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低氧诱导因子-1α介导的微小RNA-210对胃癌细胞增殖与转移功能的影响及机制
编辑人员丨1周前
目的:观察低氧微环境对胃癌细胞增殖、转移功能的影响,并探讨其相关的分子学机制。方法:细胞增殖检测试剂盒(CCK-8)、Transwell法检测SGC-7901细胞经低氧处理后的增殖、迁移及侵袭能力,应用高通量测序(Illumina Hiseq)对低氧处理后的微小RNA(miRNA,miR)差异基因进行检测;实时定量聚合酶链反应(RT-PCR)法、干扰低氧诱导因子-1α(HIF-1α)表达法验证低氧环境下HIF-1α诱导miR-210的能力;后在正常胃黏膜组织、胃癌及癌周组织中检测miR-210的表达,分析其表达量与患者临床病理学特征之间相关性;接下来进一步在体外上调/抑制miR-210后,应用CCK-8、Transwell检测miR-210对胃癌细胞株AGS、SGC-7901增殖、迁移及侵袭能力的影响;后应用生物信息分析、报告基因实验、蛋白质免疫印迹(Western blot)及靶基因干扰实验探讨其发挥功能的具体分子学机制。两组间比较采用 t检验。 结果:与常氧组比较,低氧可明显促进SGC-7901细胞的增殖(0.43±0.13比0.56±0.17, t=5.43, P<0.05)、迁移(250±28比390±30, t=10.28, P<0.05)及侵袭能力(220±40比310±45, t=9.74, P<0.05);miR-210低氧处理后显著上调的差异miRNA之一;低氧在胃癌细胞中可通过HIF-1α诱导miR-210的表达;胃癌组织中异常表达的miR-210与肿瘤的大小及临床分期相关( P<0.05);与对照组比较,过表达miR-210可明显促进AGS与SGC-7901细胞的增殖(0.58±0.16比0.73±0.21, t=6.58, P<0.05)、(0.53±0.11比0.63±0.25, t=7.18, P<0.05),迁移(200±20比295±35, t=8.36, P<0.05)、(185±20比260±10, t=7.54, P<0.05),及侵袭(150±25比215±30, t=5.87, P<0.05)、(145±25比190±30, t=4.37, P<0.05)能力,而其拮抗剂却显著抑制胃癌细胞的上述恶性能力;最后Western blot等研究表明磷脂酶和张力蛋白同源物(PTEN)是miR-210在胃癌细胞中发挥促癌功能的靶基因。 结论:低氧环境下HIF-1α介导miR-210可通过靶向调控PTEN的表达促进胃癌细胞的增殖及转移能力。
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编辑人员丨1周前
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荧光MIRA法快速检测食品中产气荚膜梭菌
编辑人员丨2024/6/15
目的 基于荧光多酶恒温快速扩增(MIRA)技术,建立一种快速准确检测食品中产气荚膜梭菌的方法.方法 利用产气荚膜梭菌共有α毒素编码基因plc保守序列设计引物探针,并建立和优化荧光MIRA方法;提取17种非目标菌基因组DNA进行方法特异性验证;梯度稀释目标菌基因组DNA和菌液用于方法灵敏度评价;选取4种食品进行基质干扰试验,评估方法的稳定性;检测实际样品并与国家标准方法进行比较,以验证该方法的实用性.结果 该方法特异性强,检测多种非目标致病菌均呈阴性反应;灵敏度高,以基因组DNA为模板和菌液为模板时最低检测限分别为1.05×101fg/μL和7.5×10℃FU/mL;该方法不受基质影响,抗干扰能力强;耗时短,约20 min即可完成检测.结论 本研究中的荧光MIRA方法快速准确、灵敏度高、特异性强,可用于食品中产气荚膜梭菌的快速检测.
