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PLOD2基因变异复合杂合缺失致Ⅱ型Bruck综合征1例
编辑人员丨5天前
对2020年5月山西省儿童医院骨科收治的1例Ⅱ型Bruck综合征(Ⅱ型BS)患儿的临床特点及基因资料进行分析。患儿,男,3 d,因"出生3 d发现右下肢疼痛、肿胀"收入院。由于患儿存在全身多处骨折,锁骨、肋骨骨折后骨痂已形成,肱骨青枝骨折、右股骨骨折、左胫腓骨骨折、先天性马蹄内翻足、先天性双腕肘髋膝关节挛缩等临床特点,考虑不能排除染色体疾病,基因测序结果示患儿(先证者) PLOD2基因存在复合杂合缺失,突变及杂合缺失分别来源于其父母,确诊为Ⅱ型BS。提示临床医师注意识别 PLOD2的1个错义突变和杂合缺失导致的Ⅱ型BS,从而降低漏诊误诊率,做到早诊断、早治疗。
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编辑人员丨5天前
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新生儿Bruck综合征1例
编辑人员丨5天前
Bruck综合征是一种常染色体隐性遗传的成骨不全症,表现为反复骨折、严重骨痛及关节挛缩。本文报道1例PLOD2基因变异导致的新生儿Bruck综合征的临床表现、诊断及治疗,加强临床医生对该疾病的认识,对无明确诱因出现骨折的患儿需考虑进行基因检测。
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编辑人员丨5天前
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PLOD1在口腔鳞状细胞癌组织和细胞中的表达及其意义
编辑人员丨3周前
目的:探讨前胶原赖氨酸,2-酮戊二酸5-双加氧酶1(PLOD1)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织和细胞中的表达及其对OSCC细胞生物学行为的影响,阐明PLOD1作为OSCC预后标志物的潜力.方法:采用肿瘤免疫评价资源(TIMER)数据库、基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库和Kaplan-Meier Plotter数据库分析头颈部鳞状细胞癌(HNSC)组织中PLOD1 mRMA表达水平及其与HNSC患者生存期的关联.免疫组织化学法检测110例OSCC组织和64例癌旁组织中PLOD1蛋白表达情况,分析其与OSCC患者临床病理特征和预后的关系.采用受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)评估PLOD1在OSCC诊断中的价值.实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法和Western blotting法检测人正常口腔上皮HOK细胞和OSCC SCC15和CAL27细胞中PLOD1 mRNA和蛋白表达水平.利用脂质体法将小干扰RNA(siRNA)片段转染至SCC15细胞,分为si-NC组(转染阴性对照si-NC)和si-PLOD1组(转染si-PLOD1),采用CCK-8法、细胞划痕愈合实验和Transwell小室实验分别检测2组细胞增殖活性、划痕愈合率和侵袭细胞数.结果:公共数据库分析,HNSC组织中PLOD1 mRNA表达水平高于癌旁组织(P<0.05);与PLOD 1低表达组比较,PLOD 1高表达组HNSC患者生存期较短(HR=1.41,P=0.018).PLOD1蛋白主要表达于OSCC细胞的细胞质中,OSCC组织中PLOD 1表达强度高于癌旁组织(P<0.01),并与OSCC患者T分期和TNM分期有关(P=0.021,P=0.004).PLOD 1诊断OSCC的AUC为0.811,特异度和灵敏度分别63.64%和90.63%.Kaplan-Meier生存分析,与PLOD1低表达组比较,PLOD1高表达组OSCC患者生存率降低(P<0.01);COX回归分析,PLOD1高表达是影响OSCC预后的独立危险因素(P=0.012).OSCC细胞中PLOD1 mRNA和蛋白表达水平高于HOK细胞(P<0.05).与si-NC组比较,si-PLOD 1组细胞增殖活性和划痕愈合率降低(P<0.05),侵袭细胞数减少(P<0.01).结论:PLOD1在OSCC组织和细胞中高表达,沉默PLOD1表达可抑制OSCC细胞增殖、迁移和侵袭.PLOD1可能是OSCC新的治疗靶点和预后标志物.
