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长链非编码RNA DANCR在甲状腺癌中的研究进展
编辑人员丨5天前
甲状腺癌是最常见的头颈部恶性肿瘤,发病率呈逐年上升趋势。因此探究甲状腺癌的发生、发展机制,开发甲状腺癌诊断标志物和治疗靶点,对提高甲状腺癌的疗效、延长患者生存时间具有重要意义。前期研究中发现长链非编码RNA(lncRNA)DANCR在甲状腺癌中异常高表达,可通过影响miRNA-185-5p及转录因子SMARCB1来促进富含亮氨酸重复序列激酶2(LRRK2)的表达,间接参与细胞自噬而调控甲状腺癌的发展,有望成为甲状腺癌诊断及治疗的新靶点。文章就lncRNA DANCR在甲状腺癌中的调控机制进行介绍,为甲状腺癌的基础研究和临床诊疗提供新思路。
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编辑人员丨5天前
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循环微小RNA-185在骨肉瘤中的表达及临床意义
编辑人员丨5天前
目的:观察微小RNA(miRNA,miR)-185在骨肉瘤患者中的表达,探讨其在骨肉瘤诊断及预后中的价值。方法:采用实时定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术检测54对骨肉瘤患者和健康对照者(性别和年龄匹配)的miR-185表达。根据miR-185的中位数(2.381),将所有患者分为两组:高miR-185表达组(21)和低miR-185表达组(33)。然后分析miR-185表达与患者临床病理因素的相关性。血清样本在郑州大学第一附属医院2012年1月1日至2014年12月份从接受手术但未接受化学疗法或放射疗法的患者中收集,并分析miR-185表达与骨肉瘤患者的临床病理特征和总体生存率的关系。使用Manne Whitney U检验比较骨肉瘤患者和正常对照组血清miR-185水平的差异。对数秩检验和Kaplan-Meier方法评估骨肉瘤患者的总体生存率。采用Cox回归和多因素分析评估预后价值。 结果:与正常对照组比较,骨肉瘤患者血清中的miR-185表达显著降低( U=373.000, P<0.05),差异有统计学意义。miR-185的低表达与较大的肿瘤体积(直径<5 cm比直径≥5 cm的miR-185:3.100±0.359比1.806±0.226, P<0.01),较高的TNM分期(一、二期比三、四期的miR-185:2.986±1.562比1.566±1.305, P<0.01)和远处转移(未转移比转移的miR-185:3.014±1.660比1.590±1.148, P<0.01)密切相关,差异有统计学意义。Kaplan-Meier曲线生存分析和对数秩检验显示,miR-185的低表达与骨肉瘤患者的总生存率降低有关。此外,多变量分析表明,miR-185表达降低是骨肉瘤患者总体生存的独立预后生物标志物( P<0.01),差异有统计学意义。 结论:血清miR-185可作为一种肿瘤抑制因子,有助于骨肉瘤患者的诊断、预后。
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编辑人员丨5天前
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X射线诱导非小细胞肺癌A549细胞凋亡的适应性反应及相关miRNA筛选的研究
编辑人员丨5天前
目的:研究X射线辐射诱导非小细胞肺癌(NSCLC) A549细胞凋亡的适应性反应,并筛选适应性反应相关的微RNA (miRNA)。方法:将NSCLC A549细胞分为6组,包括50 mGy+20 Gy、200 mGy+20 Gy、20 Gy、50 mGy、200 mGy照射组及对照组(0 Gy),前2组细胞分别用50、200 mGy初始剂量进行照射,培养6 h后用20 Gy的效应剂量进行照射,20 Gy、50 mGy、200 mGy照射组同时进行照射。培养24 h后使用流式细胞仪检测细胞凋亡情况。利用小RNA测序技术筛选差异表达miRNA,并对其靶基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路的功能富集分析。采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)对部分差异表达miRNA进行验证。2组间数据的比较采用Welch t检验。 结果:50 mGy+20 Gy照射组和200 mGy+20 Gy照射组的A549细胞早期凋亡率分别为(1.81±0.11)%和(2.17±0.19)%,低于20 Gy照射组的(4.54±0.23)%,且差异均有统计学意义( t=10.680、8.006,均 P<0.01)。与20 Gy照射组相比,50 mGy+20 Gy照射组和200 mGy+20 Gy照射组共同差异表达趋势miRNA有1个上调(miR-3662)、15个下调(miR-185-3p、miR-1908-5p、miR-1307-5p、miR-182-3p、miR-92a-3p、miR-582-5p、miR-501-3p、miR-138-5P、miR-1260b、miR-484、miR-378d、miR- 193b-3P、miR-127-3p、miR-1303及miR-654-5p)。