目的:探讨异质性胞核核糖核蛋白A2B1(HNRNPA2B1)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织浸润CD8 ＋T细胞中表达分布特征及其临床意义。 方法:利用基因表达综合数据库(GEO)公共数据分析HNRNPA2B1在ccRCC组织浸润免疫细胞以及CD8 ＋T细胞亚群中的表达分布；转录组测序技术(RNA-seq)差异分析高、低表达HNRNPA2B1 ccRCC患者高变免疫基因并富集相关通路。多标记免疫荧光染色(mIHC)检测223例ccRCC患者癌组织和癌旁正常组织浸润CD8 ＋T细胞中HNRNPA2B1的表达分布特征，采用R语言做统计分析，经单因素Cox、最优子集回归和LASSO回归交叉验证筛选临床因素并纳入多因素Cox回归构建列线图预测模型。Wilcoxon检验用于组间差异显著性分析，生存分析采用Kaplan-Meier法和Log-rank检验。 结果:HNRNPA2B1在CD8 ＋T细胞上高表达并参与抗原加工呈递、T细胞增殖调节等多个信号通路。肾透明细胞癌患者肿瘤组织浸润HNRNPA2B1 ＋CD8 ＋T细胞比率高于癌旁正常组织[1.26%(0%，35.56%)比0.28%(0%，13.35%)，4.5， U＝6 287， P<0.01]。肿瘤组织低浸润HNRNPA2B1 ＋CD8 ＋T细胞患者总体生存期(OS)显著差于高浸润患者[风险比( HR)＝0.41；95%可信区间( CI)：0.16～1.07， P<0.01]。对单因素Cox、最优子集回归筛选得到的年龄、病理分级、TNM分期和HNRNPA2B1 ＋CD8 ＋T细胞浸润程度( P<0.05)构建列线图风险预测模型。公共单细胞数据分析结果表明HNRNPA2B1在增殖CD8 ＋T细胞上高表达。 结论:肾透明细胞癌组织浸润CD8 ＋T细胞HNRNPA2B1蛋白水平表达的降低表明其参与肾透明细胞癌的进展过程。

目的:利用生物信息学分析筛选脓毒症心脏组织巨噬细胞差异表达基因（DEGs）并对关键基因进行验证。方法:实验1（基因芯片与生物信息学分析）：从基因表达数据库（GEO）下载脓毒症小鼠心脏巨噬细胞基因芯片数据GSE104342，通过R语言分析获得DEGs，使用DAVID在线数据库对DEGs进行基因本体及功能注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析，最后利用基因与蛋白质相互作用检索数据库（STRING）对DEGs进行基因编码蛋白质-蛋白质相互作用分析，并运用Cytoscape软件及MCODE等插件筛选出关键基因。实验2（脓毒症模型构建与相关基因验证）：8~14周龄雄性C57BL/6小鼠10只，随机选取5只作为对照组，5只在体构建小鼠脓毒症模型作为脓毒症组。超声心动图检测小鼠心脏功能，采用苏木精-伊红染色法检测小鼠心脏形态，原位缺口末端标记法检测小鼠心肌细胞凋亡，免疫荧光染色检测分化抗原簇206（CD206）、诱导型一氧化氮合酶（iNOS）、F4/80、细胞因子信号转导抑制因子3（Socs3）、白细胞介素1受体拮抗剂（Il1rn）和CC趋化因子7（Ccl7）蛋白表达。体外培养RAW264.7巨噬细胞，分为2组：（1）脂多糖刺激组：给予1 mg/L脂多糖干预；（2）空白对照组：加入等体积磷酸缓冲液溶液。采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应检测巨噬细胞Socs3、Il1rn和 Ccl7基因表达。结果:实验1：GSE104342数据集筛选出24 647个基因，DEGs共177个（0.72%），其中上调基因120个，下调基因57个。基因本体富集分析表明，DEGs主要参与炎症反应、免疫应答、凋亡调控和抗原加工提呈等过程。KEGG信号通路分析发现，脓毒症小鼠心脏巨噬细胞中DEGs主要富集于细胞因子-细胞因子受体相互作用、肿瘤坏死因子信号通路、NOD样受体信号通路等。STRING及Cytoscape分析构建基因相互作用网络图及重要子模块，获得了3个hub基因，分别为Socs3、Il1rn和Ccl7。实验2：在体实验发现，与对照组相比，脓毒症组小鼠心脏功能明显下降，心肌细胞明显水肿、炎性细胞浸润、心肌纤维断裂，部分心肌细胞核溶解消失，心肌细胞凋亡增加，提示小鼠脓毒症心肌损伤模型构建成功。与对照组相比，脓毒症组小鼠心脏中CD206蛋白表达下调，iNOS、F4/80、Socs3、Il1rn和Ccl7蛋白表达上调，且Socs3、Il1rn、Ccl7与F4/80蛋白存在共定位。体外实验发现，与空白对照组相比，脂多糖刺激巨噬细胞后Socs3、Il1rn和Ccl7水平明显上调。结论:脓毒症小鼠心脏中巨噬细胞Socs3、Il1rn和Ccl7基因表达上调，Socs3、Il1rn和Ccl7有望成为诊治脓毒症心脏损伤的新靶点。

