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沉默FAM83D基因调控上皮-间质转化对食管鳞癌放射敏感性影响
编辑人员丨1周前
目的:探讨沉默FAM83D对X线照射后食管鳞状细胞癌(ESCC)细胞增殖、存活能力及侵袭、迁移能力的影响及机制。方法:采用免疫组化法检测69例ESCC患者组织中FAM83D、E-cadherin、vimentin的表达。免疫印迹法检测ECA109、KYSE30细胞FAM83D基因沉默效果。MTS、克隆形成实验和Transwell方法检测ECA109、KYSE30细胞增殖活性、存活能力及侵袭能力。流式细胞术和免疫印迹法检测ECA109、KYSE30细胞凋亡分布、上皮-间质转化(EMT)及凋亡相关蛋白表达。结果:ESCC组织中55%(38/69) FAM83D强表达,36%(25/69) E-cadherin强表达,61%(42/69) vimentin强表达;FAM83D强表达与E-cadherin强表达呈负相关( r=-0.350, P<0.01),与vimentin强表达呈正相关( r=0.470, P<0.01)。ECA109、KYSE30细胞沉默FAM83D后降低了FAM83D蛋白表达( P<0.01)。MTS和克隆形成实验数据显示照射后沉默FAM83D显著抑制了ECA109、KYSE30细胞增殖水平( P<0.05)、增加了放射敏感性( P<0.01)。照射后FAM83D shRNA组ECA109、KYSE30细胞侵袭力降低( P<0.01)、E-cadherin表达增加,而N-cadherin、vimentin、Snail、p-Akt、p-GSK-3β表达降低( P<0.01)。照射后FAM83D shRNA组ECA109、KYSE30细胞凋亡率明显增加( P<0.01),同时Bcl-2、Mcl-1表达下调,Cleaved caspase-3的表达上调( P<0.01)。 结论:FAM83D与ESCC的侵袭发展密切相关。沉默ECA109、KYSE30细胞FAM83D表达联合X线照射降低了其增殖、侵袭和存活能力,诱导了细胞凋亡,增加了放射敏感性,该作用可能通过Snail/Akt/GSK-3β信号途径来调控EMT。
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编辑人员丨1周前
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肺腺癌组织中FAM83A的表达
编辑人员丨2023/8/6
目的:探讨FAM83A在肺腺癌组织中的表达及临床意义.方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载癌旁正常及肺腺癌组织中FAM83A mRNA表达的数据及其相关的临床资料.根据FAM83A mRNA表达量将肺腺癌患者分为FAM83A mRNA低表达组与高表达组,分析FAM83A mRNA的表达与患者临床病理特征的关系.结果:肺腺癌组FAM83A mRNA的表达高于癌旁正常对照组(P=0.001).FAM83A mRNA的表达量与肺腺癌患者的临床分期、TNM分期中的T分期和N分期有关(P均<0.05).FAM83A mRNA低表达组的中位生存时间为1622 d,高于高表达组(1357 d)(P=0.001).结论:肺腺癌组织中FAM83A mRNA的表达升高;FAM83A mRNA高表达及临床分期较晚与肺腺癌预后不良有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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miR-495通过靶向FAM83D抑制结肠癌细胞的增殖和迁移
编辑人员丨2023/8/6
目的 探讨miR-495通过靶向FAM83D抑制结肠癌细胞的增殖和迁移行为及其作用机制.方法 qPCR检测结肠癌和癌旁正常组织、不同结肠癌细胞株中miR-495的表达情况;CCK-8细胞增殖实验检测miR-495对结肠癌细胞增殖能力的影响;流式细胞术实验检测miR-495对结肠癌细胞周期的影响;双荧光素酶报告基因检测miR-495与FAM83D的相互作用;Transwell侵袭实验检测miR-495对结肠癌细胞侵袭能力的影响.结果 与癌旁正常组织相比,结肠癌组织中miR-495表达明显增高;结肠癌细胞HT29中miR-495的表达水平最高;抑制miR-495的表达后结肠癌细胞增殖能力减弱,促进其凋亡行为;miR-495能与FAM83D的3'UTR特异性结合,调控FAM83D的表达活性;抑制miR-495的表达后,HT29细胞的侵袭能力受到相应的抑制.结论 miR-495在结肠癌的发生发展过程中起重要作用,可以通过靶向调节FAM83D的表达影响结肠癌细胞的增殖和迁移.
