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Circ_0049447 acts as a tumor suppressor in gastric cancer through reducing proliferation, migration, invasion, and epithelial-mesenchymal transition
编辑人员丨6天前
Background::Although increasing abnormal expression of circular RNAs (circRNAs) has been revealed in various cancers, there were a small number of studies about circRNAs in gastric cancer (GC). Here, we explored the expression and function of a novel circRNA, circ_0049447, in GC.Methods::A total of 80 GC tissues and non-tumorous tissues were collected from the First Affiliated Hospital of China Medical University. And all cells were cultured with 10% fetal bovine serum and incubated at 37°C and 5% CO 2. The expression of circ_0049447 was quantified by real-time polymerase chain reaction. The biological function of circ_0049447 on proliferation, migration, invasion, and epithelial-mesenchymal transition (EMT) was evaluated by cell counting kit-8 (CCK-8), colony formation assay, transwell migration and invasion assay, and Western blotting. Luciferase report assay was used to verify the direct binding between circ_0049447 and predicted microRNA (miRNA). Furthermore, a xenograft mouse model was used to validate the function of circ_0049447 in vivo. Results::We demonstrated that circ_0049447 was downregulated in GC ( P < 0.001). The area under the receiver operating characteristic curve reached 0.838, while sensitivity was 82.3% and specificity was 77.2%. CCK-8 and colony formation assay showed that overexpression of circ_0049447 could inhibit the proliferation ( P < 0.05). Transwell migration and invasion assay showed upregulated circ_0049447 could impede migration in GC cells ( P < 0.05). In addition, overexpression of circ_0049447 could impede GC cell EMT. Upregulation of miR-324-5p in GC specimens and direct binding between miR-324-5p with circ_0049447 proven by luciferase reporter assay indicated that circ_0049447 may inhibit GC by sponging certain miRNA. Conclusion::Circ_0049447 acts as a tumor suppressor in GC through reducing proliferation, migration, invasion, and EMT, and it is a promising biomarker for diagnosis.
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-324-3p-PDRG1轴对血管瘤生物学行为的影响
编辑人员丨6天前