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编辑人员丨2024/6/15
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逆转录多酶恒温扩增技术快速检测新型冠状病毒核酸方法的建立
编辑人员丨2024/1/20
目的 建立逆转录多酶恒温扩增试纸条法(RT-MIRA-LFD),用于快速检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸.方法 依据SARS-CoV-2开放阅读框(ORF1ab)基因和核壳蛋白(N)基因序列设计RT-MIRA反应引物;筛选RT-MIRA-LF反应的最佳引物和探针;评价RT-MIRA-LF检测 SARS-CoV-2的敏感度、特异度、阳性符合率和阴性预测值等诊断效能.结果 建立的RT-MIRA-LFD方法检测SARS-CoV-2核酸特异性良好,与其他类型的病毒均无交叉反应.该方法检测ORF1ab基因和N基因的最低检出限均为100拷贝/μL,该方法的敏感度为90.00%,特异度为100.00%,阳性预测值均为100.00%,阴性预测值为95.24%.结论 基于RT-MIRA-LFD技术建立的检测SARS-CoV-2核酸新方法具有良好的临床诊断效能.
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编辑人员丨2024/1/20
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基于CRISPR/Cas13a系统建立大口黑鲈弹状病毒检测方法
编辑人员丨2024/1/20
为了建立一种灵敏度高、特异性强并且适合现场诊断的大口黑鲈弹状病毒(Micropterus salmoides rha-bdovirus,MSRV)检测方法,研究基于CRISPR-Cas13a系统并结合多酶恒温核酸快速扩增(MIRA)技术建立了一种MSRV的检测方法.实验对MSRV序列进行多重序列比对分析后,针对MSRV衣壳蛋白(CP)基因的特异性区域设计两个靶点,并通过体外转录成特异性的crRNA,同时设计合成MIRA引物序列实现目标序列的等温扩增,最后结合Cas13a蛋白、crRNA、恒温扩增体系构建检测体系,并从高效crRNA的选择、反应温度、ssRNA报告探针浓度和Cas13a与crRNA的浓度比四个方面优化了反应体系,并采用最优检测体系对大口黑鲈样本进行检测验证.结果显示,在20μL检测体系中加入200 nmo1/L Cas13a、100 nmol/L crRNA1、100 nmol/L crRNA2及500 nmol/L ssRNA报告探针,在37℃的情况下能够获得最佳的检测效果.并且该检测体系可以检测到102 fM的MSRV病毒,具有良好的特异性和灵敏性,此外检测结果可直接通过紫外灯照射直接观察.研究基于CRISPR/Cas13a系统结合等温扩增MIRA技术建立的MSRV检测方法,可在室温下且不需要昂贵的仪器进行MSRV病毒检测,检测结果可以肉眼直接观察,能在多种场合下使用,研究结果为检测MSRV提供了有效方法.
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编辑人员丨2024/1/20
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2015-2022年某中医院奇异变形杆菌检出率及耐药率变化趋势
编辑人员丨2024/1/20
目的 通过长期监测和数据对比,探索奇异变形杆菌某些缓慢而持续的变化趋势,为临床感染性疾病的诊疗及院感防控提供方向及依据.方法 使用WHONET 5.6软件及SPSSAU数据科学分析平台(Cochran-armit-age检验),回顾性分析江苏省中医院2015年1月1日-2022年12月31日期间,临床标本中分离的奇异变形杆菌的检出率、耐药率、标本分布及科室分布的变化趋势.结果 去除同一住院患者重复分离的相同菌株后,共1 569株奇异变形杆菌纳入分析;2015-2022年奇异变形杆菌的总检出率为3.32%,在革兰阴性菌、肠杆菌科细菌、变形杆菌属细菌中的检出率分别为4.90%、8.80%和85.46%,连续8年检出率均呈上升趋势(P<0.05);奇异变形杆菌主要分布于痰标本、尿标本及分泌物标本中,且在痰标本中的占比呈上升趋势(P<0.05),在尿标本中的占比呈下降趋势(P<0.05);奇异变形杆菌检出前三的科室为ICU、老年科和泌尿外科,在ICU及老年科的占比呈上升趋势(P<0.05);奇异变形杆菌对环丙沙星、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶、头孢曲松、左氧氟沙星、氨苄西林/舒巴坦的耐药率呈上升趋势(P<0.001),对哌拉西林/他唑巴坦的耐药率呈下降趋势(P<0.05).结论 奇异变形杆菌在该医院内存在流行趋势,可能成为医院感染,特别是呼吸道感染的更常见病原菌.在ICU及老年科等综合性科室流行的风险更高,应加强对相关科室的目标性监测,督促临床合理使用抗菌药物.
