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NORAD诱导的自噬促进食管胃结合部腺癌细胞对奥沙利铂耐药的研究
编辑人员丨5天前
目的:探讨DNA损伤激活的非编码RNA (NORAD)诱导细胞自噬对食管胃结合部腺癌(AEG)奥沙利铂耐药的影响及分子机制。方法:收集2023年1月至6月安阳市肿瘤医院诊治的进展期AEG患者AEG及其癌旁正常组织手术标本4对,应用长链非编码RNA微阵列芯片分析AEG及其癌旁组织中NORAD的表达情况。使用新鲜AEG组织标本制备肿瘤组织来源的AEG细胞系(PDC) ,构建PDC和AEG细胞系OE19的奥沙利铂耐药细胞系(PDC-R、OE19-R),并通过转染shNORAD制备敲减NORAD的PDC-R和OE19细胞系(shNORAD PDC-R、shNORAD OE19-R)。应用生物信息学工具Starbase v3.0和DIANA-lncBase v3.0预测NORAD潜在靶点及其与微RNA-433-3p(miR-433-3p)的相互作用。PDC、PDC-R,OE19、OE19-R细胞分别共转染miR-144-3p和野生型NORAD(NORAD-WT)或突变型NORAD(NORAD-Mut)质粒,应用双萤光素酶报告实验验证NORAD与miR-433-3p的相关性。通过定量反转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测胃正常黏膜细胞系GES-1及AEG细胞系PDC、PDC-R、shNORAD PDC-R、OE19、OE19-R、shNORAD OE19-R中NORAD和miR-433-3p表达水平,蛋白质印迹法检测上述细胞p62和微管相关蛋白1轻链3 B-Ⅱ(LC3B-Ⅱ)的表达。采用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)测定奥沙利铂对PDC、PDC-R、shNORAD PDC-R、OE19、OE19-R和shNORAD OE19-R细胞的细胞半数抑制浓度(IC 50)。统计学方法采用独立样本 t检验。 结果:微阵列芯片分析发现与癌旁正常组织相比,AEG中NORAD表达显著上调(差异表达倍数≥2.0, P<0.05)。生物信息学研究发现miR-433-3p是NORAD的潜在靶点。双萤光素酶报告实验结果显示,在PDC和PDC-R细胞中,NORAD-WT组的相对萤光素酶活性低于NORAD-Mut组(0.441±0.104比0.928±0.204、0.449±0.112比0.947±0.201),差异均有统计学意义( t=-14.74、-14.94,均 P<0.001);OE19和OE19-R细胞中双萤光素酶报告实验结果与PDC细胞系相同。qRT-PCR检测结果显示,NORAD在GES-1细胞中的相对表达量(1.016±0.213)低于PDC细胞(2.194±0.322)和PDC-R细胞(4.040±0.336),且在PDC细胞中相对表过量低于PDC-R细胞,差异均有统计学意义( t=-14.94、-37.21、-19.43,均 P<0.001);在shNORAD PDC-R细胞中的相对表达量(0.290±0.165)则低于PDC-R细胞,差异有统计学意义( t=-49.05, P<0.001)。miR-433-3p在GES-1细胞中的相对表达量(1.017±0.248)高于PDC细胞(0.470±0.156)和PDC-R细胞(0.203±0.045),且PDC细胞中的相对表达量高于PDC-R细胞,差异均有统计学意义( t=9.15、15.85、8.11,均 P<0.001),在shNORAD PDC-R细胞中的相对表达量(0.699±0.256)也高于PDC-R细胞,差异有统计学意义( t=9.37, P<0.001)。