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Y-Box结合蛋白1/锌指蛋白转录因子5轴对前列腺癌细胞成瘤性的影响及其机制
编辑人员丨1周前
目的:探讨Y-Box结合蛋白1(YB-1)通过调控锌指蛋白转录因子5(KLF5)对前列腺癌细胞成瘤能力的影响。方法:采用对照和YB-1短发卡RNA(shRNA)慢病毒感染感染人前列腺癌细胞株LNCaP,构建对照组和YB-1 KD组细胞,采用细胞计数试剂盒(CCK-8),EdU染色、克隆形成实验和体内移植瘤实验分析两组细胞的增殖和生长能力。采用荧光定量和蛋白质印迹法(Western blot)分析YB-1的靶基因KLF5 mRNA和蛋白表达水平。组间计量数据比较采用 t检验。 结果:对照组细胞吸光度( A)值(2.04±0.11)明显高于YB-1 KD组(1.36±0.11),差异有统计学意义( t=10.930, P<0.05)。对照组细胞EdU阳性率[(85.41±4.13)%]明显高于YB-1 KD组[(63.34±5.70)%],差异有统计学意义( t=7.680, P<0.05)。对照组细胞克隆形成率[(76.72±5.51)%]明显高于YB-1 KD组[(53.30±4.93)%],差异有统计学意义( t=7.759, P<0.05)。对照组体内成瘤体积[(806.90±60.26) mm 3]明显高于YB-1 KD组[(507.39±64.94) mm 3],差异有统计学意义( t=10.690, P<0.05)。对照组成瘤重量[(7.01±0.92) g]明显高于YB-1 KD组[(4.80±0.73) g],差异有统计学意义( t=5.942, P<0.05)。对照组细胞KLF5 mRNA和蛋白表达水平(1.27±0.05、1.08±0.14)明显高于YB-1 KD组(0.56±0.11、0.53±0.09),差异有统计学意义( t=14.100、8.191, P<0.05)。 结论:YB-1蛋白参与前列腺癌细胞的增殖和成瘤效应,主要通过调节KLF5的表达水平来实现。
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编辑人员丨1周前
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TLR9通路激活对原代肾小管上皮细胞转录组的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨Toll样受体9(TLR9)信号通路激活对肾小管细胞转录组的影响。方法:提取并培养小鼠原代肾小管上皮细胞,在细胞融合度达80%时分为两组,分别加入10 μL磷酸盐缓冲液(PBS,PBS对照组)和终浓度为5 μmol/L的TLR9激活剂胞嘧啶-鸟嘌呤寡脱氧核苷酸(CpG-ODN,CpG-ODN处理组)。提取细胞RNA后在Illumina平台进行测序,使用差异基因分析软件DEGseq分析两组细胞中基因的差异表达情况,通过Goatools和KOBAS在线软件分析差异基因所参与的信号通路,应用Homer软件预测转录因子。结果:与PBS对照组相比,CpG-ODN处理后有584个显著的差异表达基因,其中102个基因表达上调,482个表达下调。差异表达基因富集最显著的基因本体(GO)为β-干扰素响应、病毒响应或防御等炎症反应相关条目;京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)信号通路富集结果显示,富集系数最显著的信号通路包括2'-5'-寡腺苷酸合成酶活性、核糖核酸酶活性的调节、病毒生命周期的负调控、β-干扰素响应和对原生动物的防御反应等。转录因子预测结果显示,干扰素调节因子3(IRF3)是差异基因启动子序列上富集最显著的转录因子;IRF3是TLR9下游表达差异最显著的转录因子,转录因子21(TCF21)、锌指蛋白135(ZNF135)和阳性调节域4(PRDM4)等转录因子可能是TLR9信号通路的新候选靶标。结论:CpG-ODN激活TLR9信号通路,原代肾小管上皮细胞能直接响应CpG-ODN的刺激并发生转录组学变化,为进一步探究TLR9信号通路在脓毒症相关性急性肾损伤中的分子机制研究提供了基础。
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编辑人员丨1周前
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锌对小鼠腭突融合期细胞增殖和凋亡的影响及腭裂发生相关Sp家族候选基因研究
编辑人员丨1周前