GO富集分析结果显示,差异表达miRNA调控靶基因功能显著富集于细胞通讯调节、代谢过程的正向调节、代谢信号的调节、酶结合及催化活性等过程。KEGG富集分析结果显示,靶基因相关信号通路显著富集于溶酶体、丝裂原活化蛋白激酶、Ras和内吞作用等信号通路。qRT-PCR检测结果显示,miRNA表达情况与基因芯片结果趋势一致(10个miRNA表达水平得到验证)。 结论:X射线50、200 mGy照射剂量均能诱导NSCLC A549细胞凋亡的适应性反应,并筛选到一组共同差异表达的miRNA,可能在X射线辐射诱导细胞凋亡的适应性反应中发挥了重要作用,有可能成为调节电离辐射生物效应的潜在靶点。
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编辑人员丨5天前
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2型糖尿病患者血浆microRNA差异表达及生物信息学分析
编辑人员丨5天前
目的:构建2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)患者血浆microRNA(miRNA)差异表达谱,探讨miRNA作为T2DM诊疗靶标的可能性。方法:采用miRNA芯片技术检测T2DM患者血浆中miRNA差异表达情况,用实时荧光定量PCR(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)进行验证,对目标miRNA进行生物信息学分析。结果:T2DM患者血浆中122个miRNAs呈差异表达( FC>2, P<0.05),经多源交集筛选得到差异表达miRNAs 14个,其中上调5个,下调9个。RT-qPCR结果显示,血浆中hsa-miR-185-5p及hsa-miR-328-5p在病例组高表达,差异有统计学意义( P<0.05)。生物信息学分析结果提示,这些miRNAs可能通过胰岛素分泌及PI3K-AKT信号通路途径参与T2DM发生发展过程。 结论:T2DM患者血浆中hsa-miR-185-5p及hsa-miR-328-5p呈差异表达,可能与T2DM发病密切相关。
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编辑人员丨5天前
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长链非编码RNA HAGLR对乳腺癌预后的影响及其竞争性内源RNA互作网络的构建
编辑人员丨5天前
目的:探究长链非编码RNA(lncRNA)HAGLR在乳腺癌中的表达情况及其对乳腺癌预后的影响,并构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络。方法:采用Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology网站检索HAGLR基因染色体定位及转录本表达情况。采用lnclocater网站预测HAGLR亚细胞定位。通过lnCAR数据库分析HAGLR在乳腺癌组织和癌旁组织的差异表达情况,按HAGLR表达水平,将lnCAR数据库患者分为HAGLR高表达组和HAGLR低表达组,采用Kaplan-Meier法分析两组间总生存(OS)及无转移生存情况,并通过UCSC Xena数据库进行验证。通过lnCAR数据库检索HAGLR共表达基因,将排位前200个共表达基因提交至Metascape网站,进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,构建蛋白互作网络(PPI)。采用生物信息学在线分析网站starbase预测HAGLR靶向的微RNA(miRNA)和可直接编码蛋白的mRNA,通过Cytoscape3.8软件构建HAGLR的ceRNA网络。结果:HAGLR基因定位于2q31.1,主要分布于细胞质;HAGLR在乳腺癌组织中的表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义( P<0.001)。对lnCAR数据库和UCSC Xena数据库分析均显示,HAGLR高表达组OS较低表达组均差(均 P<0.01);lnCAR数据库中HAGLR高表达组无转移生存较低表达组差( P=0.030)。前200个HAGLR共表达基因中与HAGLR负相关基因129个,与HAGLR正相关基因71个。KEGG通路分析显示,HAGLR与代谢通路、MAPK信号通路、JAK-STAT信号通路及癌症通路有关;GO注释分析显示,HAGLR主要富集在细胞周期、着丝粒复合体组装、有丝分裂进程、蛋白激酶结合、激酶活性的调节、细胞对DNA损伤刺激的反应等多种功能中。hsa-miR-130b-3p、hsa-miR-1245b-5p、hsa-miR-182b-5p、hsa-miR-512-3p、hsa-miR-302b-3p、hsa-miR-185b-5p、hsa-miR-106b-5p为HAGLR靶向miRNA。 结论:HAGLR在乳腺癌组织中高表达,其可能是乳腺癌预后预测的生物标志物。
