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基于基因芯片数据的肾嫌色细胞癌生物信息学分析
编辑人员丨1天前
目的:利用生物信息学分析肾嫌色细胞癌基因表达谱芯片,寻找肾嫌色细胞癌发生的关键基因。方法:从GEO数据库下载肾嫌色细胞癌基因芯片数据GSE15641和GSE11151,利用R软件中的"affy"、"limma"等R软件包进行差异表达基因筛选,结合DAVID和STRING在线生物信息学工具对差异表达基因进行调控网络分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape软件中的Cytohubba插件筛选Hub基因。结果:共筛选出肾嫌色细胞癌差异表达基因261个,包括194个表达下调基因,67个表达上调基因。对差异表达基因进行基因富集(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析以挖掘其生物学功能,其中GO富集分析中的生物学过程(BP)主要富集于细胞分泌、糖异生和细胞增殖调控;在细胞组成(CC)主要富集于细胞外泌体、细胞质膜及其组成部分;在分子功能(MF)主要富集于肝素结合,在KEGG通路分析中主要富集于代谢通路、抗体的生物合成、蛋白质消化吸收、肾素-血管紧张素系统等。利用在线生物信息学工具构建PPI网络,通过Cytoscape软件中的Cytohubba插件筛选前10位Hub基因,分别是胡椒酸和肌氨酸氧化酶(PIPOX)、羟基酸氧化酶2(HAO2)、犬尿氨酸-3-单加氧酶(KMO)、溶质转运家族2成员2(SLC2A2)、甲酰亚胺基转移酶环脱氨酶(FTCD)、血管生成素(ANG)、催化多肽-1(APOBEC1)互补因子(A1CF)、重组表达醛脱氢酶8A1(ALDH8A1)、维生素D结合蛋白(GC)、血浆富含组氨酸糖蛋白(HRG)。结论:利用生物信息学方法分析肾嫌色细胞癌的差异表达基因,可有效发掘这些差异表达基因的相互作用信息,为肾嫌色细胞癌的治疗提供新的思路。
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编辑人员丨1天前
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头颈癌患者肌肉减少症的诊断与干预研究进展
编辑人员丨1天前
肌肉减少症是恶性肿瘤患者常见的临床综合征之一,且正成为一个独立的不良预后因素。研究表明在保证适宜能量摄入前提下,适当增加蛋白质、维生素D、ω-3和其他营养素的摄入量,并与运动相结合,可以改善甚至逆转肌肉减少症。对头颈癌患者肌肉减少症的评估诊断、流行病学特征、临床结局和干预的研究进展进行综述。
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编辑人员丨1天前
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激素抵抗型肾病综合征患儿的血清VDBP、SHBG表达及与预后的相关性
编辑人员丨1天前
目的:检测激素抵抗型肾病综合征(SRNS)患儿的血清维生素D结合蛋白(VDBP)、性激素结合球蛋白(SHBG)表达水平并探讨二者与SRNS患儿预后的相关性。方法:选取2014年9月至2019年9月本院收治的150例肾病综合征(NS)患者作为研究对象,根据治疗4周后对激素治疗的反应分为激素抵抗型肾病综合征(SRNS)组(34例),激素敏感肾病综合征(SSNS)组(116例)。选取同期入院体检的100例正常儿童作为对照组。根据末次随访时的临床及实验室检查情况,将SRNS组患儿分为预后良好组(20例)和预后不良组(14例)。采用酶联免疫吸附(ELISA)法检测受试者的血清VDBP、SHBG表达水平,采用化学发光法测定受试者的血清相关激素雌二醇(E2)、睾酮(T)、促卵泡刺激素(FSH)浓度;采用logistic回归分析影响SRNS患儿1年预后的危险因素;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清VDBP、SHBG对SRNS患儿预后的诊断价值。结果:对照组、SSNS组、SRNS组的血清SHBG、E2、T、尿蛋白水平均逐渐升高,25(OH)D 3、FSH水平逐渐降低,组间差异均有统计学意义(均 P<0.05);SRNS组患者的血清VDBP水平均显著高于对照组与SSNS组(均 P<0.05)。与预后良好组比较,预后不良组患儿的血清VDBP、SHBG表达水平均显著升高(均 P<0.05)。logistic回归分析结果显示,VDBP、SHBG、E2、尿蛋白是SRNS影响患儿预后不良的危险因素,25(OH)D 3、FSH是影响SRNS患儿预后不良的保护因素(均 P<0.05)。ROC曲线分析结果显示,VDBP、SHBG以及二者联合检测诊断SRNS患儿预后情况的曲线下面积(AUC)分别为0.781、0.809、0.887,二者联合的诊断效能显著高于VDBP、SHBG单独检测(均 P<0.05)。 结论:SRNS患儿的血清VDBP、SHBG呈高表达,二者的高表达水平与患儿预后不良有关,二者联合检测对SRNS患儿的预后具有一定评估价值。
