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DOCK家族蛋白基因变异与免疫缺陷病
编辑人员丨5天前
胞质分裂作用因子(DOCK)家族蛋白作为保守的鸟嘌呤核苷酸交换因子,其基因变异在免疫缺陷病发病机制中起重要作用。本文介绍了免疫缺陷病及其类型,DOCK家族蛋白及其基因变异引起的疾病,DOCK家族蛋白与免疫缺陷病的关系,DOCK2和DOCK8各自的结构及其免疫缺陷病并且关注DOCK家族现有的针对免疫缺陷的最新研究进展,以期为免疫缺陷疾病的诊断、治疗和预防提供新的思路。
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编辑人员丨5天前
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肺腺癌关键基因及潜在药物的生物信息学分析
编辑人员丨5天前
目的:基于生物信息学筛选肺腺癌预后基因,探讨预后基因与免疫治疗反应性的关系,同时筛选其潜在药物。方法:在基因表达谱(GEO)数据库用GEO2R对GSE30219、GSE31210、GSE32863、GSE33532、GSE40791和GSE75037数据集进行差异表达分析,取 P<0.05且Log2(fold change)≥1的基因,用在线网站取交集得共同上调基因。在GSE31210、GSE42127、GSE68465、GSE72094数据集和癌症基因图谱计划(TCGA)数据库中获取生存资料,用R软件对上调基因行单因素COX回归分析,得到7个预后关键基因。通过基因表达谱交互分析(GEPIA2)网站验证基因表达与预后的关系。使用人类蛋白图集(HPA)在线工具验证关键基因的蛋白表达水平。京东基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)进行基因功能富集分析。使用仙桃学术分析关键基因与免疫治疗反应的相关性。最后通过CellMiner数据库筛选关键基因的敏感性药物。两组间的比较通过Student’s t检验评估。 结果:共获得142个共同上调基因,经单因素COX回归分析和GEPIA2网站验证得到7个预后关键基因,即细胞周期蛋白B2(CCNB2)、细胞分裂周期蛋白20(CDC20)、瓣状核酸内切酶1(FEN1)、鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)上皮细胞转化序列2(ECT2)、微小染色体维持蛋白4(MCM4)、母胚亮氨酸拉链激酶(MELK)和溶质载体家族2成员1(SLC2A1)。通过GO和KEGG功能富集分析,关键基因生物学功能主要富集在作用于DNA的催化活性方面,以及在细胞周期、人类T细胞白血病病毒1感染等信号通路上。此外,免疫相关性分析显示7个关键基因与肿瘤突变负荷(TMB)、表面抗原分化簇274(CD274)表达以及肿瘤免疫功能障碍和排斥评分(TIDE)明显相关。最后,7个关键基因得到37个对应的敏感性药物。结论:CCNB2、CDC20、FEN1、ECT2、MCM4、MELK和SLC2A1可以作为肺腺癌预后不良标志物,且可能与免疫治疗低反应性相关,同时得到37个对应的敏感性药物。
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编辑人员丨5天前
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Rho-GTP酶类及相关调控因子在足细胞中作用的研究进展
编辑人员丨5天前
足细胞又称肾小球脏层上皮细胞,是构成肾小球滤过膜功能的重要屏障。以肌动蛋白为基础的细胞骨架在维持足细胞的正常功能中起着重要作用。本文综述了近年来发现的Rho-GTP酶类(Rho-GTPases)及相关调控因子在足细胞肌动蛋白骨架调控中的研究进展。在足细胞中,以RhoA、Rac1和Cdc42为代表的Rho-GTPases在调控肌动蛋白细胞骨架中起着核心作用。
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编辑人员丨5天前
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电针对佐剂性关节炎大鼠膝关节滑膜VEGF/Vav2/Rac1信号通路的影响
编辑人员丨2023/11/18
目的 观察电针对佐剂性关节炎(adjuvant arthritis,AA)大鼠膝关节滑膜组织内血管内皮生长因子(vascular endothe-lial growth factor,VEGF)、鸟嘌呤核苷酸交换因子 2(vav guanine nucleotide exchange factor 2,Vav2)和Ras相关C3 肉毒素底物1(Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1,Rac1)表达的影响,探究电针干预类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)血管新生的可能机制.方法 将 40只SPF级SD雄性大鼠随机分成 4组(空白组、模型组、西药组和电针组),每组 10只.除空白组,其他 3组采用尾根部皮下注射完全弗氏佐剂制成AA大鼠模型.造模后第 2天开始干预,电针组进行电针干预,以左侧足三里与关元穴配穴,右侧足三里与同侧阿是穴配穴,每次 20 min,每天干预 1 次,共干预 21 次;西药组给予甲氨蝶呤灌胃给药,每周 1 次,共干预 3 次.观察各组体质量、关节红肿等一般情况,每 3天测量 1 次大鼠后双侧足跖容积.干预结束后,通过大鼠一般情况、体质量、足跖容积分析各组大鼠足跖肿胀程度,HE染色观察AA大鼠膝关节滑膜组织的病理形态学,免疫组织化学法检测膝关节滑膜组织内CD31表达变化,Western blot法检测大鼠膝关节滑膜组织VEGF、Vav2 和Rac1 蛋白表达量.结果 与空白组相比,模型组大鼠第21天足跖容积均明显增大(P<0.01),膝关节滑膜组织出现显著性病理改变,CD31表达量明显升高(P<0.05),VEGF、Vav2、Rac1 蛋白表达量显著升高(P<0.01).与模型组相比,西药组足跖容积在第 21天显著减小(P<0.01),膝关节滑膜组织病理改变明显改善,VEGF、Vav2 表达量明显下降(P<0.05),Rac1 蛋白表达量显著下降(P<0.01);电针组足跖容积在第 21 天显著减小(P<0.01),膝关节滑膜组织病理改变明显改善,VEGF、Rac1 表达量明显下降(P<0.05),Vav2 蛋白表达量显著下降(P<0.01).结论 电针改善RA的作用机制可能与抑制VEGF/Vav2/Rac1 信号通路,进而抑制血管新生有关.
