目的:探讨不典型慢性粒细胞白血病（aCML）的临床特点及诊断方法。方法:对四川省宜宾市第二人民医院南岸院区收治的1例年轻aCML患者的临床资料、骨髓形态学、免疫学、遗传学及分子生物学特点进行分析。结果:患者骨髓涂片示：粒细胞系明显增生，占0.875，伴显著发育异常和不成熟的粒细胞增多，原始粒细胞占0.170，成熟粒细胞胞质内颗粒明显增多、增粗；骨髓穿刺活组织检查示：骨髓增生极度活跃，幼稚粒细胞增多，网状纤维广泛增生（骨髓纤维化2~3级）；左腹股沟淋巴结切除活组织检查病理示：淋巴结结构破坏，组织细胞背景中可见巨核细胞及不成熟粒细胞，符合髓外造血；骨髓流式细胞免疫表型示：粒细胞群约占有核细胞81.6%，异常表达CD56、CD14dim，粒细胞系发育模式异常；白血病中常见30种融合基因筛查均为阴性；聚合酶链反应（PCR）检测示：BCR-ABL1融合基因p210型、BCR-ABL1融合基因p190型、BCR-ABL1融合基因p230型、CALR基因第9号外显子、JAK2 V617F突变均为阴性。Sanger测序示：MPL-W515基因突变、CSF3R基因第14号和17号外显子、BRAF基因突变、SRSF2均为阴性；二代测序示：ASXL1基因突变阳性，NM_015338.5：c.2077C>T（p.R693*），突变频率为47.7%；U2AF1基因突变阳性，NM_006758.2：c.101C>A（p.S34V），突变频率为51%；PDGFRA、PDGFRB、SETBP1、SF3B1、STAT3、STAT5B等均为阴性。染色体核型分析示：47，XX，add（5）（q33），+8，-10，+mar[8]。综合诊断为aCML，BCR-ABL1阴性。结论:BCR-ABL1阴性aCML的诊断依赖于形态学、免疫学、遗传学和分子生物学综合诊断，二代测序在鉴别诊断及靶向药物治疗方面尤为重要；年轻患者的早期诊断及治疗极具挑战性，应引起临床医生重视。

目的:探讨较低危组和较高危组骨髓增生异常综合征（MDS）患者基因突变及基因突变功能组的差异。方法:回顾性病例系列研究。回顾性分析2018年1月至2023年8月就诊于东南大学附属中大医院227例MDS患者的临床资料。根据修订版国际预后积分系统（IPSS-R），将MDS患者分为较低危组（IPSS-R评分≤3.5分）96例与较高危组（IPSS-R评分>3.5分）131例。采用二代测序检测骨髓标本中58个MDS常见基因突变，取基因突变结果中突变率较高的24个基因纳入研究，并根据基因功能将24个突变基因分为8类。比较较低危组与较高危组临床资料、基因突变及基因突变功能组的差异。结果:227例MDS患者中至少检测出1种基因突变的患者为177例（78.0%），其中突变率较高的5种基因依次为ASXL1[21.6%（49/227）]、TET2[18.5%（42/227）]、TP53[15.4%（35/227）]、DNMT3A[13.2%（30/227）]、U2AF1[10.1%（23/227）]。按基因功能分类，最常见突变组为甲基化相关基因[31.3%（71/227）]，其次为剪接体相关基因[24.7%（56/227）]。较低危组血小板计数、中性粒细胞计数均高于较高危组，骨髓原始细胞比例、基因突变率及存在≥3种基因突变率均低于较高危组（均 P<0.05）。较低危组中突变率较高的5种基因依次为TET2[21.9%（21/96）]、DNMT3A[14.6%（14/96）]、ASXL1[13.5%（13/96）]、SF3B1[12.5%（12/96）]、U2AF1[8.3%（8/96）]，较高危组中突变率较高的5种基因依次为ASXL1[27.5%（36/131）]、TP53[23.7%（31/131）]、TET2[16.0%（21/131）]、DNMT3A[12.2%（16/131）]、U2AF1[11.5%（15/131）]，较低危组ASXL1、TP53、ETV6、NRAS基因突变率均低于较高危组（均 P<0.05）。较低危组及较高危组中甲基化相关基因突变比例均最高，但两组比较差异无统计学意义[32.3%（31/96）比30.5%（40/131）， χ2＝0.08， P>0.05]；两组肿瘤因子抑制物相关基因突变、转录因子相关基因突变、染色质修饰相关基因与RAS途径相关基因突变比例比较，差异均有统计学意义（均 P<0.05）。 结论:较高危组较较低危组MDS患者常见基因突变率高，且基因突变数量多。

