TUG1水平与老年糖尿病肾病患者肾脏损伤及预后的相关性
编辑人员丨2周前
目的 探讨血清长链非编码RNA(LncRNA)无远端同源框6反义RNA 1(Dlx6os1)、LncRNA牛磺酸上调基因1(TUG1)水平与老年糖尿病肾病(DN)患者肾脏损伤及预后的相关性.方法 选取2019年1月—2021年1月西安交通大学第一附属医院榆林医院肾病学科收治的老年DN患者201例作为DN组,同期单纯T2DM患者112例作为单纯T2DM组,同期体检健康的老年人105例作为健康对照组,随访3年根据预后将老年DN患者分为不良预后亚组(61例)和良好预后亚组(140例).检测血清LncRNA Dlx6os1、LncRNA TUG1和肾脏损伤指标[计算肾小球滤过率(eGFR)、尿白蛋白肌酐比(UACR)]水平;采用Spearman相关系数分析血清LncRNA Dlx6os1、LncRNA TUG1水平与老年DN患者肾损伤的相关性;以老年DN患者预后为因变量,建立多因素非条件Logistic回归模型分析其影响因素,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线评价血清LncRNA Dlx6os1、LncRNA TUG1水平对其的预测价值.结果 健康对照组、单纯T2DM组、DN组血清LncRNA Dlx6os1和UACR水平依次升高,血清LncRNA TUG1和eGFR依次降低(F/P=870.484/<0.001、566.671/<0.001、271.117/<0.001、196.722/<0.001);Spearman 相关性显示,老年 DN 患者血清LncRNA Dlx6os1 水平与 eGFR 呈负相关、与 UACR 呈正相关(r/P=-0.816/<0.001、0.809/<0.001),血清 LncRNA TUG1水平与eGFR呈正相关、与UACR呈负相关(r/P=0.832/<0.001、-0.806/<0.001);随访截至2024年1月,老年DN患者201例不良预后发生率为30.35%(61/201);多因素非条件Logistic回归显示,慢性肾脏病≥4期、UACR升高、LncRNA Dlx6os1升高为老年DN患者不良预后的独立危险因素[OR(95%CI)=5.758(1.480~22.401)、1.013(1.005~1.022)、1.426(1.201~1.693)],eGFR 升高、LncRNA TUG1 升高为保护因素[OR(95%CI)=0.958(0.939~0.978)、0.418(0.254~0.689)];ROC 曲线显示,血清 LncRNA Dlx6os1、LncRNA TUG1 及二者联合预测老年 DN 患者不良预后的 AUC 分别为 0.774、0.777、0.852,二者联合预测的 AUC 最大(Z/P=2.930/0.003、3.335/0.001).结论 老年DN患者血清LncRNA Dlx6os1水平升高、LncRNA TUG1水平降低,与肾脏损伤加重和不良预后风险增加有关,血清LncRNA Dlx6os1联合LncRNA TUG1水平预测老年DN患者不良预后的效能较高.
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编辑人员丨2周前
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长链非编码RNA牛磺酸上调基因1对胃癌细胞增殖、迁移和血管生成的影响
编辑人员丨3周前
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)牛磺酸上调基因1(TUG1)对胃癌细胞增殖、迁移和血管生成的影响.方法 基于公共数据库分析LncRNA TUG1在胃癌组织和癌旁组织中的表达水平.通过实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测lncRNA TUG1在胃癌细胞系中的表达;采用si-TUGl、si-NC转染胃癌细胞SGC-7901,分别采用细胞计数试剂盒8(CCK-8)法、克隆形成实验、Transwell实验和基质胶成管实验分析敲低lncRNA TUG1对胃癌细胞增殖、集落形成、迁移和血管生成的影响.基于公共数据库分析烷基化修复蛋白B同源物5(ALKBH5)基因与lncRNA TUG1的相关性.采用放线菌素D实验验证ALKBH5与lncRNA TUG1的调控关系.通过细胞功能实验分析敲低ALKBH5对胃癌细胞增殖、集落形成、迁移和血管生成的影响.结果 lncRNA TUG1在胃癌组织和胃癌细胞系中均表达上调;敲低lncRNA TUG1后,SGC-7901细胞增殖、集落形成、迁移、血管生成能力均较对照细胞下降,差异有统计学意义(P<0.05).数据库分析结果显示,在胃癌中,ALKBH5与lncRNA TUG1表达呈正相关(r=0.37,P<0.05).与对照细胞相比,敲低ALKBH5的SGC-7901细胞lncRNA TUG1的RNA稳定性下降,且细胞增殖、集落形成、迁移、血管生成能力均下降,差异有统计学意义(P<0.05).结论 ALKBH5通过诱导lncRNA TUG1表达,促进胃癌细胞的增殖、集落形成、迁移和血管生成.