目的:研究不同浓度锌离子喂养孕鼠对其子代胚胎腭突融合期细胞增殖和细胞凋亡的影响,进一步筛选参与该过程的腭突组织之间锌指蛋白Sp家族相关差异候选基因,探索锌在腭裂发生过程中的作用机制。方法:C57BL/6J雌雄小鼠合笼,将144只孕鼠按随机数字表法分为4组,每组36只,按饲料的锌离子浓度不进行喂养,常锌组含锌30 mg/kg、缺锌组为Flanagan缺锌饲料(0 mg/kg)、低锌组含锌5 mg/kg、富锌组含锌100 mg/kg。HE染色观察ED14.5、ED16.5胎鼠腭部发育状况和形态学变化,PCNA染色观察ED14.5胎鼠腭胚突融合期细胞增殖情况,TUNEL染色观察ED14.5胎鼠腭胚突融合期细胞凋亡情况;通过mRNA表达谱芯片杂交技术,收集富锌组、常锌组、缺锌组腭突组织基因表达情况并相互比较组间差异表达,采用2倍表达差异倍数对差异基因进行筛选并分析锌指蛋白Sp家族基因表达是否有差异,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证差异表达基因。结果:ED14.5时,常锌组、富锌组、低锌组和缺锌组的腭裂发生率分别为8%(3/36)、2%(1/39)、29%(12/41)和39%(15/38)。ED14.5时的HE染色结果显示,常锌组左右腭突均已上抬,相互接触、贯通;缺锌组左右侧腭突仍位于舌体两侧垂直向下最终形成腭裂;低锌组左右侧腭突上抬但并未接触,最终形成腭裂;富锌组与常锌组无明显差异。ED14.5时,常锌组和富锌组的胎鼠腭突增殖细胞阳性率(80.29%±7.39%和87.69%±6.62%)均显著高于缺锌组(56.05%±16.13%)和低锌组(56.22%±9.61%)( t=4.32, P<0.05);缺锌组和低锌组胎鼠腭突细胞凋亡指数(38.80%±3.10%和28.80%±6.19%)均显著高于常锌组(16.80%±1.82%)( t=19.35, P<0.001; t=5.81, P<0.001)。富锌组与缺锌组的2倍差异表达基因为663个,其中表达上调基因为513个,表达下调基因150个,并发现Sp5位于其中。qRT-PCR结果显示,与常锌组(2.22±0.36)相比,缺锌组的腭突组织中Sp5mRNA的表达水平(1.23±0.38)显著升高,富锌组(3.68±0.90)显著降低( P<0.05)。 结论:母鼠孕期缺锌可抑制胚胎腭突间充质细胞增殖,促进细胞凋亡,致使腭突形态变异,上抬动力减弱,且使腭中缝上皮细胞持续存在,最终形成腭裂。缺锌可致子代胚胎融合期Sp5表达升高,富锌对可致子代胚胎融合期Sp5表达下降,推测Sp5在调控缺锌导致腭裂腭突融合的过程中起负性调节作用。
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编辑人员丨1周前
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E3泛素连接酶斑点型锌指结构蛋白调控RLR信号通路抑制肠道病毒71型复制
编辑人员丨1周前
目的:探讨斑点型锌指结构蛋白[speckle-type POZ(pox virus and zinc finger protein) protein, SPOP]在肠道病毒71型(EV71)感染中的作用。方法:免疫共沉淀分析SPOP对EV71非结构蛋白2A蛋白酶(2A pro)泛素化水平的影响,Western blot检测干扰素调节因子3(IRF3)蛋白磷酸化水平,过表达或敲低细胞中SPOP后感染EV71,RT-qPCR分析IFN-β转录水平,RT-qPCR和Western blot检测EV71结构蛋白VP1的转录水平及蛋白质水平。 结果:过表达HA-SPOP后感染EV71,发现EV71感染RD细胞受抑,同时EV71-2A pro的泛素水平呈HA-SPOP梯度依赖增多。转染shSPOP质粒进行内源性SPOP敲低后,黑色素瘤分化相关基因5(MDA5)、接头蛋白线粒体抗病毒信号蛋白(MAVS)、磷酸化干扰素调节因子3 (p-IRF3)水平呈剂量依赖地减少,而转染HA-SPOP质粒后,MDA5、MAVS、p-IRF3蛋白质水平呈剂量依赖地增加。SPOP高、低表达促进或降低EV71感染的细胞表达IFN-β mRNA,同时抑制和增加VP1在mRNA或蛋白质水平表达。 结论:SPOP可提高EV71-2A pro的泛素化水平从而促进2A pro降解,推测SPOP可通过抑制2A pro对视黄酸诱导基因蛋白-Ⅰ(RIG-Ⅰ)样受体(RLR)信号通路中关键分子MAVS和MDA5的降解,从而上调IRF3磷酸化水平促进IFN-β释放,最终活化宿主细胞抗病毒固有免疫抑制EV71复制。
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编辑人员丨1周前
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N6-甲基腺苷修饰与非小细胞肺癌淋巴结转移相关
编辑人员丨1周前
