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基于生物信息学和机器学习算法鉴定PDR铁死亡关键基因
编辑人员丨4天前
目的::联合生物信息学分析方法和机器学习算法筛选增殖性糖尿病视网膜病变(PDR)中铁死亡关键基因和治疗靶点。方法::从GEO数据库和FerrDb数据库中下载PDR转录组测序数据集、基因芯片数据集和铁死亡相关基因列表;筛选出铁死亡相关差异基因并行功能富集分析;通过WGCNA分析方法筛选PDR中铁死亡相关疾病特征基因;综合LASSO算法与SVM-RFE算法筛选出铁死亡关键基因并通过受试者工作特征曲线评估诊断能力;对铁死亡关键基因行GSEA分析;通过DGIdb数据库构建铁死亡关键基因的药物调控网络;应用CIBERSORT算法分析PDR中免疫细胞浸润分布特征。组间比较采用独立样本 t检验或Mann-Whitney U检验。Pearson相关分析用于不同基因模块与临床性状之间的相关性分析。 结果::从3 678个差异基因中筛选出83个铁死亡相关差异基因。功能富集分析结果显示,这些基因参与铁死亡、长寿调节、自噬等信号通路。通过WGCNA分析方法从中筛选出17个铁死亡相关疾病特征基因。联合LASSO算法与SVM-RFE算法从17个疾病特征基因中筛选出3个铁死亡关键基因为PPARA、ABCC5、TSC1,并证明这些基因有很高的诊断效能。单基因GSEA分别展示了3个关键基因高低表达组中富集到的信号通路。从DGIdb数据库中筛选出20个相关药物并构建3个关键基因的药物调控网络。CIBERSORT结果显示,M1巨噬细胞、中性粒细胞等在PDR样本中浸润程度较高。结论::本研究分析鉴定出PDR中3个铁死亡关键基因,为进一步研究PDR的病理分子机制和诊断治疗靶点提供了新的思路与参考。
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编辑人员丨4天前
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中国9个长寿地区65岁及以上人群血砷水平与高尿酸血症的关联研究
编辑人员丨4天前
目的:分析65岁及以上人群血砷水平与高尿酸血症的关联。方法:研究对象来自2017—2018年在我国9个长寿地区开展的“老年健康生物标志物队列研究”,共纳入2 438名血砷和血尿酸数据完整的65岁及以上研究对象。通过问卷调查和体格检查,收集调查对象的人口学特征、生活方式及健康状况等信息;同时采集调查对象的静脉血以检测血砷、血尿酸等水平。根据血砷水平的三分位数将对象分为砷低水平组、砷中水平组和砷高水平组,采用logistic回归模型分析血砷水平和高尿酸血症的关联。结果:2 438名研究对象年龄为(84.57±11.41)岁,其中男性1 172名(48.07%),≥80岁者1 525名(62.55%),高尿酸血症的检出率为17.23%(420例)。砷低、中、高水平组的高尿酸血症检出率分别为11.77%、19.25%和20.62%( P<0.001)。多因素logistic回归模型分析结果显示,调整相关混杂因素后,与砷低水平组相比,砷中、高水平组高尿酸血症检出风险较高[ OR(95% CI)值分别为1.57(1.12~2.23)和2.08(1.46~2.99)]。与女性相比,男性老年人血砷水平与高尿酸血症的关联更为显著( P交互值<0.05)。 结论:中国9个长寿地区65岁及以上老年人群血砷水平与高尿酸血症的检出风险存在关联。
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编辑人员丨4天前
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广西长寿地区老年人血清溶血磷脂酰胆碱水平与老年健康指数的关联研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨血清溶血磷脂酰胆碱(LPC)水平与老年健康指数的相关性。方法:选取广西永福长寿队列2016年基线调查对象251名,其中中青年组(≤59岁)、年轻老年组(60~89岁)和长寿老年组(≥90岁)分别为66、63和122名。收集对象人口学资料并测量对象身高、体重、血压和脂质代谢相关指标,通过简易精神状态检查量表和日常生活活动量表结果评估老年人认知和躯体功能,构建老年健康指数。通过液相色谱串联质谱法测定血清LPC16∶0、LPC18∶0、LPC18∶1、LPC18∶2水平,比较其在不同年龄和不同健康状态组间的差异;采用logistic回归模型分析血清LPC水平与老年人健康指数的关联。结果:随年龄增加,对象中女性占比增加、吸烟和饮酒率下降,BMI、TC、TG、LDL-C、舒张压、4种LPC水平均随年龄增加而下降,收缩压水平随年龄增加而上升(均 P<0.05)。随老年人健康状态下降,血清LPC16∶0、LPC18∶0、LPC18∶1、LPC18∶2水平均呈下降趋势(均 P<0.001),调整年龄和性别因素后,仅LPC18∶0与老年健康状态相关[ OR(95% CI):0.48(0.25~0.92)],血清LPC18∶0浓度每增加1个标准差(16.87 nmol/L),老年人健康状态较差的风险下降52%。 结论:血清LPC18∶0是独立于年龄和性别的老年健康状态相关因素。
