目的:对河北省保定市一起水源性诺如病毒感染性腹泻暴发疫情进行调查分析，了解其流行特征，确定致病原。方法:开展现场流行病学调查，采集患者呕吐物、肛拭子或粪便标本，居民末梢水以及污水井井水标本，采用荧光定量PCR（real-time PCR）检测诺如病毒核酸，对阳性标本进行扩增并测序分析。结果:该小区发现病例70例，罹患率为2.33%。17份患者样本和6份水样经荧光定量PCR法检测均出现GI和/或GII核酸阳性。测序分析显示患者样本和污水井井水的诺如病毒都为GI.6和GII.2这两种基因型，序列同源性均高于98.8%。结论:本次疫情为一起由水源水污染导致的诺如病毒感染性胃肠炎暴发疫情，需加强对水源水的日常管理，定期消毒，广泛宣传，预防此类事件的发生。

患者男，47岁。因“咳嗽、咳痰35年，活动后气促20余年，再发2月余”于2018年8月16日至中南大学湘雅二医院就诊。反复咳嗽咳痰、劳累后气促30余年，合并鼻窦炎，冷凝集素滴度≥64，T淋巴细胞（CD3 +）比例 46%，Th淋巴细胞（CD4 +）比例 30%，免疫球蛋白未见异常。第一秒用力呼气容积（FEV1）与用力肺活量（FVC）的比值，即1秒率（FEV1/FVC）为49%。肺部CT示双肺弥漫性小气道病变。全外显子测序检测到TAP2基因 c.223_224del（p.Leu75AspfsTer91）纯合突变，其姐姐也发现TAP2基因相同位点突变，裸淋巴细胞综合征Ⅰ型及弥漫性泛细支气管炎诊断明确。予以阿奇霉素（0.5 g，1次/d）治疗后，患者咳嗽咳痰、气促症状明显改善。

目的:观察使用刺猬蛋白（Hedgehog）信号阻断剂环巴胺（cyclopamine，Cycl）对慢性氟中毒大鼠骨组织中神经胶质瘤相关癌基因同源蛋白1（glioma-associated oncogene homolog 1, Gli1）及β链蛋白（β-catenin）表达的影响，探讨两者表达变化在氟致骨形成增强中的意义。方法:SD大鼠48只分为4组，每组12只。对照组饮用自来水（含氟量<1 ppm），氟中毒组（F组）、氟+环巴胺组（F+Cycl组）和氟+二甲基亚砜组（F+DMSO组）分别饮用含50 ppm氟化钠（NaF）的自来水。饲养6个月后分别给F+Cycl组和F+DMSO组大鼠腹腔注射环巴胺和DMSO。检测各组大鼠尿氟含量；酶联免疫吸附试验测定血清骨碱性磷酸酶（bone alkaline phosphatase,BALP）含量；HE染色观察骨组织形态计量学变化；实时荧光定量PCR法、免疫组织化学和蛋白印迹法检测骨组织中Gli1和β-catenin的mRNA和蛋白表达情况。结果:染氟后F组、F+Cycl组和F+DMSO组大鼠尿氟含量、骨小梁密度、骨小梁宽度较对照组明显增加，但3组间未见明显差异（ P>0.05）。F组较对照组血清BALP含量增加，Cycl阻断后血清BALP含量明显降低（ P<0.05）。与对照组比较，F组Gli1和β-catenin mRNA和蛋白均有表达增强。使用Cycl后，两者表达均较F组降低（ P<0.05），而F+DMSO组则无明显变化。Gli1与β-catenin的表达呈正相关关系（ r=0.476， P<0.05）；Gli1、β-catenin蛋白表达与血清BALP、骨小梁密度分别呈正相关关系（ r 1=0.457， r 2=0.466， r 3=0.581， r 4=0.554， P<0.05）。 结论:Cycl可阻断慢性氟中毒大鼠骨组织Gli1表达，并且其影响成骨相关因子β-catenin的表达，这可能参与到氟致骨形成增强的过程中。