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编辑人员丨2023/11/18
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ALKBH5调控GEFT的m6A修饰对胆管癌转移及EMT的实验研究
编辑人员丨2023/8/19
目的 探究alkB同源蛋白 5(ALKBH5)调控鸟嘌呤核苷酸交换因子T(guanine nucleotide exchange factors T,GEFT)的m6A修饰对胆管癌转移和上皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的影响.方法 将HuCCT1 细胞按照转染类别分为Control组,NC-sh组、ALKBH5-sh组、NC-LV组、ALKBH5-LV组、ALKBH5-LV+NC-sh组和ALKBH5-LV+GEFT-sh组.Control组细胞不进行转染,使用Lipofectamine 2000 对其他组细胞分别转染相应的慢病毒.采用MTT法检测细胞增殖水平,流式细胞仪检测细胞凋亡水平,Transwell实验检测细胞迁移和侵袭水平.采用RT-qPCR分析HuCCT1 细胞中的ALKBH5,GEFT,Bax,Bcl-2,MMP2,MMP9,E-cadherin,N-cadherin和Vimentin的mRNA水平.采用Western blot分析HuCCT1 细胞中的ALKBH5 和GEFT蛋白水平.采用MeRIP-qPCR分析HuCCT1 细胞中GEFT m6A甲基化水平.结果 与Control组和NC-sh组比较,ALKBH5-sh组ALKBH5 和GEFT的mRNA和蛋白水平降低,相对细胞活力降低,细胞凋亡率和Bax mRNA水平升高,Bcl-2 mRNA水平降低,迁移和侵袭细胞数量降低,MMP2 和MMP9 mRNA水平降低,E-cadherin mRNA水平升高,N-cadherin和Vimentin水平降低,GEFT m6A甲基化水平升高,差异具有统计学意义(F=43.347~1 995.868,均P<0.001).与Control组和NC-LV组比较,ALKBH5-LV组ALKBH5 和GEFT的mRNA和蛋白水平升高,相对细胞活力升高,细胞凋亡率和Bax mRNA水平降低,Bcl-2 mRNA水平升高,迁移和侵袭细胞数量升高,MMP2 和MMP9 mRNA水平升高,E-cadherin mRNA水平降低,N-cadherin和Vimentin水平升高,GEFT m6A甲基化水平降低,差异具有统计学意义(F=42.421~720.275,均P<0.001).与ALKBH5-LV+NC-sh组比较,ALKBH5-LV+GEFT-sh组GEFT的mRNA和蛋白水平降低,相对细胞活力降低,细胞凋亡率和Bax mRNA水平升高,Bcl-2 mRNA水平降低,迁移和侵袭细胞数量降低,MMP2 和MMP9 mRNA水平降低,E-cadherin mRNA水平升高,N-cadherin和Vimentin水平降低,差异具有统计学意义(t=7.175~77.872,均P<0.001).结论 ALKBH5 和GEFT均促进胆管癌细胞的生长和转移,ALKBH5 可能通过调控GEFT m6A甲基化修饰来影响胆管癌的转移及EMT.
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编辑人员丨2023/8/19
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Vav1对T细胞的调控作用及其与相关疾病的关系
编辑人员丨2023/8/6
Vav1作为T细胞受体下游的关键信号分子,拥有鸟苷酸交换因子功能的催化核心结构DH-PH-ZF和接头蛋白功能的SH3-SH2-SH3结构,因而在T细胞发育、活化、增殖和功能发挥等各个阶段,以及在自身免疫性疾病、移植排斥和肿瘤等发生、发展中具有不同的调控作用,可为临床治疗提供潜在靶点.本文综述了Vav1对T细胞的调控作用及其与相关疾病的关系.
