目的:探讨miRNA-4686（miR-4686）和蛋白质二硫键异构酶A4（PDIA4）在食管癌组织和细胞中的表达，以及miR-4686体外对食管癌细胞增殖和迁移能力的影响及可能机制。方法:采用miRWalk version 3在线网站预测到miR-4686与PDIA4 mRNA互补结合。利用从加州大学圣克鲁兹分校基因组（UCSC）数据库获得的miR-4686和PDIA4 mRNA的表达谱，分析食管癌组织和癌旁组织中miR-4686和PDIA4 mRNA相对表达量。从UCSC数据库获得miR-4686在人体细胞中的定位。采用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）检测食管癌细胞Eca109、TE-13、EC9706、KYSE-510与正常食管上皮细胞HET-1A中miR-4686和PDIA4 mRNA的相对表达量。选择miR-4686相对表达量最低的Eca109细胞进行后续研究。将Eca109细胞分为miR-4686组（转染miR-4686模拟物）和miR-NC组（转染miR-4686阴性对照序列模拟物）。通过克隆形成实验检测两组Eca109细胞增殖能力，划痕愈合实验检测Eca109细胞迁移能力，双萤光素酶报告基因实验验证miR-4686与PDIA4 mRNA的靶向关系；蛋白质印迹法检测PDIA4蛋白和PI3K-AKT-mTOR信号通路相关蛋白的表达。结果:与癌旁组织比较，食管癌组织中miR-4686呈低表达、PDIA4 mRNA呈高表达（均 P<0.01）。与正常食管上皮细胞HET-1A（0.98±0.15）比较，食管癌细胞Eca109（0.11±0.04）、TE-13（0.58±0.10）、EC9706（0.34±0.05）、KYSE-510（0.69±0.06）中miR-4686相对表达量均降低（均 P<0.05）。与miR-NC组比较，miR-4686组Eca109细胞miR-4686相对表达量升高（9.4±2.1比1.0±0.4， t＝3.88， P＝0.008），克隆形成数减少[（38±9）个比（114±18）个， t＝3.78， P＝0.009]，划痕愈合率降低[（27.13±0.91）%比（45.05±3.89）%， t＝4.48， P＝0.004]，PDIA4 mRNA相对表达量降低[1.0±0.5比6.3±0.9， t＝5.04， P＝0.002]。与野生型（WT）-PDIA4+miR-NC组比较，WT-PDIA4+miR-4686组Eca109细胞相对荧光素酶活性下降（0.31±0.08比0.99±0.08， t＝5.96， P<0.001）。与miR-NC组比较，miR-4686组Eca109细胞中PDIA4、p-PI3K、p-AKT、p-m-TOR蛋白表达均降低。 结论:食管癌组织中miR-4686呈低表达，PDIA4 mRNA呈高表达。miR-4686可能通过靶向调控PDIA4表达而抑制食管癌Eca109细胞增殖和迁移。

目的:以28个关节疾病活动度评分(disease activity score in 28 joints，DAS28)为基础对不同活动度群组的类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)病人和健康人群进行分析，挑选出RA活动度相关基因，为RA的诊断治疗提供新思路与线索。方法:收集苏州大学附属第一医院风湿免疫科门诊28个不同活动度的RA病人和18个健康人的基本信息并对它们外周血单个核细胞中mRNA水平进行检测，通过生物信息学分析寻找活动度相关基因。结果:筛选出80个单纯与RA活动度相关的基因，36个与RA活动度和发病都有关系的基因。在这些基因中，12个单纯与活动度相关的基因( SOCS3、 C12 orf44、 KIFC1、 MRPS18 A、 GYG1、 RAB35、 B4 GALT5、 LRRC41、 LILRB4、 LILRA5、 CR1、 PDIA6)与DAS28显著相关( r值分别为0.55、0.53、0.52、0.49、0.44、0.42、0.42、0.41、0.41、0.41、0.40、0.39, P值均<0.05)且呈趋势性下降，与发病和活动度都与相关基因 PPIH与DAS28显著相关( r＝－0.38, P<0.05)且呈趋势性上升。生物功能聚类发现有四项功能和甲基化相关，一项功能和应激反应相关。蛋白质关联分析显示 HIST1 H3 E、 HIST1 H4 I、 HIST1 H4 F、 HIST1 H3 D和 HIST1 H3 F这五个基因不仅出现在与甲基化相关的功能中，而且在实验、文本挖掘和共表达三个方面都存在相互关系。 结论:以DAS28为基础挑选出80个单纯与RA活动度相关的基因，功能分析表明他们大多受到甲基化调控作用，部分与免疫应激反应有关。