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编辑人员丨2023/8/6
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FAM83D inhibits autophagy and promotes proliferation and invasion of ovarian cancer cells via PI3K/AKT/mTOR pathway
编辑人员丨2023/8/6
Ovarian cancer is one of the most lethal malignant tumors in women.The family with sequence similarity 83,member D (FAM83D) plays an important role in several cancers,but its function and underlying mechanism in ovarian cancer remain unknown.To investigate the role of FAM83D in ovarian cancer,the expression of FAM83D was determined by immunohistochemistry in tissue microarray slide.Cellular proliferation and invasion were detected by 5-Ethynyl-2'-deoxyuridine assays and transwell invasion assays.The correlations between FAM83D and autophagy were detected by western blot analysis and confocal microscopy.Western blot analysis was used to identify the protein expression of FAM83D,phosphoinositide 3-kinase (PI3K),protein kinase B (AKT),mammalian target of rapamycin (mTOR) and Sequestosome 1 (P62).Tumorigenesis in nude mice was used to explore the function of FAM83D in vivo.We found high expression level of FAM83D in ovarian cancer tissues as compared to the normal ovarian tissues.Knockdown of FAM83D in SKOV3 cells enhanced autophagy and inhibited the proliferation and invasion in vitro,whereas ectopic expression of FAM83D in A2780 cells exerted an opposite effect.Mechanistically,overexpression of FAM83D activated the PI3K/AKT/mTOR pathway,and Torin1 could suppress FAM83D-induced cell proliferation and invasion.In vivo,overexpression FAM83D promoted tumor growth.Overall,FAM83D promoted ovarian cancer cell invasion and proliferation,while inhibited autophagy via the PI3K/AKT/mTOR signaling pathway.Our results suggest that FAM83D may be a candidate oncogene in ovarian cancer,which provides a fresh perspective of FAM83D in ovarian cancer.
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编辑人员丨2023/8/6
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7-lncRNA风险评估模型在胰腺癌预后判断中的价值
编辑人员丨2023/8/5
目的:筛选胰腺癌预后相关长链非编码RNA(lncRNA),构建预后风险评估模型.方法:下载TCGA数据库中胰腺癌数据,使用R语言分析差异表达的lncRNA分子.通过单因素Cox回归和Lasso回归分析胰腺癌预后相关lncRNA分子,采用多因素Cox回归构建预后风险评估模型,并应用Ka-plan-Meier(K-M)生存分析、受试者操作特征(ROC)曲线进行效能评价.结果:以|log2 Fold Change|>2,错误发现率(FDR)<0.05为筛选标准,发现179个lncRNA分子在胰腺癌中呈差异表达,对其中高表达的117个lncRNA进行单因素Cox回归与Lasso回归分析,得到7个与预后相关的lncRNA.通过多因素Cox回归建立预后风险评分模型,风险评分=1.4231×AL161431.1+1.3457×ANLN+1.4731×FAM83A+1.4721×LAMA3+1.2198×LY6D+×1.1515×MYEOV+1.1825×TINAG.K-M分析显示高风险组的总生存时间较短,训练集、验证集和总体数据集ROC曲线显示3年生存率的曲线下面积分别为0.859、0.878和0.886.结论:通过生物信息学分析,成功构建了包括AL161431.1、ANLN、FAM83A、LAMA3、LY6D、MYEOV和TINAG的胰腺癌7-lncRNA预后模型,能够对患者生存状态进行有效预测.
