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外泌体微小RNA-877-5p通过调控Nrf2/HO-1轴诱导铁死亡对肝癌细胞的影响
编辑人员丨4天前
目的 分析外泌体微小RNA-877-5p(miR-877-5p)通过调控转录因子NF-E2相关因子2(Nrf2)/血红素加氧酶1(HO-1)轴诱导铁死亡对肝癌细胞增殖、凋亡的影响.方法 检测正常肝细胞与肝癌细胞株中miR-877-5p表达量,并对MHCC97H细胞进行转染,分为空白组、miR-877-5p抑制剂组、miR-877-5p模拟物组,检测各组铁死亡相关因子Nrf2、HO-1表达量,观察并分析各组MHCC97H细胞增殖、侵袭、迁移、凋亡情况.结果 与正常肝细胞L02相比,肝癌细胞株中HEP3B、HCCLM3、HepG2、MHCC97H mRNA表达量降低(P<0.05);与肝癌细胞HEP3B、HCCLM3、HepG2相比,肝癌细胞MHCC97H mRNA表达量降低(P<0.05);与空白组相比,miR-877-5p抑制剂组miR-877-5p mRNA表达量、细胞凋亡率降低(P<0.05),溶质载体家族7成员11(SLC7A11)和谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)的表达量、增殖活性、迁移细胞数、侵袭细胞数及Nrf2、HO-1表达量升高(P<0.05),miR-877-5p模拟物组miR-877-5p mRNA表达量、细胞凋亡率升高(P<0.05),SLC7A11、GPX4的表达量、增殖活性、迁移细胞数、侵袭细胞数及Nrf2、HO-1表达量降低(P<0.05);与miR-877-5p抑制剂组相比,miR-877-5p模拟物组miR-877-5p mRNA表达量、细胞凋亡率升高(P<0.05),SLC7A11、GPX4的表达量、增殖活性、迁移细胞数、侵袭细胞数及Nrf2、HO-1的表达量降低(P<0.05).结论 上调外泌体miR-877-5p可抑制Nrf2/HO-1轴的激活,促使铁死亡,抑制肝癌细胞增殖,加快癌细胞的凋亡速度.
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编辑人员丨4天前
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骨性关节炎软骨下骨改变中的潜在生物标志物
编辑人员丨1周前
目的:通过生物信息学分析骨性关节炎(OA)软骨下骨改变过程中的潜在生物标志物及相关通路。方法:从基因表达数据库(GEO)下载GSE51588数据集,鉴定差异表达基因(DEGs)并进行富集分析。构建蛋白互作网络(PPI),模块分析并筛选Hub基因。预测Hub基因的靶向MicroRNAs(miRNAs),鉴定关键miRNAs并绘制其受试者工作特征(ROC)曲线。结果:最终鉴定出与OA软骨下骨改变相关的10个Hub基因,3-磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、白蛋白(ALB)、骨髓肿瘤细胞(MYC)、Toll样受体2(TLR2)、髓过氧化物酶(MPO)、中性粒细胞表达的弹性蛋白酶(ELANE)、甲酰肽受体2(FPR2)、精氨酸酶1(ARG1)、前血小板碱性蛋白(PPBP)、甲酰肽受体1(FPR1),及8个关键miRNAs(hsa-miR-6809-3p、hsa-miR-4263、hsa-miR-6759-5p、hsa-miR-6165、hsa-miR-6754-5p、hsa-miR-5588-5p、hsa-miR-877-3p、hsa-miR-4270)。结论:本研究结果显示的潜在生物标志物及相关通路为OA的诊断和治疗研究提供候选靶点。
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编辑人员丨1周前
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右归丸对激素型肾阳虚证miRNA表达谱的影响及其靶基因功能分析
编辑人员丨2024/6/22