蛋白质印迹法检测结果显示,PDC-R中LC3B-Ⅱ相对表达量高于PDC细胞(0.426±0.060比0.212±0.041),shNORAD PDC-R细胞中LC3B-Ⅱ的相对表达量(0.155±0.029)低于PDC细胞,差异均有统计学意义( t=8.70、-79.45,均 P<0.001);而p62在各细胞系中表现呈相反趋势,在PDC-R中相对表达量低于PDC(0.205±0.031比0.311±0.040),在shNORAD PDC-R中的相对表达量(0.504±0.084)高于PDC,差异均有统计学意义( t=-31.19、62.80,均 P<0.001)。在OE19细胞系的原始细胞、耐药细胞和NORAD敲减细胞中NORAD和miR-433-3p,以及LC3B-Ⅱ和p62表达变化规律与PDC细胞系相似。CCK-8评估靶细胞活力发现,奥沙利铂对PDC、PDC-R和shNORAD PDC-R细胞的IC 50值分别为14.28、22.27和2.51 μg/mL,对OE19、OE19-R和shNORAD OE19-R细胞的IC 50值分别为3.95、8.12和1.89 μg/mL。 结论:NORAD在AEG组织及细胞中呈高表达;在奥沙利铂耐药的细胞呈过表达,而且增加了细胞的自噬活性。敲减NORAD后AEG细胞自噬活性受到抑制,而且AEG细胞对奥沙利铂的敏感性增加。
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编辑人员丨5天前
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miR-485-5p靶向EGFR对卵巢癌顺铂耐药细胞系的影响
编辑人员丨5天前
目的:探讨miR-485-5p对顺铂耐药卵巢癌细胞的影响及其机制。方法:RT-qPCR检测人正常卵巢上皮细胞株(IOSE-80)及卵巢癌细胞株(A2780、SKOV3、OVCAR3、OVCA433)中miR-485-5p的表达。构建顺铂(DDP)耐药卵巢癌细胞并检测miR-485-5p与EGFR的表达。CCK8法检测各组细胞增殖能力,流式细胞术测定细胞凋亡。结果:相对于IOSE-80细胞,各卵巢癌细胞株中miR-485-5p的表达显著下降,EGFR表达上升(均 P<0.05)。SKOV3/DDP细胞株(0.17±0.02)中miR-485-5p表达较SKOV3细胞(0.32±0.04)进一步下降( t=5.81, P=0.004)。而SKOV3/DDP细胞中EGFR表达则较SKVO3进一步上升( P<0.05)。SKOV3/DDP细胞转染miR-485-5p mimic能抑制细胞增殖活力、诱导细胞凋亡,转染miR-485-5p inhibitor则相反(均 P<0.05)。SKOV3/DDP细胞转染EGFR能促进细胞增殖并抑制细胞凋亡,该作用被miR-485-5p mimic部分抵消。 结论:miR-485-5p参与调控卵巢癌细胞的顺铂耐药,过表达miR-485-5p能提高卵巢癌化疗敏感性,该作用可能是通过负调控EGFR实现的。
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编辑人员丨5天前
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免疫调节因子miR-433-3p通过靶向MAPK8及GRB2调控卵巢癌进展的机制研究
编辑人员丨5天前
目的:研究miR-433-3p对卵巢癌细胞生物学行为的影响,并探究其相关分子机制,以期为卵巢癌的早期诊断和治疗提供新的方向。方法:生物信息学及数据库分析miR-433-3p在卵巢癌中的表达模式,并利用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time fluorescence quantitative PCR,qPCR)方法检测其在卵巢癌细胞中的表达;分别将miR-433-3p mimic和inhibitor及其阴性对照转染到卵巢癌细胞系A2780和SKOV3中,分为miR-433-3p inhibitor组、inhibitor NC组、miR-433-3p mimic组和mimic NC组。