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多重PCR-毛细管电泳法的应用及HPV感染亚型分布特征分析
编辑人员丨1天前
目的:分析河北省石家庄地区人乳头状瘤病毒(human papillomavirus,HPV)感染特征以及HPV亚型分布情况,探讨多重PCR-毛细管电泳片段分析法的应用评估。方法:采用横断面调查研究,2022年5至8月期间纳入河北省人民医院434例女性(年龄范围17~74岁,就诊者260例、查体者174例)进行横断面调查,应用多重PCR-毛细管电泳片段分析法进行HPV分型检测。以多重荧光定量PCR试剂盒作为参考,采用卡方检验分析多重PCR-毛细管电泳片段分析法的诊断效果, Kappa值分析其一致性。 结果:总HPV感染率为45.85%(199/434),其中高危型HPV(HR-HPV)阳性率为35.48%(154/434)、低危型HPV(LR-HPV)3.92%(17/434)、HR-HPV和LR-HPV混合感染6.45%(28/434)、单一型别感染率27.88%(121/434)和多型别17.97%(78/434)。HPV52(9.68%,42/434)、HPV16(6.91%,30/434)、HPV58(6.91%,30/434)为常见HPV亚型。查体者阳性率为45.40%(79/174),接近于就诊者阳性率为54.76%(120/260),差异无统计学意义( χ2=0.024, P>0.05)。17~30岁年龄组感染率最高为56.32%(46/84),各年龄组之间阳性率差异无统计学意义( χ2=4.123, P>0.05)。以多重荧光定量PCR为参考,多重PCR-毛细管电泳片段分析法的敏感度和特异度分别是92.96%和94.04%, Kappa值为0.870。 结论:HPV感染可能呈现年轻化,HR-HPV感染阳性率最高,以HPV52、16、58为主要感染亚型。多重PCR-毛细管电泳片段分析法与多重荧光定量PCR相比的检测结果具有高度一致性,适合HPV DNA分型检测。
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编辑人员丨1天前
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定量CT腰椎骨密度测量分析绝经后女性骨质疏松与APC基因多态性的相关性
编辑人员丨1天前
目的:探讨结肠腺瘤性息肉病蛋白(adenomatous polyposis coli, APC)基因的两个SNP位点E1317Q(rs1801166,G>C)和D1822V(rs45952,A>T)多态性与绝经后女性骨质疏松及骨代谢指标的相关性。方法:选择2019年3月至2021年3月于浙江大学医学院附属第二医院进行常规体检的374例绝经后女性作为研究对象,分为骨量正常组(103例)、骨量减少组(114例)和骨质疏松组(157例)。采用西门子公司生产的128排螺旋CT机测量骨密度;记录临床和骨代谢指标;应用毛细管电泳和片段分析(SNaPshot)技术对2个SNP位点进行基因分型。在定量实时荧光定量聚合酶链式反应系统中测定APC基因mRNA的相对表达量。结果:APC基因rs1801166和rs45952位点基因型和等位基因频率分布在三组间的差异均有统计学意义( P均<0.05)。对于rs1801166位点,两两比较结果显示骨质疏松组的基因型分布与骨量正常组、骨量减少组间差异具有统计学意义( P均<0.05);等位基因频率比较在不同两组间差异均有统计学意义( P均<0.05);对于rs45952位点,两两比较结果显示基因型分布和等位基因频率在骨质疏松组与骨量正常组间差异有统计学意义( P<0.05)。rs1801166位点野生型和突变型间的血钙、血磷、碱性磷酸酶、25-羟基维生素和骨密度比较差异均有统计学意义( P均<0.05);rs45952位点野生型和突变型间血钙、碱性磷酸酶、25-羟基维生素和骨密度比较差异均有统计学意义( P均<0.05)。骨量正常组、骨量减少组和骨质疏松组的APC基因mRNA相对表达量两两比较差异有统计学意义( P均<0.05)。rs1801166和rs45952位点位点野生型的APC基因mRNA相对表达量均显著低于突变型( P均<0.05)。 结论:APC基因变异与绝经后女性骨质疏松及骨代谢指标显著相关,并可能影响基因的表达水平。
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编辑人员丨1天前
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DLL1基因遗传变异及表达对乳腺癌新辅助化疗后骨髓抑制的影响
编辑人员丨1天前
