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miRNA-133b和miRNA-150对非小细胞肺癌的诊断价值
编辑人员丨1天前
目的:探讨miRNA-133b(miR-133b)和miRNA-150(miR-150)在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达情况及临床意义。方法:选取2018年6月至2019年6月连云港市第一人民医院手术并经病理确诊的30例NSCLC患者,收集患者术前清晨空腹外周血10 ml以及术后新鲜癌组织、癌旁组织(距离癌组织≤3 cm)、正常肺组织(距离癌组织>5 cm)。以30名同期健康体检者作为健康对照组,收集清晨空腹外周血10 ml。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测两组受试者血清及NSCLC患者各组织中miR-133b、miR-150的相对表达量。分析NSCLC患者血清miR-133b、miR-150水平与临床病理特征的关系;以病理诊断为金标准,应用受试者工作特征(ROC)曲线判断miR-133b、miR-150诊断NSCLC的效能。结果:NSCLC患者中,miR-133b在癌、癌旁、正常肺组织中的相对表达量分别为0.55±0.17、0.68±0.11、0.69±0.12,癌组织中miR-133b表达水平低于癌旁组织和正常肺组织(均 P<0.01);miR-150在癌、癌旁、正常肺组织中的相对表达量分别为1.19±0.14、1.13±0.13、1.09±0.12,癌组织与癌旁组织间miR-150表达水平差异无统计学意义( t=1.98, P=0.051),癌组织中miR-150表达水平高于正常肺组织( t=3.06, P=0.003)。NSCLC患者血清miR-133b相对表达量较健康对照组低(0.43±0.11比0.55±0.16, t=3.68, P<0.05),miR-150相对表达量较健康对照组高(1.14±0.13比1.04±0.12, t=-3.18, P<0.05)。NSCLC患者血清中miR-133b的表达水平与淋巴结转移有关( P=0.003),而与患者的性别、年龄、病理分型、TNM分期均不相关(均 P>0.05)。NSCLC患者血清中miR-150表达水平与各项临床病理特征均不相关(均 P>0.05)。根据ROC曲线,NSCLC患者血清中miR-133b、miR-150的曲线下面积分别为0.732、0.726,二者联合检测的曲线下面积为0.811。 结论:NSCLC患者癌组织和血清中miR-133b表达水平均降低,miR-150表达水平均升高,二者在NSCLC患者的癌组织与血清中的表达趋势一致。miR-133b可能与NSCLC的恶性程度和侵袭、转移有关。miR-133b、miR-150可能成为诊断NSCLC的分子标志物,二者联合检测的诊断效能更高。
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编辑人员丨1天前
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miR-146b调控甲状腺乳头状癌细胞生物学行为的机制研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨miR-146b在甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma, PTC)细胞增殖、转移和凋亡中的作用及相关机制。方法:qRT-PCR检测miR-146b在PTC细胞(NPA、GLAG-66、ONCNO-DG1和B-CPAP)和正常人甲状腺细胞系HTori3中的表达水平。miR-146b抑制剂转染B-CPAP细胞后,通过qRT-PCR检测其抑制效率,利用MTT实验、Transwell实验和流式细胞术分别检测miR-146b对PTC细胞增殖、侵袭能力及凋亡率的影响。SiRNA-IRAK1转染B-CPAP细胞后,利用MTT实验、细胞划痕实验和流式细胞术分别检测IRAK1对PTC细胞增殖率、转移及凋亡率的影响。利用生物信息学软件预测miR-146b的靶基因白介素1关联受体激酶1(interleukin-1 receptor-associated kinases, IRAK1),并通过双荧光素报告基因实验验证miR-146b对IRAK1的调控作用。应用SPSS 20.0软件进行分析,组间对比采用两独立样本 t检验。 结果:qRT-PCR结果表明,与正常细胞HTori3相比,miR-146b在NPA87、KAT-5、FTC-133和B-CPAP细胞系中表达显著升高,尤以B-CPAP较高[相对表达量1 vs(1.61±0.11)、(1.92±0.21)、(1.93±0.22)、(2.43±0.31), P<0.05]。miR-146b抑制剂转染后可显著降低B-CPAP细胞中miR-146b的表达水平[相对表达量1 vs(0.41±0.12, P<0.01]。