目的:研究伴环状铁粒幼红细胞增多（RS）的骨髓增生异常综合征（MDS-RS）患者的基因突变特征及其临床意义。方法:收集2001年1月至2019年6月于中国医学科学院血液病医院新诊断的255例原发性MDS-RS患者资料。129例采用一代测序、126例采用包含112个血液肿瘤相关基因的二代测序（NGS）进行基因突变分析。结果:共193例（75.7%）检出SF3B1突变，其中SF3B1 K700E突变147例（76.2%）。非SF3B1基因突变较常见的有TET2（16.7%）、ASXL1（14.3%）、U2AF1（11.1%）、TP53（7.9%）、SETBP1（6.3%）和RUNX1（6.3%）。RS 5%~<15%患者SETBP1突变率显著高于RS≥15%患者（21.4%对4.5%， P=0.044），其余基因突变率差异无统计学意义（ P值均>0.05）。在114例NGS检出SF3B1突变的患者中，RS 5%~<15%患者SF3B1等位基因突变频率（VAF）与骨髓RS比例呈正相关（ r=0.486， P=0.078）；RS≥15%组SF3B1突变型患者骨髓RS比例显著高于野生型患者[40.0%（15.0%~80.0%）对25.5%（15.0%~82.0%）， P<0.001]，且SF3B1 VAF与骨髓RS比例呈正相关（ P=0.009， rs=0.261）。全部患者SF3B1突变型与野生型年龄、ANC、PLT、平均红细胞体积、RS比例、IPSS-R染色体核型及IPSS-R预后分组等方面差异有统计学意义（ P值均<0.05）。多因素分析显示，SF3B1突变是影响总生存（OS）时间的独立良好预后因素（ HR=0.265，95% CI 0.077~0.917， P=0.036），TP53突变是独立不良预后因素（ HR=6.272，95% CI 1.725~22.809， P=0.005）。根据SF3B1和TP53突变状态将MDS-RS患者分为四组：SF3B1和TP53均突变组、SF3B1和TP53均野生组、SF3B1野生伴TP53突变组及SF3B1突变伴TP53野生组，四组患者OS时间差异显著（ P<0.001）。组间两两比较显示SF3B1突变伴TP53野生组OS时间显著长于SF3B1野生伴TP53突变组、SF3B1和TP53野生组，而与SF3B1和TP53均突变组比较差异无统计学意义。 结论:SF3B1突变在MDS-RS中的发生率较高，几乎均是错义突变，以K700E突变最为常见。SF3B1突变是MDS-RS患者生存的独立良好预后因素，TP53突变是独立不良预后因素，二者联合可更精细地指导MDS-RS患者预后分层。

目的:分析甲状腺癌的可变剪切（AS）事件，探讨AS事件与甲状腺癌预后的相关性，并建立AS事件与剪接因子（SF）的调控网络。方法:分别从癌症基因图谱（TCGA）和TCGA SpliceSeq数据库下载507例甲状腺癌患者临床资料和AS事件数据，合并得到AS事件生存数据的矩阵，评估7种AS事件的发生情况。采用单因素Cox回归分析筛选与预后相关的AS事件，最小绝对值收敛和选择算子（LASSO）回归分析筛选变量避免模型过度拟合，多因素Cox回归分析构建预后模型。Kaplan-Meier 曲线和受试者工作特征（ROC）曲线对预后模型的价值和效能进行评价。利用Pearson试验分析AS事件与SF的相关性，并对SF基因进行GO富集和KEGG通路分析。结果:本研究共纳入507例甲状腺癌患者，研究发现10 447个基因发生了45 150次可变剪切事件。其中ES为主要类型（38.84%），ME发生次数最少（0.51%）。单因素Cox回归筛选出1 842个与预后相关的AS事件，多因素Cox分析建立了基于USHBP1-48249-AA、CACNB1-40626-AT和BEX5-89679-AP的预后风险模型。以风险分数0.807为最佳临界值，能够很好地区分高风险和低风险组（ P<0.001，AUC=0.929）。构建的SF-AS调控网络中发现多个关键SF基因能够调控AS事件的表达，包括CDK12、RBM25、DDX39B、SRRM2和DDX46等。 结论:基于3-AS事件的模型对于评估患者预后具有较高的价值，构建的SF-AS调控网络为探讨甲状腺癌发生发展机制提供了新的思路。