目的:本研究旨在探讨Delta-like配体蛋白1(delta-like ligand protein-1,DLL1)基因的两个SNP位点rs2738822(C>T)、rs9459988(T>G)及基因表达对乳腺癌新辅助化疗后骨髓抑制的影响。方法:选择在临沂市人民医院首次就诊并接受新辅助化疗的乳腺癌患者作为研究对象,其中重度骨髓抑制90例,轻度骨髓抑制72例。收集患者的一般人口学特征和实验室检测指标。采用毛细管电泳和片段分析(SNaPshot)技术对DLL1基因的两个SNP位点rs2738822、rs9459988进行基因分型。采用定量实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测法测定DLL1基因mRNA相对表达量。结果:对于DLL1基因rs2738822位点,严重骨髓抑制组和轻度骨髓抑制组的基因型分布差异有统计学意义( χ2=8.622, P=0.013);相对于CC基因型,CT和TT基因型携带者发生严重骨髓抑制的风险均更高, OR值分别为2.746(1.335~6.882)和3.054(1.282~8.143);显性模型结果显示,TT或CT携带者发生严重骨髓抑制的风险显著高于CC基因型患者, OR值为2.976(1.231~4.963)。对于rs9459988位点,严重骨髓抑制组和轻度骨髓抑制组的基因型分布差异无统计学意义( χ2=2.149, P=0.342)。显性模型结果表明,TG或GG携带者发生严重骨髓抑制的风险显著高于TT携带者, OR值为2.046(1.053~5.611)。严重骨髓抑制者DLL1基因mRNA相对表达量为1.15±0.23,显著低于轻度骨髓抑制者2.64±0.51( t=6.381, P<0.001)。对于rs2738822位点,随着T等位基因的增加,DLL1基因mRNA相对表达量逐渐降低( P<0.05);对于rs9459988位点,携带突变等位基因G患者的DLL1基因mRNA相对表达量也显著低于野生型CC携带者( P<0.05)。 结论:DLL1基因rs2738822和rs9459988突变与乳腺癌新辅助化疗后严重骨髓抑制的发生有关,可作为预测乳腺癌患者新辅助化疗骨髓抑制程度的遗传标志。
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编辑人员丨1天前
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转录因子7类似物2基因多态性及表达在绝经后2型糖尿病合并骨质疏松中的作用
编辑人员丨1天前
目的:探讨转录因子7类似物2(transcription factor 7-like 2,TCF7L2)基因多态性及表达在绝经后2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)合并骨质疏松(osteoporosis,OP)患者中的作用及相关机制。方法:选择2019年1月至2020年6月在宁波大学医学院附属医院就诊的148例绝经后T2DM女性患者作为研究对象。其中合并OP 86例(T2DM+OP组),未合并OP 62例(T2DM组),并纳入同期在本院进行健康体检的100例自然绝经后健康女性作为对照组。抽取空腹静脉血,检测临床和骨代谢指标;采用毛细管电泳和片段分析(SNaPshot)技术对TCF7L2基因的两个SNP位点rs7901695(T>C)、rs290487(C>T)进行分型;采用实时荧光定量聚合酶链式反应检测法测定TCF7L2基因mRNA的相对表达量。构建过表达和沉默慢病毒载体,探究TCF7L2过表达和沉默对大鼠成骨细胞增殖的影响。结果:对于rs7901695位点,T2DM+OP组、T2DM组和对照组间的TT、TC和CC基因型分布差异有统计学意义( χ2=12.545, P=0.014),3组间的T、C等位基因频率分布差异有统计学意义( χ2=17.089, P<0.001)。对于rs290487位点,T2DM+OP组、T2DM组和对照组间的CC、CT和TT基因型分布差异有统计学意义( χ2=10.500, P=0.033),3组间的C、T等位基因频率分布差异有统计学意义( χ2=14.665, P=0.001)。对于rs7901695位点,携带CC+TC基因型的T2DM+OP患者FPG、TG水平显著高于携带野生型TT基因型的患者(FPG: t=2.559, P=0.014;TG: t=2.034, P=0.036),而血钙和25OHD3水平显著低于后者(血钙: t=3.889, P<0.001;25OHD: t=4.112, P<0.001);对于rs290487位点,携带TT+CT基因型的T2DM+OP患者血钙、BGP和25OHD3水平均显著低于携带野生型CC基因型的患者,差异有统计学意义(血钙: t=3.751, P<0.001;BGP: t=2.731, P=0.007;25OHD3: t=3.225, P=0.002)。T2DM+OP患者TCF7L2基因mRNA相对表达量显著低于T2DM组和对照组( F=5.735, P<0.05);随着rs7901695位点C等位基因的增加,TCF7L2基因mRNA相对表达量逐渐降低( F=5.723, P<0.05)。此外,TCF7L2过表达的大鼠成骨细胞增殖率显著升高,而TCF7L2沉默的成骨细胞增殖水平显著下降( F=7.846, P<0.05)。 结论:在绝经后T2DM女性中,TCF7L2基因变异会导致基因表达水平降低,抑制成骨细胞的增殖,从而参与到OP的发病机制中。