MTT结果发现,miR-146b抑制剂可抑制B-CPAP细胞的增殖能力[相对增殖率值1.00 vs(0.52±0.12)、(0.56±0.11)、(0.62±0.12), P<0.05]。流式细胞仪检测发现,miR-146b抑制剂可促进B-CPAP细胞的凋亡能力[(3.74%±0.12%)vs(7.62%±0.21%), P<0.05]。Transwell结果表明,miR-146b抑制剂可减弱B-CPAP细胞的侵袭能力[侵袭细胞数目(280.00±67.00)vs(82.00±32.00), P<0.05]。转染入siRNA-IRAK1后,B-CPAP细胞增殖率显著升高[MTT实验,相对增殖率1 vs(2.11±0.21)、(2.33±0.18)、(2.21±0.16)]、转移能力增强[细胞划痕实验,24 h相对迁移率(0.58%±0.11%)vs(0.81%±0.21%)]且细胞凋亡率显著降低[流式细胞术,相对凋亡率(6.96%±1.12%)vs(24.30±1.52%), P<0.05]。双荧光素酶报告基因结果显示,IRAK1是miR-146b的靶基因[相对荧光素酶活性(0.85±0.11)vs(1.19±0.17), P<0.05],miR-146b抑制剂可显著上调B-CPAP细胞中IRAK1蛋白的表达水平[相对灰度值1.00 vs(2.76±0.99), P<0.05)]。 结论:miR-146b可能通过抑制下游靶蛋白IRAK1的表达来促进PTC细胞增殖、转移和抑制细胞凋亡的作用。
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编辑人员丨1天前
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左归丸对去卵巢致骨质疏松症模型大鼠破骨细胞活性及miR-133b-3p/RhoA表达的影响
编辑人员丨1天前
目的:研究左归丸对去卵巢致骨质疏松症大鼠破骨细胞中miR-133b-3p、RAS同源基因家族成员A(RhoA)表达的影响,探讨其作用机制。方法:将SD雌性大鼠按随机数字表法分为正常组、模型组、假手术组、左归丸组,每组6只。模型组、左归丸组采用卵巢切除术构建大鼠骨质疏松症模型。左归丸组灌胃左归丸水煎液10 g/kg,连续灌胃12周。采用比色法测定大鼠血清钙、磷水平,ELISA法检测ALP水平;骨密度仪检测各组大鼠股骨骨密度。培养各组破骨细胞,采用Western blot法检测RANKL、RUNX2蛋白表达。对各组大鼠骨组织进行miRNA测序及差异表达分析。采用miR-133b-3p类似物及其对照处理破骨细胞,采用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)方法检测破骨细胞增殖活力,采用抗酒石酸酸性磷酸酶染色检测破骨细胞活性,双荧光素酶报告基因实验检测miR-133b-3p与RhoA的靶向关系,采用miR-133b-3p类似物及RhoA共表达的“挽救”实验研究左归丸影响破骨细胞活性的分子调控机制。结果:与模型组比较,左归丸组骨密度增加( P<0.05或 P<0.01),血清钙、磷水平增加( P<0.05),ALP水平下降( P<0.05),RANKL蛋白表达下降( P<0.01),RUNX2蛋白表达增加( P<0.05)。测序结果显示,左归丸组骨质疏松大鼠破骨细胞中rno-miR-133b-3p表达下调幅度最大( P<0.01)。左归丸组破骨细胞miR-133b-3p表达低于模型组。miR-133b-3p过表达可促进破骨细胞增殖和分化,RhoA过表达可逆转由miR-133b-3p过表达所引起的破骨细胞过度增殖和分化。 结论:RhoA是miR-133b-3p调控的靶基因,左归丸通过调控miR-133b-3p/RhoA抑制破骨细胞活性,从而缓解骨质疏松症状。
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编辑人员丨1天前
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微RNA-34b/c rs4938723基因多态性与肾母细胞瘤易感性的相关性研究
编辑人员丨1天前
目的:探讨微RNA(miR)-34b/c rs4938723基因多态性与肾母细胞瘤易感性的相关性。方法:选取从2014年3月至2018年3月在本院确诊的133例肾母细胞瘤患者,作为病例组,在本院征召的志愿者中随机选取529与对照组性别、年龄等无统计学差异的健康人群作为对照组,提取他们血液DNA,采用Taq-man荧光定量PCR技术,对miR-34b/c的rs4938723进行检测。统计不同基因型在观察组和对照组中的频率,并分析不同的基因型与肾母细胞瘤易感性的相关性。结果:病例组和对照组均得到了较好的基因分型结果。病例组中,rs4938723位点的三种基因型TT、TC和CC分布频率与对照组差异无统计学意义( P>0.05)。2组的显性模型(TC+CC/TT),隐性模型(TT+TC/CC)和加性模型(TT/TC/CC)的差异均无统计学意义( P>0.05)。不同性别中miR-34b/c rs4938723的基因型频率分布与肾母细胞瘤发生差异无统计学意义( P>0.05)。在总人群和男女性人群中miR-34b/c rs4938723等位基因频率分布差异无统计学意义( P>0.05),miR-34b/c rs4938723等位基因频率分布与肾母细胞瘤无关( P>0.05)。病例组中rs4938723三种基因分型的病理分级,Ⅰ级、Ⅱ级、Ⅲ级和Ⅳ级的差异均无统计学意义( P>0.05)。 结论:miR-34b/c rs4938723多态性位点与肾母细胞瘤的遗传易感性无关。