目的:探讨不同SF3B1基因型在骨髓增生异常综合征（MDS）患者中的分布情况以及在生存预后中的价值。方法:回顾性分析2014年1月至2022年1月南京医科大学第一附属医院诊断的377例初诊 MDS患者临床资料，根据不同SF3B1基因型将其分为SF3B1野生型（SF3B1 WT）317例，其中男214例，女103例，年龄63（49，71）岁；SF3B1 K700E突变型（SF3B1 K700E）39例，其中男17例，女22例，年龄65（52，73）岁；以及SF3B1非K700E突变型（SF3B1 non-K700E）21例，其中男13例，女8例，年龄67（63，73）岁。采用靶向测序技术检测与MDS相关的20项基因突变情况；Kaplan-Meier法比较3组患者总生存期（OS）和无进展生存期（PFS）；Cox回归对MDS进行单因素和多因素分析。 结果:与SF3B1 non-K700E患者相比，SF3B1 K700E患者中性粒细胞数更高（ P=0.002）。根据IPSS评分，SF3B1 K700E患者处于低危和中危-1分组的例数多于SF3B1 non-K700E患者数（ P=0.023）。利用靶向测序检测20个基因突变情况发现，与SF3B1 WT患者相比，SF3B1 K700E患者ASXL1和U2AF1突变率明显降低（ P=0.018和 P=0.003）；与SF3B1 non-K700E患者相比，SF3B1 K700E患者ASXL1突变率降低（ P=0.029）。生存分析显示，与SF3B1 WT和SF3B1 non-K700E患者相比，SF3B1 K700E患者OS明显延长（ P<0.001和 P=0.045）；在不伴骨髓原始细胞增多（<5%）的MDS患者中，与SF3B1 WT患者相比，SF3B1 MUT患者OS和PFS均明显延长（ P<0.001和 P<0.001）；在伴骨髓原始细胞数增多（≥5%）的MDS患者中，SF3B1 WT和SF3B1 MUT患者OS和PFS差异均无统计学意义（ P>0.05）；在IPSS评分中危-1的MDS患者中，与SF3B1 WT患者相比，SF3B1 K700E患者OS和PFS均明显延长（ P=0.010和 P=0.013）。多因素回归分析提示SF3B1 K700E是影响MDS生存预后的独立保护因素（ HR=0.461，95% CI 0.262~0.811， P=0.007）。 结论:相比于SF3B1 WT患者，SF3B1 K700E和SF3B1 non-K700E患者预后更好，其中SF3B1 K700EMDS患者的OS明显优于SF3B1 non-K700E的患者，而SF3B1 MUT不能克服骨髓原始细胞增多的不良预后，提示SF3B1突变类型在骨髓原始细胞不增多的MDS患者中具有重要的预后价值。

目的:探讨JAK2、MPL和CALR驱动基因突变情况与BCR-ABL阴性骨髓增殖性肿瘤（MPN）的3种疾病类型[原发性骨髓纤维化（PMF）、真性红细胞增多症（PV）、原发性血小板增多症（ET）]选择间的关系。方法:采用高通量测序靶向检测156例BCR-ABL阴性MPN患者的32种MPN相关基因，分析患者一般情况、驱动基因及伴随基因突变特点等因素与MPN疾病类型的关系。结果:患者疾病类型与年龄关系的分析显示，在JAK2 V617F阳性状态下，PMF患者中60岁以上者的比例较高。通过高通量测序检测，在46例JAK2、MPL或CALR突变患者中检出22种伴随异常基因，其中PV 4例（8.3%），ET 20例（29.4%），PMF 22例（55.0%）。PV仅检出DNMT3A突变，而剪接因子相关基因SF3B1、SRSF2和U2AF1突变仅出现在PMF患者。根据JAK2 V617F突变的变异等位基因频率（VAF值）进行对比分析，结果显示，PV相关的VAF值最高（68.15%），其次为PMF（37.7%）和ET（23.0%），而MPN的3种疾病类型间JAK2 V617F纯合状态比例的差异有统计学意义。且在JAK2突变阳性状态下，PV和ET患者基因突变个数均明显低于PMF。结论:MPN患者的年龄、驱动基因（JAK2、MPL和CALR）的突变特点（VAF值、纯合状态）以及伴随异常基因的种类和突变个数等因素，与驱动基因突变状态下MPN疾病类型的选择密切相关，其相关性有助于我们进一步认识MPN和早期评估疾病风险。