目的:为解决传统临床病种库系统存在的依赖大量人工判断、缺乏辅助标注、电子病历数据可用性差等问题,设计一种基于后结构化技术的临床病种库系统.方法:先通过I2B2标准以及双向长短期记忆网络(bi-directional long short-term memory,BiLSTM)模型构建实体识别模型,形成病历模板库,然后组合病历模板库形成关系模板,抽取复杂的医学实体,实现电子病历的后结构化.之后,基于电子病历后结构化技术构建包括病历结构化、结构化评估、数据标注、常规功能和系统管理5个模块的临床病种库系统.结果:该系统可以将电子病历文本转化为结构化语言,提供更精细化的数据要素提取、更智能的结构化服务,提高了临床和科研工作的效率.结论:该系统提高了临床病种的数据可用性,减轻了用户数据加工的工作强度,保证了数据应用的高质量,为医学研究、临床辅助决策打下了坚实的基础.

目的 为了探讨汉语为母语者在处理双耳分听模式下汉语听觉信号的脑区分布特征及偏侧化特点,本研究利用低通过滤的方法获取韵律信号,结合双耳分听技术,通过脑功能磁共振成像得到汉语语言和韵律双耳分听信号的神经处理模型.材料与方法 从2022年1月至5月在昆明医科大学第一附属医院共招募30位志愿者,年龄(25.36±0.88)岁,汉语为母语,强右利手者.汉语短句音频信号通过低通滤波器,只保留低频率语言韵律信号(<320 Hz),并得到两组双耳分听语音信号:左耳低通过滤右耳不过滤组(filtered in the left ear and unfiltered in the right ear,FL);右耳低通过滤左耳不过滤组(filtered in the right ear and unfiltered in the left ear,FR).受试者依次聆听两组语音信号,同时进行两组组块设计的脑功能磁共振成像.使用SPM 12软件对得到的影像数据进行预处理后,进行组内单样本t检验、组间双样本t检验,以此观察两组语音信号激活脑区的分布和强度的共性、差异性.根据单样本t检验的统计结果,确定感兴趣区域,计算相应脑区的偏侧化指数,以获得大脑在处理双耳分听模式下的汉语语言和韵律信号时的脑区偏侧化特点.结果 两组信号都激活了双侧颞中回、颞上回、额下回,左侧中央前回和右侧额中回(P<0.05,FDR校正);FL信号诱导左侧额中回血氧水平增高(P<0.05,FDR校正);FR信号还激活了双侧顶下小叶(P<0.05,FDR校正).对两组语音信号进行双样本t检验后,发现FR与FL相比,右侧颞中回、颞上回具有明显差异(P<0.05,FDR校正);FL与FR相比无明显差异性脑区.对两组语音信号进行偏侧化指数计算后发现,在大脑半球水平上两组语音信号无明显的偏侧化表现.两组信号的额中回具有右侧优势,中央前回都表现出左侧化趋势;顶下小叶在FR刺激下呈现左侧化趋势.结论 大脑处理两种语音信号时具有一个由双侧颞中回、颞上回、额下回和右侧额中回组成的基础语音处理模型.双耳分听信号FR除激活了基础语音加工脑区外,相较于FL招募了更多的听觉相关脑区参与言语感知和认知控制;FL则可以降低右侧颞中回、颞上回的音韵处理负荷,可能是一种符合左、右两侧半球处理语言、韵律优势的信号.

目的 探讨听力正常人在选择性注意影响下言语感知的大脑神经机制.方法 入组32名正常人,操纵受试者的选择性注意,将同时播放的两段语音流区分为目标/干扰言语,采集受试者聆听时的脑电信号,使用频谱分析计算两类言语引发的能量响应,对比二者在字、词、短语水平上引发的能量差异.结果 目标言语和忽略言语在词水平(2 Hz)的脑电响应存在显著差异,而在字(4 Hz)和短语(1 Hz)水平上未观察到目标言语和忽略言语间脑电响应的显著差异.结论 选择性注意主要在词语水平快速有效的加工编码感兴趣语音流,使其与无关语音区分开,该研究初步揭示选择性注意调节下大脑如何表征听觉语言信息并构建不同语言层级单元,为听力障碍患者的助听算法提供理论模型.