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编辑人员丨1天前
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前列腺多形性巨细胞腺癌的临床病理特征与预后
编辑人员丨1天前
目的:探讨前列腺多形性巨细胞腺癌(PGCA)的临床病理特征及预后,加强对该罕见变异型的认识。方法:选取陆军军医大学第一附属医院2009年1月至2019年12月诊断的383例Gleason评分为8~10分的前列腺腺癌病理样本,通过观察苏木精伊红染色切片组织形态筛选PGCA。进一步采用免疫组化染色检测PGCA前列腺特异标志物和错配修复蛋白表达,聚合酶链式反应-毛细管电泳法检测微卫星不稳定性(MSI)状态,并结合文献报道的病例总结分析其临床病理特征、诊断、治疗及预后。结果:本研究共筛选出3例PGCA患者,年龄分别为68、63、71岁。例1术前3个月有经尿道前列腺切除术和口服比卡鲁胺治疗史。3例均行根治性前列腺切除术,术后予内分泌治疗、放疗和/或化疗,分别于术后18、23、10个月死亡。3例肿瘤组织显微镜下均可观察到Gleason评分9~10分的普通型前列腺腺癌和具有间变特征的多形性巨细胞成分,后者占比分别为90%、10%、20%。免疫组化染色检查示上述两种成分均不同程度表达上皮性标志物(CK、CK8/18)和前列腺特异性标志物(NKX3.1、PSA、P504S),错配修复蛋白MSH2、MSH6、MLH1、PMS2的表达均无缺失。3例样本经显微切割分离获取的普通型前列腺腺癌和PGCA成分均未检测出MSI。结合文献报道的10例,共13例PGCA,平均年龄66(45~81)岁,中位年龄66岁。随访时间3~36个月,7例复发/转移,6例在诊断后23个月内死亡,其中4例在1年内死亡。结论:PGCA是一种新认识的罕见变异型前列腺腺癌,目前报道的所有病例均伴有Gleason评分9~10分的高级别普通型前列腺腺癌,但其在病理形态和临床表现上均有别于高级别普通型前列腺腺癌。PGCA侵袭性强、预后差,对常规的内分泌治疗、放化疗不敏感。准确诊断前列腺PGCA有助于判断患者的预后和指导治疗。
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编辑人员丨1天前
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雌激素受体 α基因多态性与女童1型糖尿病易感性的相关性研究
编辑人员丨1天前
目的:本研究旨在探讨雌激素受体- α(estrogen receptor- α,ESR1)基因PvuⅡ(rs2234693,C>T)和XbaⅠ(rs9340799,A>G)位点多态性与女童1型糖尿病(type 1 diabetes,T1D)易感性的相关性。 方法:纳入2016年1月至2019年12月于重庆三峡中心医院就诊的86例新发T1D女性患儿作为研究对象,并选择同期于本院参加健康体检的100例健康女童作为健康对照。测定研究对象的身高、体重和相关代谢指标;采用毛细管电泳和片段分析(SNaPshot)技术对ESR1基因进行分型;采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)法检测ESR1基因的mRNA表达量。结果:基因分型结果显示T1D组和对照组的PvuII位点基因型分布差异有统计学意义( χ2=11.672, P=0.003),而XbaI位点基因型分布差异无统计学意义( χ2=5.433, P=0.066),T1D组的PvuII位点T等位基因频率和XbaI位点G等位基因频率均显著高于对照组(PvuII T vs C: OR=1.909,95% CI=1.261~2.892, P=0.002;XbaI G vs A: OR=1.815,95% CI=1.112~2.961, P=0.016)。携带PvuII T等位基因的T1D患者糖化血红蛋白(HbA1c)和总胆固醇(total cholesterol, TC)水平显著高于携带CC基因型的患者( P均<0.05),携带XbaI G等位基因的T1D患者低密度脂蛋白(LDL-C)和TC水平显著高于携带AA基因型的患者( P均<0.05)。T1D患者的ESR1基因mRNA相对表达量显著低于对照组(0.42±0.05 vs 1.04±0.16, t=6.227, P<0.001)。PvuII位点CC、CT和TT基因型的T1D患者ESR1基因mRNA相对表达量差异有统计学意义( F=5.823, P<0.001),XbaI位点AA、AG和GG基因型的T1D患者ESR1基因mRNA相对表达量差异也有统计学意义( F=5.415, P<0.001)。 结论:ESR1基因PvuII和XbaI位点多态性可通过影响基因表达,参与到女童T1D的发生、发展中。