目的:探讨N6-甲基腺苷(m6A)修饰与非小细胞肺癌(NSCLC)淋巴结转移的相关性。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载NSCLC患者的转录组测序数据,共包含1 037例原发肺癌组织样本和108例癌旁组织样本。分析参与m6A修饰过程的调控蛋白在肿瘤组织和癌旁正常组织样本中表达水平的差异,利用加权基因共表达分析(WGCNA)算法识别与m6A调控因子存在共表达关系的信使RNA(mRNA)和非编码RNA(ncRNA)并根据RNA的表达模式对NSCLC患者进行共识聚类。采用 t检验比较聚类亚组间m6A甲基化丰度的差异,采用 χ2检验比较组间淋巴结转移发生率的差异。 结果:共纳入20个m6A调控因子,肿瘤组织中15个调控因子的表达水平显著上调[甲基转移酶样蛋白3(METTL3)、YTH结构域蛋白1(YTHDC1)、YTH结构域结合蛋白1-3(YTHDF1-3)、异质核核糖蛋白A2B1(HNRNPA2B1)和HNRNPC、ALK B同源物5(ALKBH5)等],3个调控因子显著下调[M0ETTL14、含锌指CCCH结构域蛋白13(Zc3h13)、脂肪和肥胖相关蛋白(FTO)],差异有统计学意义( P<0.05),YTHDC2和METTL16差异无统计学意义。通过WGCNA算法识别出454个与调控因子存在共表达关系的mRNAs和400个ncRNAs[325个长链非编码RNAs(lncRNAs)、23个微小RNAs(miRNAs)、28个核仁小RNAs(snoRNAs)、24个核内小RNAs(snRNAs)]。根据854个RNAs的表达模式进行共识聚类,将NSCLC患者分为2个聚类亚组(聚类1和聚类2)。WT1相关蛋白WTAP( t=14.322, P<0.01)和HNRNPC( t=15.424, P<0.01)等11个调控因子的表达水平在聚类1中均显著上调,其他9个调节因子在聚类亚组间差异无统计学意义,聚类1患者具有较高的m6A甲基化丰度。聚类1患者淋巴结转移发生率38.16%(292/765)明显高于聚类2组的22.27%(55/247),差异有统计学意义( χ2=19.487, P<0.01)。 结论:通过m6A甲基化与非小细胞肺癌淋巴结转移的相关分析,有助于探讨肺癌淋巴结转移相关机制。
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编辑人员丨1周前
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人脑胶质瘤组织中锌指样转录因子4的表达及其对肿瘤细胞活性的影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨人脑胶质瘤组织中锌指样转录因子4(KLF4)的表达及其对肿瘤细胞活性的影响。方法:收集2018年3月至2019年5月河南省南阳市第二人民医院收治的74例初发恶性胶质瘤患者术中切除的胶质瘤组织标本,收集同期手术切除的50例良性脑膜瘤组织,以及31例因头部外伤手术切除的正常脑组织。实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测组织中KLF4 mRNA表达水平。选取脑胶质瘤U-87MG细胞,构建KLF4低表达脑胶质瘤细胞模型,分为空白对照组、KLF4-NC组、KLF4-siRNA组。MTS细胞增殖检测试剂盒检测细胞增殖能力,蛋白质印迹法检测E-钙黏蛋白、波形蛋白、紧密连接蛋白1(ZO-1)表达水平。结果:低级别胶质瘤、良性脑膜瘤、正常脑组织中KLF4 mRNA相对表达量分别为0.26±0.04、0.13±0.02、0.11±0.02,均低于高级别胶质瘤的0.34±0.06,差异均有统计学意义( t值分别为8.381、15.720、15.984,均 P<0.05);良性脑膜瘤、正常脑组织中KLF4 mRNA相对表达量低于低级别胶质瘤,差异均有统计学意义( t值分别为13.771、14.239,均 P<0.05)。细胞培养各时间点,KLF4-siRNA组U-87MG细胞增殖能力均低于空白对照组和KLF4-NC组,差异均有统计学意义(均 P<0.05);空白对照组与KLF4-NC组U-87MG细胞增殖能力之间差异无统计学意义( P>0.05)。KLF4-siRNA组E-钙黏蛋白、ZO-1蛋白相对表达量分别为0.82±0.10、0.79±0.11,均高于空白对照组的0.24±0.08、0.39±0.05和KLF4-NC组的0.26±0.05、0.42±0.09,差异均有统计学意义(均 P<0.01);KLF4-siRNA组波形蛋白相对表达量为0.31±0.08,低于空白对照组的0.90±0.08和KLF4-NC组的0.92±0.05,差异均有统计学意义(均 P<0.01);空白对照组与KLF4-NC组间E-钙黏蛋白、波形蛋白、ZO-1蛋白表达水平差异均无统计学意义(均 P>0.05)。 结论:人脑胶质瘤组织,尤其高级别胶质瘤中KLF4表达水平升高。下调KLF4表达可能抑制胶质瘤细胞增殖和上皮间质转化的发生,降低细胞活性。