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编辑人员丨5天前
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三七总皂苷调控破骨细胞外泌体中差异miRNA表达抑制成骨细胞铁死亡
编辑人员丨3周前
背景:激素性股骨头坏死多是由于长期大量使用激素所致,但具体的发病机制尚未明确,有待于进一步研究.目的:筛选出三七总皂苷干预破骨细胞来源外泌体中的差异miRNA,在此基础上构建成骨相关铁死亡调控网络,以探索激素性股骨头坏死发生的潜在机制及研究方向.方法:MTT实验检测不同浓度地塞米松和不同质量浓度三七总皂苷对Raw264.7细胞系的毒性作用;抗酒石酸酸性磷酸酶染色和TUNEL染色检测三七总皂苷对破骨细胞抑制和凋亡的影响;从三七总皂苷干预的破骨细胞中提取外泌体,对外泌体进行测序找出差异表达miRNA,通过CytoScape 3.9.1构建并可视化差异表达的miRNA与mRNA间的调控网络;通过GO分析和KEGG分析筛选候选mRNA;最后筛选出铁死亡相关的差异基因,构建铁死亡相关基因的调控网络.结果与结论:①通过MTT实验确定了适合干预Raw264.7细胞的地塞米松浓度(0.1 μmol/L)和三七总皂苷质量浓度(1 736.85 μg/mL);②三七总皂苷对破骨细胞有抑制作用并能促进其凋亡;③从破骨细胞来源外泌体样本中鉴定出20个差异miRNA,通过靶标mRNA预测出11种成骨相关的差异miRNA,并构建了4个上调的差异表达miRNA对应于155个下调的候选mRNA以及7个下调的差异表达miRNA对应于238个上调的候选mRNA的调控网络;④在差异基因中筛选出与铁死亡相关的基因24个,最终构建了12个网络(miR-98-5p/PTGS2,miR-23b-3p/PTGS2,miR-425-5p/TFRC,miR-133a-3p/TFRC,miR-185-5p/TFRC,miR-23b-3p/NFE2L2,miR-23b-3p/LAMP2,miR-98-5p/LAMP2,miR-182-5p/LAMP2,miR-182-5p/TLR4,miR-23b-3p/ZFP36,miR-182-5p/ZFP36).这些结果表明三七总皂苷可能通过调控破骨细胞外泌体来源miRNA的表达来调节成骨细胞铁死亡,为激素性股骨头坏死的机制研究提供新的思路.
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编辑人员丨3周前
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细胞游离miR-185、miR-134、miR-22和CEA组合谱对肺癌相关的恶性胸腔积液诊断价值研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究循环细胞外miR-185、miR-134、miR-22对肺癌相关的恶性胸腔积液的诊断价值.方法 采用实时荧光定量PCR方法 (RT-q PCR) 检测58例肺癌恶性胸腔积液 (MPE) 和40例良性胸腔积液 (BPE) 中胸液3个游离miRNA的相对表达水平.曲线下面积 (AUC) 用来评估3个miRNAs和CEA的诊断价值.结果 肺癌恶性胸腔积液中miR-185、miR-134和miR-22的表达水平较BPE减少, 差异有统计学意义 (P<0.01).miR-185、miR-134和miR-22的AUC分别为0.861 (95%CI:0.776~0.922) 、0.818 (95%CI:0.727~0.888) 和0.827 (95%CI:0.738~0.896).当3个miRNAs和CEA联合检测时, 敏感度增高到91.9%, 特异度为92.5%, AUC升高到0.942 (95%CI:0.864~0.982).结论 胸液游离miR-185、miR-134和miR-22可作为肺癌恶性胸腔积液诊断的分子标志物.
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编辑人员丨2023/8/6
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微小核糖核酸调控胆固醇稳态的研究进展
编辑人员丨2023/8/6
胆固醇稳态受多种因素的密切调节,而胆固醇代谢紊乱与2型糖尿病、动脉粥样硬化、非酒精性脂肪性肝病等多种疾病的发生、发展密切相关.微小RNA(microRNA,miRNA)是脂代谢的转录后调控因子,miRNA-185-5p、miRNA-758-5p、miRNA-33a、miRNA-21、miRNA-122和miRNA-370与胆固醇的合成有关,miRNA-33、miRNA-144、miRNA-26、miRNA-758-3p、miRNA-106b、miRNA-10b、miR-NA-302、miRNA-145、miRNA-27a/b和miRNA-613与胆固醇的转运有关,多种microRNA共同参与调控胆固醇代谢中关键蛋白的表达,调控胆固醇的稳态平衡.