目的:探讨miR-324-3p-PDRG1轴对血管瘤生物学行为的影响。方法:选取新乡医学院第一附属医院收治的20例血管瘤组织和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)分析癌旁组织和肿瘤组织miR-324-3p和PDRG1的表达水平。采用荧光定量PCR分析人脐静脉内皮细胞(HUVEC)、人血管瘤内皮细胞HemECs和HDEC中miR-324-3p表达水平。将人血管瘤内皮细胞HemECs分为miRNA对照组和miR-324-3p组,采用细胞计数试剂盒(CCK-8)和克隆形成实验分析两组细胞的增殖能力;流式细胞术和原位缺口末端标记法(TUNEL)染色分析两组细胞的凋亡水平;采用划痕实验和Transwell实验分析两组细胞的迁移和侵袭能力,采用双荧光素酶报告基因技术分析miR-324-3p靶基因,采用蛋白质免疫印迹细胞靶基因的表达水平。组间计量数据比较采用 t检验。 结果:血管癌组织中miR-324-3p表达水平(0.98±0.08)明显低于癌旁组织表达水平(0.51±0.12),差异有统计学意义( t=14.410, P<0.05)。癌旁组织中PDRG1蛋白表达水平(0.98±0.16)明显低于血管瘤组织(1.81±0.24),差异有统计学意义( t=12.820, P<0.05)。人正常血管内皮细胞miR-324-3p表达水平(1.05±0.10)明显低于人血管瘤内皮细胞HemECs和HDEC (0.52±0.09、0.69±0.09),差异有统计学意义( t=9.768、6.662, P<0.05)。miRNA对照组细胞吸光度值和克隆形成率[(2.02±0.09)、(71.84±8.61)%]高于miR-324-3p组细胞[(1.44±0.11)、(44.31±6.38)%],差异有统计学意义( t=9.910、6.295, P<0.05)。miR-324-3p对细胞凋亡的影响:miRNA对照组细胞凋亡比例和TUENL阳性率[(3.44±1.07)%、(3.38±0.55)%]高于miR-324-3p组细胞[(19.48±2.62)%、(13.79±2.53)%],差异有统计学意义( t=13.840、9.831, P<0.05)。miRNA对照组细胞迁移和侵袭数量[(112.33±14.62)、(86.17±8.18)个]高于miR-324-3p组细胞[(79.83±7.57)、(44.67±10.73)个],差异有统计学意义( t=4.834、7.534, P<0.05)。PDRG1是miR-324-3p的靶基因。miRNA对照组细胞PDRG1蛋白表达水平(1.25±0.18)明显高于miR-324-3p组(0.74±0.21),差异有统计学意义( t=5.741, P<0.05)。 结论:miR-324-3p在血管癌组织中呈低表达,促进肿瘤细胞的增殖和迁移侵袭,通过调控PDRG1蛋白实现的。
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编辑人员丨6天前
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miRNA-324-5p和转录因子叉头框C1在脑胶质瘤中的表达及其临床意义
编辑人员丨6天前
目的:探讨miRNA-324-5p(miR-324-5p)、转录因子叉头框C1(FOXC1)在脑胶质瘤中的表达及与患者预后的关系。方法:收集2012年3月至2015年3月重庆海吉亚肿瘤医院和重庆市南川区人民医院收治的72例脑胶质瘤患者脑胶质瘤组织以及28例因颅脑手术切除的正常人脑组织。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-324-5p、FOXC1 mRNA表达水平,采用免疫组织化学法检测FOXC1蛋白表达情况。采用Pearson法分析脑胶质瘤组织miR-324-5p、FOXC1表达的相关性;Kaplan-Meier法对脑胶质瘤患者进行生存分析;Cox回归分析影响脑胶质瘤患者预后的危险因素。结果:FOXC1蛋白主要定位于脑胶质瘤细胞质,在脑胶质瘤组织中的阳性表达率为81.94%(59/72),高于其在正常脑组织中的阳性表达率[17.86%(5/28)],差异有统计学意义( χ2=35.938, P<0.01)。与正常脑组织相比,miR-324-5p在脑胶质瘤组织中表达下调(0.62±0.19比0.98±0.02, t=9.974, P<0.05),FOXC1 mRNA表达上调(1.41±0.29比0.99±0.02, t=7.633, P<0.05)。miR-324-5p、FOXC1蛋白表达水平与脑胶质瘤原发灶数目、分化程度、TNM分期及淋巴结转移有关(均 P<0.05)。脑胶质瘤组织中miR-324-5p、FOXC1 mRNA表达水平呈负相关( r=-0.550, P<0.01)。miR-324-5p高表达组患者5年总生存率高于低表达组(45.71%比24.33%, χ2=6.531, P=0.011),FOXC1蛋白高表达组患者5年总生存率低于低表达组(30.41%比42.34%, χ2=3.631, P=0.047)。多因素Cox回归分析结果显示,肿瘤分化程度低、TNM分期Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结转移、miR-324-5p低表达、FOXC1蛋白高表达是影响脑胶质瘤患者预后的独立危险因素(均 P<0.05)。 结论:脑胶质瘤组织中miR-324-5p呈低表达,FOXC1呈高表达,二者可能参与调控肿瘤分化转移,并与患者预后不良有关,可能作为脑胶质瘤的潜在治疗靶点。
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-216a、324-5p、29a在急性胰腺炎患者外周血中的表达及其与并发肝损伤的相关性