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编辑人员丨1周前
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红藤方从Hippo/YAP通路抑制子宫腺肌症纤维化的机制研究
编辑人员丨1周前
目的:通过观察红藤方对子宫腺肌症(ADS)小鼠子宫组织上皮细胞间充质转化(EMT)、成纤维细胞向肌成纤维细胞转化(FMT)及Hippo通路中关键蛋白的影响,探讨红藤方抑制ADS纤维化的作用机制。方法:将小鼠按随机数字表法分为空白组、模型组、红藤方组、维替泊芬组,每组8只。小鼠出生当日为第0天,从第1天开始,模型组、红藤方组、维替泊芬组小鼠灌胃1 mg/kg他莫昔芬溶剂,连续给药 5 d。造模后第42天,经HE染色验证造模成功。第43天开始,红藤方组小鼠每日灌胃红藤方水煎液16.5 g/kg,每3日腹腔注射0.9%NaCl溶液(100 μl/10 g);维替泊芬组小鼠每3日腹腔注射维替泊芬溶液100 mg/kg,同时每日灌胃蒸馏水100 μl/10 g;空白组及模型组小鼠每日灌胃等体积蒸馏水及每3日腹腔注射等体积0.9%NaCl溶液,共给药60 d。采用Masson染色法评估各组小鼠子宫组织纤维化程度;采用免疫组化染色及Western blot法检测各组小鼠子宫组织中E-钙黏附蛋白(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、Yes相关蛋白(YAP)、锌指转录因子(Snail)表达情况。结果:与模型组比较,红藤方组Masson染色蓝染面积与总染色面积比值降低( P<0.05);免疫组化和Western blot检测显示,与模型组比较,红藤方组小鼠子宫组织E-cadherin表达升高( P<0.05),Vimentin、α-SMA、YAP表达降低( P<0.01或 P<0.05)。 结论:红藤方可抑制ADS发生EMT、FMT,从而抑制纤维化,其作用机制与调控Hipoo/YAP通路相关。
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编辑人员丨1周前
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锌指蛋白580过表达对氧糖剥夺SH-SY5Y细胞凋亡的影响及可能机制
编辑人员丨1周前
目的:探讨锌指蛋白580(zinc finger protein 580,ZNF580)在SH-SY5Y细胞系氧糖剥夺(oxygen-glucose deprivation,OGD)模型中的表达情况及其过表达对缺氧缺血神经元凋亡的影响及可能机制。方法:研究分两部分:(1)培养人神经母细胞瘤SH-SY5Y细胞系,分为模型组和对照组,模型组建立OGD模型(95% N 2、5% CO 2、0.1% O 2的三气培养箱37 ℃恒温培养6 h),并于OGD后6、12和24 h提取蛋白,利用蛋白质印迹技术定量检测ZNF580的表达情况。(2)慢病毒转染过表达ZNF580对细胞凋亡及半胱氨酸蛋白酶3的活化形式(cleaved caspase-3)表达的影响:取对照组和模型组OGD后24 h的细胞。过表达组细胞首先通过慢病毒转染技术构建过表达ZNF580细胞,再行OGD处理。采用流式细胞技术检测各组细胞凋亡率,采用蛋白质印迹技术检测cleaved caspase-3的表达。采用两独立样本 t检验、单因素方差分析及LSD- t两两比较进行统计学分析。 结果:(1)与对照组(1.00)相比,模型组OGD后6、12及24 h ZNF580相对表达量分别为1.36±0.05、2.12±0.07和1.69±0.05,均显著升高(LSD- t值分别为9.20、28.26和19.21, P值均<0.001)。(2)对照组、模型组、过表达组细胞凋亡率分别为(1.07±0.56)%、(21.51±1.65)%和(3.42±0.93)%,cleaved caspase-3相对表达量分别为1.00、2.47±0.59和1.70±0.25。与对照组相比,模型组的细胞凋亡率及cleaved caspase-3相对表达量升高(LSD- t值分别为21.98和8.17, P值均为0.001);与模型组相比,过表达组的细胞凋亡率及cleaved caspase-3相对表达量降低(LSD- t=19.45, P=0.001;LSD- t=4.28, P=0.005)。 结论:缺氧缺血可导致ZNF580过表达,ZNF580过表达可能通过抑制cleaved caspase-3表达从而影响其酶解活化来减轻缺氧缺血神经元的凋亡。
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编辑人员丨1周前