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编辑人员丨1天前
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Serum microRNA expression profiling revealing potential diagnostic biomarkers for lung adenocarcinoma
编辑人员丨1天前
Background::Recent studies have demonstrated that microRNAs (miRNAs) in the blood circulation can serve as promising diagnostic markers for cancers. This four-stage study aimed at finding serum miRNAs as potential biomarkers for lung adenocarcinoma (LA) diagnosis.Methods::The study was carried out between 2016 and 2017. The Exiqon miRNA qPCR panel (3 LA vs. 1 normal control [NC] pooled serum samples) was used for initial screening to acquire miRNA profiles. Thirty-five dysregulated miRNAs were further evaluated in the training (24 LA vs. 24 NCs) and testing stages (110 LA vs. 110 NCs) using quantitative real-time polymerase chain reaction assays. Results::Four serum miRNAs (miR-133a-3p, miR-584-5p, miR-10b-5p, and miR-221-3p) were significantly overexpressed in LA patients compared with NCs. The diagnostic value of the four-miRNA panel was validated by an external cohort (36 LA vs. 36 NCs). The areas under the receiver operating characteristic curve of the four-miRNA panel in the training, testing, and external validation stages were 0.734, 0.803, and 0.894 respectively. Meanwhile, the expression level of miR-221-3p was much higher in LA tumor samples than that in the adjacent normal tissues (19 LA vs. 19 NCs). The expression level of miR-10b-5p was also elevated in the serum-derived exosomes samples (18 LA vs. 18 NCs). The expression of miR-133a-3p, miR-584-5p, and miR-10b-5p was significantly elevated in LA patients with epidermal growth factor receptor mutation compared with NCs. Conclusion::The study established a four-miRNA signature in serum that could improve the diagnostic capability of LA.