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编辑人员丨4天前
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基于多状态Markov模型的我国老年人无失能期望寿命及其影响因素
编辑人员丨4天前
目的:了解我国老年人无失能期望寿命(DFLE)现状及其影响因素和影响程度。方法:利用中国老年人口健康长寿调查研究2011-2018年数据,采用多状态Markov模型和微观仿真法计算我国≥65岁老年人的期望寿命(LE)、DFLE、DFLE占比(DFLE/LE)及危险因素所致的DFLE损失,利用Bootstrap法估计95% CI。 结果:我国≥65岁老年人DFLE为14.27(95% CI:13.85~14.74)年,女性高于男性,经济状况较好者高于经济状况较差者;DFLE/LE为86.33%(95% CI:85.52%~87.18%),男性高于女性,农村高于城镇。未定期体检、蔬菜水果摄入不足、吸烟和压力分别造成男性0.74、0.41、0.62、0.12年和女性0.82、0.42、0.19、0.20年的DFLE损失。消除以上4种危险因素,可使我国男女性老年人的DFLE分别增长1.73年和1.45年。 结论:提高我国老年人DFLE应重点关注男性、经济状况较差的人群。促进老年人定期体检和足量的蔬菜水果摄入、禁烟、缓解老年人压力等措施可提高我国老年人的DFLE。
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编辑人员丨4天前
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中国9个长寿地区65岁及以上老年人尿镉水平与体重指数及身体围度的关联研究
编辑人员丨4天前
目的:研究我国9个长寿地区65岁及以上老年人尿镉与体重指数(BMI)及身体围度的关联。方法:研究对象来自2017—2018年在我国9个长寿地区开展的“中国老年健康生物标志物队列研究”,共计1 968名65岁及以上老年人被纳入本研究。通过问卷调查和体格检查,收集调查对象的社会人口学特征、生活方式、膳食摄入和健康状态等信息,采集调查对象晨尿以检测尿镉和尿肌酐水平;身体围度包括腰围、臀围和小腿围。根据尿肌酐校正后尿镉水平三分位数将调查对象分为低水平组(<0.77 μg/g·肌酐)、中水平组(0.77~1.69 μg/g·肌酐)和高水平组(≥1.69 μg/g·肌酐),采用多重线性回归模型分析尿肌酐校正后尿镉不同水平与BMI及身体围度的关联,采用限制性立方样条拟合多重线性回归模型分析尿肌酐校正后尿镉水平与BMI及身体围度的剂量-反应关系。结果:1 968名研究对象年龄为(83.34±11.14)岁,尿肌酐校正后尿镉水平的 M( Q1, Q3)为1.13(0.63,2.09)μg/g·肌酐,BMI为(22.70±3.82)kg/m 2,腰围为(85.42±10.68)cm,臀围为(92.67±8.90)cm,小腿围为(31.08±4.76)cm。多重线性回归模型分析结果显示,调整相关混杂因素后,尿肌酐校正后尿镉每增加1 μg/g·肌酐,BMI、腰围、臀围和小腿围的变化水平 β(95% CI)值分别为-0.28(-0.37,-0.19)kg/m 2、-0.74(-0.96,-0.52)cm、-0.78(-0.96,-0.61)cm和-0.20(-0.30,-0.11)cm;限制性立方样条模型结果显示,尿肌酐校正后尿镉水平与BMI呈负向非线性关联( P非线性<0.001),与腰围、臀围和小腿围呈负向线性关联(均 P线性<0.001)。 结论:中国9个长寿地区65岁及以上老年人尿肌酐校正后尿镉水平与BMI、腰围、臀围和小腿围呈负向关联。
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编辑人员丨4天前