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核转运蛋白a2和锌指转录因子Snail在结直肠癌组织中表达的临床价值
编辑人员丨1周前
目的:探讨核转运蛋白a2(KPNA2)和锌指转录因子Snail在结直肠癌组织中的表达其临床价值。方法:选择广东医科大学附属医院2020年5月至2023年5月病理学确诊的123例结直肠癌组织标本及其癌旁组织标本,应用免疫组织化学法检测上述组织中KPNA2和Snail的表达,采用 χ2检验分析两者表达与结直肠癌临床病理因素的关系。 结果:结直肠癌组织中KPNA2表达率为69.11%(85/123),明显高于癌旁组织中KPNA2表达率22.76%(28/123),差异有统计学意义( χ2=53.181, P<0.01)。KPNA2表达水平与结直肠癌患者淋巴结转移、组织学分化程度、TNM分期明显相关( χ2=5.198、6.096、6.691, P<0.05),KPNA2表达水平与结直肠癌患者性别、年龄、肿瘤部位、浸润深度无明显相关( χ2=0.152、0.033、0.028、0.003, P>0.05)。结直肠癌组织中Snail表达率为64.23%(79/123),明显高于癌旁组织中Snail表达率17.89%(22/123),差异有统计学意义( χ2=54.575, P<0.01)。Snail表达水平与结直肠癌患者浸润深度、淋巴结转移、TNM分期明显相关( χ2=4.513、5.192、5.811, P<0.05),Snail表达水平与结直肠癌患者组织学分化程度、性别、年龄、肿瘤部位无明显相关( χ2=0.015、0.030、0.226、0.022, P>0.05)。 结论:结直肠癌组织中KPNA2和Snail的表达均升高,进行KPNA2和Snail检测可判断结直肠癌患者病情及预测结直肠癌患者的预后。
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编辑人员丨1周前
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长链非编码RNA POU3F3在黑色素瘤中的表达及其与转移的关系
编辑人员丨1周前
目的:探讨长链非编码RNA(lncRNA) POU3F3在黑色素瘤中的表达变化,以及lncRNA POU3F3与黑色素瘤转移的关系。方法:选取来郑州大学第一附属医院2022年1月至2023年5月收治并接受手术治疗的47例患者的临床样本作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)技术分析黑色素瘤和癌旁组织lncRNA POU3F3的表达水平,并采用免疫组织化学分析肿瘤组织和癌旁组织中黏着斑激酶(FAK)、β-连环蛋白(β-catenin)、N-钙黏蛋白(N-Cadherin)和锌指转录因子Snail蛋白的表达水平。相关性分析lncRNA POU3F3和转移相关蛋白水平的关系。采用Transwell分析lncRNA POU3F3敲降对细胞迁移和侵袭的影响。组间计量数据比较采用 t检验。相关性分析采用皮尔森分析。 结果:癌旁组织中lncRNA POU3F3表达水平(1.23±0.18)明显低于黑色素瘤组织表达水平(2.31±0.19),差异有统计学意义( t=27.890, P<0.05)。癌旁组织中FAK和β-catenin表达水平(58.98±11.11、73.38±12.26)明显低于黑色素瘤组织(96.28±11.74、129.60±14.61),差异有统计学意义( t=16.660、20.200, P<0.05)。癌旁组织中N-Cadherin和Snail表达水平(45.83±13.49、55.47±7.35)明显低于黑色素瘤组织(82.17±21.99、93.47±11.70),差异有统计学意义( t=8.846、18.860, P<0.05)。lncRNA POU3F3表达水平与FAK、β-catenin、N-Cadherin和Snail表达水平呈正相关(r=0.587、0.671、0.814、0.344, P<0.05)。lncRNA POU3F3敲降细胞迁移和侵袭数量[(45.75±9.19)、(36.13±8.76)个]明显低于对照组细胞[(92.50±5.04)、(66.13±9.51)个],差异有统计学意义( t=12.610,6.564, P<0.05)。 结论:lncRNA POU3F3在黑色素瘤组织中表达显著上调,并与肿瘤组织中转移相关蛋白FAK、β-catenin、N-Cadherin和Snail表达呈正相关。敲降lncRNA POU3F3可显著抑制黑色素瘤细胞的转移特性。
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编辑人员丨1周前
