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外周血单个核细胞中mRNA表达与类风湿关节炎活动度的相关性研究
编辑人员丨1周前
目的:以28个关节疾病活动度评分(disease activity score in 28 joints,DAS28)为基础对不同活动度群组的类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)病人和健康人群进行分析,挑选出RA活动度相关基因,为RA的诊断治疗提供新思路与线索。方法:收集苏州大学附属第一医院风湿免疫科门诊28个不同活动度的RA病人和18个健康人的基本信息并对它们外周血单个核细胞中mRNA水平进行检测,通过生物信息学分析寻找活动度相关基因。结果:筛选出80个单纯与RA活动度相关的基因,36个与RA活动度和发病都有关系的基因。在这些基因中,12个单纯与活动度相关的基因( SOCS3、 C12 orf44、 KIFC1、 MRPS18 A、 GYG1、 RAB35、 B4 GALT5、 LRRC41、 LILRB4、 LILRA5、 CR1、 PDIA6)与DAS28显著相关( r值分别为0.55、0.53、0.52、0.49、0.44、0.42、0.42、0.41、0.41、0.41、0.40、0.39, P值均<0.05)且呈趋势性下降,与发病和活动度都与相关基因 PPIH与DAS28显著相关( r=-0.38, P<0.05)且呈趋势性上升。生物功能聚类发现有四项功能和甲基化相关,一项功能和应激反应相关。蛋白质关联分析显示 HIST1 H3 E、 HIST1 H4 I、 HIST1 H4 F、 HIST1 H3 D和 HIST1 H3 F这五个基因不仅出现在与甲基化相关的功能中,而且在实验、文本挖掘和共表达三个方面都存在相互关系。 结论:以DAS28为基础挑选出80个单纯与RA活动度相关的基因,功能分析表明他们大多受到甲基化调控作用,部分与免疫应激反应有关。
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编辑人员丨1周前
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驱动蛋白家族成员C1在三阴性乳腺癌中的作用机制
编辑人员丨1周前
目的:探究驱动蛋白家族成员C1(KIFC1)在三阴性乳腺癌(TNBC)中的功能和作用。方法:通过生物信息学的方法分析KIFC1在TNBC组织及癌旁正常组织中的mRNA水平,并分析其表达与患者的生存率间的关系。回顾性分析96例TNBC患者的临床病理特征资料。用免疫组织化学的方法检测肿瘤组织和癌旁正常组织中KIFC1的表达,分析TNBC患者的KIFC1表达及与临床病理特征的关系。结果:生物信息学分析结果显示,TNBC组织中KIFC1高表达且与患者的无病生存期相关( P<0.05)。在TNBC组织中,KIF23阳性高表达率为58.3%,而在癌旁组织中主要是低表达或无表达。KIF23的高表达与TNBC患者的肿瘤分级相关( P<0.05)。体外细胞实验结果表明,敲低KIFC1可显著降低TNBC细胞的集落形成能力和增殖能力。小鼠体内实验结果表明,敲低KIFC1可显著降低肿瘤体积。 结论:KIFC1可作为TNBC的预后因子,低表达KIFC1可在体内外抑制TNBC细胞的增殖。KIFC1有望作为TNBC的预后标志物和治疗靶点。
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编辑人员丨1周前
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PD-1抑制剂联合安罗替尼治疗二线化疗失败的老年晚期非小细胞肺癌的效果
编辑人员丨2024/4/27
目的 探究程序性死亡受体1(PD-1)抑制剂联合安罗替尼治疗二线化疗失败的老年晚期非小细胞肺癌(NSCLC)的临床疗效.方法 选取2019年1月—2021年4月泰州市第二人民医院收治的106例二线化疗失败的老年晚期NSCLC患者作为研究对象,按照随机数字表法分为单药组和联合组,各53例.单药组采用安罗替尼治疗,联合组采用PD-1抑制剂联合安罗替尼治疗.比较两组的疾病控制率、毒副反应发生情况、生存率、肿瘤标志物[细胞角蛋白19片段抗原21-1(CYFRA21-1)、癌胚抗原(CEA)、糖类抗原125(CA125)]、血管新生指标[血管内皮生长因子(VEGF)-A、VEGF受体2(VEGFR2)]、血清驱动蛋白超家族蛋白(KIF)C1、N-钙黏蛋白、生活质量核心量表(QLQ-C30)评分.结果 联合组疾病控制率高于单药组(P<0.05);治疗2个周期后,联合组血清CYFRA21-1、CA125、CEA、VEGF-A、VEGFR2、KIFC1 及 N-钙黏蛋 白水平均低于单药组(P<0.05),QLQ-C30评分低于单药组(P<0.05);两组各毒副反应总发生率比较,差异均无统计学意义(P>0.05);Kaplan-Meier生存分析显示,联合组累积生存率高于单药组(P<0.05).结论 PD-1抑制剂联合安罗替尼治疗二线化疗失败的老年晚期NSCLC效果显著,可有效调节血清KIFC1、N-钙黏蛋白表达,抑制VEGF-A、VEGFR2水平,降低肿瘤标志物水平,提高生活质量,延长生存时间,安全性高.