EdU增殖实验、克隆形成实验、Transwell迁移和侵袭等体外功能学实验检测miR-433-3p对卵巢癌生物学行为的影响;裸鼠体内实验检测miR-433-3p对卵巢癌细胞成瘤能力的影响;数据库预测miR-433-3p可能作用的靶基因,并通过双萤光素酶报告实验、qPCR以及Western blot实验进一步验证miR-433-3p对靶基因及其所在分子通路的调控作用。结果:相对于正常卵巢组织,miR-433-3p在卵巢癌组织中低表达。抑制miR-433-3p的表达可以促进卵巢癌细胞的增殖、迁移、侵袭以及对卡铂的耐药性( t值分别为4.92、5.52、3.02、3.77、5.99、4.03, P值均<0.05);而过表达miR-433-3p具有相反的作用( t值分别为5.56、4.15、2.30、3.38、7.69、2.68, P值均<0.05)。裸鼠体内实验证实miR-433-3p能够明显抑制卵巢癌细胞皮下成瘤能力( t值分别为3.78、2.26、3.46、2.65, P值均<0.05)。通过数据库预测和双萤光素酶报告实验等证实丝裂原活化蛋白激酶8(mitogen-activated protein kinase 8,MAPK8)和生长因子受体结合蛋白2(growth factor receptor-bound protein 2,GRB2)是miR-433-3p的靶基因。MAPK8和GRB2蛋白在卵巢癌组织中表达上调,与miR-433-3p表达趋势相反,MAPK8和GRB2的高表达与卵巢癌患者的不良预后密切相关。此外,miR-433-3p还可调控MAPK信号通路相关蛋白的表达。 结论:miR-433-3p可能通过靶向结合MAPK8和GRB2,抑制其表达,调控下游MAPK信号通路,从而抑制卵巢癌的进展。
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编辑人员丨5天前
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秋水仙碱对胶质瘤细胞系化疗敏感性的影响
编辑人员丨2024/6/15
目的 探讨秋水仙碱对胶质瘤细胞系化疗敏感性的影响及其机制.方法 采用不同浓度的替莫唑胺(TMZ)处理人脑胶质瘤细胞系U87和A172细胞,构建TMZ耐药细胞系U87/TR和A172/TR,再使用秋水仙碱(10、30 ng/ml)干预1、2、3 d,采用细胞计数法、BrdU法和流式细胞术检测细胞活力、细胞增殖和细胞周期.生物信息学方法分析胶质瘤组织差异表达的微小RNA(miRNAs),并预测其靶基因;然后,采用qRT-PCR检测U-87/TR和A172/TR细胞中这些miRNAs的表达情况,调控miRNAs的表达以观察秋水仙碱效应的变化.结果 秋水仙碱显著抑制U87/TR和A172/TR细胞的增殖活力(P<0.05),呈时间依赖性和剂量依赖性(P<0.05),而且显著阻滞U87/TR和A172/TR的有丝分裂,使细胞阻滞在G0/G1期.30 ng/ml秋水仙碱显著增加TMZ对U87/TR和A172/TR细胞增殖的抑制效果(P<0.05),明显降低TMZ的IC50值(P<0.05).生信分析显示,胶质瘤组织miR-330-3p、miR-491-5p、miR-6782-5p、miR-31-5p、miR-330-5p、miR-137和miR-433-3p呈差异表达,秋水仙碱明显上调U87/TR和A172/TR细胞miR-330-3p的表达(P<0.05)、明显抑制miR-330-3p靶基因ErbB的表达(P<0.05).抑制miR-330-3p表达明显逆转秋水仙碱的生物学效应(P<0.05).结论 秋水仙碱可以抑制TMZ耐药的胶质瘤细胞的增殖,其机制可能涉及到miR-330-3p/ErbB信号通路的调节.