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编辑人员丨2023/8/6
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miRNA-95在宫颈癌放疗敏感性中的作用及其机制研究
编辑人员丨2023/8/6
目的 研究miRNA-95在不同放射敏感性的宫颈癌患者肿瘤组织和宫颈癌细胞株中的表达情况及其调控表达后对宫颈癌细胞放射敏感性的影响.方法 分别利用Real-time PCR方法检测放疗敏感患者组20例、 放疗耐受患者组20例的宫颈癌肿瘤组织和辐射抵抗宫颈癌细胞株(HeLa、SiHa)、辐射敏感宫颈癌细胞株(Me180)中miRNA-95的表达情况.利用脂质体2000将miRNA-95 mimics和miRNA-95 inhibitions转染至辐射抵抗的HeLa、SiHa细胞中,分别为miRNA-95mimics组和miRNA-95 inhibition组,同时设置miRNA-NC组为对照.CCk-8方法检测在0、2、4、6、8、10 Gy剂量60 Coγ射线照射下各组宫颈癌细胞的增殖情况;平板单克隆实验检测4 Gy照射后各组宫颈癌细胞单克隆形成能力;流式细胞术检测4 Gy照射后各组宫颈癌细胞凋亡变化;双荧光素酶活性实验检测miRNA-95在宫颈癌细胞中的靶向基因;裸鼠实验检测4 Gy照射后各组宫颈癌裸鼠成瘤的变化.结果 miRNA-95在放疗耐受患者组宫颈癌肿瘤组织中表达显著高于放疗敏感组(t=12.279,P<0.05);miRNA-95在HeLa、SiHa细胞中表达量显著,与Me180细胞比较,差异有统计学意义(t=5.162、7.114,P<0.05);与miRNA-NC组相比,miRNA-95 inhibition组HeLa、SiHa细胞株中miRNA-95表达水平显著下降(t=9.284、8.036,P<0.05),而细胞增殖率显著下降(t=8.273、11.354、13.489、15.396和6.197、9.185、10.994、12.442,P<0.05);单克隆形成率显著下降(t=8.378、7.931,P<0.05);细胞凋亡率显著上升(t=10.265、8.386,P<0.05);miRNA-95 inhibition组裸鼠成瘤重量显著降低(t=8.881、10.037,P<0.05).结论 miRNA-95在放疗敏感的宫颈癌肿瘤组织和辐照敏感的宫颈癌细胞中均呈低表达,而抑制miRNA-95表达水平能够显著提高宫颈癌细胞的辐射敏感性,并通过靶向SGPP1基因从而发挥作用.
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编辑人员丨2023/8/6
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人类免疫缺陷病毒阳性Burkitt淋巴瘤和弥漫大B细胞淋巴瘤中差异微小核糖核酸的筛选及靶基因预测
编辑人员丨2023/8/6
目的 筛选 HIV感染相关Burkitt淋巴瘤(Burkitt lymphoma ,BL )与弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma ,DLBCL)中差异性微小核糖核酸(microRNA ,miRNA).方法 收集上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心5份BL和3份DLBCL新鲜冰冻组织标本,19份BL和15份DLBCL石蜡标本. Agilent human miRNA microarray芯片技术检测新鲜冰冻的BL和DLBCL组织中miRNA表达情况,查找差异miRNA .利用SmartRNAplexTMmiRNA技术在BL和DLBCL石蜡组织中验证关键miRNA ,生物信息学方法预测靶基因.结果 以DLBCL 为参照,BL 组中有42个差异性miRNA ,其中28个miRNA上调,14个miRNA下调.以真核生物正向调控和高表达分子能促进肿瘤发生为依据,从BL组表达上调的miRNA选出5个关键miRNA验证,结果与芯片一致.与DLBCL相比,5个 miRNA 在 BL 中的表达均上调,分别为 miRNA-16-2-3p 、miRNA-20a-3p 、miRNA-130b-3p 、miRNA-185-5p和miRNA-423-5p(t值分别为2 .715 、2 .539 、2 .750 、4 .004和3 .625 ,均 P<0 .05) .其中miRNA-16-2-3p对应的靶基因可能主要为CTNND2和 RAD21 ;miRNA-20a-3p的靶基因可能主要为DYRK1A和GPAM ;miRNA-130b-3p的靶基因可能主要与IRF1 、DICER1 、PTEN等相关;miRNA-185-5p的靶基因可能主要为VEGFA 、NFATC3和SEC24C ;miRNA-423-5p的靶基因可能主要是PA2G4和PNKD .结论 BL和DLBCL中存在差异表达的miRNA ,有望为BL和DLBCL 诊断、鉴别诊断提供新的分子标志物.关键miRNA潜在靶基因与细胞生存、增殖、分化、凋亡和癌变等相关,可能对BL的发生、发展起重要作用.
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编辑人员丨2023/8/6