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编辑人员丨3周前
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PLOD2基因在肾透明细胞癌中的作用及与预后的关系
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨PLOD2基因在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达与患者的诊断率、生存率的关系及其对细胞增殖和迁移的影响.方法 收集ccRCC及对应癌旁肾组织各12例,qRT-PCR和免疫组织化学方法分别检测配对组织中PLOD2基因mRNA和蛋白的表达,分析其与患者诊断率和生存率的关系;采用siRNA技术敲减786-O和ACHN细胞中PLOD2的表达;MTT和克隆形成实验检测786-O和ACHN细胞的增殖;Transwell和流式细胞技术分别检测786-O和ACHN细胞的迁移和周期分布.结果 在ccRCC组织中,PLOD2基因mRNA表达高于癌旁肾组织(P<0.01);PLOD2蛋白的阳性表达率高于癌旁肾组织[91.7%(11/12)比8.3%(1/12),P<0.001].PLOD2高表达的ccRCC患者比低表达的生存率低(P=0.026),且具有更好的诊断率(AUC=0.6366).786-O和ACHN细胞中,与各自对照组相比,PLOD2敲减组的吸光度值和克隆形成数均明显减少;786-O细胞敲减组G0/G1期细胞百分率高于其对照组[(50±4)%比(27±5)%,P<0.01];ACHN细胞敲减组G0/G1期细胞百分率高于其对照组[(67±8)%和(59±8)%,P<0.05];786-O细胞敲减组迁移细胞数少于其对照组[(56±8)个比(100±12)个,P<0.01];ACHN细胞敲减组迁移细胞数少于其对照组[(52±5)个和(143±6)个,P<0.001].结论PLOD2基因在ccRCC组织呈高表达,与患者的诊断和预后相关;PLOD2基因下调能抑制ccRCC细胞的增殖和迁移,提示其可能在ccRCC的发生发展中具有重要作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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基于数据挖掘分析PLOD2基因在肺腺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/6
目的:阐明PLOD2基因在肺腺癌中的表达及临床意义.方法:检索Oncomine和TCGA等生物信息数据库中有关PLOD2的信息,对所获取的数据资料挖掘并进行2次分析,对PLOD2在肺腺癌中的作用进行荟萃分析.结果:Oncomine数据库中共收集了444项不同类型PLOD2的研究结果,关于在肿瘤与对照组织中PLOD2表达有统计学差异的结果有56项,其中PLOD2表达增高的有49项,表达降低的有7项.涉及到肺癌的研究共有9项.肺腺癌中高表达的数据集有8项、低表达的有0项.共有815例样本涉及PLOD2的mRNA在肺腺癌和正常组织中的表达.在数据库中综合比较8项研究成果,发现与对照组相比,PLOD2在肺腺癌中的表达高于正常组织(P<0.05).另外,免疫组织化学显示PLOD2在肺腺癌组织中表达较强或中等,而在正常组织中表达较弱或呈阴性.不仅如此,通过挖掘TCGA数据库,发现高表达PLOD2的患者总体死亡率较高,低表达PLOD2的患者预后较好(P<0.05).结论:通过深入挖掘公共数据库中肿瘤相关的基因信息,提示PLOD2的mRNA水平在肺腺癌组织中呈现高表达,并与肺腺癌预后相关,有望成为肺腺癌药物治疗的重要治疗靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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骨肉瘤患者肿瘤组织中PLOD2基因表达水平及其对肿瘤细胞迁移/侵袭的影响