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编辑人员丨1天前
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TNFAIP3基因多态性与老年性骨质疏松性骨折及骨代谢指标的相关性研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨TNFAIP3基因多态性与老年性骨质疏松性骨折及骨代谢指标的相关性。方法:收集2019年1月至2021年6月山西省长治医学院附属和平医院就诊的115例老年性骨质疏松性骨折患者作为观察组,同时选择120例与观察组性别、年龄和体质量指数相匹配的老年骨质疏松无骨折患者作为对照组。记录所有研究对象的血钙、血磷、碱性磷酸酶、25-羟基维生素D等骨代谢指标的水平。采用毛细管电泳和片段分析(SNaPshot)技术进行分析TNFAIP3基因上rs10499194和rs13207033位点的基因型。应用实时荧光定量聚合酶链式反应测定外周血中的TNFAIP3基因mRNA相对表达量。结果:观察组和对照组的rs10499194、rs13207033基因型分布和基因频率比较差异均有统计学意义( P均<0.05)。对于rs10499194位点,相较于野生型CC基因型携带者,CT基因型携带者发生骨折的风险显著增大[ OR=3.25(1.22~8.65), P=0.014];显性模型差异也有统计学意义( P=0.003)。对于rs13207033位点,相较于野生型GG基因携带者,GA基因携带者发生骨折的风险显著增大[ OR=3.78(1.19~11.95), P=0.016];显性模型差异有统计学意义( P=0.009)。rs13207033位点AA+GA组的血钙水平显著高于GG组( P=0.006)。观察组TNFAIP3基因mRNA表达水平为(1.41±0.09),显著低于观察组的表达水平(2.07±0.12)( t=6.69, P<0.001)。rs10499194位点TT+CT组患者的TNFAIP3基因mRNA表达水平为(1.35±0.11),显著低于CC组的表达水平(1.43±0.13)( t=2.82, P=0.007)。 结论:TNFAIP3基因多态性与老年性骨质疏松性骨折发生及骨代谢指标有关,并可影响基因表达水平。
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编辑人员丨1天前
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LRP5基因单核苷酸多态性与儿童糖皮质激素性骨质疏松症的相关性研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白5(LRP5)基因的两个SNP位点(rs901823和rs3736228)多态性与儿童糖皮质激素性骨质疏松症(glucocorticoids-induced osteoporosis,GIOP)的相关性。方法:选择2015年1月至2020年12月在北京爱育华妇儿医院和首都医科大学附属北京儿童医院就诊的87例GIOP患儿作为研究对象,并纳入同期在本院应用糖皮质激素治疗但骨量正常的100例患儿作为对照组。采用毛细管电泳和片段分析(SNaPshot)技术对SNP位点rs901823(T>C)、rs3736228(C>T)进行基因分型,采用定量实时荧光定量聚合酶链式反应检测法测定LPR5基因mRNA的相对表达量。结果:对于LRP5基因rs901823位点,GIOP组和对照组的TT、TC、CC基因型分布差异有统计学意义( χ2=14.176, P=0.001)。相对于TT基因型,TC和CC基因型携带者发生GIOP的风险均更高( P<0.05)。对于rs3736228位点,GIOP组和对照组的的CC、CT、TT基因型分布差异有统计学意义( χ2=9.597, P=0.008)。与CC携带者相比,CT基因型携带者发生GIOP的风险显著增加( P<0.05)。GIOP组和对照组的rs901823位点T、C等位基因频率分布差异有统计学意义( χ2=17.298, P<0.001),rs3736228位点的C、T等位基因频率分布差异也有统计学意义( χ2=9.356, P=0.002)。GIOP患儿的LRP5基因mRNA相对表达量为(1.34±0.26),显著低于对照组的LRP5基因mRNA表达量(3.06±0.42)( t=8.248, P<0.001)。在GIOP患儿中,rs901823位点TT、TC、CC基因型患者的LRP5基因mRNA相对表达量两两比较差异有统计学意义( P<0.001);rs901823位点CC、CT、TT基因型患者的LRP5基因mRNA相对表达量两两比较结果显示,TT组和CT组间差异无统计学意义( P>0.05),但CC组的表达量显著高于CT组和TT组( P<0.05)。 结论:LRP5基因的rs901823和rs3736228多态性与GIOP的发生具有相关性,可作为预测患儿GIOP的遗传标志。