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编辑人员丨2024/6/15
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基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA
编辑人员丨2024/6/8
目的 基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA,从而基于分子层面探讨高原病潜在的发病机制.方法 (1)在GEO数据库获取与高原病相关的miRNA表达谱芯片(GSE90500数据集)和mRNA表达谱芯片(GSE29977数据集),再采用R语言3.6软件limma程序包筛选差异表达miRNA和差异表达mRNA.(2)利用FunRich软件预测差异表达miRNA的下游靶基因(mRNA)和上游转录因子,并对上游转录因子进行功能富集分析.使用R语言3.6软件、DAVID数据库对下游靶基因分别进行功能和通路富集分析.(3)对GSE29977数据集的差异表达mRNA与差异表达miRNA下游靶基因取交集,并根据miRNA及其靶基因的表达关系,筛选miRNA-mRNA调控轴.结果 (1)共筛选出14个差异表达miRNA及其385个下游靶基因、123个上游转录因子.差异表达miRNA主要富集的转录因子包括EGR1、RREB1、MYF5和MEF2A.(2)上游转录因子涉及的生物学过程主要包括信号转导、核酸代谢的调节、脂肪酸代谢、糖代谢、细胞因子和趋化因子介导的信号通路、细胞周期等.下游靶基因富集的生物学过程主要包括转录调控、心肌细胞增殖、血管生成和染色质重塑等,富集的信号通路主要包括PD-L1表达和PD-1免疫检查点通路、细胞衰老、MTOR信号通路、MAPK信号通路及PI3K/AKT信号通路等.(3)共筛选得到443个差异表达mRNA,与差异表达miRNA的下游靶基因取交集后获得与高原病相关的5个核心mRNA,并构建出hsa-miR-155-5p-MYO1D调控轴.结论 高原病中存在多个差异表达的miRNA,其上游转录因子EGR1、RREB1、MYF5、MEF2A可能是参与调控下游靶基因转录的核心因子;差异表达miRNA的上游转录因子和下游靶基因可能通过调控基因转录、细胞增殖与凋亡、炎症过程等生物学过程,共同参与高原病的发生、发展.hsa-miR-155-5p与下游靶基因MYO1D之间的调控关系可能在高原病的发生、发展中发挥重要的作用.
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编辑人员丨2024/6/8
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黄芩苷联合奥沙利铂调控miR-433-3p/SRC对胃癌细胞增殖和侵袭的影响
编辑人员丨2024/5/11
目的 探究黄芩苷联合奥沙利铂调控miR-433-3p/SRC对胃癌细胞增殖和侵袭的影响.方法 将SGC-7901细胞分为对照组、黄芩苷(100、200、300 μmol·L-1)组、奥沙利铂(33 μmol·L-1)组,联合用药(300μmol·L-1黄芩苷+33μmo1·L-1奥沙利铂)组,miR-433-3p组、miR-NC组、anti-miR-433-3p组、anti-miR-NC组、pcDNA-SRC组、si-SRC组,miR-433-3p+联合用药组、anti-miR-433-3p+联合用药组、pcDNA-SRC+联合用药组、si-SRC+联合用药组、miR-433-3p+pcDNA-SRC+联合用药组.CCK-8检测细胞增殖能力;Transwell小室法检测细胞侵袭能力;流式细胞仪检测细胞凋亡率;实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测细胞中miR-433-3p表达;双荧光素酶报告检测miR-433-3p和SRC的靶向关系;Western blotting检测细胞中SRC蛋白表达.