目的:探讨miRNA-4469（miR-4469）体外调控肾癌细胞增殖和侵袭的机制。方法:基于OncomiR数据库分析miR-4469不同表达水平患者生存差异。采用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）法检测miR-4469在肾癌细胞株ACHN、OS-RC-2、SK-RC-20、769-P、A498和正常肾小管上皮细胞株HK-2中的表达，将miR-4469表达水平最低的肾癌细胞分为miR-4469组和对照组，分别转染miR-4469模拟物和阴性对照序列。采用CCK-8法检测两组细胞增殖能力（以吸光度值表示），采用Transwell实验分析两组侵袭细胞数。应用TargetScan Release 8.0软件预测miR-4469与蛋白二硫化物异构酶A4（PDIA4）mRNA的结合位点，采用双荧光素酶报告基因实验验证miR-4469与PDIA4 mRNA的靶向关系。采用qRT-PCR法检测各组细胞PDIA4 mRNA的表达量，采用蛋白质印迹法检测各组细胞PDIA4蛋白和PI3K-AKT-m-TOR通路蛋白表达水平。结果:分析OncomiR数据库相关数据显示，miR-4469高表达肾癌患者的总生存优于miR-4469低表达患者（ P<0.001）。各肾癌细胞株中miR-4469的相对表达量均低于HK-2细胞（均 P<0.05），其中769-P细胞miR-4469表达量最低，选取769-P细胞进行后续实验。miR-4469组769-P细胞增殖能力低于对照组（ P<0.01）。miR-4469组769-P细胞侵袭数少于对照组[（19± 3）个比（64±7）个， t＝5.44， P＝0.002]。与共同转染野生型PDIA4和miR-4469阴性序列组相比，共同转染野生型PDIA4和miR-4469模拟序列组细胞相对荧光素酶活性低（0.42±0.07比1.01±0.08， t＝5.74， P＝0.001）；共同转染突变型PDIA4和miR-4469阴性序列组与共同转染突变型PDIA4和miR-4469模拟序列组间细胞相对荧光素酶活性差异无统计学意义（0.99±0.11比1.02±0.11， t＝0.19， P＝0.001）。miR-4469组769-P细胞PDIA4 mRNA相对表达量低于对照组[0.98±0.23比7.19±2.23， t＝2.77， P＝0.032]。与对照组相比，miR-4469组769-P细胞PDIA4蛋白和PI3K-AKT-m-TOR通路相关的p-PI3K、p-AKT、p-mTOR、p-SGK1蛋白表达量均低（均 P<0.05）。 结论:miR-4469与肾癌患者生存可能有相关性，其在各肾癌细胞株中表达均下调。miR-4469可能通过PDIA4调节PI3K-AKT-m-TOR通路，从而抑制肾癌769-P细胞增殖和侵袭。