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中国长寿地区高龄老人血浆尿酸水平与2型糖尿病发病风险的队列研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨高龄老人血浆尿酸水平对2型糖尿病(T2DM)发病风险的影响。方法:资料来自老年健康生物标志物队列研究(HABCS),该项目于2008—2009年开展基线调查,于2011—2012年、2014年和2017—2018年进行了3次随访,共2 213名≥80岁高龄老人被纳入本研究。收集对象人口学特征、生活方式和患病情况等资料,并对其进行体格测量,收集空腹静脉血进行尿酸和血糖检测。追踪随访对象糖尿病发病、死亡结局情况。采用 Cox比例风险回归模型探索高尿酸血症和血浆尿酸水平对T2DM发病的影响,采用限制性立方样条(RCS)函数来探索血浆尿酸水平与T2DM发病风险之间的剂量反应关系。结果:研究对象年龄为(93.2±7.6)岁,女性占66.7%(1 475名)。基线调查时血浆尿酸水平为(289.1 ±88.0)μmol/L,高尿酸血症患病率为13.3%(294例)。9年累积随访7 471人年(人均随访3.38年),T2DM新发病例122例,发病密度为1 632.98/10万人年。Cox比例风险回归分析结果显示,血浆尿酸水平每升高10 μmol/L,T2DM发病风险增加1.1% [ HR(95% CI):1.011(1.004,1.017)]。与处于血浆尿酸最低五分位数( Q1)者相比,最高五分位数( Q5)高龄老人T2DM发病风险增加20.7 % [ HR(95% CI):1.207(1.029,1.416)]。与血浆尿酸正常者相比,高尿酸血症者T2DM发病风险增加19.2% [ HR(95% CI):1.192(1.033,1.377)]。RCS函数显示,随着血浆尿酸水平升高,糖尿病发病风险增加,呈非线性剂量反应关系( P=0.016)。 结论:随着血浆尿酸水平升高高龄老人T2DM发病风险增加。
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编辑人员丨4天前
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中国9个长寿地区65岁及以上人群血铅浓度与认知功能受损的关联研究
编辑人员丨4天前
目的:探讨65岁及以上人群血铅水平与认知功能受损的关联。方法:研究对象来自2017—2018年在我国9个长寿地区开展的“老年健康生物标志物队列研究”,最终将1 684名血铅和认知功能数据完整的65岁及以上人群纳入本研究。通过问卷调查和体格检测,收集调查对象的人口学特征、生活方式、健康状况及认知功能评分等信息;同时采集调查对象的静脉血以检测血铅水平。根据血铅水平的四分位数将调查对象分为4组( Q 1~ Q 4组),采用多因素logistic回归模型分析血铅浓度与认知功能受损的关系,采用限制性三次样条检验血铅浓度与认知受损之间是否存在非线性关联。 结果:1 684名研究对象年龄为(83.1±11.1)岁,其中女性843名(50.1%);认知功能受损者191名(11.3%)。调整相关混杂因素后,老年人血铅浓度每升高10 μg/L,认知功能受损患病风险 OR(95% CI)值为1.05(1.01~1.10);与血铅浓度 Q 1组老年人相比,血铅浓度较高者认知功能受损的患病风险较高, Q 2, Q 3, Q 4组的 OR(95% CI)值分别为1.19(0.69~2.05)、1.45(0.84~2.51)和1.92(1.13~3.27)。 结论:我国9个长寿地区65岁及以上老年人血铅水平与认知功能受损患病风险存在关联。
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编辑人员丨4天前
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L-[1- 13C]-苯丙氨酸呼气试验测定肝脏储备功能的增龄变化研究
编辑人员丨4天前
目的:采用L-[1- 13C]-苯丙氨酸呼气试验( 13C-pheBT)对不同年龄组健康人肝脏储备功能进行评估,并与老年肝硬化患者进行比较,探讨肝脏储备功能的增龄变化规律。 方法:健康志愿者37例,按年龄分为中青年组(10例)、低龄老年组(9例)、高龄老年组(9例)、长寿组(9例);老年肝硬化对照组(8例)。研究对象均口服100 mg L-[1- 13C]-苯丙氨酸,在口服本试剂前及服用后150 min内的12个不同时间点采集呼气样本,用气体同位素比值质谱仪检测样本中 13C丰度值,计算各时相 13C排除速率( 13CO 2ERt)、各时相 13C累积排除率( 13Ccumt)和服药后 13C排除速率峰值( 13CO 2ERmax),并对 13C-pheBT参数与常用肝功能检测指标的相关性进行分析。 结果:13CO 2ER 3013、 13CO 2ER 45、 13CO 2ER 60、 13Ccum 45、 13Ccum 60、 13Ccum 75、 13Ccum 90、 13Ccum 105、 13Ccum 120、 13Ccum 135、 13Ccum 150在健康志愿者组中,长寿组与中青年组、低龄老年组比较差异有统计学意义,老年肝硬化组与健康志愿者比较各亚组均有统计学差异(均 P<0.05); 13CO 2ERmax、 13CO 2ER 30、 13Ccum 45、 13Ccum 60、 13Ccum 75、 13Ccum 90、 13Ccum 105、 13Ccum 120、 13Ccum 135、 13Ccum 150参数的均值在中青年组、低龄老年组、高龄老年组、长寿组、老年肝硬化组中依次降低(均 P<0.05)。