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编辑人员丨2024/1/20
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实时荧光多酶恒温扩增技术检测小鼠细小病毒核酸的方法建立
编辑人员丨2023/9/16
目的 旨在建立基于实时荧光多酶恒温扩增(exo-MIRA)技术的小鼠细小病毒(MVM)核酸检测新方法.方法 收集2021年1月至2022年1月南京大学医学院附属金陵医院实验动物室共75份小鼠肠道内容物标本.针对MVM VP2基因的保守区域设计4对引物,琼脂糖凝胶电泳分析扩增产物以筛选最优引物对,并设计特异性荧光探针,构建exo-MIRA 检测法.通过检测梯度稀释模拟样本,进行检出限评价.检测其他小鼠病毒,包括仙台病毒(SV)、小鼠肝炎病毒(MHV)、小鼠鼠痘病毒(Ect)、小鼠肺炎病毒(PVM)、呼肠孤病毒(Reo),分析exo-MIRA法的交叉反应性.采用qPCR法和exo-MIRA法同时检测收集的75份标本,统计分析两种方法的一致性.以qPCR法为参比方法,评估该法的敏感度和特异度,进行诊断效能评价.结果 采用exo-MIRA技术建立MVM核酸检测方法,该方法检测MVM的检出限为10 copies/μL,且与其他五种小鼠病毒无交叉反应,可特异性检出MVM.75份标本检出结果显示,exo-MIRA法和qPCR法高度一致,Kappa值为0.921(P<0.05),exo-MIRA法的敏感度为100.0%,特异度为96.7%.结论 建立了一种基于实时荧光MIRA恒温扩增技术的MVM核酸检测方法,具有简单快速、实验要求低、敏感特异等优点.该方法可应用于现场复杂环境的即时检测,在实验动物质量检测应用上有一定前景.
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编辑人员丨2023/9/16
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GC-MS法分析得荣县光核桃仁油中脂溶性成分
编辑人员丨2023/8/6
目的 采用GC-MS法分析得荣县光核桃Prunus mira Koehne仁油中脂溶性成分.方法 热榨法榨取光核桃仁油,GC-MS法分离、鉴定,并测定各个化合物相对含有量,对结果进行聚类分析和主成分分析.结果 夺松村的光核桃仁油中有20个化合物,β-谷甾醇、反式角鲨烯和油酸羟丙基酯含有量较高,1个特有化合物(4-甲基壬烷);日堆村的有22个化合物,β-谷甾醇、油酸和γ-生育酚含有量较高,1个特有化合物(1,2,4-三甲基环己烷);绒贡村的有24个化合物,油酸、β-谷甾醇和反式角鲨烯含有量较高;张仁村的有22个化合物,以β-谷甾醇、油酸和γ-生育酚含有量较高,2个特有化合物(反式-2,4-癸二烯醛和二十八醛).10批样品分为6类.夺松村第一主成分的累积贡献率81.86%.结论 得荣县光核桃仁油有35个化合物,以油酸、β-谷甾醇、反式角鲨烯、γ-生育酚和维生素E为主,特有化合物4个.