目的 本研究旨在了解本中心体外循环变温水箱是否有非结核分枝杆菌(NTM)污染.方法 在含氯消毒剂消毒水箱后次日,留取本中心1号楼19个水箱的水样,进行NTM培养.对于水样分枝杆菌培养阳性的水箱,用无菌拭子分别涂抹水箱内胆生物膜和水箱出风口处,做NTM培养和鉴定,采用rpoβ基因和 16S rRNA基因片段聚合酶链反应扩增测序,将测序结果进行基本局部比对搜索工具(BLAST)比对以确定菌种.结果 4个水箱的水样检测NTM阳性,2 个水箱在内胆和出风口都检测到奇美拉分枝杆菌,1 个水箱仅在内胆区检测到奇美拉分枝杆菌,1 个水箱在内胆区和出风口分别检测到戈登分支杆菌和奇美拉分枝杆菌.结论 本中心体外循环变温水箱存在NTM污染,以奇美拉分枝杆菌为主.应通过加强变温水箱NTM监测、使用过滤水、定期清除生物膜、定期消毒、合理摆放水箱等方法降低NTM污染和感染风险.

目的 建立针对水样中产气荚膜梭菌检测的TaqMan实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)方法,并测试该方法在自来水样中的检测效果.方法 选择位于该菌拟核中高度保守的plc基因,设计特异性引物和TaqMan 探针,经优化后建立了针对该菌的TaqMan实时荧光定量PCR检测方法,结合滤膜法处理含有plc基因的标准菌株的模拟污染水样,并对所建立的方法进行测试.结果 所建立的产气荚膜梭菌TaqMan实时荧光定量PCR检测方法具有高度的特异性,13株食源性致病菌、3株艰难梭菌及1株腐败梭菌的Ct值大于40;该方法的最低检出限为1× 10copies/μL,具有较高的灵敏性;对模拟污染水样的最低检测限为1.0×102 CFU/mL.应用该方法对4份人工模拟污染阳性水样与90份自来水样进行检测发现,2份1.0×102CFU/mL的模拟污染水样可检出产气荚膜梭菌,2份1.0×10CFU/mL的模拟污染水样与90份自来水样均未检出产气荚膜梭菌.结论 所建立的产气荚膜梭菌TaqMan实时荧光定量PCR检测方法具有特异性好、灵敏性高的优点,对水体中产气荚膜梭菌的检测具有较高的应用价值.

目的 探讨乳腺癌中肿瘤异常糖链糖蛋白(tumor abnormal protein,TAP)水平与乳腺癌分子分型、临床病理特征的关系,分析TAP在乳腺癌筛查、诊断和预后中的价值.方法 收集357例乳腺癌患者的临床资料,采集患者肘部静脉血检测TAP凝聚物面积.运用免疫组化EnVision两步法分析AR、ER、PR、HER2、p53、Ki67等表达,应用FISH检测HER2基因,分析TAP表达与乳腺癌临床病理特征、分子分型和临床分期的关系,并复习相关文献.结果 357例乳腺癌患者中,TAP阴性9例(2.52％),TAP弱阳性36例(10.08％),TAP强阳性312例(87.40％),TAP阳性率为97.48％.免疫表型:AR阳性321例、阴性36例,ER阳性256例、阴性101例,PR阳性214例、阴性143例,HER2强阳性98例、弱阳性214例和阴性45例,p53阳性146例、阴性211例,Ki67增殖指数≥20％者276例、＜20％者81例.FISH法:155例乳腺癌免疫组化HER2(2+)患者行FISH检测,其中140例阴性,15例阳性.≥50岁患者TAP表达水平明显高于＜50岁患者(P＜0.05),Ki67增殖指数高表达者的TAP表达水平高于Ki67低表达者(P＜0.05).不同分子分型乳腺癌患者的TAP表达差异有统计学意义(P＜0.05);三阴型乳腺癌患者的TAP表达高于非三阴型患者(P＜0.05),Luminal B型患者的TAP表达高于非Luminal B型患者(P＜0.05);不同临床分期的乳腺癌患者TAP表达差异有统计学意义(P＜0.05),在乳腺癌中TAP表达水平与临床分期呈正相关.结论 TAP检测可提高乳腺癌诊断准确率,与乳腺癌患者生存率和预后有相关性.