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编辑人员丨1天前
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女性雄激素性脱发代谢相关蛋白质组学研究
编辑人员丨1天前
目的:研究女性雄激素性脱发(FAGA)患者血浆中代谢相关蛋白及其价值。方法:2021年3月至2023年3月从复旦大学附属华山医院皮肤科门诊招募年龄18~50岁的FAGA患者(FAGA组)及健康对照女性(HC组)。采集每位受试者的外周静脉血3 ml,离心获得血浆。对血浆行Olink蛋白质组学分析,通过R语言筛选2组间的差异表达蛋白,并以受试者工作特征(ROC)曲线评估差异蛋白的诊断性能;对差异表达蛋白行基因本体论(GO)分析。取FAGA组顶区、HC组枕区毛囊行免疫荧光分析,对筛选的差异表达蛋白进行验证。应用SPSS 25.0软件对数据进行分析,正态分布计量资料以 ± s表示,2组受试者基本资料比较、毛囊中差异蛋白相对荧光强度比较采用 t检验;对血浆中代谢相关蛋白与受试者基本资料行Pearson相关分析。 P<0.05为差异有统计学意义。 结果:FAGA组纳入61例患者,年龄(33.8±7.4)岁,发病年龄(29.5±7.8)岁,其中轻度38例、中度14例、重度9例;HC组纳入27例健康女性,年龄(32.0±7.7)岁。2组受试者的基本资料(年龄、体重指数及睾酮、25-羟维生素D、尿酸、铁蛋白水平)比较,差异均无统计学意义( P>0.05)。与HC组相比,FAGA组血浆中有26种差异蛋白表达显著上调( P<0.05),其中AHCY、NECTIN2差异最为显著( P均=0.003),ROC曲线评估显示AHCY和NECTIN2的曲线下面积均大于0.7,表现出良好的诊断准确性。GO分析显示,差异蛋白主要富集在BAT3复合物(细胞组分),泛素依赖性ERAD途径、自然杀伤细胞活化(生物学过程),以及泛素蛋白连接酶结合、泛素特异性蛋白酶结合(分子功能)等方面。Pearson相关分析显示,AHCY( r=-0.23, P=0.010)、NECTIN2( r=-0.31, P=0.033)均与FAGA患者的脱发严重程度呈负相关。毛囊免疫荧光分析结果显示,FAGA组中AHCY、NECTIN2相对荧光强度高于HC组( P<0.05),即AHCY、NECTIN2均在FAGA组中表达上调。 结论:代谢相关蛋白在FAGA中起着重要作用,AHCY及NECTIN2有可能作为FAGA的早期诊断生物标志物。
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编辑人员丨1天前
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基于SYNTAX评分评价RBP4、miR-1-3p、VDBP与STEMI病情严重程度的相关性及对其的诊断价值
编辑人员丨1周前
目的:基于SYNTAX评分分析人视黄醇结合蛋白4(RBP4)、miR-1-3p、重组人维生素D结合蛋白(VDBP)与ST段抬高型心肌梗死(STEMI)病情严重程度的相关性及对其的诊断价值.方法:选择2020年1月至2021年6月入住我院接受治疗的162例STEMI患者(STEMI组),另选取同期在我院接受体检的67例健康受试者作为健康对照组.根据SYNTAX评分,STEMI组被进一步分为低危组(68例,<22分)、中危组(53例,23分≤SYNTAX评分≤32分)和高危组(41例,>33分).比较上述各组RBP4、VDBP水平和miR-1-3p表达水平,分析上述指标单独及联合检测对STEMI患者病情严重程度的诊断价值,分析STEMI患者SYNTAX评分与上述指标的相关性.结果:与健康对照组比较,STEMI组RBP4[(47.18±5.24)μg/L比(81.40±6.11)μg/L]、VDBP[(2.36±0.75)μg/ml 比(3.55±1.04)μg/ml]水平显著升高,miR-1-3p 表达[(1.18±0.13)比(0.72±0.07)]显著降低(P均<0.001).与低危组比较,中危组和高危组的RBP4[(69.97±2.98)μg/L比(85.23±3.76)μg/L 比(95.41±3.16)μg/L]、VDBP[(3.19±0.50)μg/ml 比(3.55±0.52)μg/ml 比(4.16±0.64)μg/ml]水平显著升高,miR-1-3p 表达[(0.80±0.05)比(0.70±0.04)比(0.61±0.03)]显著降低,且高危组的RBP4和VDBP水平显著高于中危组,miR-1-3p表达显著低于中危组(P均<0.001).ROC曲线分析显示上述指标联合检测的曲线下面积(AUC)为0.892,显著高于各单独检测(Z=4.787、3.078、2.495,P<0.05或<0.01).Spearman相关分析显示,STEMI病情严重程度与RBP4、VDBP水平呈显著正相关(r=0.849、0.776,P 均<0.001),与 miR-1-3p 呈显著负相关(r=-0.790,P<0.001).结论:RBP4、VDBP 水平及miR-1-3p表达水平能够反映STEMI患者的病情严重程度,三项联合检测对病情严重程度具有较高的诊断效能,可作为临床重要的观察指标来评估患者病情.