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨骨肉瘤患者肿瘤组织中赖氨酸羟化酶2(PLOD2)基因表达水平及其对肿瘤细胞迁移/侵袭的影响.方法 选取西安交通大学第二附属医院骨科采集的95例新鲜骨肉瘤患者肿瘤组织及其癌旁正常组织标本,采用免疫组化染色和实时荧光定量PCR(RT-PCR)方法检测其表达水平,分析PLOD2表达与临床病理特征的关系.取对数生长期人骨肉瘤细胞系MG-63,随机分为小干扰RNA(siRNA)-PLOD2组、阴性对照组(NC组)以及空白组,siRNA-PLOD2组转染siRNA-PLOD2干扰序列,NC组转染空载体,空白组不予任何处理.采用RT-PCR方法检测各组PLOD2基因表达水平,观察抑制PLOD2基因表达对骨肉瘤细胞迁移、侵袭能力的影响.结果 免疫组化染色结果显示,骨肉瘤肿瘤组织中PLOD2阳性表达率(96.84%)明显高于癌旁正常组织(7.37%),差异有显著性(P<0.05);骨肉瘤肿瘤组织中PLOD2 mRNA表达水平明显高于癌旁正常组织,差异有显著性(P<0.05);PLOD2表达与TNM分期、软组织浸润、淋巴结远处转移密切相关(P<0.05),与Ⅰ、Ⅱ期、不存在软组织浸润以及未发生淋巴结远处转移骨肉瘤患者比较,Ⅲ、Ⅳ期、存在软组织浸润以及发生淋巴结远处转移骨肉瘤患者肿瘤组织中PLOD2表达水平明显升高(P<0.05),而与骨肉瘤患者性别、年龄、肿瘤直径、组织学类型无关(P>0.05);转染48 h,siRNA-PLOD2组PLOD2基因表达水平明显低于NC组、空白组(P<0.05),NC组、空白组PLOD2基因表达水平无显著差异(P>0.05);Transwell侵袭实验以及划痕实验结果显示,siRNA-PLOD2组骨肉瘤细胞穿透基底膜数量、迁移细胞数量明显少于NC组、空白组(P<0.05),NC组、空白组骨肉瘤细胞穿透基底膜数量、迁移细胞数量无显著差异(P>0.05).结论 骨肉瘤患者肿瘤组织中PLOD2基因表达水平高于癌旁正常组织,其表达水平与骨肉瘤患者肿瘤TNM分期、软组织浸润、淋巴结远处转移有关,抑制PLOD2基因表达可抑制骨肉瘤肿瘤细胞迁移、侵袭.
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编辑人员丨2023/8/6
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TGFβ1/Smad3信号通路介导的赖氨酸羟化酶2活性变化在肺纤维化胶原沉积中的作用
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨TGFβ1/Smad3信号通路对赖氨酸羟化酶2(lysyl hydroxylase 2,LH2)活性变化的影响,以及这一变化在肺纤维化胶原沉积中的作用及机制.方法:用含10%胎牛血清的F12培养基培养人肺成纤维细胞株HFL1.实验分为对照组、TGFβ1(10 μg/L)刺激组和米诺地尔(5μmol/L)干预组,对照组加等量培养基;48 h后收集各组RNA及蛋白,采用RT-qPCR检测PLOD2、α-SMA及COL Ⅰ的mRNA表达水平,Western blot检测LH2、总Smad3、磷酸化Smad3、α-SMA、COLⅠ和COLⅣ的蛋白水平变化,ELISA检测细胞中羟基赖氨酰吡啶酚(hydroxylysylpyridinoline,HP)的含量变化.结果:TGFβ1刺激后,PLOD2、α-SMA及COL Ⅰ的mRNA表达上调(P<0.01);其对应的蛋白水平如LH2、磷酸化Smad3、α-SMA、COL Ⅰ和COLⅣ蛋白水平增高,而总Smad3的蛋白水平没有变化.米诺地尔干预后上述基因的mRNA及蛋白表达减少(P<0.01).TGFβ1刺激后ELISA检测到HP含量较对照组增加,米诺地尔干预后合成减少(P<0.05).结论:TGFβ1/Samd3信号通路激活,使LH2表达增多;而米诺地尔通过抑制TGFβ1/Samd3信号转导,减少LH2的表达,减少羟基化胶原吡啶链的合成,从而减轻肺纤维化病变.