目的:研究转录激活因子6（ATF6）与需肌醇酶1-X-框结合蛋白1（IRE1-XBP1）在氧糖剥夺/复氧（OGD/R）损伤小鼠海马神经元（HT22）细胞中的交互作用。方法:复制OGD/R损伤HT22细胞模型，观察OGD/R后不同时间点（0、3、6、12、24 h）内质网应激（ERS）、细胞活性和凋亡的变化。将对数生长期的HT22细胞分为空白对照组、对照+ATF6激动剂AA147组、对照+IRE1抑制剂4μ8c组、OGD/R模型组、OGD/R+AA147组、OGD/R+4μ8c组（AA147组和4μ8c组于全程添加10 μmol/L AA147或16 μmol/L 4μ8c）。采用蛋白质免疫印迹试验（Western blotting）检测各组HT22细胞ERS相关蛋白〔葡萄糖调节蛋白78（GRP78）、磷酸化需肌醇酶1（p-IRE1）、磷酸化真核细胞翻译起始因子2α（p-eIF2α）〕以及凋亡相关蛋白Bcl-2、Bax、天冬氨酸特异性半胱氨酸蛋白酶3（caspase-3）、活化caspase-3的表达；采用实时荧光定量聚合酶链反应（RT-qPCR）检测ERS相关基因以及ATF6〔同型半胱氨酸内质网应激泛素样结构域1（Herpud1）、蛋白二硫键异构酶家族成员4（Pdia4）、Lin-12样抑制子/增强子（Sel1L）〕和剪接型X-框结合蛋白1〔XBP1s，包括DnaJ热休克蛋白成员B9（Erdj4）、Sec24相关基因家族成员D（Sec24d）、信号受体序列3（Ssr3）〕介导的转录反应相关基因的mRNA表达；采用细胞增殖与毒性检测试剂盒（CCK-8）检测细胞活性；采用免疫荧光法检测活化caspase-3表达。结果:与空白对照组比较，ERS相关蛋白p-IRE1和p-eIF2α的蛋白表达量分别在OGD/R 12 h、OGD/R 3 h升高（p-IRE1/β-actin：2.09±0.10比1.00±0.00，p-eIF2α/β-actin：1.39±0.11比1.00±0.00，均 P<0.01），ERS相关基因ATF6、XBP1s、非剪接型X-框结合蛋白1（XBP1u）、转录激活因子4（ATF4）、CCAAT/增强子结合蛋白同源蛋白（CHOP）的mRNA表达量在OGD/R后不同时间点也明显升高，表明ERS在OGD/R作用的HT22细胞中被激活。与OGD/R模型组比较，OGD/R+AA147组p-IRE1蛋白表达量无改变，但XBP1s和XBP1u的mRNA表达量明显下降〔XBP1s（2 -ΔΔCt）：0.76（0.71，0.92）比1.13（1.03，1.29），XBP1u（2 -ΔΔCt）：0.29±0.05比0.52±0.04，均 P<0.01〕，而XBP1s介导的转录反应相关基因表达量无明显改变。与OGD/R模型组比较，在使用4μ8c后短链ATF6（sATF6）和GRP78的蛋白表达量无明显改变，ATF6介导的转录反应相关基因的mRNA也无明显改变。提示ATF6的激活能抑制XBP1s和XBP1u的mRNA表达，但ATF6与XBP1s介导的转录反应无交互作用。与空白对照组比较，HT22细胞活性在OGD/R 3 h时显著降低〔（44.64±5.12）%比（99.13±5.76）%， P<0.01〕，凋亡相关蛋白Bax/Bcl-2比值和活化caspase-3/caspase-3比值分别在OGD/R 3 h和OGD/R 0 h显著升高（Bax/Bcl-2比值：6.15±1.65比1.00±0.00，活化caspase-3/caspase-3比值：17.48±2.75比1.00±0.00，均 P<0.01），表明凋亡在OGD/R作用的HT22细胞中被激活。与OGD/R模型组比较，OGD/R+AA147组细胞活性显著下降〔（36.52±17.78）%比（69.90±9.43）%， P<0.01〕，Bax/Bcl-2比值和活化caspase-3/caspase-3比值明显升高（Bax/Bcl-2比值：2.06±0.31比1.10±0.25，活化caspase-3/caspase-3比值：3.35±0.59比0.55±0.09，均 P<0.01）。 结论:在OGD/R损伤HT22细胞中，ATF6和XBP1s介导的转录反应无明显交互作用，但AA147激活的ATF6能抑制XBP1s和XBP1u的mRNA表达并促进应激HT22细胞中死亡的发生。