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编辑人员丨2023/8/6
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环腺苷酸结合蛋白在心脏功能及相关心脏疾病中的作用研究进展
编辑人员丨2023/8/6
3,5-环磷酸腺苷(cAMP)是心血管系统中细胞对于外界刺激反应的关键信号分子.它控制很多生物效应,如细胞增殖、变异和凋亡等.cAMP是ATP通过跨膜腺苷酸环化酶激活的G蛋白偶联受体[1].细胞内cAMP不仅由腺苷酸环化酶产生,而且由cAMP的磷酸二酯酶调控其降解,催化cAMP水解成5-AMP.磷酸二酯酶是限制cAMP合成的关键因素,并且是各种特定反应动态微小区域的关键组成部分[2].研究显示,细胞内cAMP效应与蛋白激酶A(PKA)及环核苷酸-门控离子通道相关联.1998年,一种新的cAMP受体蛋白被发现,即环腺苷酸结合蛋白(EPAC).EPAC家族由作为小分子G蛋白Rap的特异性鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF)的EPAC1和EPAC2组成,其功能与PKA平行.EPAC可促使二磷酸鸟苷(GDP)转变为三磷酸鸟苷(GTP),从而激活小分子G蛋白Rap[3]相反,Rap-GTPase激活蛋白提高了内在GTP水解活性,使Rap转化为无活性的GTPase.Rap在有活性和无活性状态的转换形成其与效应蛋白结合的主要机制.EPAC的发现打破了关于cAMP与PKA的传统观点,并揭示cAMP信号在心血管系统中新的作用.这些cAMP敏感的GEF在不同亚细胞器及细胞内环境中的功能将逐步阐明,诸多研究表明,EPAC与cAMP的多种生理反应相关联,例如心肌肥大和血管炎症等[4].我们将对EPAC在心脏中的功能及相关心脏疾病中的作用进行综述,并探讨EPAC配体在相关心脏疾病中的治疗潜力.
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编辑人员丨2023/8/6
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蓝萼甲素诱导胶质瘤细胞凋亡及其上调GEF-H1的作用机制
编辑人员丨2023/8/6
蓝萼香茶菜[Rabdosia japonica (Burm.f.) Hara var.glaucocalyx (Maxim.) Hara]是中国民间草药,具有抗肿瘤活性.此研究的目的是探讨蓝萼甲素(glaucocalyxin A,GLA),一种从蓝萼香茶菜中分离纯化得到的二萜类化合物,诱导胶质瘤细胞凋亡的作用及其机制.通过检测C6大鼠胶质瘤细胞的存活率及干扰核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)、聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)和蛋白质免疫印迹(Western blot)技术以探究细胞凋亡的分子信号机制.当GLA存在时,C6大鼠胶质瘤细胞的存活率明显降低,鸟嘌呤核苷酸交换因子H1 (guanine nucleotide-exchange factor,GEF-H1)表达上调,引起细胞外调节蛋白激酶(extracellular regulated protein kinases,ERK)蛋白磷酸化,造成细胞凋亡.因此,GLA诱导神经胶质细胞凋亡是通过激活GEF-H1/ERK途径.
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编辑人员丨2023/8/6
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蛋白转导Rab GEF1减轻小鼠肝脏缺血再灌注所致的肺损伤
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨转录反式激活因子-Rab鸟嘌呤核苷酸交换因子1 (Tat-RabGEF1) 融合蛋白对小鼠肝脏缺血再灌注 (IR) 所致肺损伤的作用及其可能的机制.方法:选用雄性C57BL/6小鼠24只, 按随机数字表法分为假手术 (sham) 组、IR组和Tat-RabGEF1组, 每组8只.采用肝脏缺血90 min再灌注4 h制备肺损伤模型, Tat-Rab-GEF1组于再灌注即刻经尾静脉注射Tat-RabGEF1 (10 mg/kg) .再灌注4 h后处死小鼠, 收集支气管肺泡灌洗液 (BALF) , 采用ELISA法检测BALF中肿瘤坏死因子α (TNF-α) 、白细胞介素6 (IL-6) 和白细胞介素1β (IL-1β) 的含量;取肺组织进行病理学检测, 测定湿/干重比、β-氨基己糖苷酶 (β-Hex A) 和髓过氧化物酶 (MPO) 水平, 并采用Western blot法测定肺组织类胰蛋白酶的表达水平.结果: (1) 肝缺血90 min再灌注4 h肺组织病理损伤明显, 湿/干重比增高, Tat-RabGEF1尾静脉注射明显减轻肺脏病理损伤. (2) 与IR组比较, Tat-RabGEF1组BALF中TNF-α、IL-6和IL-1β浓度, 以及肺组织β-Hex A、MPO水平和类胰蛋白酶表达显著降低 (P <0.05) .结论:体内蛋白转导Rab GEF1减轻肝IR所致的肺损伤, 减少肺组织炎症反应和细胞因子水平, 其机制可能与抑制肥大细胞激活有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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Epac信号分子在纤维化疾病中作用的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
由cAMP激活的交换蛋白分子(exchange protein activated by cAMP,Epac)是近年来新发现的鸟嘌呤核苷酸交换因子,参与一系列cAMP介导的信号通路.纤维化疾病是临床上常见的一类疾病,是在正常生理学(如衰老)或不同致病因素持续刺激下,使得细胞外基质过度沉积的结果.有研究表明,Epac在纤维化疾病中发挥重要作用,因此,该文对Ep-ac在纤维化疾病中的作用进行综述,以促进对于Epac相关机制及药物的研究与开发.
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编辑人员丨2023/8/6