目的 探讨微小RNA(miRNA)在右归丸对激素型肾阳虚证肾组织与正常肾组织中的表达差异,并用生物信息学方法分析其意义,为右归丸干预肾阳虚证的进一步机制研究奠定基础.方法 15只SD大鼠随机分为正常组(5只)和造模组(10只),正常组注射2 mL生理盐水,造模组后肢肌注氢化可的松注射液.成模后将造模组随机分为模型组和右归丸组,每组5只.右归丸组给予右归丸汤剂灌胃,模型组和正常组给予生理盐水灌胃.麻醉处死后使用TRIzol法提取肾组织中RNA,使用NanoDrop ND-1000对总RNA进行质量检测,用标记后的RNA与Agilent Rat 8 ×60k miRNA芯片进行杂交.收集原始数据进行标准化处理,进行聚类分析和火山图分析.利用生物信息学方法,预测差异miRNA富集的基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路.结果 筛选出右归丸干预肾阳虚证相关差异表达miRNA 18 条(|log2FC|≥ 1.5,P≤0.05),其中包括 5 条上调 miRNA,分别是 rno-miR-149-3p、rno-miR-188-5p、rno-miR-221-5p、rno-miR-762、rno-miR-877;13 条下调 miRNA,分别是 rno-miR-101b-5p、rno-miR-125a-3p、rno-miR-125b-2-3p、rno-miR-3085、rno-miR-344a-5p、rno-miR-347、rno-miR-34b-3p、rno-miR-351-3p、rno-miR-3573-3、rno-miR-370-3p、rno-miR-409a-3p、rno-miR-448-3p、rno-miR-503-3p.GO分析显示差异表达miRNA主要参与DNA、RNA转录的正调控进程且与ATP的结合显著相关.KEGG分析显示差异表达miRNA显著富集于cAMP通路和FoxO信号通路,这两条通路与线粒体功能密切相关.结论 右归丸通过干预miRNA的表达,改善肾阳虚证大鼠线粒体功能,调节能量代谢异常,进一步为右归丸干预肾阳虚证的机制研究提供理论依据.
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编辑人员丨2024/6/22
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益脉降脂汤含药血清对THP-1源性泡沫细胞模型miRNA差异表达分析
编辑人员丨2024/3/16
目的:探讨益脉降脂汤含药血清干预THP-1源性泡沫细胞模型后差异表达miRNA及相关生物功能、信号通路.方法:实验分为巨噬细胞组、泡沫细胞模型组、益脉降脂含药血清组,以佛波酯对THP-1细胞诱导为巨噬细胞,经诱导分化的巨噬细胞给予ox-LDL建立泡沫细胞模型,以益脉降脂汤大鼠血清干预泡沫细胞.提取各组细胞Total RNA进行miRNA测序,筛选差异表达miRNA,预测相关靶基因后进行GO分析、KEGG分析,建立蛋白互作网络、miRNA-靶基因互作网络,RT-qPCR验证改善动脉粥样硬化可能信号通路.结果:空白组与模型组差异 miRNA 为 hsa-miR-302c-3p、hsa-miR-302d-3p、hsa-miR-30d-3p、hsa-miR-3189-3p、hsa-miR-374b-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-4781-3p、hsa-miR-663a;模型组和益脉降脂含药血清组差异miRNA为hsa-miR-3150a-3p、hsa-miR-7704、hsa-miR-877-3p、hsa-miR-150-5p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-374c-3p、hsa-miR-374b-5p;模型组与益脉降脂含药血清组差异miRNA预测靶基因显示主要富集于MAPK信号通路、ErbB信号通路、Hippo信号通路、Wnt信号通路等信号通路;SCN1A、PRKACA、MECP2、EIF4E、SRSF1、MBNL1、PRKCA、PPARGC1A可能是益脉降脂汤含药血清向THP-1源性泡沫细胞发挥作用潜在关键靶标.结论:hsa-miR-374c-3p、hsa-miR-423-5p、hsa-miR-374b-5p是益脉降脂汤含药血清作用于泡沫细胞重要的miRNAs,差异表达显著的miRNA以及显著富集的相关信号通路可为诊断和治疗动脉粥样硬化提供新的思路.