编辑人员丨6天前
目的:探讨微小RNA(miR)-216a、miR-324-5p、miR-29a在急性胰腺炎(AP)患者外周血中表达的意义及与胰腺炎并发肝损伤的相关性。方法:采用病例对照研究设计,选取2017年6月至2019年5月商丘市第一人民医院收治的130例AP患者,分为轻症AP组(MAP组)和中重症AP组(SAP组),肝损伤组54例(MAP 20例、SAP 34例)与非肝损伤组76例(均为MAP);另选取40名健康志愿者为健康组。比较MAP组、SAP组、健康组以及肝损伤组与非肝损伤组外周血miR-216a、miR-324-5p、miR-29a表达水平,并分析其与临床指标相关性;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析外周血各miRNA水平对AP并发肝损伤的预测价值。结果:MAP组、SAP组外周血miR-216a、miR-29a水平均高于健康组,miR-324-5p水平低于健康组(均 P<0.01);SAP组外周血miR-216a、miR-29a水平均高于MAP组,miR-324-5p水平低于健康组(均 P<0.01)。Balthazar CT评分、急性生理与慢性健康状况评分(APACHEⅡ)评分、C反应蛋白水平、住院时间与外周血miR-216a、miR-29a水平均呈正相关(均 P<0.05),与miR-324-5p水平呈负相关(均 P<0.05)。肝损伤组外周血miR-216a、miR-29a水平高于非肝损伤组,且在肝损伤组中SAP患者高于MAP患者(均 P<0.05);肝损伤组外周血miR-324-5p水平低于非肝损伤组,且肝损伤组中SAP患者低于MAP患者(均 P<0.05)。外周血miR-216a、miR-324-5p、miR-29a预测AP并发肝损伤的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.694、0.750、0.814。 结论:miR-216a、miR-29a水平在AP患者外周血中表达增高,miR-324-5p水平降低,与Balthazar CT评分、APACHEⅡ评分、C反应蛋白水平、住院时间关系密切,且对AP并发肝损伤有一定预测价值,其中miR-29a预测价值最高。
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编辑人员丨6天前
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阿戈美拉汀联合高压氧治疗抑郁症患者血清miR-324-5p表达量的变化及意义
编辑人员丨6天前
目的:探讨抑郁症患者经阿戈美拉汀联合高压氧治疗后,血清微小核糖核酸-324-5p(miR-324-5p)表达量的变化及其临床意义。方法:选取2019年3月至2020年12月在青岛市精神卫生中心就诊的122例抑郁症患者(抑郁症组)作为研究对象,另选取同期参加健康体检的50例健康人作为对照组。阿戈美拉汀联合高压氧治疗抑郁症,根据疗效将患者分为有效组( n=91)和无效组( n=31)。用实时荧光定量PCR法检测血清miR-324-5p的相对表达量,用受试者工作特征(ROC)曲线评估miR-324-5p预判疗效的效能,用Logistic回归分析miR-324-5p与疗效的关系,用限制性立方样条拟合Logistic回归分析miR-324-5p与疗效的量效关系。 结果:治疗后2组患者的miR-324-5p相对表达量均高于治疗前;无效组患者的miR-324-5p相对表达量低于有效组,差异均有统计学意义( P<0.05)。按1∶1倾向性评分匹配后,治疗后有效组患者的miR-324-5p相对表达量高于治疗前;无效组患者的miR-324-5p相对表达量低于有效组,差异均有统计学意义( P<0.05)。汉密尔顿抑郁量表(HAMD)评分高是抑郁症疗效的独立危险因素( P<0.05),治疗后miR-324-5p高表达是抑郁症疗效的独立保护因素( P<0.05)。治疗后miR-324-5p预判抑郁症疗效的ROC曲线下面积、最佳截断点、灵敏度和特异度分别为0.778(95% CI:0.589~0.908)、0.72、53.33%和100.00%。治疗后miR-324-5p与抑郁症疗效有关( χ2=9.26, P=0.026),呈非线性关系( χ2=8.24, P=0.016)。以治疗后miR-324-5p预判抑郁症疗效的最佳截断点作为参考点,当治疗后miR-324-5p值<0.72时,治疗无效风险高;>0.72时,治疗无效风险低。 结论:阿戈美拉汀联合高压氧治疗后抑郁症患者血清miR-324-5p相对表达量降低与疗效差有关。
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编辑人员丨6天前
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桥本甲状腺炎患者血浆外泌体miRNA表达谱研究
编辑人员丨6天前