结果 与对照组相比,黄芩苷(100、200、300 μmol·L-1)组、奥沙利铂组、联合用药组细胞增殖抑制率、凋亡率和miR-433-3p表达显著增加(P<0.05),细胞侵袭数目、SRC蛋白表达显著减少(P<0.05);与黄芩苷300μmol·L-1组、奥沙利铂组相比,联合用药组细胞增殖抑制率、凋亡率显著增加,细胞侵袭数目显著减少;与黄芩苷300 μmol·L-1组比较,miR-433-3p表达显著增加(P<0.05);与奥沙利铂组比较,SRC蛋白表达显著减少(P<0.05).与对照组比较,miR-433-3p组细胞中miR-433-3p表达显著升高,SRC蛋白表达显著降低,anti-miR-433-3p组细胞中miR-433-3p表达显著降低,SRC蛋白表达显著升高(P<0.05);miR-433-3p+联合用药组细胞增殖抑制率和凋亡率显著高于联合用药组,细胞侵袭数目显著少于联合用药组(P<0.05),anti-miR-433-3p+联合用药组细胞增殖抑制率和凋亡率显著低于联合用药组,细胞侵袭数目显著多于联合用药组(P<0.05).miR-433-3p组SRC-WT荧光素酶活性显著低于miR-NC组(P<0.05).si-SRC组细胞中SRC蛋白表达显著低于对照组(P<0.05),pcDNA-SRC组细胞中SRC蛋白表达显著高于对照组(P<0.05);与pcDNA-SRC组相比,miR-433-3p+pcDNA-SRC组细胞中SRC蛋白表达显著降低(P<0.05).si-SRC+联合用药组细胞增殖抑制率和凋亡率显著高于联合用药组,细胞侵袭数目显著少于联合用药组(P<0.05),pcDNA-SRC+联合用药组细胞增殖抑制率和凋亡率显著低于联合用药组,细胞侵袭数显著高于联合用药组(P<0.05).与pcDNA-SRC+联合用药组相比,miR-433-3p+pcDNA-SRC+联合用药组细胞增殖抑制率和凋亡率显著降低(P<0.05),细胞侵袭数目显著升高(P<0.05).结论 黄芩苷联合奥沙利铂可通过miR-433-3p靶向调控SRC抑制胃癌细胞的增殖和侵袭,诱导胃癌细胞凋亡.
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编辑人员丨2024/5/11
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微小RNA-433调控组蛋白去乙酰化酶6抑制胶质瘤增殖与侵袭
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨脑胶质瘤组织中微小RNA(miR)-433、组蛋白去乙酰化酶6(HDAC6)的表达水平及miRNA-433对脑胶质瘤细胞增殖、侵袭的影响和作用机制.方法 (1)收集新乡医学院第一附属医院神经外科自2010年1月至2014年12月手术切除并经病理检查证实的脑胶质瘤标本42例(低级别14例,高低级别28例),另外选取同期因颅脑外伤手术切除的正常脑组织标本13例.采用RT-PCR检测脑胶质瘤组织和正常脑组织miRNA-433、HDAC6 mRNA的表达.(2)体外常规培养脑胶质瘤U251细胞,分为空白对照组、无义序列对照组和miRNA-433模拟物组,后2组分别转染无义序列和miRNA-433模拟物,空白对照组不做处理.RT-PCR检测细胞miRNA-433和HDA C6、P21 mRNA的表达.CCK-8法检测培养1~5 d时的细胞存活率.流式细胞仪检测细胞周期及凋亡率.Transwell实验检测细胞的侵袭能力.Western blotting检测细胞HDAC6蛋白的表达.(3)构建野生型(WT)HDAC63'-UTR、突变型(MUT)HDAC63'-UTR荧光报告载体.将miR-433模拟物+WT HDAC63'-UTR、无义序列+WT HDAC63'-UTR分别转染U251细胞,双荧光素酶实验检测2组细胞的荧光强度.将miR-433模拟物+MUT HDAC63'-UTR、无义序列+MUT HDAC63'-UTR分别转染U251细胞,双荧光素酶实验检测2组细胞的荧光强度.(4)将U251细胞分为无义序列对照组、HDAC6表达质粒组、HDAC6 siRNA组,分别转染无义序列、HDAC6表达质粒和HDAC6 siRNA后RT-PCR检测细胞P21、HDA C6 mRNA及miRNA-433的表达.将U251细胞分为miR-433模拟物组、miR-433模拟物+HDAC6表达质粒组,分别转染miR-433模拟物、miR-433模拟物+HDAC6表达质粒后1~5 d时采用CCK-8法检测细胞存活率.