目的:提高对伴（t9；22）（q34；q11）/BCR-ABL融合基因阳性骨髓增生异常综合征（MDS）的认识。方法:回顾性分析中国医学科学院血液病医院2015年收治的1例原发性t（9；22）（q34；q11）/BCR-ABL p190（+）MDS铁粒幼红细胞性贫血伴多系发育异常患者的临床资料，并进行相关文献复习。结果:患者，男性，69岁，血红蛋白84 g/L，白细胞和血小板计数正常。骨髓穿刺涂片分类计数，原始细胞比例为0.01，粒系和红系细胞有发育异常形态学改变。染色体核型为46，XY，t（9；22）（q34；q11）[8]/46，XY[12]。BCR-ABL融合基因检测p190 16.67%，p210和p230均阴性。二代测序结果显示存在SF3B1 p.K700E突变（VAF 44.9%）和TET2 p.G1814fs*6（VAF 43.4%）。确诊为MDS铁粒幼红细胞性贫血伴多系发育异常。结论:费城染色体阳性MDS罕见，预后极差，确诊后尽早接受造血干细胞移植可能是最佳治疗选择。

目的:探讨丝氨酸-精氨酸蛋白激酶2(SRPK2)与前列腺癌细胞周期的相关性。方法:通过皮尔森相关性分析探索癌症基因组图谱(TCGA)数据库中前列腺癌和SRPK2的相关基因集，并进一步将SRPK2相关基因集导入蛋白质相互作用关系检索工具(STRING)蛋白互作网络在线分析网站，通过Cytoscape软件进行可视化，提取与SRPK2相关联蛋白子网络；将上述分析所得基因通过京都基因和基因组百科全书(KEGG)数据集分析出与SRPK2潜在相关的通路，运用基因探针富集分析(GSEA)富集分析探索SRPK2所激活和抑制的相关通路；构建SRPK2敲低的前列腺癌细胞株DU145，分为空白载体组(DU145-KO-NC)和敲低组(DU145-KO-SRPK2)，通过细胞周期检测试剂盒、细胞增殖-毒性检测试剂盒、划痕实验、侵袭实验检测细胞的周期变化、增殖、迁移和侵袭能力，组间比较采用独立样本 t检验。 结果:TCGA数据库分析结果显示有2 158个基因在表达量上与SRPK2呈正相关，779个基因与SRPK2呈负相关；通过STRING蛋白互作网络在线分析，SRPK2与SF3B1、SRSF10、PRPF40A、PRPF4B、DDX46、BCLAF1、NUDT21、CLASRP等基因除了在表达量上存在统计学相关性，在蛋白层面上同样存在着相互作用的关系。对2 937个与SRPK2相关的基因进行功能和通路分析，结果显示SRPK2与细胞周期相关通路相关，如有丝分裂纺锤(Mitotic Spindle)，G 2~M期检查点(G 2~M Checkpoint)，E2F靶点(E2F Targets)，Myc-V1靶点(Myc-V1 Targets)通路。KEGG数据集表明与SRPK2潜在相关的通路有细胞周期(Cell Cycle)、核糖体(Ribosome)、线粒体自噬(Mitophagy)、凋亡(Apoptosis)等。通过进一步GSEA富集分析，结果显示SRPK2同样在前列腺癌中激活细胞周期相关通路，如有丝分裂纺锤体(Mitotic Spindle)，G 2~M期检查点(G 2~M Checkpoint)，E2F靶点(E2F Targets)(NES>0)。为了进一步验证SRPK2对细胞周期的影响，成功构建SRPK2敲低的DU145细胞株，结果提示敲低SRPK2基因后，敲低组的S期高于空白载体组(DU145-KO-NC比DU145-KO-SRPK2为27.053±0.860比33.297±0.883， t＝-7.166， P<0.01)，而敲低组的增殖(DU145-KO-NC比DU145-KO-SRPK2为0.085±0.002比0.344±0.042， t＝10.655; P<0.01)、迁移(30 h：DU145-KO-NC比DU145-KO-SRPK2为0.929±0.066比0.690±0.057， t＝6.101， P<0.01)、侵袭能力(DU145-KO-NC比DU145-KO-SRPK2为81.667±4.163比42.333±7.572， t＝5.750， P<0.05)低于空白载体组，差异均具有统计学意义。 结论:SRPK2可能通过促进细胞周期从而影响前列腺癌进展。