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编辑人员丨2024/3/16
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新生儿急性呼吸窘迫综合征患儿血清miR-877-5p表达变化及其与病情严重程度和预后的关系
编辑人员丨2023/10/21
目的 探讨新生儿急性呼吸窘迫综合征(NARDS)患儿血清微小RNA-877-5p(miR-877-5p)表达变化及其临床意义.方法 选择NARDS患儿95例(观察组),病情严重程度:轻度38例、中度35例、重度22例,28 d内临床结局:死亡21例、存活74例,同期选择健康新生儿40例作为对照组.采集所有研究对象外周静脉血,离心留取血清,采用实时荧光定量聚合酶链式反应检测血清miR-877-5p表达,采用酶联免疫吸附试验检测血清IL-1β、IL-6、TNF-α.采用Spearman相关分析法分析NARDS患儿血清miR-877-5p表达与氧指数和血清IL-1β、IL-6、TNF-α水平的关系.采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清miR-877-5p表达对NARDS诊断和预后的预测价值.结果 观察组血清miR-877-5p表达低于对照组,血清IL-1β、IL-6、TNF-α水平高于对照组(P均<0.01).随着病情严重程度增加,NARDS患儿血清miR-877-5p表达逐渐降低,血清IL-1β、IL-6、TNF-α水平逐渐升高(P均<0.01).Spearman相关分析显示,NARDS患儿血清miR-877-5p表达与氧指数和血清IL-1β、IL-6、TNF-α水平均呈负相关关系(rs分别为-0.785、-0.779、-0.778、-0.788,P均<0.01).NARDS患儿死亡者血清miR-877-5p表达低于其存活者(P<0.01).ROC曲线分析显示,血清miR-877-5p表达诊断NARDS的曲线下面积为0.857(95%CI:0.787~0.911),其最佳截断值为1.23,此时其诊断NARDS的灵敏度和特异度分别为73.68%、95.00%;血清miR-877-5p表达预测NARDS死亡的曲线下面积为0.805(95%CI:0.711~0.879),其最佳截断值为0.97,此时其预测NARDS死亡的灵敏度和特异度分别为80.95%、75.68%.结论 NARDS患儿血清miR-877-5p表达降低,其表达变化与病情严重程度和预后密切相关.
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编辑人员丨2023/10/21
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瑞巴派特通过抑制miR-877-5p的表达减轻阿司匹林对人胃黏膜上皮细胞损伤的研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究瑞巴派特是否通过抑制miR-877-5p的表达减轻阿司匹林对人胃黏膜上皮细胞GES-1的损伤.方法 体外培养GES-1细胞株,将其分为空白对照组、阿司匹林(IC10浓度)损伤组和阿司匹林(IC10浓度)联合不同浓度瑞巴派特(0. 2、0. 5、1. 0 mmol/L)保护组,利用qRT-PCR检测miR-877-5p的表达情况.转染miR-877-5p inhibitors到阿司匹林损伤组的细胞,转染miR-877-5p mimics到0. 5 mmol/L瑞巴派特保护组的细胞,CCK-8法检测细胞增殖情况,流式细胞技术检测细胞凋亡情况.利用miRNA靶基因数据库预测miR-877-5p的靶基因,并利用生物信息学分析miR-877-5p的功能.结果 阿司匹林损伤组中的miR-877-5p表达量明显高于瑞巴派特保护组(P<0. 05),miR-877-5p表达量在保护组中随着瑞巴派特浓度增加而逐渐降低(F=71. 87, P<0. 05).转染miR-877-5p inhibitors能减轻阿司匹林对人胃黏膜上皮细胞增殖的抑制作用(P<0. 05),抑制细胞的凋亡(P<0. 05).转染miR-877-5p mimics能抑制瑞巴派特对细胞的增殖效应(P<0. 05),促进细胞凋亡(P<0. 05).生物信息学发现,miR-877-5p共有945 个靶基因,这些靶基因多参与cAMP信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等发挥作用.结论 瑞巴派特通过抑制miR-877-5p的表达,减轻阿司匹林对人胃黏膜上皮细胞GES-1的损伤.