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编辑人员丨1天前
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miR-1、miR-133b与肝泡型棘球蚴病患者肝纤维化的关系
编辑人员丨1天前
目的:探讨肝泡型棘球蚴病患者肝纤维化与微小核糖核酸(microRNA,miR)-1、miR-133b的相关性。方法:选择2020年10月至2021年4月在新疆医科大学第一附属医院明确诊断为肝泡型棘球蚴病(9例)、肝硬化(9例)、肝细胞癌(5例)患者作为研究对象,并以同期健康志愿者为对照(10例),采集所有对象外周血样本制备血浆,经实时荧光定量PCR法检测外周血miR-1、miR-133b表达量;同时,自5例肝泡型棘球蚴病患者采集肝脏病灶周围组织(近端)、距病灶约5 cm处相应组织(远端),并采用免疫组织化学染色法检测肝泡型棘球蚴病患者肝脏病灶近、远端的细胞活化相关指标[细胞周期蛋白D1(CyclinD1)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、α平滑肌肌动蛋白(α-SMA)],纤维化指标[Ⅰ、Ⅲ型胶原蛋白(CollagenⅠ、CollagenⅢ)],转化生长因子β1(TGF-β1)信号通路相关基因[TGF-β1,Ⅰ、Ⅱ型转化生长因子β1受体(TGF-β1RⅠ、TGF-β1RⅡ)]及其下游相关蛋白(SMAD2、SMAD3)表达情况。结果:实时荧光定量PCR结果显示,肝泡型棘球蚴病、肝硬化、肝细胞癌和对照组人群外周血miR-1、miR-133b表达水平比较,差异均有统计学意义( H = 16.54、28.40,均 P < 0.001);其中,肝泡型棘球蚴病组miR-1、miR-133b表达水平均高于对照组、肝硬化组(均 P < 0.05)。肝泡型棘球蚴病患者病灶近端和远端CDK1(0.46 ± 0.02、0.42 ± 0.01),α-SMA(0.54 ± 0.09、0.51 ± 0.07),TGF-β1(0.55 ± 0.15、0.51 ± 0.13),TGF-β1RⅠ(0.58 ± 0.09、0.57 ± 0.08),TGF-β1RⅡ表达水平(0.40 ± 0.05、0.39 ± 0.05)比较,差异均有统计学意义( t = 5.56、3.17、3.18、4.27、5.65, P = 0.005、0.034、0.034、0.024、0.011);CyclinD1、CollagenⅠ、CollagenⅢ、SMAD2、SMAD3表达水平比较,差异均无统计学意义( t = 3.06、3.06、2.86、1.43、1.50, P = 0.055、0.055、0.064、0.247、0.230)。Pearson相关分析结果显示,肝泡型棘球蚴病患者外周血miR-1与肝脏病灶近端TGF-β1RⅠ表达水平呈正相关( P = 0.001);miR-1、miR-133b与CDK1、α-SMA、TGF-β1、TGF-β1RⅡ表达水平均无相关性(均 P > 0.05)。 结论:肝泡型棘球蚴病患者肝脏病灶近端TGF-β1信号通路相关因子表达上调;外周血miR-1和miR-133b表达上调,且miR-1与肝脏病灶近端TGF-β1RⅠ表达水平呈正相关,提示miR-1可能促进肝泡型棘球蚴病肝纤维化发生。
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编辑人员丨1天前
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三七总皂苷调控破骨细胞外泌体中差异miRNA表达抑制成骨细胞铁死亡
编辑人员丨3周前