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编辑人员丨2024/4/27
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子宫内膜样癌中KIFC1的表达及临床意义
编辑人员丨2024/4/27
目的 探讨驱动蛋白家族成员C1(KIFC1)在子宫内膜样癌中的表达与其临床病理特征和患者预后的相关性.方法 采用免疫组化SP法检测30例癌旁正常子宫内膜组织和95例子宫内膜样癌组织中KIFC1的表达;应用qRT-PCR和Western blot法检测30对新鲜癌组织和相邻非癌组织中KIFC1 mRNA和蛋白表达;利用TCGA数据库分析KIFC1的表达与子宫内膜样癌患者生存期的关系;分析其临床病理特征并复习相关文献.结果 KIFC1在子宫内膜样癌组织中的阳性率(61.05%)显著高于癌旁正常子宫内膜组织(13.33%),差异有统计学意义(P<0.05);KIFC1表达与子宫内膜样癌肌层浸润深度、FIGO分期和淋巴结转移均相关(P均<0.05).qRT-PCR结果显示,子宫内膜样癌中KIFC1 mRNA相对表达量(2.99±0.59)显著高于癌旁正常子宫内膜组织(1.00±0.29,P<0.05).Western blot结果显示,子宫内膜样癌中KIFC1蛋白相对表达量(1.70± 0.36)显著高于癌旁正常子宫内膜组织(0.72±0.17,P<0.05).生存分析发现,子宫内膜样癌中 KIFC1阳性患者生存期明显低于阴性患者(P<0.05).结论 KIFC1在子宫内膜样癌中表达上调与患者不良预后相关,提示其可能成为子宫内膜样癌潜在的治疗靶点和预后评估指标.
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编辑人员丨2024/4/27
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CRISPR/Cas9介导的KIFC1基因敲除对宫颈癌细胞增殖及凋亡的影响
编辑人员丨2023/12/30
目的 探讨KIFC1基因在宫颈癌细胞中的功能及对宫颈癌HeLa细胞增殖的影响.方法 设计靶向KIFC1基因的sgRNAs并基于pSpCas9(BB)-2A-GFP载体构建重组质粒,共转染至HeLa细胞.通过流式细胞分选、有限稀释和测序验证筛选单克隆敲除细胞株.采用RT-qPCR、Western blot和免疫荧光法检测敲除细胞的KIFC1转录及蛋白表达水平,利用相差显微成像、荧光共聚焦显微成像观察细胞核、微管骨架等细胞表型.通过生长曲线绘制、EdU标记、吖啶橙染色分析细胞增殖、细胞周期及细胞凋亡情况.结论 KIFC1基因缺失影响HeLa细胞微管骨架的组装并形成异常延伸和细胞分裂,进而导致细胞核形态异常、染色质丢失、细胞周期停滞、凋亡增加.