青少年肌阵挛癫痫(juvenile myoclonic epilepsy,JME)是特发性全面性癫痫(idiopathic generalized epi-lepsy,IGE)中常见的一种亚型.遗传因素在JME中起重要作用,已发现多个基因和染色体位点与JME的发病有关.根据基因突变引起JME中涉及的不同机制,可以将JME相关基因分为离子通道基因和非离子通道基因,离子通道基因的作用机制已经被逐渐明确且只占少数病例,对JME相关的非离子通道基因的研究尚未明确,本文从神经递质相关基因(CHRNA4、GRM4、SLC6A4)、神经系统发育相关基因(TOP3B、CILK1、BRD2、EFHC1)、其他相关基因(TAP-1、CX36)三个方面对JME相关非离子通道基因的研究进展进行综述.

目的 通过生物信息学方法筛选影响宫颈癌辐射敏感性的差异基因并进行表达验证以及免疫相关性分析.方法 从GEO数据库下载包含放疗前后宫颈癌组织、正常宫颈组织、宫颈癌组织的数据集,使用R软件筛选其中的差异基因,使用韦恩图取交集筛选宫颈癌辐射敏感性差异基因.从TCGA数据库及GTEx数据库收集宫颈癌组织样本、正常宫颈组织样本的表达数据及患者临床资料、随访数据,通过GEPIA2数据库对筛选出的宫颈癌辐射敏感性差异基因进行表达分析,验证所选差异基因是否可靠.通过GEPIA2数据库进行生存分析,筛选不同基因表达水平对患者预后有影响的差异基因为宫颈癌辐射敏感性关键差异基因;通过R软件对患者临床资料及预后情况进行单因素、多因素COX回归分析,验证筛选出的关键差异基因是否为宫颈癌患者预后的影响因素;通过HPA数据库比较筛选出的关键差异基因在宫颈癌以及正常宫颈组织中的蛋白表达.通过基因集富集分析对关键差异基因的GO功能及KEGG信号通路进行富集分析,通过TIMER数据库分析关键差异基因在宫颈癌中的表达与免疫细胞浸润水平的关系,通过TCGA数据库数据观察免疫检查点相关基因的表达情况,并对关键差异基因与宫颈癌高度相关的免疫检查点基因进行Spearman相关性分析.结果 共筛选出宫颈癌辐射敏感性差异基因10个,分别为HELLS、TOP2A、KIF23、TAP1、WDR76、LMNB1、RFC4、TFRC、IFI44L、IFIT3;10个差异基因均在宫颈癌组织中高表达.生存分析结果显示,TFRC高表达的宫颈癌患者总生存率及无病生存率低于TFRC低表达的患者,故选择TFRC为宫颈癌辐射敏感性关键差异基因.单因素COX回归分析结果显示,TFRC及宫颈癌TNM分期是宫颈癌患者预后的影响因素;多因素COX回归分析结果显示,TFRC及宫颈癌TNM分期是宫颈癌患者预后的独立影响因素.通过HPA数据库验证TFRC在宫颈癌组织和正常宫颈组织中的蛋白表达,结果显示TFRC在正常宫颈组织中未检测到,在宫颈癌组织中呈高表达.GO功能分析显示,TFRC主要涉及染色体分离、RNA定位、适应性免疫反应等生物过程,染色体区、核糖前体、免疫突触等细胞成分,解旋酶活性、组蛋白结合、抗原结合等分子功能.KEGG信号通路富集分析显示,TFRC主要与RNA转运、细胞周期、同种异体移植物排斥反应等信号通路有关.TIMER数据库分析结果显示,宫颈癌中TFRC表达与细胞纯度呈正相关,与CD8+ T淋巴细胞呈负相关,TFRC表达影响记忆B淋巴细胞、CD8+ T淋巴细胞、巨噬细胞M0、静息肥大细胞的浸润程度.Spearman相关性分析显示,TFRC表达与大部分宫颈癌免疫检测点相关基因呈负相关.结论 宫颈癌辐射敏感性差异基因为TFRC,其可能与适应性免疫反应、宫颈癌相关的免疫检测点相关;这提示其可在宫颈癌的放射免疫治疗中发挥作用,从而影响宫颈癌的进展和预后.