结果 (1)高级别脑胶质瘤、低级别脑胶质瘤、 正常脑组织中miRNA-433的表达水平逐渐增高,HDA C6 mRNA的表达水平逐渐降低,差异均有统计学意义(P<0.05).脑胶质瘤组织中二者的表达呈负相关关系(r=0.829,P=0.000).(2)与空白对照组和无义序列对照组比较,miRNA-433模拟物组U251细胞miRNA-433、P21 mRNA表达水平升高,HDA C6 mRNA表达水平降低,培养2~5 d时细胞存活率降低,G0/G1期细胞所占比例增高,细胞凋亡率升高,穿膜细胞数减少,HDAC6蛋白表达水平降低,差异均有统计学意义(P<0.05).(3)miR-433模拟物+WT HDAC63'-UTR组细胞的荧光素酶活性明显低于无义序列+WT HDAC63'-UTR组,差异有统计学意义(P<0.05);miR-433模拟物+MUT HDAC63'-UTR组和无义序列+MUT HDAC63'-UTR组细胞的荧光素酶活性比较差异无统计学意义(P>0.05).(4)HDAC6 siRNA组、 无义序列对照组、HDAC6表达质粒组细胞HDAC6 mRNA的表达水平逐渐增高,P21 mRNA的表达水平逐渐降低,差异有统计学意义(P<0.05).培养2~5 d时,miR-433模拟物+HDAC6表达质粒组细胞存活率高于miR-433模拟物组,差异有统计学意义(P<0.05).结论 miRNA-433在脑胶质瘤组织中呈低表达水平,过表达miRNA-433可能通过调控HDAC6抑制脑胶质瘤细胞的侵袭、增殖,并促进细胞凋亡.
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编辑人员丨2023/8/6
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长链非编码RNA Dancr在糖异生相关模型中的表达规律以及与糖异生的可能调控关系
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究长链非编码RNA(lncRNA)Dancr在肝脏中的时空表达规律,探索其与糖异生的可能调控关系与分子机制.方法 建立小鼠饥饿-再喂养模型、高脂饮食诱导的肥胖(high-fat diet,HFD)模型,并以磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶、葡萄糖-6-磷酸酶为阳性对照,检测Dancr在两组模型小鼠肝脏中的表达;分离小鼠主要脏器组织,检测不同组织中Dancr的表达量;运用NCBI、UCSC、RegRNA、TargetScan等数据库,分析Dancr的序列特征,预测与其相互作用的miRNA,并对miRNA下游靶基因进行基因本体和京都基因与基因组百科全书分析.采用Student-t检验分析各组之间差异的显著性,采用单因素方差分析比较多组间差异.结果 Dancr的表达量随饥饿进程持续升高,并在16 h达到最高,再进食后迅速恢复正常水平(4.20±0.27比1.00±0.23,t=22.10,P<0.01).在HFD小鼠肝脏中Dancr表达量同样显著升高(1.69±0.30比1.00±0.25,t=4.33,P<0.01).Dancr在心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、骨骼肌、小肠、胃、白色脂肪组织、棕色脂肪组织和脑组织中表达差异有统计学意义(F=180.32,均P<0.01),Dancr在肝脏中的表达量显著高于除脾、肺外的其余组织(t=6.03~36.19,均P<0.01).在线分析Dancr位于chr5:74,093,083-74,090,355,全长1060 bp,由2个外显子构成,可能存在9个与之相互作用的miRNAs(mmu-let-7i-5p、mmu-miR-134-5p、mmu-miR-326-5p、mmu-miR-433-5p、mmu-miR-497-5p、mmu-miR-504-3p、mmu-miR-1906、mmu-miR-432、mmu-miR-5620-5p),调节下游2124个靶基因,其中多条基因与糖异生调控相关.结论 Dancr的表达受生理及病理性糖异生信号影响,可能介导肝脏糖异生的调控,且生物信息学分析为后续实验提供了一定的数据支持,有助于我们进一步了解Dancr在糖异生调控中的分子机制.