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编辑人员丨2023/12/30
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LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿外周血单个核细胞基因表达谱的RNA-Seq分析
编辑人员丨2023/8/6
目的:分析LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿外周血单个核细胞基因表达谱的转录组测序(RNA-seq)结果.方法:将3例LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿作为病例组,1例正常儿童为对照组,应用RNA-seq技术对两组外周血单个核细胞进行全转录组测序,分析差异表达基因,并对这些差异基因进行GO功能和Pathway显著性富集分析.结果:病例组与对照组差异表达基因共有135个,其中下调91个,上调44个.差异基因功能涉及DNA复制、能量代谢、信号转导、炎症等方面,其中MCM、GINS2、CDC45与DNA复制有关;IL-8、FOS、CXCR2等与炎症有关;TOP2A、ABCG1、KIF4A、KIF2C、KIF20A、KIF14、KIF11、KIF18B、KIFC1、KIF15等与细胞能量代谢有关;BUB1、AURKB、BUB1B、PKMYT1、MELK与蛋白激酶活性有关.GO功能显著性富集分析结果显示:差异基因的功能主要包括生物学行为调控、细胞组分形成及分子功能,集中表现在生物学过程部分行为的调控.Pathway显著性富集分析10条具有显著性差异的通路,其中细胞周期及细胞衰老通路明显富集.结论:调控细胞周期的相关基因的表达量改变可能参与LMNA基因R527C纯合突变早老症患儿疾病的发生和发展.
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编辑人员丨2023/8/6
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miR-105靶向负调控KIFC1抑制非小细胞肺癌细胞增殖、迁移和侵袭能力
编辑人员丨2023/8/6
目的:研究微小RNA-105(miR-105)对非小细胞肺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响,并探讨其机制.方法:运用RT-qPCR法检测非小细胞肺癌组织及癌旁组织和细胞中miR-105和驱动蛋白家族成员C1(KIFC1)mRNA的表达;用Western blot检测非小细胞肺癌组织及癌旁正常组织和细胞中KIFC1蛋白的表达.将细胞分为miR-105组(转染miR-105 mimics)、miR-NC组(转染mimics阴性对照序列)、inhibitor-NC组(转染inhibitor阴性对照序列)、inhibitor-miR-105组(转染miR-105 inhibitor)、si-NC组(转染阴性对照siRNA)、si-KIFC1组(转染KIFC1 siRNA)、miR-105+vector组(miR-105 mimics和pcDNA 3.1共转染)和miR-105+KIFC1组(miR-105 mimics和pcDNA 3.1-KIFC1共转染),均以脂质体法转染至非小细胞肺癌H460细胞;MTT法检测各组细胞活力;Transwell法检测各组细胞的迁移和侵袭能力;双萤光素酶报告基因检测实验检测各组细胞萤光素酶相对活性.结果:与癌旁组织相比,非小细胞肺癌组织中的miR-105表达显著降低,KIFC1的表达显著升高(P<0.05);与人正常胚肺成纤维细胞MRC-5相比,H460细胞中的miR-105表达显著降低,KIFC1的表达显著升高(P<0.05);miR-105可降低野生型KIFC1的H460细胞萤光素酶相对活性,且负向调控KIFC1的蛋白表达.过表达miR-105或敲减KIFC1表达均可显著抑制H460细胞的增殖、迁移和侵袭能力,且过表达KIFC1可逆转miR-105对细胞活力、迁移和侵袭能力的抑制作用.结论:miR-105可抑制非小细胞肺癌细胞增殖、迁移和侵袭,其机制与靶向负调控KIFC1的表达有关.