目的 将免疫基因组学与临床特征结合,用R语言等生物信息学方法筛选与卵巢癌预后有关的独立预后因素,并构建卵巢癌预后相关的列线图模型,预测患者生存情况.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得卵巢癌表达谱数据以及临床数据,标准化处理后通过单因素Cox分析筛选出预后相关基因,并将这些预后相关基因与免疫相关基因数据集取交集,得到与卵巢癌预后相关的免疫基因,通过LASSO回归分析以及多因素Cox回归分析进一步筛选出免疫预后基因构建多因素Cox风险模型.结果 经过LASSO回归以及多因素Cox回归分析共筛选出 12 个预后相关免疫基因,分别为趋化因子CCL配体 28(chemokine CCL ligand 28,CCL28)、封闭蛋白 4(recombinant claudin 4,CLDN4)、趋化因子CXC配体 12(chemokine CXC ligand 12,CXCL12)、内皮细胞特异性分子 1(endothelial cell specific molecular-1,ESM1)、鸟苷酸结合蛋白 2(guanylate binding protein 2,GBP2)、免疫球蛋白κ可变 4-1(immunoglobulin kappa variable 4-1,IGKV4-1)、免疫球蛋白λ可变 2-8(immunoglobulin lambda variable 2-8,IGLV2-8)、白细胞介素 27 受体α(recombinant interleukin 27 receptor alpha,IL27Ra)、peptidase inhibitor 3(PI3)、前列腺素F2α受体(prostaglandin F2α receptor,PTGFR)、S100 钙结合蛋白A5(recombinant S100 calcium binding protein A5,S100A5)和抗原加工相关转运体 1(transporter associated with antigen processing 1,TAP1).基于这些免疫预后基因构建的预测模型的 1、2、3 和 5 年的受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下的面积(area under the curve,AUC)值分别为 0.658、0.748、0.725 和 0.748.单因素和多因素Cox回归显示,临床分级、年龄以及该模型计算所得的风险评分是卵巢癌患者预后相关的独立因素(均P<0.05).将临床分级、年龄和风险评分纳入卵巢癌预后相关的列线图模型预测生存期.该模型对卵巢癌患者 1、2 和 3 年生存率预测性能的一致性参数(concordance index,C-index)值为 0.669.结论 基于 12 个免疫基因计算的风险评分、临床分级以及年龄是卵巢癌患者预后相关的独立因素.本研究构建的免疫基因预后模型可有效预测卵巢癌患者1、2和3年的生存状况.这些免疫基因有望成为卵巢癌免疫治疗的新靶标.

目的 调查天津某地小区生活饮用水中非苛养耐药菌的污染状况.方法 采用R2A琼脂对自来水进行细菌分离,利用16S rRNA基因测序法对细菌分离株进行种属鉴定.同时采用Kirby-Bauer纸片扩散法(K-B纸片法)进行细菌的抗生素敏感性试验.结果 在分离的39株非苛养菌中,耐药菌占79.49％,耐药细菌涉及肠球菌属、葡萄球菌属、不动杆菌属、假单胞菌属.其中,仅对一种抗生素耐药的细菌占28.21％,而多药耐药菌则占51.28％.耐药菌对复方新诺明的耐药最为普遍,耐药率为53.85％;对磺胺甲噁唑的耐药次之,占28.21％.结论 该小区生活饮用水中的非苛养耐药菌污染较为严重,应加强关注其潜在的人群风险.