背景:激素性股骨头坏死多是由于长期大量使用激素所致,但具体的发病机制尚未明确,有待于进一步研究.目的:筛选出三七总皂苷干预破骨细胞来源外泌体中的差异miRNA,在此基础上构建成骨相关铁死亡调控网络,以探索激素性股骨头坏死发生的潜在机制及研究方向.方法:MTT实验检测不同浓度地塞米松和不同质量浓度三七总皂苷对Raw264.7细胞系的毒性作用;抗酒石酸酸性磷酸酶染色和TUNEL染色检测三七总皂苷对破骨细胞抑制和凋亡的影响;从三七总皂苷干预的破骨细胞中提取外泌体,对外泌体进行测序找出差异表达miRNA,通过CytoScape 3.9.1构建并可视化差异表达的miRNA与mRNA间的调控网络;通过GO分析和KEGG分析筛选候选mRNA;最后筛选出铁死亡相关的差异基因,构建铁死亡相关基因的调控网络.结果与结论:①通过MTT实验确定了适合干预Raw264.7细胞的地塞米松浓度(0.1 μmol/L)和三七总皂苷质量浓度(1 736.85 μg/mL);②三七总皂苷对破骨细胞有抑制作用并能促进其凋亡;③从破骨细胞来源外泌体样本中鉴定出20个差异miRNA,通过靶标mRNA预测出11种成骨相关的差异miRNA,并构建了4个上调的差异表达miRNA对应于155个下调的候选mRNA以及7个下调的差异表达miRNA对应于238个上调的候选mRNA的调控网络;④在差异基因中筛选出与铁死亡相关的基因24个,最终构建了12个网络(miR-98-5p/PTGS2,miR-23b-3p/PTGS2,miR-425-5p/TFRC,miR-133a-3p/TFRC,miR-185-5p/TFRC,miR-23b-3p/NFE2L2,miR-23b-3p/LAMP2,miR-98-5p/LAMP2,miR-182-5p/LAMP2,miR-182-5p/TLR4,miR-23b-3p/ZFP36,miR-182-5p/ZFP36).这些结果表明三七总皂苷可能通过调控破骨细胞外泌体来源miRNA的表达来调节成骨细胞铁死亡,为激素性股骨头坏死的机制研究提供新的思路.
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编辑人员丨3周前
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基于生物信息学筛选食管鳞状细胞癌生物标志物
编辑人员丨1个月前
目的 应用生物信息学筛选食管鳞状细胞癌(ESCC)组织中差异表达的microRNA(miRNA)并预测其靶基因,分析生物学功能.方法 收集西南医科大学附属医院2021年6月—2022年2月期间的20对食管鳞状细胞癌癌组织和癌旁正常配对组织标本.通过GEO数据库下载ESCC miRNA表达谱芯片数据,利用R软件limma包进行归一化,筛选差异表达miRNA;利用在线工具Kaplan-meier Plotter对差异表达miRNA进行生存分析.通过qRT-PCR验证与生存率相关的差异miRNA在ESCC组织中的表达;利用TargetScan和miRDB预测靶基因,应用DAVID对靶基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;通过STRING和Cytoscape构建PPI网络鉴定核心基因并构建miRNA-mR-NA网络图;最后利用UALCAN评估核心基因在食管癌中的表达.结果 与癌旁正常组织相比,hsa-miR-93、hsa-miR-130b、hsa-miR-18a、hsa-miR-23b 在 ESCC 组织中表达上调;而 hsa-miR-1、hsa-miR-133b、hsa-miR-378a 在 ESCC 组织中表达下调.其中3种下调miRNA在ESCC组织中的表达较癌旁正常组织有显著差异(P<0.01).核心基因HNRN-PK、HNRNPU、DHX15、MATR3、HNRNPA3在食管癌中的表达明显上调,且与hsa-miR-1密切相关.结论 ESCC癌组织中miRNA存在差异表达,miRNA可能通过作用靶基因间接参与调控相关的生物功能和通路,从而影响ESCC的发生发展.