健康志愿者中 13CO 2排除速率曲线和累积排除率曲线显示中青年组、低龄老年组两组曲线几乎重合,而其高龄老年组、长寿组依次降低,长寿组与中青年组、低龄老年组差异最为显著。 结论:13C-pheBT是一种安全、灵敏、可靠的定量肝功能试验方法,建议采样时点控制在口服试剂后60 min以内,以 13CO 2ERmax、 13CO 2ER 30、 13Ccum 45、 13Ccum 60为主要参数;肝脏具有强大的储备和代偿功能,健康人的肝脏储备功能随增龄减退是一个渐进、缓慢的过程,在80岁之后才明显减退,90岁之后减退更为显著。
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编辑人员丨4天前
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长寿老年人急性胃扭转一例
编辑人员丨4天前
胃扭转是临床中一种罕见的疾病,急性起病时常病情凶险,目前尚无统一规范的指南文件指导治疗。本文报道1例94岁长寿的急性胃扭转患者,总结其临床特点及诊疗过程,同时对相关文献进行复习总结,并且针对该病例的诊治过程,结合老年患者人群的特殊之处,阐述作者的治疗体会和思考。
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编辑人员丨4天前
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用以评估和校准人类生物学年龄的表观遗传学时钟的构建
编辑人员丨4天前
目的:构建适用于评估和校准人类生物学年龄的表观遗传学时钟模型。方法:于2019年7月1日至11月30日从广西壮族自治区长寿队列选取186名研究对象,于2020年10月1日至12月31日从解放军总医院第七医学中心体检人群选取124名研究对象。采用自制问卷收集人口学特征、家族疾病史等资料,通过体格检查测量对象的心率和血压,采集空腹外周静脉血,分别检测空腹血糖(FBG)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和端粒长度,采用靶向甲基化位点测序检测EDARADD cg09809672、IPO8 cg19722847、NHLRC1 cg22736354、P2RX6 cg05442902和SCGN cg06493994基因位点的甲基化水平。排除DNA甲基化和端粒长度检测质量控制不合格的54名对象,最终对256名对象资料进行分析。分析不同年龄段甲基化水平变化情况,采用多重线性回归法构建生物学年龄预测模型,采用Kendal秩相关分析评价年龄差值[即(公历年龄-生物学年龄)]与端粒长度的相关性,比较各年龄组不同年龄差值对象的健康相关指标。结果:对象年龄的 M( Q1, Q3)为67(51,91)岁,其中女性166名(64.84%)。随年龄增加,基因位点甲基化水平分别呈下降(EDARADD cg09809672、IPO8 cg19722847和P2RX6 cg05442902)和上升趋势(NHLRC1 cg22736354和SCGN cg06493994)(均 P<0.05)。所构建的生物学年龄预测模型为: Y=-53.121×EDARADD cg09809672-137.564×IPO8 cg19722847+141.040×NHLRC1 cg22736354-67.893×P2RX6 cg05442902+149.547×SCGN cg06493994+4.592×sex+64.185( R2=0.86, P<0.001),式中 Y为生物学年龄,方程各项依次为5个基因位点甲基化水平、性别(男性=1,女性=2)和截距。年龄差值与端粒长度Kendall秩相关系数为0.731( P<0.001)。与年龄差值<0的对象相比,年龄差值≥0的对象未成年期收缩压较高[分别为(88.50±8.89)和(109.83±9.48)mmHg,1 mmHg=0.133 kPa],青壮年期TC较低[分别为(5.48±0.23)和(3.98±0.54)mmol/L],TG较低[分别为(3.51±0.32)和(3.41±0.20)mmol/L],中年期FBG较低[分别为(6.17±0.67)和(5.37±0.79)mmol/L],高龄老年期舒张压较高[分别为(76.99±6.78)和(83.97±9.36)mmHg](均 P<0.05)。 结论:所构建的表观遗传学时钟模型可用于评估和校准人类生物学年龄。
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编辑人员丨4天前