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编辑人员丨2023/8/6
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MicroRNA-433在非小细胞肺癌A549细胞增殖及迁移中的作用
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究microRNA-433(miR-433)对人非小细胞肺癌(NSCLC)A549细胞增殖及迁移的作用.方法 采用实时聚合酶链反应(real-time PCR)检测miR-433在A549、NCI-H1299、NCI-H358以及人肺成纤维细胞系HFL1中的表达.不同浓度miR-433 mimic转染A549细胞,选取最佳浓度进行后续实验;MTT法检测细胞增殖情况;Transwel检测细胞迁移情况;双荧光素酶报告基因法检测miR-433与p21活化激酶4(PAK4)的靶向关系;Western blotting检测PAK4、单丝氨酸蛋白激酶1(LIMK1)、磷酸化单丝氨酸蛋白激酶1(p-LIMK1)、丝切蛋白(Cofilin)和磷酸化丝切蛋白(p-Cofilin)的表达.结果 与HFL1比较,miR-433在3种NSCLC中的表达均降低.过表达miR-43348 h后,A549细胞增殖和迁移能力降低,差异有统计学意义(P<0.05).双荧光素酶报告基因法证明PAK4为miR-433的靶向调节基因,且PAK4在3种NSCLC中的表达均上升.过表达miR-433后细胞中PAK4、p-LIMK1、p-Cofilin的表达均降低,与mimic control组比较,差异有统计学意义(P<0.05).结论 miR-433能通过靶向下调PAK4的表达,抑制LIMK1/Cofilin信号通路,抑制A549细胞的增殖及迁移.
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编辑人员丨2023/8/6
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MicroRNA标志物在早期诊断室间隔缺损中的价值
编辑人员丨2023/8/6
目的 评价血浆microRNA(miRNA)在室间隔缺损(VSD)早期诊断中的临床应用价值以及作为VSD分子诊断标志物的可行性,并建立临床早期诊断模型.方法 采用以济南市儿童医院、泰安市妇幼保健院为基础的病例-对照研究方法开展本次研究.研究分为VSD组85例和对照组80例,分3个阶段进行检测:首先选取VSD组及其匹配对照组各3例,应用miRNA全基因组表达谱芯片进行初筛;然后扩大样本量(20例VSD组VS 15例对照组),对选定的8个有差异的miRNA采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)进行芯片结果 的验证;最后进一步扩大样本(62例VSD组VS 62例对照组)进行qRT-PCR检测,筛选先天性心血管病早期诊断的生物标志物,建立多指标的Logistic回归模型,并应用MedCalc软件进行受试者工作特征(ROC)曲线分析评价诊断模型的价值.结果芯片杂交初筛结果显示,与对照组比较,有36个表达有差异的miRNA(P<0.05),两阶段大样本qRT-PCR验证,检测到5种血浆miRNA(let-7e-5p、miR-155-5p、miR-222-3p、miR-433-3p和miR-487b-5p)在VSD中的表达差异有统计学意义(P<0.05),可以选择作为具有VSD早期诊断意义的生物标志物.5种血浆miRNA的ROC曲线下面积(AUC)分别在0.678~0.832,其中miR-222-3p的ROC曲线下面积最大为0.832.建立多指标Logistic回归分析模型,5种血浆miRNAs联合模型可提高VSD的诊断效率,ROC曲线下面积达到0.955,敏感性和特异性分别为83.87% 和95.16%;3种血浆miRNA(let-7e-5p、miR-155-5p、miR-222-3p)联合诊断模型,ROC曲线下面积达到0.910,敏感性和特异性分别为82.30% 和90.30%,接近5个miRNA的诊断效率.结论 5种血浆miRNA作为VSD早期诊断标志物,具有一定的可信性.将其整合后可建立起多指标的联合诊断模型.联合3种血浆miRNA构建诊断模型可提高VSD的诊断效率,临床应用价值更大.
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编辑人员丨2023/8/6