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编辑人员丨2023/8/6
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Molecular Cloning and Putative Functions of KIFC1 for Acrosome Formation and Nuclear Reshaping during Spermiogenesis in Schlegel's Japanese Gecko Gekko japonicus
编辑人员丨2023/8/6
Spermiogenesis,occurring in the male testis,is a complicated and highly-ordered developmental process resulting in the production of fertile mature sperm.In Gekkojaponicus,this process occurs in 7 steps during which the spermatids undergo dramatic changes in the cytoskeleton and nucleus.Here,we cloned and sequenced the cDNA of the mammalian KIFC1 homologue in the testis of G.japonicus.The 2 344 bp full-length cDNA sequence contained a 191 bp Y-untranslated region,a 134 bp 31-untranslated region and a 2 019 bp open reading frame encoding a protein of 672 amino acids.Tissue expression analysis revealed the highest expression of kifc1 mRNA was in the testis.Fluorescence in situ hybridization revealed that the kifc1 mRNA signal was hardly detected in step 1 spermatids but became concentrated at the acrosome of step 2 spermatids and abundant in the nucleus of step 5 spermatids where the nucleus then undergoes dramatic elongation and compression.The kifc1 mRNA signal then gradually disappears in mature sperm.This expression of KIFC 1 at specific stages of spermiogenesis in G.japonicus implies its important role in the major cytological transformations such as acrosome biogenesis and nucleus morphogenesis.
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编辑人员丨2023/8/6
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肌动蛋白家族成员C1在肝细胞癌中的表达及其与预后和临床病理特征的相关性
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究肌动蛋白家族成员C1(KIFC1)在肝细胞癌(HCC)中的表达,分析其与患者临床病理特征及预后的相关性.方法 通过免疫组化染色法测定KIFC1蛋白在82例HCC组织中的表达水平.分析KIFC1蛋白与临床病理特征(年龄、性别、肿瘤结节、肿瘤分级、肿瘤体积、淋巴结转移及甲胎蛋白表达)的相关性.通过Kaplan-Meier分析,分析HCC患者中KIFC1表达水平对总生存期和无进展生存期的影响.通过GPEIA数据库分析KIFC1的mRNA在肝癌组织中的表达水平.通过KM-plotter分析KIFC1表达与预后相关性.结果 KIFC1蛋白在肝癌组织中显著高表达,其表达水平与肿瘤结节数(P=0.023)及肿瘤大小(P=0.011)有显著的相关性.KIFC1高表达的HCC患者的疾病总生存期和无病生存期均较短(均P<0.05).KIFC1的mRNA在肝癌组织中显著高表达,并与患者无病生存率及总生存率相关.结论 KIFC1蛋白在肝癌组织中异常高表达,其表达水平与肝癌的临床病理特征相关,生物信息学分析结果显示其与患者不良预后相关,提示KIFC1有望成为潜在的肝癌预后的预测因子和治疗靶点.
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编辑人员丨2023/8/6
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KIFC3基因在结直肠癌中的表达及预后分析
编辑人员丨2023/8/5
目的 比较驱动蛋白家族分子C3(KIFC3)基因在结直肠癌组织中的表达及对预后的影响.方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)和Oncomine数据库中收集结直肠癌RNA表达数据,分析KIFC3的表达情况;收集2017年1-6月汕头大学医学院附属第一医院收治的19例结直肠癌切除标本,采用实时荧光定量聚合酶链反应检测癌组织及癌旁正常组织中KIFC3的表达.结合TCGA结直肠癌患者的临床资料,比较各项临床病理特征中KIFC3的表达水平;采用Kaplan-Meier plotter和Cox回归比较KIFC3高表达组与低表达组患者的预后.结果 KIFC3在结直肠癌中的表达显著高于正常组织(3.39土6.26比2.07±4.93)(P<0.05).结直肠癌患者中发生淋巴结转移的KIFC3 mRNA水平高于无转移者(8.42±0.97比8.05±1.05),肿瘤浸润T3~4期的KIFC3 mRNA水平高于肿瘤浸润T1~2期的患者(8.30±1.01比7.87±1.03),病理分期Ⅲ~Ⅳ期的KIFC3 mRNA水平高于Ⅰ~Ⅱ期患者(8.38±0.95比8.06±1.07)(P<0.01).KIFC3表达水平越高,结直肠癌患者总生存时间越短(P<0.05),KIFC3高表达患者的死亡风险约为低表达患者的1.8倍(HR=1.808,95%CI 1.012~3.229,P=0.045).结论 KIFC3在结直肠癌组织中表达升高,KIFC3高表达的结直肠癌患者预后更差.
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编辑人员丨2023/8/5