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编辑人员丨1个月前
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冠心病病人外周血微RNA-133b表达与预后的关系分析
编辑人员丨2024/4/27
目的 探究冠心病病人外周血微RNA-133b(miR-133b)表达水平,并分析其表达与病人预后的关系.方法 选取2019年7月至2021年1月于华北石油管理局总医院就诊的冠心病病人95例,其中稳定性冠心病(SACD)病人54例为SACD组,急性冠状动脉综合征(ACS)41例为ACS组,另选同期该院进行体检的健康人群60例作为对照组.采用实时荧光定量PCR法检测血清miR-133b水平;随访6个月,根据是否出现主要心脏不良事件,分为预后不良组(出现主要心脏不良事件,33例)和预后良好组(未出现主要心脏不良事件,62例).采用Spearman相关性分析检验血清miR-133b水平与Gensini评分的关系;采用多因素logistic回归分析影响冠心病病人预后的危险因素;采用受试者操作特征曲线(ROC曲线)分析血清miR-133b水平对冠心病病人预后不良的预测价值.结果 SACD组、ACS组身体质量指数、高血压、吸烟史及血脂异常者比例高于对照组(P<0.05),ACS组Gensini评分、病变支数≥3支占比高于SACD组(P<0.05).ACS组、SACD组血清miR-133b(1.59±0.15比1.36±0.12比1.02±0.05)水平均高于对照组(P<0.05),ACS组血清miR-133b水平高于SACD组(P<0.05).SACD组病人血清miR-133b水平与Gensini评分呈正相关(r=0.58,P<0.001),ACS组病人血清miR-133b水平与Gensini评分也呈正相关(r=0.57,P<0.001).预后不良组病人Gensini评分、血清miR-133b水平及病变支数≥3支占比高于预后良好组(P<0.05).Gensini评分、病变支数、miR-133b均为影响冠心病病人预后的危险因素(P<0.05).血清miR-133b水平预测冠心病病人预后不良的曲线下面积为0.83,最佳截断值为1.55,灵敏度高达97.0%,特异度为64.5%.结论 冠心病病人血清miR-133b水平升高,对病人的预后不良有一定的预测价值.
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编辑人员丨2024/4/27
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益景汤对早期糖尿病视网膜病变大鼠视网膜miRNA表达的影响
编辑人员丨2024/3/30
目的 探究益景汤对早期糖尿病视网膜病变(DR)大鼠视网膜组织中微小RNA(miRNA)表达的影响,筛选出益景汤干预早期DR的靶点miRNA.方法 将20只2月龄雄性SD大鼠使用链脲佐菌素建立糖尿病大鼠模型,随机分为模型组(MG)和益景汤组(YJG),另将常规喂养的大鼠设为对照组(CG),每组10只.YJG组大鼠每日灌胃益景汤12.50 g/kg,CG、MG组大鼠灌胃等体积0.9%氯化钠注射液,均干预16周.给药完成后记录大鼠体质量,摘除双侧眼球剥离视网膜,提取总RNA,PCR扩增构建小RNA文库,采用高通量测序技术对该文库进行测序.对差异miRNA进行靶基因预测,并对靶基因进行基因本体论(GO)、Pathway分析,选择差异倍数较大的miRNA进行PCR验证.结果 (1)已知miRNA差异:筛选出644个已知miRNA,其中差异miRNA共59个.与CG组比较,MG组35个miRNA上调、6 个miRNA下调,YJG组20个miRNA上调、4个miRNA下调;与MG组比较,YJG组6个miRNA上调、13个miRNA下调,差异均有统计学意义(均P<0.05);其中,1个上调miRNA,11个下调miRNA为益景汤干预DM大鼠后,3组共同差异性表达miRNA.(2)新发现miRNA差异:3组筛选出242个新发现的miRNA,其中差异miRNA共105个.与CG组比较,MG组50个miRNA上调,15个miRNA下调;与CG组比较,YJG组55个miRNA上调,20个miRNA下调;与MG组比较,YJG组16个miRNA上调,6个miRNA下调,差异均有统计学意义(均P<0.05).(3)差异miRNA生物学功能和通路:差异基因主要涉及生物学过程方面的多种蛋白的转录调节;靶基因关联的通路主要是肿瘤相关的信号通路和糖脂代谢相关通路.(4)PCR验证:MG组大鼠视网膜miR-673-3p表达低于CG组,余11个miRNA表达均高于CG组;YJG组大鼠视网膜miR-673-3p、miR-23b-5p表达均高于MG组,余10个miRNA表达均低于MG组,差异均有统计学意义(均P<0.05).除miR-23b-5p外,其余11个miRNA与上述RNA检测结果一致.结论 miR-673、miR-1、miR-133、miR-214、miR-23b、miR-31a、miR-451等可能是益景汤干预早期DR微血管损害的靶点miRNA.
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编辑人员丨2024/3/30