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编辑人员丨2023/8/6
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白肉灵芝水提物对衰老大鼠皮肤的作用研究
编辑人员丨2023/8/6
为研究白肉灵芝水提物(Ganoderma leucocontextum aqueous extracts,GLAE)对D-半乳糖致衰大鼠皮肤的影响,用D-半乳糖构建衰老大鼠模型,同时分别给予不同剂量的(0、50、100和200 mg/kg)的GLAE处理,利用生物显微技术观察皮肤组织结构的变化,ELISA法检测Ⅰ、Ⅱ型胶原蛋白含量,彗星电泳检测细胞DNA损伤,定量PCR检测基因MAP3K5、TGF-β1和PLOD2的表达水平.结果 显示与模型组比较,GLAE干预后,大鼠皮肤病理改变明显减轻;皮肤细胞DNA损伤程度显著降低,Ⅰ、Ⅱ型胶原蛋白含量显著升高;基因MAP3K5、TGF-βl表达上调,基因PLOD2的表达下调.GLAE可增加胶原蛋白含量、抑制皮肤细胞DNA损伤、调节MAP3K5、TGF-β1和PLOD2基因的表达而发挥延缓皮肤衰老的作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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2-氧化戊二酸依赖性加氧酶在10种癌症中的双重预后作用:对细胞周期调节和细胞黏附维持的影响
编辑人员丨2023/8/5
背景与目的 肿瘤缺氧与转移和放化疗耐药相关.氧敏感相关基因具有临床价值,对预后有重要意义.在本研究中,我们研究了2-氧化戊二酸依赖性加氧酶家族氧敏感基因的泛癌症预后意义.方法对25种癌症的20,752个样本的转录谱进行回顾性多队列研究,以鉴定2-氧化戊二酸依赖性加氧酶基因家族(由61个基因组成的氧依赖酶家族)的泛癌症预后特征.我们使用3个独立的胰腺癌队列(n=681)来确定最小的预后基因集.发现了2个特征,每个特征由5个基因组成.利用Cox回归和受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析,测试了这些特征对生存的预测效能.结果特征1(KDM8、KDM6B、P4HTM、ALKBH4、ALKBH7)和特征2(KDM3A、P4HA1、ASPH、PLOD1、PLOD2)分别与预后良好、预后不佳相关.特征1在6种癌症的8个队列(n=2627)中具有预后意义:膀胱尿路上皮癌(P=0.039)、肾乳头细胞癌(P=0.013)、肝癌(P=0.033和P=0.025)、肺腺癌(P=0.014)、胰腺癌(P<0.001和P=0.040)和子宫内膜癌(P<0.001).特征2在9种癌症的12个队列(n=4134)中具有预后意义:膀胱尿路上皮癌(P=0.039)、宫颈鳞状细胞癌和宫颈腺癌(P=0.035)、头颈鳞状细胞癌(P=0.038)、肾透明细胞癌(P=0.012)、乳头状细胞癌(P=0.002)、肝癌(P<0.001,P<0.001)、肺腺癌(P=0.011)、胰腺癌(P=0.002,P=0.018,P<0.001)和胃腺癌(P=0.004).多变量Cox回归分析证实了这些癌症特征独立的临床相关性.ROC曲线分析证实了这些特征比目前的肿瘤分期标准更佳.在肝癌和胰腺癌中,KDM8可能是一种下调的肿瘤抑制因子,是一个独立的预后因子.KDM8表达与细胞周期调控因子表达负相关.肿瘤中KDM8低表达与HNF4A信号转导介导的细胞黏附力降低相关.结论明确了氧敏感基因的2个泛癌症预后特征.这些基因可用于10种不同癌症的风险分层,以揭示侵袭性肿瘤亚型.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于GEO数据库筛选胃癌分子标志物
编辑人员丨2023/8/5
目的:运用生物信息学方法结合基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)筛选参与胃癌发生发展的关键基因,以获得用于胃癌诊断、治疗靶标选择及预后判断相关分子标志物.方法:从GEO数据库中下载与胃癌(gastric cancer,GC)相关芯片数据集,筛选差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),对DEG做功能富集分析,构建蛋白互作网络(protein-protein interaction network,PPI),筛选关键基因(key gene),进而构建共表达网络、生存曲线以及层次聚类分析.结果:共筛选出261个GC相关DEG,通过分析获得14个关键基因,分别为PLOD1、PLOD3、COL1A1、COL1A2、COL2A1、COL3A1、COL4A1、COL4A2、COL8A1、COL12A1、COL15A1、ITGA2、LUM、SERPINH1.关键基因主要参与胶原纤维的组织、细胞外基质的组织、细胞外结构的组织、皮肤形态发生、胶原的合成及血管的发育等生物学过程.生存曲线分析表明,基因COL3A1(P=0.0241)表达的改变显著降低了胃癌患者整体生存率;基因ITGA2(P=0.0679)的表达改变也显示与GC患者的无病生存率降低有关.与正常胃组织相比,层次聚类分析表明,GC组织中基因PLOD1、PLOD3、COL3A1、ITGA2、COL1A2、COL1A1、COL4A1、LUM、COL12A1、SERPINH1、COL8A1表达上调.结论:经筛选获得的关键基因可作为潜在分子标志物用于GC的早期诊断、治疗靶点选择和预后判断,并为后续的研究提供参考.
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编辑人员丨2023/8/5