目的:检测桥本甲状腺炎患者(Hashimoto′s thyroiditis,HT)甲状腺功能正常组、HT合并亚临床甲状腺功能减退(SCH)组以及对照组外泌体微小RNAs(microRNAs,miRNAs),探讨HT病程中不同甲状腺状态下的miRNA差异表达谱及其相应的生物学功能。方法:选取HT甲状腺功能正常者、HT合并SCH患者及健康志愿者各3人,提取外周血浆外泌体进行miRNA高通量测序,统计分析3组间差异表达miRNA,并进行靶基因预测、基因本体功能(GO)及京都基因与基因组百科全书通路(KEGG pathway)分析。结果:得到75条差异表达miRNA( log2FC>1且 Q- value≤0.001),数据挖掘后获得hsa-miR-324-3p、hsa-miR-370-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-532-3p等10条核心miRNA。GO分析表明,差异miRNA的靶基因主要参与细胞过程、生物调节、代谢过程等生物学过程,具备结合、催化活性、转录调节活性等分子功能。KEGG分析得到的通路主要为环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、人类表皮生长因子受体(human epidermal growth factor receptor,ErbB)信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)信号通路等。 结论:HT患者血浆外泌体miRNA较健康人存在差异表达,其在甲状腺功能正常与SCH两种不同状态中也存在差异表达。hsa-miR-324-3p、hsa-miR-370-3p、hsa-miR-423-5p及hsa-miR-532-3p等miRNA可能通过cAMP、ErbB及HIF-1等信号通路在HT病程进展中发挥一定的作用。
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编辑人员丨6天前
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微小RNA-324-5p在胰腺癌中的表达及对胰腺癌细胞增殖和迁移能力的影响
编辑人员丨6天前
目的:检测分析微小RNA(miR)-324-5p在胰腺癌中的表达情况及临床意义,并探究其对胰腺癌细胞增殖和迁移能力的影响及潜在分子机制。方法:实时定量PCR方法检测34对2018年10月至2019年9月在北京大学第一医院手术切除的胰腺癌和癌旁组织中miR-324-5p表达水平,结合癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析其与胰腺癌临床病理特征及预后的相关性。实时定量PCR方法检测miR-324-5p在胰腺癌细胞系中表达情况,在PANC-1细胞中转染miR-324-5p mimic后通过细胞增殖实验(CCK8)、细胞迁移实验(Transwell)和划痕实验检测miR-324-5p对胰腺癌细胞增殖、迁移能力的影响,蛋白质电泳检测相关蛋白表达变化并结合miRNA在线靶点预测分析工具和基因功能分析,寻找miR-324-5p直接调控的下游靶基因。结果:TCGA数据库资料显示miR-324-5p在胰腺癌中的表达水平显著低于正常胰腺组织,且低表达miR-324-5p的胰腺癌患者预后更差;34对胰腺癌及癌旁组织检测结果证实miR-324-5p在胰腺癌中的表达水平(11.7±2.0)低于癌旁胰腺组织(70.9±14.4),低表达miR-324-5p的患者神经侵犯率(82.1%,23/28)高于高表达患者(33.3%,2/6),差异具有统计学意义( P<0.05)。胰腺癌细胞系中miR-324-5p表达水平降低,上调PANC-1细胞中miR-324-5p表达后细胞增殖能力显著下降,细胞垂直迁移数量(30.11±5.2)个和水平运动能力(174.6±27.0)μm也较对照组(63.6±4.2)个和(458.3±22.3)μm降低,差异有统计学意义(均 P<0.05)。在线靶点预测工具和基因功能分析结果发现4个与肿瘤转移或EMT调控相关的基因(KLF3、MGAT3、PBX1、ZNRF2)可能是miR-324-5p直接调控的下游靶基因。 结论:胰腺癌中miR-324-5p具有抑癌作用,其低表达与肿瘤神经侵犯、预后差相关。胰腺癌细胞中miR-324-5p可能直接调控KLF3、MGAT3、PBX1、ZNRF2等基因表达,进而抑制细胞增殖、迁移能力。
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编辑人员丨6天前
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不同碘水平下甲状腺结节患者血清外泌体中miRNA生物学标志物的筛选
编辑人员丨2024/3/30
目的 比较不同碘水平下甲状腺结节患者与健康人血清外泌体微小核糖核酸(microRNA,miRNA)表达谱的差异,分析其共同点,为筛选不同碘水平下甲状腺结节早期诊断标志物提供参考依据.方法 收集 10 例不同碘水平下甲状腺结节患者及体检健康者的外周血样本,采用砷铈催化分光光度法测定各组血清碘水平;提取外泌体miRNA,利用高通量测序技术测定血清miRNA的表达水平;预测差异靶基因,并进一步进行GO(Gene ontology)分析和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分析.结果 在不同碘水平的甲状腺结节患者与健康人群中存在 6 个表达下调的 miRNA,分别为 miR-324-5p、miR-6511b-3p、miR-9903、miR-550a-3p、miR-5001-3p、miR-3688-3p.差异表达的外泌体 miRNA 可调控 MAPK 信号通路、PI3K-AKT信号通路、VEGF 信号通路及NF-κB信号通路.结论 筛选出 6 个差异表达miRNA,有望作为不同碘水平下甲状腺结节早期诊断的生物学标志物.