目的:综合采用生物信息学分析和体外细胞实验验证,研究化学性低氧诱导剂氯化钴(Co-Cl2)诱导血管平滑肌细胞损伤与细胞器应激反应及自噬性死亡(自噬)和铁死亡之间的关系.方法:从基因表达数据库(GEO)中获取CoCl2处理血管平滑肌细胞的基因芯片数据集GSE119226,采用R语言分析数据,探讨CoCl2处理与细胞器应激反应(高尔基体应激、内质网应激)及两种细胞死亡方式(铁死亡、自噬性死亡)间的关系.采用原代培养的大鼠血管平滑肌细胞(rVSMC)和CoCl2诱导的体外缺氧模型,CCK-8法检测细胞活力变化,DCFH-DA法检测细胞内活性氧水平,Western blot法检测缺氧关键分子HIF-1α、高尔基体应激标志物GM130与p115、内质网应激标志物GRP78与CHOP、自噬标志物LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ与Beclin1以及铁死亡标志物GPx4与xCT的表达水平,并观察给予相应的处理剂来诱导或抑制细胞器应激反应或细胞死亡对CoCl2诱导的细胞损伤作用的影响.结果:对GSE119226数据集进行差异表达基因筛选分析,结果显示CoCl2处理血管平滑肌细胞对细胞器功能与应激反应、自噬和铁死亡相关基因有明显影响,其中内质网应激、内质网蛋白加工、高尔基体对质膜蛋白转运的调控、自噬/自噬性死亡、铁离子调节与铁死亡等是主要富集的信号通路和生物学过程.体外实验结果显示,与培养的正常对照rVSMC相比,CoCl2处理后细胞活力明显降低,细胞内HIF-1α蛋白表达与活性氧水平升高.CoCl2处理后,rVSMC中反映高尔基体应激发生的高尔基体结构蛋白GM130与p115的表达水平降低,反映内质网应激发生的标志分子GRP78与CHOP升高;同时CoCl2也使细胞自噬标志物LC3-Ⅱ/LC3-Ⅰ与Beclin1水平降低,提示自噬水平降低,而铁死亡标志物GPx4与xCT的表达水平降低则提示细胞发生铁死亡.与CoCl2处理组相比,诱导高尔基体应激、内质网应激或铁死亡可使细胞活力进一步降低,而抑制上述过程可改善细胞活力;另一方面,升高自噬水平可改善CoCl2降低的细胞活力.结论:CoCl2诱导低氧可导致血管平滑肌细胞损伤,高尔基体应激、内质网应激和铁死亡发生以及自噬水平降低在其中起重要作用,抑制细胞器应激反应和铁死亡或升高自噬水平可改善CoCl2导致的血管平滑肌细胞缺氧损伤.

目的 本研究旨在采用中国失语症语言评估量表(Chinese aphasia language battery,CALB)对卒中后运动性失语症(post-stroke Broca's aphasia,PSBA)患者进行语言功能的详细评估,分析卒中后运动性失语症患者的语言损伤特点.方法 连续入组2021年3月—2022年12月就诊于首都医科大学附属北京天坛医院神经病学中心和康复医学科的PSBA患者,根据失语商分数分为轻、中、重度组,同时招募同时间段内年龄、受教育程度相匹配的受试者作为健康对照组.采用CALB评估两组受试者语言功能.比较PSBA组和健康对照组以及轻、中、重度组PSBA患者CALB评分的差异.结果 PSBA组共纳入患者35例(轻度15例,中度12例,重度8例),健康对照组纳入36例.①PSBA组在CALB命名分量表的分项任务表现方面,除音调理解外,评分均低于健康对照组;轻度、中度和重度3组患者在对证命名(高频、低频词汇)、复述(假词、真词)任务方面差异存在统计学意义;在高频词汇的命名和理解方面,评分明显优于低频词汇,在整体分析和轻度组患者中尤为明显.在不同范畴名词词汇(动物、服装、身体部位、果蔬、工具、颜色)的表现方面,差异并不具有统计学意义.名词和动词分析发现,患者在名词命名和理解的正确率方面优于动词,但各组的差异均不具有统计学意义.在动词分类分析方面,患者在不带宾动词的表现方面优于带宾动词,在不同论元结构动词的表现方面,三元动词的命名和理解能力最差.②在动词语义和语句分量表的表现方面,患者所有的任务表现评分均低于健康对照组;不同严重程度的患者在动词命名、论元结构产出、语句启动产出方面差异存在统计学意义;在论元结构产出方面,论元结构越多的语句,患者产出的正确率越低,在整体分析及轻度组中尤为明显.结论 PSBA患者在整体语言通路上存在不同程度的损害,其中语音输入通路的损害较输出通路轻.在不同范畴词汇表现方面,患者处理动词的困难大于名词,名词中低频词汇处理损害重于高频名词;在动词处理方面,论元结构越复杂的动词,患者的表现越差.