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编辑人员丨2023/8/6
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miR-877-5p靶向YAP1调控乳腺癌细胞的增殖、迁移侵袭
编辑人员丨2023/8/5
目的:研究微小RNA(miR)-877-5p对YAP1的调控作用及对乳腺癌细胞的增殖、迁移侵袭的影响.方法:实时荧光定量聚合酶链反应(qPCR)和Western blot检测miR-877-5p、YAP1 mRNA和YAP1蛋白在乳腺癌组织中的表达.利用LipofectamineTM 2000试剂将miR-877-5p或si-YAP1转染乳腺癌细胞MCF-7.噻唑蓝(MTT)检测细胞增殖,Transwell小室法检测细胞迁移侵袭,Western blot检测细胞周期蛋白D1 (CyclinD1)、p21、基质金属蛋白酶(MMP)-2、MMP-9蛋白表达,双荧光素酶报告实验分析miR-877-5p与YAP1的靶向关系.共转染miR-877-5p和pcDNA-YAP1,观察YAP1过表达对miR-877-5p过表达诱导的MCF-7细胞增殖、迁移侵袭的影响.结果:乳腺癌组织中miR-877-5p表达量明显减少,YAP1 mRNA和YAP1蛋白表达量显著增加(P<0.05).miR-877-5p过表达或抑制YAP1表达明显降低MCF-7细胞的OD值、迁移细胞数、侵袭细胞数和CyclinD1、MMP-2、MMP-9蛋白水平,并显著提高p21蛋白表达量(P<0.05).miR-877-5p靶向调控YAP1的表达.YAP1过表达逆转了miR-877-5p过表达对MCF-7细胞增殖、迁移侵袭、CyclinD1、MMP-2和MMP-9蛋白表达的抑制作用,以及对p21蛋白表达的促进作用.结论:miR-877-5p在乳腺癌组织中表达下调,miR-877-5p过表达通过靶向YAP1抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移侵袭.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于生物信息学方法分析心肌梗死大鼠miRNA芯片
编辑人员丨2023/8/5
目的 筛选大鼠梗死心肌组织microarray芯片中差异表达的miRNA,预测其互作lncRNA和靶基因,探索心肌梗死潜在的病理机制.方法 结扎左前降支冠状动脉建立大鼠心梗模型.应用TRIzol法提取梗死左心室心肌区总RNA进行芯片检测.用生物信息学方法找出可能存在的ln-cRNA-miRNA-mRNA调控网络.结果 19个明显差异表达的miRNAs中8个miRNAs(miR-21、miR-132、miR-222、miR-223-3p、miR-146a/b、miR-181b、miR-449a-5p、miR-122)已被证明是治疗心梗的候选分子,7个miRNAs(miR-365-5 p、miR-490-5p、miR-6333、miR-30c-1-3p、miR-3591、miR-3596c、miR-877)是否与心肌梗死有关未知.心肌梗死发生发展中可能存在几条新的lncRNA-miRNA-mRNA作用机制.EN-SRNOT00000076620-miR-146b-5p-STAT3/Rnf7/Qrsl1可能参与梗死心肌细胞的凋亡和线粒体损伤过程.EN-SRNOT00000071991-miR-122-Deptor可能抑制心肌细胞自噬的发生,加剧心肌梗死的过程.NR_132625-miR-21-3P/miR-18a-5p-Coq5/Acsl1/Tmem65可能参与心肌梗死线粒体损伤过程.结论 通过心肌梗死大鼠miRNA芯片分析得到的lncRNA-miRNA-mRNA三元关系,为深入研究心肌梗死分子水平的病理机制,揭示相关药物作用机制以及寻找治疗新靶标提供方向和理论依据.