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编辑人员丨1天前
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两种方法检测结直肠癌微卫星不稳定性及相关临床病理和分子特征比较
编辑人员丨2024/7/6
目的 采用两种不同方法检测结直肠癌(colorectal cancer,CRC)手术样本微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)并比较分析相关临床病理及分子特征.方法 收集2018年6月至2022年2月本院经手术治疗的CRC患者的福尔马林固定石蜡包埋组织(formalin fixation and paraffin embedding,FFPE)样体450例.根据检测方法将患者分为两组:免疫组织化学(immunohistochemistry,IHC)组(n=312)采用 IHC 法检测 DNA 错配修复(mismatch repair,MMR)蛋白 MutS homolog 2(MSH2)、MSH6、MutL homolog 1(MLH1)和PMS homolog 2(PMS2)的表达;多重荧光聚合酶链式反应-毛细管电泳(multiple fluorescent polymerase chain reaction based capillary electrophoresis,mPCR-CE)组(n=353)采用 mPCR-CE 法检测 MSI 单核苷酸位点(NR24、BAT25、CAT25、BAT26和MONO27).其中215例同时接受IHC法和mPCR-CE法检测.对这215例样本采用实时荧光定量PCR方法检测KRAS原癌基因GTP酶(KRASproto-oncogene,GTPase,KRAS)、NRAS原癌基因GTP酶(NRAS proto-oncogene,GTPase,NRAS)和 B-Raf 原癌基因丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(B-Raf proto-oncogene serine/threonine-protein kinase,BRAF)基因(KRAS/NRAS/BRAF,KNB)突变,采用IHC方法检测Ki-67蛋白表达.比较分析两种不同方法检测的MSI结果分布在人口学特征(年龄和性别)、临床病理特征(肿瘤位置、组织类型、分化程度、肿瘤侵犯深度、神经侵犯、脉管侵犯和淋巴结转移状态)以及分子特征方面的差异.结果 IHC组错配修复缺陷(mismatch repair deficiency,dMMR)样本占6.1%(19/312),其中52.6%(10/19)的dMMR样本是由MLH1和PMS2共同表达缺失导致.dMMR的分布在人口学特征和临床病理特征方面比较,差异均无统计学意义(均P>0.05).mPCR-CE组高频MSI(high-frequency MSI,MSI-H)样本占4.0%(14/353),MSI-H的分布仅在肿瘤位置方面比较,差异具有统计学意义(P=0.020).IHC法和mPCR-CE法共同检测样本中,检测结果一致性为97.2%(209/215);dMMR和MSI-H的分布在BRAFV600E突变方面比较,差异均具有统计学意义(均P<0.05).结论 尽管IHC法和mPCR-CE法检测CRC MSI/dMMR的一致性高达97.2%,但dMMR和MSI-H在CRC中的分布在临床病理特征方面并不一致,表明在特定亚群中需要采用特定方法检测CRC MSI/dMMR.
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编辑人员丨2024/7/6
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老年结直肠癌病人UGT1A1*28及*6基因多态性分析
编辑人员丨2023/11/11
目的 利用分子病理学检测平台分析老年结直肠癌病人UGT1A1*28 及*6 基因多态性.方法 采用PCR-毛细管电泳法以及测序法对老年结直肠癌病人手术切除组织样本进行分析.结果 360 例老年结直肠癌病人中,UGT1A1*28 和UGT1A1*6 基因型的分布规律从多到少均为野生型、突变杂合型和突变纯合型.两种基因的多态性在不同性别、肿瘤类型、肿瘤T分期和原发肿瘤部位的分布差异均无统计学意义(P>0.05).结论 UGT1A1*28 和UGT1A1*6 基因型的分布规律不受性别、肿瘤类型、分期和原发肿瘤部位的影响.UGT1A1*6比UGT1A1*28 更易发生纯合突变.如果任一位点发生纯合突变,另一位点则可能存在突变排斥.
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编辑人员丨2023/11/11