目的:探究蛋白质二硫化物异构酶A3抗体(protein disulfide isomerase A3，PDIA3Ab)与自身免疫甲状腺炎(autoimmune thyroiditis，AIT)孕妇流产风险的关系。方法:选择2018年5月至2020年5月江苏省海安市人民医院收治的127例AIT孕妇，根据其是否发生流产分为未流产组(n＝67)与流产组(n＝60)，比较两组临床资料及血清PDIA3Ab滴度，采用Spearman相关分析血清PDIA3Ab滴度与AIT孕妇流产的相关性，采用Logistic回归分析AIT孕妇流产的影响因素，采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve，ROC)分析血清PDIA3Ab滴度预测AIT孕妇流产的价值。结果:流产组与未流产组患者年龄、孕周、体质量指数、吸烟史、饮酒史及血清游离甲状腺素(free thyroxine，FT4)、促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone，TSH)、甲状腺过氧化物酶抗体(thyroid peroxidase antibody，TPOAb)甲状腺球蛋白抗体(thyroglobulin antibody，TgAb)TPOAb、水平差异无统计学意义( P值均>0.05)；流产组PDIA3Ab滴度较未流产组高[(53.49±18.77)IU/mL比(38.36±12.60)IU/mL； t＝5.382， P＝0.000]；血清PDIA3Ab滴度与AIT孕妇流产呈正相关( r＝0.476， P＝0.000)；血清PDIA3Ab滴度升高是AIT孕妇流产的危险因素( P＝0.039)；血清PDIA3Ab滴度预测AIT孕妇流产的AUC(95%CI：0.749～0.894)为0.821，敏感性为59.3%，特异性为98.5%，约登指数为0.578，最佳临界值为51.15 IU/mL。 结论:血清PDIA3Ab滴度升高可增加AIT孕妇流产风险，临床对于血清PDIA3Ab滴度升高的AIT孕妇应予以重视并及时干预，可能改善其妊娠结局。

本研究利用选择信号分析方法在美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪中筛选与重要经济性状相关的候选基因.选取健康状态良好、饲养管理水平一致的成年美系杜洛克公猪33头、丹系杜洛克公猪11头,提取DNA并重测序,利用Fst&Pi的联合分析,保留候选区域,对注释基因进行GO功能和KEGG通路富集分析,进一步筛选与重要经济性状相关的相关候选基因.美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪的全基因组重测序平均测序深度在13×以上,测序数据平均效率为99.82％,Q30平均值分别为91.91％、91.93％,G+C含量分别在42.90％-43.83％和42.48％～43.55％,均表明本次测序数据质量较高.以5％为筛选阈值,关联Fst&Pi提取相关候选区域,采用选择性消除方法检测到相应的选择信号区域,美系杜洛克猪和丹系杜洛克猪之间的Fst值为0.268,θπ比值分别为0.495和-1.415,Pi值分别为4.206和3.506.在美系杜洛克猪的选择性消除分析中有557个受选择区域,注释到1 323个基因;丹系杜洛克猪的选择性消除分析中有207个受选择区域,注释到338个基因.GO分析和KEGG通路富集分析发现,在美系和丹系杜洛克群体中初步筛选到ERLIN2、TMCO2、PITX2、SORCS3和SUFU等5个与精子发生、脂肪形成、生殖功能等性状相关的候选基因.在美系杜洛克猪中筛选到ATP1B1、LAMA4、EP300、ELOVL3、ECHS1、THEME5、PIP5K1A、PPT1、UBQLN1、1L2、CNTFR、ITGA10、SEC24D、MAP3K5 和 HSP90B1 等 15 个与肉质、脂肪合成与代谢、精子发生、生长发育、骨发生和饲料效率等性状相关的候选基因.在丹系杜洛克猪中筛选到PDIA3、CBLIN2、CYCS和CDH7等4个候选基因,分别与产奶量、肉质性状、骨骼肌、饲料效率相关;BMI1、LHX8、ELL3、CATSPER2和CSMD1等5个与繁殖性状相关的候选基因.本研究发现美系杜洛克猪群体和丹系杜洛克猪群体间存在较大的遗传分化,为进一步研究杜洛克公猪的遗传特性提供了基因组数据支撑.

目的:建立肾癌舒尼替尼耐药细胞株,探讨蛋白二硫键异构酶A成员4(PDIA4)调控肾细胞癌舒尼替尼耐药的机制.方法:采用小剂量间歇诱导法建立786-O和OS-RC-2耐药细胞株(786-OR和OS-RC-2R),采用实时荧光定量PCR法、蛋白免疫印迹法检测PDIA4在耐药肾癌细胞株与非耐药肾癌细胞株中的表达情况,通过慢病毒感染构建PDIA4稳定过表达或敲减肾癌细胞系,通过细胞计数试剂盒(CCK-8)法检测PDIA4对肾癌细胞增殖影响;通过qRT-PCR和Western blot检测凋亡相关蛋白BCL2、BAX、Caspase3、Cleaved-Caspase3、Caspase9表达.结果:与对照组亲本细胞株786-O和OS-RC-2相比,耐药细胞株786-OR和OS-RC-2R的PDIA4表达水平明显升高(P＜0.05).过表达PDIA4可促进肾癌细胞的生长和活力以及降低肾癌细胞对舒尼替尼的敏感性(P＜0.05);而敲低PDIA4能抑制肾癌细胞的生长和活力以及升高肾癌细胞对舒尼替尼的敏感性(P＜0.05).此外,过表达PDIA4能抑制促凋亡蛋白的表达(P＜0.05),而敲低PDIA4能促进促凋亡蛋白的表达(P＜0.05).结论:PDIA4与肾细胞癌舒尼替尼耐药有关,其机制是抑制细胞凋亡引起肾癌细胞癌舒尼替尼耐药,靶向PDIA4则可以逆转耐药.