目的 将免疫基因组学与临床特征结合,用R语言等生物信息学方法筛选与卵巢癌预后有关的独立预后因素,并构建卵巢癌预后相关的列线图模型,预测患者生存情况.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得卵巢癌表达谱数据以及临床数据,标准化处理后通过单因素Cox分析筛选出预后相关基因,并将这些预后相关基因与免疫相关基因数据集取交集,得到与卵巢癌预后相关的免疫基因,通过LASSO回归分析以及多因素Cox回归分析进一步筛选出免疫预后基因构建多因素Cox风险模型.结果 经过LASSO回归以及多因素Cox回归分析共筛选出 12 个预后相关免疫基因,分别为趋化因子CCL配体 28(chemokine CCL ligand 28,CCL28)、封闭蛋白 4(recombinant claudin 4,CLDN4)、趋化因子CXC配体 12(chemokine CXC ligand 12,CXCL12)、内皮细胞特异性分子 1(endothelial cell specific molecular-1,ESM1)、鸟苷酸结合蛋白 2(guanylate binding protein 2,GBP2)、免疫球蛋白κ可变 4-1(immunoglobulin kappa variable 4-1,IGKV4-1)、免疫球蛋白λ可变 2-8(immunoglobulin lambda variable 2-8,IGLV2-8)、白细胞介素 27 受体α(recombinant interleukin 27 receptor alpha,IL27Ra)、peptidase inhibitor 3(PI3)、前列腺素F2α受体(prostaglandin F2α receptor,PTGFR)、S100 钙结合蛋白A5(recombinant S100 calcium binding protein A5,S100A5)和抗原加工相关转运体 1(transporter associated with antigen processing 1,TAP1).基于这些免疫预后基因构建的预测模型的 1、2、3 和 5 年的受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下的面积(area under the curve,AUC)值分别为 0.658、0.748、0.725 和 0.748.单因素和多因素Cox回归显示,临床分级、年龄以及该模型计算所得的风险评分是卵巢癌患者预后相关的独立因素(均P<0.05).将临床分级、年龄和风险评分纳入卵巢癌预后相关的列线图模型预测生存期.该模型对卵巢癌患者 1、2 和 3 年生存率预测性能的一致性参数(concordance index,C-index)值为 0.669.结论 基于 12 个免疫基因计算的风险评分、临床分级以及年龄是卵巢癌患者预后相关的独立因素.本研究构建的免疫基因预后模型可有效预测卵巢癌患者1、2和3年的生存状况.这些免疫基因有望成为卵巢癌免疫治疗的新靶标.

目的:探讨泌尿系结石手术前的临床信息(症状、体征等)和CT报告与手术方式的相关性.方法:选取因泌尿系结石住院治疗的患者的病例资料,导出有完整术前资料的患者文档,以自然语言处理(NLP)技术对文档进行分析,提取加工其中的关键信息,研究术前关键信息与手术方式的相关性.结果:收集连续患者资料371例,行输尿镜碎石术(URI)患者190例,行经皮肾镜碎石取石术(PNL)患者142例,行输尿管软镜碎石术(RIRS)患者39例.利用NLP比较临床信息、CT报告与手术方式的相关性,单纯“CT报告”分类符合率为0.456,ROC曲线下面积为0.608;“CT报告+临床信息”分类符合率为0.461,ROC曲线下面积为0.618.增加临床信息后,NLP模型的分类符合率未见明显变化,但决策树路径变长,节点变多,规则复杂,不利于临床使用.结论:对于拟行手术的泌尿系结石患者,手术前的CT报告与手术方式具有相关性,可为手术方式的临床决策提供直接有效的信息.增加症状和体征的临床信息,不能提高预测手术方式的符合率.

语义加工在语言理解过程中扮演着核心作用.随着认知神经科学技术的发展,在过去的20余年间,研究者们对语义加工的时间进程和大脑机制开展了深入的研究,构建了多个经典的理论模型.未来的研究应着重于对语义加工的概念进行更精细而系统的划分,在此基础上,从大脑功能协同与交互的角度以及不同成像技术辐合性运用的角度对语义加工开展更为系统的研究.