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编辑人员丨3周前
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急性心肌梗死患者血清lncRNA TUG1、miR-370-3p水平变化及意义
编辑人员丨1个月前
目的 探讨急性心肌梗死(AMI)患者血清长链非编码核糖核酸牛磺酸上调基因1(lncRNA TUG1)和微小核糖核酸370-3p(miR-370-3p)水平变化及意义.方法 选取122例AMI患者为AMI组,同期选择体检健康的志愿者122例为对照组,RT-qPCR法检测血清lncRNA TUG1和miR-370-3p水平.所有AMI患者出院后随访12个月,根据主要心脏不良事件(MACE)发生情况分为MACE组(n=39)、非MACE组(n=83).Pearson相关性分析血清中lncRNA TUG1和miR-370-3p的关系.多因素Logistic回归分析AMI患者发生MACE的影响因素.受试者工作特征(ROC)曲线分析血清lncRNA TUG1和miR-370-3p水平对AMI患者发生MACE的预测价值.结果 与对照组相比,AMI组血清中lncRNA TUG1水平降低,miR-370-3p水平升高(P均<0.05).Pearson相关性分析结果显示,血清lncRNA TUG1和miR-370-3p水平呈负相关(r=-0.389,P<0.05).与非MACE组相比,MACE组血清中lncRNA TUG1水平降低,miR-370-3p水平升高(P均<0.05).Logistic回归分析结果显示,lncRNA TUG1、miR-370-3p水平是影响AMI患者发生MACE的影响因素(P<0.05).与lncRNA TUG1和miR-370-3p单独预测相比,二者联合预测AMI患者发生MACE的AUC显著升高(Z分别为18.667、3.200,P均<0.05).结论 AMI患者血清lncRNA TUG1水平降低,miR-370-3p水平升高,二者联合检测有助于预测AMI患者发生MACE.
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编辑人员丨1个月前
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抑制牛磺酸上调基因1通过上调脑源性神经生长因子减轻大鼠脑缺血再灌注损伤
编辑人员丨1个月前
目的:探讨牛磺酸上调基因1(TUG1)在大鼠脑缺血再灌注损伤(CIRI)中的作用及其可能的机制.方法:建立CIRI大鼠模型,分别转染反义寡核苷酸(ASO)-TUG1及其空白对照ASO-NC,将大鼠分为对照组、CIRI组、CIRI+ASO-NC组、CIRI+ASO-TUG1组,采用mNSS评估各组大鼠的神经功能,TTC染色观察各组大鼠的脑梗死体积,PCR检测大鼠脑组织中TUG1和脑源性神经生长因子(BDNF)mRNA的表达水平,Western Blot和免疫组化实验检测各组BDNF蛋白的表达.结果:CIRI组大鼠脑组织中TUG 1的表达水平显著高于对照组(P<0.05);转染ASO-TUG1可显著降低TUG1的表达水平(P<0.05);CIRI+ASO-TUG1组大鼠的mNSS评分和脑梗死体积显著低于CIRI组和CIRI+ASO-NC组(P<0.05);CIRI+ASO-TUG1组大鼠脑组织中BDNF mRNA和蛋白表达水平均高于CIRI组和CIR1+ASO-NC组(P<0.05).结论:降低TUG1的表达则可显著增加CIRI大鼠脑组织中BDNF基因和蛋白的表达水平,减少脑梗死体积,改善神经功能.
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编辑人员丨1个月前
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重型颅脑损伤病人血清微小RNA-542-3p、长链非编码RNA牛磺酸上调基因1表达及其与预后的关系
编辑人员丨2024/7/6
目的 探讨微小RNA-542-3p(miR-542-3p)、长链非编码RNA牛磺酸上调基因1(ln-cRNA TUG1)在重型颅脑损伤(STBI)病人血清中的表达及与病人预后的关系.方法 2020年1月~2022年7月收治的128例STBI病人为重型组,130例轻、中型TBI病人为对照组,检测病人血清miR-542-3p、lncRNA TUG1表达量,采用Pearson法分析二者相关性.Logistic回归分析血清miR-542-3p、lncRNA TUG1对STBI病人预后不良的影响,并以受试者工作特征(ROC)曲线分析二者对STBI病人预后的预测效能.结果 重型组病人血清miR-542-3p与lncRNA TUG1表达量分别低于和高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05).STBI病人血清miR-542-3p与lncRNA TUG1表达量呈负相关(r=-0.595,P<0.001).预后不良组血清lncRNA TUG1与miR-542-3p水平分别高于和低于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05).高lncRNA TUG1水平是STBI病人预后不良的危险因素(P<0.05),高miR-542-3p水平是保护因素(P<0.05).血清miR-542-3p、lncRNA TUG1联合预测STBI病人预后的曲线下面积(AUC)(0.939)高于单独预测的AUC(Z=2.410,P=0.016;Z=3.339,P<0.001).结论 STBI 病人血清 miR-542-3p 表达下调,lncRNA TUG1 表达上调,二者均可用于STBI病人预后预测,且二者联合的预测价值更高.
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编辑人员丨2024/7/6
