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基于生物信息学分析识别老年骨质疏松症核心致病基因及通路
编辑人员丨4天前
目的:采用生物信息学方法分析老年骨质疏松症相关的核心致病基因及相关通路。方法:于2020年11月至2021年8月,以在北京积水潭医院就诊的8例骨质疏松症病例和5名健康体检者为研究对象。采集8例老年骨质疏松症患者与5名健康体检者的外周血,开展高通量转录组测序,并对表达谱进行分析。对差异表达基因进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。通过 STRING、Cytoscape 工具构建 PPI 调控网络、筛选核心基因。结果:8例骨质疏松症病例中,男性1例,女性7例,年龄为(72.4±4.2)岁;5名健康体检者中,男性1名,女性4名,年龄为(68.2±5.7)岁。分析筛选出差异表达基因1 635个,其中847个基因高表达,788个基因低表达。GO富集分析结果显示,差异基因在分子功能方面主要富集于核糖体结构成分、蛋白质二聚化活性等;细胞组分方面主要富集于核小体、DNA组装复合物、胞质部分、蛋白-核酸复合物、游离核糖体等。KEGG信号通路分析结果显示,差异表达基因主要富集于系统性红斑狼疮、核糖体等。筛选出的10个核心基因分别为 UBA52 、UBB、RPS27 A、RPS15 、RPS12 、RPL13 A、RPL23 A、RPL10 A、RPS25和 RPS6,且其中7个基因均可编码核糖体蛋白。 结论:老年骨质疏松症的发病可能与核糖体相关基因和通路有关联。
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编辑人员丨4天前
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cGAS-cGAMP-STING信号通路的活化机制及其在肾脏疾病中作用的研究进展
编辑人员丨4天前
环状GMP-AMP合成酶(cyclic GMP-AMP synthase,cGAS)是近几年发现的一种新的DNA模式识别受体,通过将信号2’-3’环化二核苷酸(cyclic GMP-AMP,cGAMP)传递至接头蛋白干扰素刺激蛋白(stimulator of interferon genes,STING)激活固有免疫系统,从而发挥抵抗病毒感染的作用。近年来,研究发现cGAS-cGAMP-STING信号通路可通过识别自身DNA诱导无菌性炎性反应从而参与急性肾损伤、免疫性肾病及肾脏肿瘤的发生,可为该类疾病的药物研发提供新的靶点。本文系统综述了cGAS-cGAMP-STING信号通路的发现、蛋白结构与功能及其在肾脏疾病中的作用,探讨了cGAS-cGAMP-STING信号通路在肾脏疾病治疗方面的意义。
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编辑人员丨4天前
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TLR9在幽门螺杆菌相关性疾病中作用机制的研究进展
编辑人员丨4天前
幽门螺杆菌是一种感染人类胃的革兰氏阴性病原体,是世界上最常见的细菌感染。幽门螺杆菌的长期、持续感染可导致患者发展为消化性溃疡、胃腺癌、胃粘膜相关淋巴组织淋巴瘤。Toll样受体(Toll-like receptors,TLRs)是抵御微生物入侵的第一道防线,在多种感染性疾病的发生发展中起重要作用。TLR9是机体免疫应答中发挥关键作用的I型整合跨膜蛋白,在树突状细胞、B细胞、巨噬细胞和上皮细胞中均有表达,它能够通过低甲基化的DNA和糖骨架等结构识别DNA,并介导一系列免疫应答反应。尽管近年来对TLR9的激活机制进行了广泛的研究,但其在幽门螺杆菌感染导致的相关性疾病中的确切作用仍不明确。文章从TLR9在固有免疫中的功能及其信号通路、TLR9在幽门螺杆菌感染中的作用机制、TLR9与胃粘膜相关淋巴组织淋巴瘤这三个方面阐述TLR9在在幽门螺杆菌相关性疾病中的作用机制。
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编辑人员丨4天前
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cGAS-cGAMP-STING信号通路的功能及研究进展
编辑人员丨4天前
cGAS-cGAMP-STING信号通路是固有免疫系统重要组成部分,通过识别胞浆DNA诱导I型干扰素(interferons,IFNs)和其他细胞因子产生,介导抗微生物先天免疫,同时也在肿瘤进展及远处转移中发挥作用。深入了解cGAS-cGAMP-STING信号通路与炎症性疾病、自身免疫性疾病及肿瘤发生发展的关系,以及STING激动剂的研究现状等,将对临床相关疾病的治疗方案给予理论支持,也将对开发cGAS-cGAMP-STING信号通路的抗肿瘤靶向药物提供新的启示。
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编辑人员丨4天前
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EB病毒感染中DNA识别通路的研究进展
编辑人员丨4天前
EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)在人群中普遍易感,其感染可累及血液、呼吸、泌尿、消化、神经等全身多个系统,亦在相关肿瘤、自身免疫病等疾病发展中扮演重要角色,严重威胁人类健康。作为一种DNA病毒,EBV可被固有免疫应答中的DNA识别受体感知,触发下游一系列免疫应答。DNA识别通路由DNA感受器、接头分子及下游效应信号组成。双链DNA感受器主要包括黑色素瘤缺乏因子2样受体(absent in melanoma 2-like receptors,ALRs)、环状GMP-AMP合酶(cyclic GMP-AMP synthase,cGAS)等;接头分子主要是干扰素基因刺激因子(stimulator of interferon genes,STING)和含有caspase招募结构域的凋亡相关斑点样蛋白(apoptosis-associated speck-like protein containing a caspase recruitment domain,ASC);下游免疫效应主要包括Ⅰ型IFN、炎性小体及促炎细胞因子等。作为一种疱疹病毒科的双链DNA病毒,EBV可触发宿主复杂的固有免疫和适应性免疫应答,尤其是多种DNA识别受体介导的通路,在宿主免疫防御及病原体免疫逃避等方面均发挥关键作用。本文以DNA感受器为线索,全面总结近年来DNA识别信号在EBV感染中的活化作用、调控机制及临床相关性,以进一步理解EBV感染后宿主的固有免疫应答,为EBV感染引起的相关疾病的防治提供免疫学依据。
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编辑人员丨4天前
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DNMT1与DNA损伤应答反应
编辑人员丨4天前
DNMT1不仅是一种重要的DNA甲基转移酶,维持子代与亲代甲基修饰的统一,它的N端还含有特异性序列,使其在DNA损伤应答反应中发挥重要作用。DNA损伤应答反应是细胞对DNA损伤反应的统称,包括对DNA损伤信号的识别和放大、招募DNA修复因子启动修复通路和协调周期调控、诱发细胞凋亡。本文对DNMT1的作用、DNA损伤应答反应过程以及DNMT1通过参与损伤信号的感知和传导,调控DNA修复、周期检查点停滞和细胞凋亡参与DNA损伤应答反应过程加以综述。
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编辑人员丨4天前
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NOD信号通路及其对心肌重构作用的研究进展
编辑人员丨4天前
心肌重构是心力衰竭的关键性临床阶段,是多种心血管疾病向心力衰竭发展的共有病理生理过程。在心肌重构过程中,会出现细胞器和细胞核的损伤,导致线粒体DNA和核DNA释放到细胞质中,成为重要的损伤相关分子模式(DAMPs),激活NOD样受体(NLRs)等模式识别受体(PRRs),启动天然免疫反应,参与心肌重构与心力衰竭的发生发展。NLRs主要存在于细胞胞浆中,与其配体结合后能够激活下游信号通路,对免疫反应、自噬、细胞凋亡、焦亡等病理生理过程有重要的调节作用,与心肌重构密切相关。以NOD信号通路为靶点治疗心肌重构和心力衰竭具有潜在的临床价值。本文就NOD信号通路及其对心肌重构作用的研究进展做一综述。
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编辑人员丨4天前
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STING信号通路在非酒精性脂肪性肝病中作用的研究进展
编辑人员丨4天前
非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)已成为全球最常见的慢性肝病之一,目前尚无有效治疗措施。脂质代谢紊乱和肠道菌群失调诱导的固有免疫炎症在NAFLD进展中发挥重要作用。作为固有免疫的关键调控蛋白,干扰素基因刺激因子(STING)可通过识别胞浆DNA诱导Ⅰ型干扰素和其他细胞因子产生免疫应答,发挥抗病毒、抗肿瘤和免疫调节等作用。新近研究表明,STING介导的信号通路在巨噬细胞活化诱导的肝脏炎症及相关糖脂代谢紊乱中发挥关键作用,有望成为NAFLD治疗的新靶点。
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编辑人员丨4天前
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cGAS-STING信号通路在脑肿瘤中的研究进展
编辑人员丨4天前
环鸟苷酸-腺苷酸合成酶(cGAS)-干扰素基因刺激因子(STING)信号通路是STING激活的经典途径,其在激发天然免疫方面的作用近年来逐渐被广泛关注。cGAS可识别并结合内源性或外源性DNA,催化三磷酸腺苷(ATP)和三磷酸鸟苷(GTP)合成环鸟苷酸-腺苷酸(cGAMP),继而激活STING信号,促进Ⅰ型干扰素(IFN)和炎性因子的产生,诱导天然免疫和适应性免疫。现有研究表明,cGAS-STING信号通路在感染、炎症、肿瘤等的治疗中发挥着重要作用,尤其是在临床治疗效果欠佳的高级别胶质瘤的治疗中也有着巨大潜力。本文将对cGAS-STING信号通路做简要概述并总结其在脑肿瘤中的作用及机制,以期为脑肿瘤治疗靶点和治疗药物的发掘提供新思路。
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编辑人员丨4天前
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高迁移率族蛋白B1在肺动脉高压中的作用
编辑人员丨4天前
肺动脉高压(PAH)是一种以肺血管阻力和肺动脉压力进行性升高为特征,并最终导致右心衰竭的致死性心血管疾病。高迁移率族蛋白B1(HMGB1)是一种主要表达于细胞核内的DNA结合蛋白,因其多种细胞定位而具有多种相应功能。近年来研究显示,HMGB1在PAH患者肺部表达明显上调,其受体信号转导通路能够促发炎症反应及肺血管重构,从而诱导PAH发生,并且HMGB1及其受体信号转导通路中的多位点有望成为PAH治疗的新靶点。本文就PAH的炎症免疫机制、HMGB1的生物学特性及其在PAH发生发展中的主要作用进行综述,以期发现PAH治疗新途径。
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编辑人员丨4天前