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编辑人员丨2023/8/5
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基于TCGA数据库分析肝细胞肝癌组织中HMMR表达与患者临床特征及预后的相关性
编辑人员丨2023/8/5
目的:研究透明质酸介导的运动受体(hyaluronan-mediated motility receptor,HMMR)的表达与肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的发生发展以及预后的关系.方法:在本研究中,我们通过从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载HCC有关的数据进行生物信息学分析,探讨HMMR表达在HCC发生、发展和预后中的价值.根据HMMR mRNA表达的中位值将患者分为两组(HMMR高表达组和HMMR低表达组),应用Kruskal-Wallis检验和Logistic回归分析HMMR表达与患者临床特征之间的关系,利用Kaplan-Meier和Cox分析观察HMMR表达对HCC患者生存的影响,并进行PPI蛋白互作网络、GO富集和KEGG通路分析.最后通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)验证HMMR mRNA在HCC组织样本中的表达.结果:HCC组织中HMMR的高表达与组织学分级(G3 vs G1,OR=2.675)、癌组织阶段(ⅢvsⅠ,OR=2.509)、T分期(T4 vs T1,OR=3.568)相关(P均<0.05).Kaplan-Meier生存分析显示,HMMR高表达的HCC预后比HMMR低表达的患者差(P=6.858E-05).Cox分析显示HMMR高表达是总体生存(overall survival,OS)的危险因素(HR:1.166,95%CI:1.027~1.324,P=0.018).PPI蛋白互作、GO富集和KEGG通路分析鉴定了与HMMR存在相互作用的10个基因,分别为:FAM83D、CD44、TPX2、PLK4、AURKA、PLK1、NEK2、CDK1、BUB1及DLGAP5,它们主要富集在有丝分裂细胞周期相变的调控、细胞周期过程、ECM-受体相互作用、FoxO信号通路、EB病毒感染等.qRT-PCR结果显示,HMMR mRNA在HCC癌组织中高表达(P<0.05).结论:HMMR mRNA的高表达与HCC的发生发展密切相关,是HCC预后不良的独立危险因素.
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编辑人员丨2023/8/5
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miR-206靶向FAM83A影响Wnt/β-catenin通路调控胰腺癌放疗敏感性
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究microRNA-206(miR-206)对胰腺癌细胞放疗敏感性的影响.方法 通过2 Gy照射胰腺癌细胞(AsPC-1、Capan-2、PL45、PANC-1),以人类正常胰腺上皮细胞(HPNE)作为对照,荧光定量聚合酶链反应(qPCR)实验观察细胞中miR-206的表达量;细胞克隆实验检测过表达miR-206对PANC-1细胞存活率的影响,流式细胞术分析其凋亡率;在线软件Targetscan预测miR-206的靶基因,双荧光素酶报告基因验证miR-206与序列相似性家族83成员(FAM83)A的靶向关系;过表达/敲低miR-206对FAM83A蛋白水平的影响;Western印迹检测共转染过表达miR-206和FAM83A对FAM83A蛋白及β-catenin、细胞周期蛋白(Cyclin)D1蛋白水平的影响.结果 miR-206在放射照射的胰腺癌多种细胞系中表达量显著降低(P<0.05);过表达miR-206显著促进其凋亡(P<0.05);FAM83A是miR-206的直接靶基因;miR-206可负反馈调节FAM83A表达量;共转染过表达miR-206和FAM83A可显著逆转miR-206对FAM83A蛋白水平的抑制作用,恢复其对PANC-1细胞存活分数的抑制、凋亡促进作用,改善miR-206对Wnt/β-catenin信号通路的抑制作用.结论 miR-206靶向抑制FAM83A表达影响Wnt/β-catenin信号通路的活性,从而介导胰腺癌PANC-1细胞的放疗敏感性.