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编辑人员丨2023/8/6
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日本血吸虫病治疗后血清抗体消长观察
编辑人员丨2023/8/6
目的 分析人群日本血吸虫病治疗后抗体滴度变化,为制订监测巩固方案提供科学依据.方法 采用定群前瞻性研究法,以江陵县2014年检出的粪检阳性病人及血检阳性滴度1:80以上(含1:80)者为对象,先用吡喹酮2日疗法治疗,于治疗后半年、1年、2年分别采集血样、粪样,进行IHA抗体检测和集卵孵化法检测.结果2014年粪检阳性病例251人,年龄以41岁以上为主,占93.23%(234/251);IHA法检测抗体高滴度病例581人,年龄以41岁以上为主,占89.16% (518/581).粪检阳性人群治疗后半年、1年、2年粪检转阴率分别为99.60%(250/251)、100%(239/239)、100%(234/234), IHA法检测抗体转阴率分别是21.91%(55/251)、64.11%(156/239)和76.89%(193/234);IHA法检测抗体高滴度人群治疗后半年、1年、2年转阴率分别为38.04%(221/581)、64.11%(359/560)、77.86%(429/551);抗体转阴率进行χ2检验,差异均有统计学意义(χ2=77.538、183.412、25.469,P值均<0.001).分别对两组人群治疗前后不同时间段抗体滴度的几何均值进行t检验,治疗前两组人群的抗体滴度几何均值差异有统计学意义(t=23.576,P<0.01);治疗后半年、1年、2年两组人群抗体滴度的几何均值差异均无统计学意义(t=-0.046、1.165、-0.132,P均>0.01).结论 日本血吸虫病治疗后人群血清中抗体水平消退缓慢,尚需开发特异的诊断技术以满足监测需求.
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编辑人员丨2023/8/6
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哈氏蜈蚣线粒体基因组全序列分析
编辑人员丨2023/8/6
[目的]获取哈氏蜈蚣线粒体基因组全序列.[方法]应用差速离心以及滚环扩增的方法得到纯度较高的线粒体DNA,采用Illumina HiSeq X Ten技术对扩增得到的哈氏蜈蚣线粒体DNA进行测序,采用从头组装和mapping近缘种的方法拼接组装线粒体基因组,应用MITOS在线注释及与近缘种进行本地注释等方法注释线粒体基因组.[结果]获得14538 bp哈氏蜈蚣线粒体基因组全序列.其共有20个tRNA及13个蛋白基因,2个rRNA(16S rRNA、12S rRNA).[结论]获取哈氏蜈蚣线粒体基因组全序列,并可用于药用蜈蚣的资源调查与保护研究.
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编辑人员丨2023/8/6
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精制芒硝与柴芍承气汤辅助治疗重度急性胰腺炎并腹腔间隔室综合征
编辑人员丨2023/8/6
目的 比较精制芒硝与柴芍承气汤在治疗重度急性胰腺炎(SAP)并腹腔间隔室综合征(ACS)的临床疗效差异.方法 SAP合并ACS患者60例,随机分为治疗组32例,对照组28例.治疗组在常规西医治疗基础上,予以精制芒硝鼻饲+灌肠;对照组在常规西医治疗基础上,予以柴芍承气汤鼻饲+灌肠.比较两组患者治疗前与治疗第1、3、7天的APACHEⅡ评分、腹内压、内毒素、降钙素原(PCT)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)变化;比较两组患者肠鸣音恢复时间、自主排便恢复时间、住院时间及住院费用.结果 两组患者治疗7 d后,肠道通透性指标(内毒素)及感染相关指标(PCT、TNF-α)均较治疗前显著下降,差异有统计学意义(P<0.05).两组在治疗第1、3、7天腹内压均显著低于治疗前(P<0.05),且同时间两组间比较差异无统计学意义(P > 0.05).治疗第3、7天APACHE Ⅱ评分均较治疗前显著改善(P <0.05),且同时间两组比较差异无统计学意义(P>0.05).在肠鸣音恢复时间、自主排便恢复时间、住院时间、住院费用方面,两组比较差异无统计学意义(P>0.05).结论 精制芒硝辅助治疗SAP合并ACS,能有效降低腹内压,促进肠道功能恢复,保护肠道黏膜屏障功能,减少肠道细菌及内毒素移位,减少感染并发症的发生,有利病情恢复,与柴芍承气汤具有相似的临床疗效.
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编辑人员丨2023/8/6