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编辑人员丨2023/8/5
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硝呋齐特通过miR-877-5p/蛋白磷酸酶2A的癌性抑制因子通路调控肺癌细胞增殖、迁移和侵袭的研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨硝呋齐特对肺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响及作用机制.方法 实验分为对照组(不做任何处理)、低、中、高剂量实验组(5,10和20μmol·L-1硝呋齐特)、miR-NC组(转染miR-NC)、miR-877-5p组(转染miR-877-5p mimics)、anti-miR-NC-20组(转染anti-miR-NC+20μmol·L-1硝呋齐特)和+anti-miR-877-5 p-20组(转染anti-miR-877-5 p+20μmol·L-1硝呋齐特).用噻唑蓝检测细胞增殖抑制率,用Transwell检测细胞迁移和侵袭,用逆转录聚合酶链反应法检测miR-877-5 p和蛋白磷酸酶2A的癌性抑制因子(CIP2A)mRNA表达水平.结果 对照组、低、高剂量实验组、miR-NC组、miR-877-5 p组、anti-miR-NC-20组和anti-miR-877-5p-20组细胞增殖抑制率分别为(0.00±0.01)%,(14.65±1.42)%,(54.23±5.71)%,(5.47±0.58)%,(34.58±3.44)%,(54.31±5.48)%和(19.65±1.87)%,细胞迁移数分别为(124.33±11.07),(98.67±9.17),(61.22±6.18),(125.44±10.24),(69.33±6.67),(62.78±6.34)和(101.56±9.51)个,细胞侵袭数分别为(109.33±10.07),(81.33±8.35),(52.33±5.14),(106.33±9.44),(59.56±5.87),(53.44±5.96)和(89.56±8.43)个,miR-877-5p相对表达水平分别为1.01±0.09,1.52±0.15,2.64±0.25,1.00±0.08,2.54±0.25,2.69±0.25,1.53±0.15,CIP2A mRNA分别为1.02±0.08,0.86±0.07,0.54±0.05,1.01±0.06,0.62±0.05,0.51±0.04和0.79±0.05.低、高剂量实验组的上述指标与对照组比较,miR-877-5p组的上述指标与miR-NC组比较,anti-miR-877-5p-20组的上述指标与anti-miR-NC-20组比较,差异均有统计学意义(均P<0.05).结论 硝呋齐特可抑制肺癌细胞A549增殖、迁移和侵袭,其机制可能与miR-877-5p和CIP2A有关.
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编辑人员丨2023/8/5
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差异表达微RNA作为多囊卵巢综合征生物标志物的研究
编辑人员丨2023/8/5
目的·探索可作为多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)生物标志物的微RNA (microRNA,miRNA)及其在PCOS发病机制中的生物学意义.方法·选取上海交通大学医学院附属仁济医院2019年1月-10月收治的5例PCOS患者为观察组,另选取5例体检健康女性作为对照组.采集2组的颗粒细胞,用TRIzol法从中提取RNA,利用TruSeq Small RNA Library Prep试剂盒构建miRNA-seq文库,文库质检合格后用NextSeq500进行高通量测序,对测序结果进行生物信息学数据分析.采用RT-qPCR实验检验候选miRNA标志物是否存在差异表达.结果·分析获得颗粒细胞中20条差异表达miRNA(均P<0.05),其中miR-196a-5p、miR-10a-5p和miR-451a表达显著上调,miR-877-5p和miR-2355-5p表达显著下调,这些差异表达miRNA及其靶基因可能参与PCOS发生发展的转录调控机制.结论·差异表达miRNA具有作为PCOS生物标志物的潜能,并参与PCOS的发生发展.
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编辑人员丨2023/8/5