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编辑人员丨1周前
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化湿行瘀清热方联合曲安奈德治疗糜烂型口腔扁平苔藓的疗效及对血清炎症因子和差异蛋白的影响研究
编辑人员丨2023/11/18
目的 研究分析化湿行瘀清热方联合曲安奈德治疗糜烂型口腔扁平苔藓(OLP)的临床疗效及对血清中白细胞介素8(IL-8)、正常T细胞表达和分泌因子(RANTES)、人抗凝血酶Ⅲ(AT-Ⅲ)、维生素D结合蛋白(Gc蛋白)的影响.方法 将60 例糜烂型OLP患者按照随机数字表法分为治疗组和对照组,每组各 30 例.对照组予曲安奈德口腔软膏局部涂抹治疗,治疗组在对照组治疗基础上加用化湿行瘀清热方治疗,2 组均治疗8 周后统计疗效.比较2 组治疗前后疼痛视觉模拟评分(VAS)、口腔糜烂和白纹面积,以及血清IL-8、RANTES、AT-Ⅲ、Gc蛋白浓度变化.治疗结束后随访3、6 个月,统计2 组复发率.结果 治疗组总有效率96.7%(29/30),对照组总有效率96.7%(29/30),2 组总有效率比较差异无统计学意义(P>0.05).治疗后,2 组血清IL-8、RANTES、AT-Ⅲ、Gc蛋白水平均显著低于本组治疗前(P<0.05),且治疗组均低于对照组(P<0.05).随访 3、6 个月时治疗组复发率分别为 13.79%(4/29)、17.24%(5/29),对照组分别为20.69%(6/29)、31.03%(9/29),治疗组均低于对照组同期(P<0.05).结论 化湿行瘀清热方联合曲安奈德治疗糜烂型OLP维持效果好,长期疗效佳,能降低IL-8、RANTES、AT-Ⅲ和Gc蛋白水平,且这些细胞因子可考虑作为OLP患者的血清生物标记物.
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编辑人员丨2023/11/18
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部分军兵种营养KAP与膳食营养状况调查及体检结果分析
编辑人员丨2023/8/6
目的 对不同兵种官兵进行营养KAP及膳食营养状况调查,并结合体检结果进行分析,以了解军人营养知识普及情况、膳食营养状况和身体健康状况,为在部队开展有针对性的健康教育、提高官兵健康素养以促进其身体健康提供依据和方向.方法 采用整群抽样法对4个军兵种8支基层部队4720名基层官兵进行营养KAP问卷调查,并对所属伙食单位采用称重法连续3 d进行膳食营养状况调查,同时进行健康体检.结果 营养KAP调查结果:营养KAP满分50分,最高得35分,最低得29分,平均得分32.16±5.04分,有47.2%的被调查官兵存在不健康饮食行为.膳食营养调查结果:各类食物摄入量与军标比较,油脂类人均每天摄入量为119.30 g,远超军标要求;牛奶制品摄入量除飞行员达标外,其他所调查军兵种单位均未达标;能量和营养素摄入情况,各军兵种能量、蛋白质、钾、钠、镁、磷、铁、硒、烟酸和维生素C均达到或超过军标;水面舰艇人员钙、锌、维生素B1、维生素B2摄入不足.体检结果:被调查者体检结果有异常者占35.2%,其中超重、肥胖、高尿酸血症的平均检出率分别为14.51%、4.20%、4.71%;水面舰艇人员和飞行员超重检出率较高,水面舰艇人员高尿酸血症检出率较高.结论 军人营养知识普及率不高,营养行为存在诸多不符合营养科学现象,伙食单位食谱设计不符合营养科学,营养素摄入不均衡,体检结果与营养相关的异常指标检出率较高.应加强对官兵营养知识的普及,采用多种方式进行干预指导,提高官兵健康素养,促进其身体健康.