目的:探讨免疫标记物CC-趋化因子受体7（CCR7）抗原在慢性淋巴细胞白血病（CLL）诊断和鉴别诊断中的价值。方法:收集南京医科大学第一附属医院2015年1月至2018年12月间收治的B型慢性淋巴细胞增殖性疾病（B-CLPD）患者643例，包括327例CLL、58例套细胞淋巴瘤（MCL）、34例滤泡淋巴瘤（FL）、36例边缘区淋巴瘤（MZL）、10例毛细胞白血病或其变异型（HCL/HCL-v）、40例华氏巨球蛋白血症（WM），以及48例CD5 +B型慢性淋巴细胞增殖性疾病未分类（B-CLPD-U）和90例CD5 -B-CLPD-U。同时收集本院健康管理中心2018年20名正常对照样本。利用流式细胞术检测B-CLPD患者免疫表型及CCR7表达，采用荧光原位杂交技术（FISH）分析了共济失调毛细血管扩张突变基因（ATM）缺失、13q14缺失、P53缺失和12三体，并利用Sanger测序分析了剪接因子3b亚基1（ SF3B1）、 NOTCH1、肿瘤蛋白53（ TP53）和免疫球蛋白重链可变区（ IGHV）的基因突变情况。计量资料的比较采用Mann-Whitney检验，率的比较采用χ 2检验。CCR7的诊断价值和最佳阳性界值利用受试者工作特征（ROC）曲线计算。 结果:CCR7在典型CLL和非典型CLL中阳性表达率分别为90.8%（257/283）和84.1%（37/44），阳性率差异无统计学意义（χ 2=1.228， P=0.268）。CCR7在CLL中阳性表达率为89.9%（294/327），平均荧光强度（MFI）为278（246，307），而CCR7在MCL、CD5 +B-CLPD、CD5 -B-CLPD、FL、WM、HCL/HCL-v和MZL中的阳性表达率分别为10.3%（6/58）、6.3%（3/48）、8.9%（8/90）、0、0、0和13.9%（5/36），MFI分别为114（106，128）、112（106，117）、110（104，121）、108（105，119）、111（105，124）、112（108，115）和109（105，120），与CLL相比，其他类型B-CLPD中CCR7阳性表达率较低，差异具有统计学意义（χ 2=181.3、177.8、232、164.7、180.8、62.6、129， P<0.01）。另外CCR7阳性用于鉴别CLL与其他类型B-CLPD的敏感度、特异度和准确度分别为89.9%、93.0%和92.3%。CCR7 +CLL患者CD49d阳性表达率为13.9%，低于CCR7 -CLL患者（42.1%）（χ 2=7.6， P=0.01）；而13q14缺失发生率为50.3%，高于CCR7 -CLL患者（20%）（χ 2=6.56， P=0.01）。 结论:CCR7在CLL与其他类型B-CLPD鉴别诊断中具有重要的临床价值。

目的:探究精神分裂症表达异常的致病风险基因。方法:选取56 418例精神分裂症患者与78 818名健康对照者的全基因组关联研究（genome-wide association study，GWAS）数据和大脑表达数量性状位点（expression quantitative trait loci，eQTLs），采用基于汇总数据的孟德尔随机化（summary data-based mendelian randomization analysis，SMR）整合分析精神分裂症的重要风险致病基因，并采用精神分裂症患者尸脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元、人诱导多能干细胞（human induced pluripotent stem cell，hiPSC）和全血表达数据集进行差异表达分析，以验证风险基因表达失调情况。结果:基于SMR共发现16个精神分裂症风险基因（ PSMR<5×10 -6），分别为C4A、HLA-C、EMB、SLC9B1、PCDHA7、BTN3A2、KRT8P46、PCDHA8、SFMBT1、PCCB、WBP1L、BTN3A3、MUSTN1、PPM1M、TYW5和SF3B1。差异表达分析结果进一步验证显示，SF3B1在大脑背外侧前额叶皮质第3层和第5层锥体神经元（ Padjust=5.22×10 -3）和hiPSC（ Padjust=1.41×10 -4）中表达水平均显著下调。WBP1L在hiPSC（ Padjust=1.28×10 -8）和全血（ Padjust=1.17×10 -4）中表达水平均显著上调。TYW5（ Padjust=3.06×10 -6）在hiPSC中表达水平显著上调，PCCB（ Padjust=1.34×10 -4）、BTN3A2（ Padjust=1.48×10 -3）、PPM1M（ Padjust=5.13×10 -6）和PCDHA8（ Padjust=4.31×10 -2）在hiPSC中表达水平显著下调。BTN3A3（ Padjust=2.18×10 -2）在全血中表达水平显著下调。 结论:精神分裂症风险基因SF3B1、TYW5、PCCB、BTN3A2、PPM1M、PCDHA8、WBP1L和BTN3A3异常表达可增加发病风险。