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编辑人员丨2023/8/5
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Lnc⁃FAM83D⁃3通过miR⁃504⁃3p-FAM83D轴调控三阴性乳腺癌的机制研究
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨长链非编码RNA FAM83D?3(lnc?FAM83D?3)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的表达及其对HCC1937、MDA?MB?231生物学行为的影响及作用机制.方法 通过TCGA数据库分析lnc?FAM83D?3在乳腺癌中的表达情况及病理相关性.RT?qPCR检测lnc?FAM83D?3和微小RNA?504?3p(miR?504?3p)在组织标本和乳腺癌细胞系中的表达;慢病毒转染干扰lnc?FAM83D?3表达,利用MTT、细胞划痕实验、侵袭实验和流式细胞术检测实验组与对照组细胞功能改变.使用生物信息学软件和双荧光素酶报告基因实验分析lnc?FAM83D?3和miR?504?3p及FAM83D之间的关系.FISH实验证实lnc?FAM83D?3在胞浆内的表达,Western bolt检测下游蛋白变化情况.结果 在乳腺癌组织、癌细胞HCC1937和MDA?MB?231中lnc?FAM83D?3的表达增加(P<0.01).与对照组相比,干扰lnc?FAM83D?3表达后,TNBC细胞株增殖、迁移和侵袭能力降低,凋亡比例增加;miR?504?3p表达上升,FAM83D表达下降;双荧光素酶报告基因实验结果显示lnc?FAM83D?3靶向调控miR?504?3p表达,miR?504?3p进一步负向调控FAM83D的水平.结论 Lnc?FAM83D?3在TNBC细胞株中表达增加且通过抑制miR?504?3p促进FAM83D表达,影响乳腺癌恶性生物学行为.
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编辑人员丨2023/8/5
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FAM83D在胰腺癌中的表达及临床意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 探讨FAM83D在胰腺腺癌(PAAD)组织中的表达及临床意义.方法 基因表达谱动态分析(GEPIA)工具在线分析FAM83D基因表达及预后,KMplot数据库进行验证;选择2018年1月至2019年12月皖南医学院附属弋矶山医院病理科PAAD术后组织蜡块60对,包括癌组织和癌旁组织,使用免疫组织化学染色(IHC)检测FAM83D蛋白的表达;FAM83D作用机制使用基因集富集分析.结果 与正常组织比较,肿瘤组织中FAM83D mRNA表达明显升高(P<0.01).与癌旁组织比较,癌组织IHC评分显著增高(P<0.01).PAAD患者FAM83D蛋白高表达与淋巴结转移有关(P<0.05).与FAM83D mRNA低表达组比较,FAM83D mRNA高表达组总生存期、无进展生存期明显缩短(P<0.01).FAM83D上调与多个基因集呈正相关(P<0.05).结论 FAM83D在PAAD发生发展中具有重要作用,可望成为潜在治疗靶点和新型分子标志物.
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编辑人员丨2023/8/5
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FAM83D在卵巢癌中的表达及其临床意义
编辑人员丨2023/8/5
目的 探究卵巢癌中FAM83D的表达与临床病理特征及预后的关系.方法 用免疫组化的方法检测72例卵巢恶性肿瘤、20例卵巢交界性肿瘤和17例卵巢组织中FAM83D蛋白表达水平,分析其与卵巢癌临床病理特征(年龄、肿瘤大小、临床分期及病理学分型)之间的关系.使用生物信息学方法对FAM83D进行预后和生物学功能富集分析.结果 与正常组织相比,卵巢癌中FAM83D在转录及翻译水平均有显著提高,并且与肿瘤临床分期密切相关(P<0.05);与FAM83D低表达患者相比,FAM83D高表患者的生存时间明显缩短(P<0.05);FAM83D高表达可作为卵巢癌患者预后不良的独立预测因素;功能富集分析显示,FAM83D参与P53信号通路、细胞周期及DNA复制等癌症相关生物学过程.结论 FAM83D在卵巢癌中表达增高与临床分期呈正相关,且可作为卵巢癌预后不良的独立危险预测分子.
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编辑人员丨2023/8/5