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编辑人员丨2023/8/6
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大鼠肺纤维化和活性维生素D3干预后P32和PKD1的表达及作用研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨大鼠肺纤维化发生发展中透明质酸结合蛋白(P32)和蛋白激酶D1(PKD1)的表达及相互作用,以及活性维生素D3(VD3)干预后这2种因子表达的变化.方法 90只清洁级雄性SD大鼠随机分成3组:对照组、模型组和治疗组.模型组和治疗组通过气管内注射博来霉素(BLM,5 mg/kg)的方法复制大鼠肺纤维化模型,对照组经气管注射等体积的生理盐水(500μl/kg).术后第2天,治疗组腹腔注射VD3(2μg/kg),模型组腹腔注射等量的VD3的溶剂(99.9%丙二醇和0.1%乙醇),对照组腹腔注射等量的生理盐水,各组均注射1次/2 d.各组分别于术后第14、21、28天处死10只大鼠.通过检测大鼠肺组织羟脯氨酸含量来验证肺纤维化,应用实时聚合酶链反应(real-time PCR)和免疫组织化学技术分别检测大鼠肺组织中P32和PKD1的表达水平.结果 纤维化早期(14 d),治疗组中P32和PKD1 mRNA和蛋白质表达量与模型组比较,差异有统计学意义(P <0.05),治疗组均高于模型组;相关性分析发现这2种基因的mRNA和蛋白质表达量具有相关性.结论 在大鼠肺纤维化过程中,活性VD3可能在纤维化早期促进P32和PKD1的表达,通过P32和PKD1在线粒体内的相互作用来实现抗氧化作用,进而抑制肺纤维化的发生发展.
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编辑人员丨2023/8/6
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上海三家长照机构600例老年人膳食摄入和营养状况研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 了解上海地区长期照护结构(长照机构)老年人的营养状况及膳食摄入情况,为改善老年人的营养状况提供科学的依据.方法 在上海市3家老年长照机构中采用整群抽样的方法对600例65岁及以上老人,采用微型营养评定法简版(MNA-SF)进行营养状况评估和日常生活活动能力(ADL)量表进行生活自理能力评估;采用3d24h膳食回顾和称重法相结合的方法调查3d饮食摄人情况,分析评估膳食结构、能量和营养素的摄入量;空腹静脉采血检测血红蛋白、白蛋白、前白蛋白.结果 (1)受调查的老年人营养不良发生率为10.67%,营养不良风险43.67%;并且发现生活自理能力越差,营养不良的发生率越高.(2)膳食结构:长照机构老年人的膳食结构不尽合理,其中禽畜肉类95 g/d,蛋类的摄入量52 g/d,均达到推荐摄入量;谷类242 g/d接近推荐摄入量;大豆及坚果21 g/d、蔬菜类221 g/d均低于推荐摄入量;鱼虾类21 g/d、水果37 g/d、奶类65 g/d均远低于推荐摄入量.(3)能量和营养素摄入情况:能量(男性1 652.9 kcal/d,女性1 498.8 kcal/d)、蛋白质(男性56.9 g/d,女性52.9 g/d)、钙、铁、硒、锌、维生素A、维生素E、维生素B1、维生素B2、维生素C均低于推荐摄入量,其中钙、膳食纤维的摄入严重不足.(4)本次调查贫血发生率为61.3%,低白蛋白血症发生率为26.5%;低前白蛋白发生率为36.3%.结论 长照机构老年人膳食结构不尽合理,能量、蛋白质和多种微量营养素摄入不足,营养不良及营养风险发生率高,应引起重视.
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编辑人员丨2023/8/6
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糖尿病肾病早期标志物研究新进展
编辑人员丨2023/8/6
糖尿病肾病是造成终末期肾脏病的主要原因之一并导致糖尿病患者的死亡率不断增加.早期诊断和治疗是改善预后的关键.目前多用微量白蛋白尿和肾小球滤过率综合评价,但微量白蛋白尿的敏感性和特异性不强,肾小球滤过率在正常偏高水平时检测较为困难.因此,近几年很多研究致力于寻找检测糖尿病肾病和预测肾功能下降的早期标志物,包括足细胞标记蛋白、WilmsTumor-1、胱抑素C、megalin和cubilin、肝脏脂肪酸结合蛋白、尿微小RNA、尿蛋白质组学、中性粒细胞趋化因子、维生素D结合蛋白、骨诱导因子和骨膜蛋白等.
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编辑人员丨2023/8/6