目的 通过生物信息技术分析GSE72224 基因芯片数据,比较衰老小鼠与青年小鼠B细胞基因差异,探索关键基因,为衰老机制研究及药物研发提供思路.方法 通过NCBI提供的GEO数据库下载GSE72224,利用生物信息方法筛选衰老与青年小鼠B细胞差异表达基因,然后对差异表达基因进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,并且构建蛋白质相互作用网络获得关键基因和关键模块.结果 共筛选出 87 个表达基因,包括其中66 个下调基因及 21 个上调基因.差异表达基因主要参与B细胞活化、内质网及内质网蛋白加工通路等.通过构建蛋白质相互作用网络从而筛选出H2A组蛋白家族成员(H2af)x、Zeste基因增强子人类同源物(Ezh)2、蛋白二硫化物异构酶(Pdi)A4、H2B组家族成员b(Hist2h2bb)、白细胞介素(IL)-10、Sel1l、Dnajb9、泛素样含PHD和环指域(Uhrf)1 这 8 个关键基因.并且筛选出两个重要模块,模块中的基因主要也与内质网蛋白加工通路等有关.结论 H2afx、Ezh2、Pdia4、Hist2h2bb、IL-10、Sel1l、Dnajb9、Uhrf1 此 8 个关键基因,主要参与B细胞发育、DNA甲基化和内质网的蛋白质调控等过程.但是有关基因的上下游作用点还需深入研究.

蛋白质二硫键异构酶A3(PDIA3),也被称为ERp57,是一种58kD的葡萄糖调节蛋白,是属于PDI家族的硫醇氧化还原酶伴侣蛋白[1].该分子涉及多种细胞功能,包括新合成的蛋白质的折叠和主要组织相容性复合物Ⅰ(MHC-Ⅰ)的装配[2,3].在人类的卵巢癌、乳腺癌、子宫癌、肺癌、胃癌和前列腺癌中都有PDIA3的表达[4-6].本研究对PIDA3在大肠癌组织中的表达情况及其在细胞内的定位进行初步探讨.

目的 探索内质网氧化还原1样蛋白(endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like protein,ERO1L)在肺腺癌中的表达及意义.方法 利用cBioPortal在线分析癌症基因图谱(The Cancer Genome At-las,TCGA)数据库中586例肺腺癌样本中的RNA-Seq数据,并结合患者的完整生存时间信息,采用Kaplan-Meier法分析ERO1L变异与肺腺癌患者生存之间的关系.通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profi-ling Interactive Analysis,GEPIA)数据库搜索ERO1L mRNA在正常肺组织与肺腺癌组织表达的情况,分析其在不同TNM分期中的表达情况.用MethHC数据库分析ERO1L基因在肺腺癌中的甲基化水平.String-DB数据库分析与ERO1L相互作用的蛋白.结果 在230例肺腺癌样本中有18例发生ERO1L基因变异,变异率为8％.Kaplan-Meier生存曲线分析显示ERO1L变异组总体生存期(overall survival,OS)短于无变异组(P=0.0268).肺腺癌组织中ERO1L mRNA表达明显高于正常肺组织(P<0.05),且其启动子甲基化水平显著减低(P<0.005).ERO1LB、ERP29、ERP44、GPX7、GPX8、INS、P4HB、PDIA4、PDIA6、TXNDC5等基因与ERO1L有明显的相互作用.结论 通过肿瘤基因数据库信息挖掘表明,ERO1L在肺腺癌组织中呈高表达,且与患者预后不良相关,为深入研究ERO1L在肺腺癌发生发展中的作用提供重要理论依据.