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编辑人员丨2024/3/30
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新生大鼠缺氧缺血性脑病中miRNA表达谱的改变及分析
编辑人员丨2024/1/20
目的 通过基因芯片检测新生大鼠缺氧缺血性脑病(HIE)模型中差异性表达miRNA,构建HIE中miRNA及其靶基因调控网络.方法 将7d龄新生SD大鼠12 只随机分为HIE组及假手术对照组,每组6只.采用Rice法建立新生大鼠HIE模型,造模24h取新生大鼠海马组织,基因芯片检测HIE组和假手术对照组海马组织中差异性表达的miRNA,采用生物信息软件分析相关miRNA调控的靶基因及信号通路.结果 筛选出差异性表达的miRNA共22 个,其中表达上调9 个(mm u-miR-215-5 p,mmu-miR-1249-3p,mmu-miR-3072-5p,mmu-miR-324-3p,mmu-miR-690,mmu-miR-874-5p,11_10767,11_10888,13_12928_star)、表达下调共 13 个(mmu-miR-141-3p,mmu-miR-182-5p.mmu-miR-183-5p,mmu-miR-190a-3p,mmu-miR-200a-3p,mmu-miR-200b-3p,mm u-miR-200c-3p,mmu-miR-429-3p,mmu-miR-455-3p,mmu-miR-760-5p,mmu-miR-96-5p,6_5971_star,9_8784).GO功能分析显示,差异性表达的miRNA调控基因在生物过程中主要参与调节生物生长发育、神经元形成与分化过程,KEGG 通路分析显示主要有丝裂原活化蛋白激酶信号通路被激活.结论 差异性表达的miRNA可能参与调控HIE发病的机制,将为HIE的机制研究、临床诊断及药物设计提供理论依据和新的思路.
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编辑人员丨2024/1/20
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lncRNA MEG3靶向miR-130a-5p调控人视网膜色素上皮细胞损伤的研究
编辑人员丨2023/12/30
目的 探讨lncRNA MEG3在年龄相关性黄斑变性(AMD)患者中的表达及其靶向miR-130a-5p对人视网膜色素上皮(RPE)细胞损伤的影响.方法 选取2020年6月至2021年8月永州职业技术学院附属医院收治的AMD患者38例以及同期的健康体检者38例,收集其空腹静脉血,qRT-PCR检测其血清lncRNA MEG3表达水平.不同浓度(0μmol/L、100μmol/L、200μmol/L、400μmol/L、600μmol/L)过氧化氢(H2O2)处理人RPE细胞系ARPE-19细胞构建RPE细胞损伤模型,并检测lncRNA MEG3在H2O2处理的ARPE-19细胞中表达.双荧光素酶报告基因实验和RNA结合蛋白免疫沉淀(RIP)实验分析lncRNA MEG3与miR-130a-5p的靶向关系.ARPE-19细胞分为对照组(常规培养,不进行任何特殊处理)、H2O2组(200μmol/L H2O2处理24 h)、Vector组(转染pcDNA3.1-NC 24 h后200μmol/L H2O2处理24 h)、lncRNA MEG3组(转染pcDNA3.1-lncRNA MEG324 h后200μmol/L H2O2处理24 h)、lncRNA MEG3+miR-NC组(共转染pcDNA3.1-lncRNA MEG3和miR-NC 24 h后200μmol/L H2O2处理24 h)、lncRNA MEG3+miR-130a-5p组(共转染pcDNA3.1-lncRNA MEG3和miR-130a-5p mimics 24 h后200μmol/L H2O2处理24 h),qRT-PCR检测各组细胞中lncRNA MEG3、miR-130a-5p表达水平,噻唑蓝(MTT)法检测各组细胞活性,流式细胞仪检测各组细胞凋亡,2,7-二氯二氢代荧光黄二醋酸(DCFH-DA)荧光探针法、硫代巴比妥酸(TBA)法、水溶性四唑盐1(WST-1)法分别检测各组细胞内活性氧(ROS)、丙二醛(MDA)、超氧化物歧化酶(SOD)水平,ELISA法检测各组细胞上清液中白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、β-淀粉样蛋白(Aβ)水平,Western blot检测各组细胞中核因子E2相关因子2(Nrf2)/血红素氧合酶1(HO-1)通路相关蛋白表达.结果 与健康体检者比较,lncRNA MEG3在AMD患者血清中呈低表达(P<0.05).与0μmol/L H2O2处理组比较,100μmol/L、200μmol/L、400μmol/L、600μmol/L H2O2处理ARPE-19细胞均可降低细胞存活率以及下调细胞中lncRNA MEG3表达水平(P<0.05).双荧光素酶报告基因实验和RIP实验证实lncRNA MEG3与miR-130a-5p存在靶向关系.过表达lncRNA MEG3通过下调miR-130a-5p表达提供了H2O2诱导的ARPE-19细胞存活率、SOD水平及Nrf2、HO-1蛋白表达水平,降低了细胞凋亡率及ROS、MDA、IL-6、TNF-α、Aβ水平(P<0.05).结论 lncRNA MEG3在AMD患者血清中呈低表达,上调lncRNA MEG3可靶向负调控miR-130a-5p表达,激活Nrf2/HO-1通路,减轻人RPE细胞氧化应激和炎症反应,保护细胞免受损伤.
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编辑人员丨2023/12/30
